科研产出
中华鲟ASDIGIRR与ASTRAF6基因的克隆与表达
《水产学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：中华鲟是处在硬骨鱼类与软骨鱼类之间的中国古老的珍稀鱼类之一,但在人工繁殖和养殖过程中,容易受到不同疾病的危害,因此,需要深入研究其免疫调控,为其疾病预防提供理论依据。单个免疫球蛋白白细胞介素-1受体相关分子（SIGIRR）和肿瘤坏死因子受体相关因子6（TRAF6）是toll样受体（TLR）信号通路的2个重要的信号转导元件。本研究鉴定了中华鲟的SIGIRR和TRAF6的同源物,分别命名为ASDIGIRR （Acipenser sinensis DIGIRR）和ASTRAF6 （A. sinensis TRAF6）,并研究它们在正常组织中的表达和Poly（I:C）诱导后的表达模式。结果显示,ASDIGIRR和ASTRAF6在健康鲟的10个组织中均有表达,且分别在肠道和头肾组织中表达量最高;用Poly （I:C）孵育中华鲟脾脏细胞后,ASDIGIRR在3 h时的表达量显著下调,在6 h时恢复至正常水平,后在24 h显著上调达到最高值,随后开始下调,至48 h时仍显著高于对照组,而ASTRAF6在6 h达到最高表达量,维持到24 h后再下调,48 h时下降至最低水平。研究表明,ASDIGIRR和ASTRAF6在中华鲟抵御病原入侵的免疫防御过程中起着重要作用。
关键词： 中华鲟 ASDIGIRR ASTRAF6 Poly （I:C） 基因克隆 基因表达
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高温期大宗淡水鱼病害的防与治
《科学养鱼 》 2021 北大核心
摘要：科学养鱼:近年来大宗淡水鱼总体的发病情况如何?袁圣:近年来大宗淡水鱼发病总体呈上升趋势,主要表现在发病期有所延长、新发疾病不断出现、危害程度越来越大、引起的损失越来越高。发病时间:原本几乎不发病的越冬期及春季成了发病的高峰期,从2019年起,春季开始暴发大宗淡水鱼越冬综合征,并在全国广泛流行,造成了很大损失（图1）。
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DNA条形码技术鉴定青岛市售三文鱼水产品
《渔业科学进展 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：仅凭感官甄别市售三文鱼（鲑鳟鱼类的统称）是大西洋鲑（Salmo salar）或虹鳟（Oncorhynchus mykiss）难度很大,而广泛应用于物种分类学研究的DNA条形码为物种快速准确鉴定提供了强有力的技术支撑。本研究采用DNA条形码技术,对山东省青岛市6个城区大型商超和农贸市场的三文鱼商品标识与实际物种信息进行了调查。在采集的74份三文鱼样品中,成分为大西洋鲑的样品有61份,占比为82.43%;成分为虹鳟的样品有11份,占比为14.86%;另外,青岛市售三文鱼商品中还含有一定比例的大麻哈鱼（Oncorhynchus keta）和银大麻哈鱼（Oncorhynchus kisutch）,各占比为1.35%。调查数据显示,青岛市场流通的三文鱼商品以大西洋鲑为主,但核对商品标识与实际物种信息发现,14.86%的三文鱼外包装标识商品名称与检测结果不一致,且有多于40%的三文鱼商品未标注产地信息。可见,三文鱼水产品仍存在一定的掺假风险和食品安全风险,这一国际公认的高端水产品的市场监管还有待于加强,建议相关部门应尽快制定产品标准和检测标准,确保三文鱼水产品质量安全可溯源。
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裂壶藻蛋白肽美拉德反应产物的制备及其抗氧化特性
《南方水产科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：该研究以裂壶藻（Schizochytrium limacinum）渣为原料,采用酶解法制备得裂壶藻酶解物（S. limacinum hydrolysate, SLH）,分析其美拉德反应条件,同时探究其不同超滤组分和葡聚糖凝胶柱层析组分美拉德反应产物（Maillard reaction products, MRPs）的抗氧化能力。结果表明,当还原糖为核糖、糖肽质量比为1∶1、反应pH为9、反应温度为100℃、反应时间为6 h时,SLH的MRPs还原力(5 mg·mL-1)为1.24,DPPH自由基清除率(12.5 mg·mL-1)为88.62%。将SLH经超滤后分别得到SLH-1 （<5 kD）、SLH-2 （<10 kD）和SLH-3 （<50 kD）组,发现SLH-1组在美拉德反应前后的抗氧化能力最强。将SLH-1组经Sephadex G-25凝胶柱分离后分别得到SLH-1-Ⅰ、SLH-1-Ⅱ、SLH-1-Ⅲ和SLH-1-Ⅳ组,发现分子量较大的SLH-1-Ⅰ组经美拉德反应修饰后的抗氧化活性最好,其还原力(2 mg·mL-1)为0.741,DPPH自由基的清除率(5 mg·mL-1)为79.41%。此外,氨基酸组成分析表明美拉德反应可导致酪氨酸（Tyr）、赖氨酸（Lys）、组氨酸（His）、精氨酸（Arg）、色氨酸（Trp）等氨基酸含量明显降低,但对必需氨基酸总含量影响不大。
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桁架与板架混合结构形式养殖船水动力特性频域分析
《南方水产科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了研究由桁架结构和多个板架结构浮体构成的养殖船的水动力性能及运动响应特性,文章基于三维势流理论结合Morison方程对养殖船的水动力特性进行了频域计算,获得了养殖船的水动力参数和运动响应,据此完成了分析。结果表明,养殖船附加质量、辐射阻尼对频率的变化较为敏感,敏感程度在养殖船各方向运动上明显不同;且摇动运动的附加质量和辐射阻尼大于平动运动,均与养殖船结构形状有密切关系;在各向入射波的作用下,养殖船的一阶波浪力随频率的增加呈现先增大后减小的趋势,位于高频段的养殖船在不同方向入射波作用下的一阶波浪力曲线趋于稳定,在中低段则出现了较大差异;在高频与低频激励作用下,养殖船的运动响应均较小,但在中短周期规则波中运动时产生共振,随浪或迎浪时养殖船的纵荡、纵摇为主要运动模态,在横浪时养殖船的横摇和垂荡为主要运动模态。
关键词： 养殖船 桁架与板架混合结构 水动力性能 运动响应 势流理论 Morison方程
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南极磷虾壳聚糖、壳寡糖的制备与品质鉴定
《食品工业科技 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：本研究以南极磷虾壳为原料,制备较高品质的壳聚糖与壳寡糖,并对二者的品质进行鉴定。南极磷虾壳经脱钙、脱蛋白处理,探索脱乙酰反应条件（碱溶液浓度、反应温度与反应时间）,制备具有较高脱乙酰度的南极磷虾壳聚糖,并对壳聚糖的理化指标进行鉴定;探索酶法降解条件（壳聚糖酶添加量、酶解时间）,制备较高纯度的南极磷虾壳寡糖,并对壳寡糖的结构特征进行鉴定。结果表明,使用60%的氢氧化钠于110℃脱乙酰处理4 h制备的南极磷虾壳聚糖脱乙酰度为85.74%,粘均分子量为305.65 kDa,水分含量4.66%,灰分含量0.98%,酸不溶物含量0.40%,各项理化指标均符合食品级壳聚糖的要求;使用壳聚糖酶水解南极磷虾壳聚糖制备壳寡糖,在壳聚糖酶添加量为0.2%（m/V）,酶解16 h条件下,南极磷虾壳寡糖产品得率为46.0%,红外光谱与NMR谱图显示了表征壳寡糖结构的全部特征峰,质谱结果显示南极磷虾壳寡糖主要由二糖（GlcN）2、三糖（GlcN）2-GlcNAc与四糖（GlcN）3-GlcNAc构成。本研究通过制备较高品质的壳聚糖与壳寡糖,为南极磷虾壳的高值综合利用与南极磷虾新产品开发提供了技术支持。
关键词： 南极磷虾 壳聚糖 壳寡糖 制备 鉴定 红外光谱 核磁共振
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嗜冷黄杆菌CRISPR/Cas系统生物信息学分析
《中国畜牧兽医 》 2021 北大核心
摘要：为了开发基于嗜冷黄杆菌CRISPR/Cas系统的基因组编辑技术,本研究对嗜冷黄杆菌的CRISPR/Cas系统结构及其作用机制进行生物信息学分析。从GenBank数据库中获得8株嗜冷黄杆菌的全基因组序列,利用CRISPRCasFinder软件查找成簇规律间隔短回文重复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR）结构和CRISPR相关（Cas）蛋白在嗜冷黄杆菌基因组上的数量和分布;利用CRISPRFinder软件分析CRISPR结构的重复序列和间隔序列,并使用Mega X软件对cas基因核苷酸序列做相似性对比;通过与重复序列配对,获得反式激活crRNA（trans-activating CRISPR RNA,tracrRNA）与重复序列配对序列,使用ARNold软件预测tracrRNA基因的终止子;使用BPROM软件预测tracrRNA基因和crRNA前体（pre-CRISPR RNA,pre-crRNA）的启动子;使用Clustal X软件对所有的间隔序列做相似性对比,并使用CRISPRTarget软件对独特的间隔序列配对从而获得原间隔序列（protospacers）及原间隔序列邻近基序（protospacer adjacent motif, PAM）序列;使用WebLogo软件使PAM序列可视化。结果显示,8株嗜冷黄杆菌均含有1个完整的CRISPR/Cas9系统,由1个CRISPR结构和3个Cas蛋白组成。CRISPR结构由短而重复的序列即重复序列和短而可变的序列即间隔序列相间排列组成;重复序列大小为46 bp,核苷酸序列高度保守;间隔序列大小在29～31 bp之间,数量在20～41个之间。Cas蛋白含有Cas9、Cas1和Cas2,并且cas基因核苷酸序列高度保守。8株嗜冷黄杆菌的tracrRNA基因均位于cas9基因上游并且核苷酸序列相似性为100%。tracrRNA上有一段大小为24 bp的核苷酸序列,其中23个核苷酸与重复序列完全配对。每个重复序列均含有一个较短的启动子,可单独启动pre-crRNA的转录。不同菌株的间隔序列比对结果表明,新获得的间隔序列可以插入到嗜冷黄杆菌CRISPR结构的5′端或内部。在65个独特的间隔序列中,13个间隔序列能够配对上原间隔序列,这些原间隔序列均来源于噬菌体或质粒。原间隔序列上游侧翼序列分析结果表明,嗜冷黄杆菌Cas9识别的PAM序列是5′-GANTTTT-3′。以上结果表明嗜冷黄杆菌的CRISPR/Cas9系统理论上可以开发适用于嗜冷黄杆菌的基因组编辑技术。
关键词： 嗜冷黄杆菌 CRISPR/Cas9系统 Cas蛋白 tracrRNA 重复序列 间隔序列
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三斑海马骨骼染色方法改进及骨骼结构特点研究
《南方农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确三斑海马（Hippocampus trimaculatus）的骨骼特点,为三斑海马的种类鉴定提供技术支持,同时为海马的基础生物学积累数据。【方法】在透明化骨骼染色法的基础上,进一步改进三斑海马骨骼染色方法,并对三斑海马的骨骼特点进行细节性描述。【结果】相对于传统的透明化骨骼染色法,改进后的透明化骨骼染色法在再脱色与透明环节中,通过添加少量H2O2有效去除组织中残留的染色剂,同时添加少量2%KOH促使组织更加透明,且在装瓶步骤中正向直立放置三斑海马骨骼标本。三斑海马的背鳍鳍条数为19～21条,胸鳍鳍条数为18～19条;其头部有独特结构:有多个凸出的棘,颌骨部分构成管状结构,鳃盖后缘无鳃孔,鳃孔开口在鳃盖后缘正上方头顶位置;三斑海马自头部以下至尾端体表均由菱形骨片构成的骨环包被,胸腹部共有12节骨环,除第11和12节骨环外,每节骨环均由7片不规则的菱形骨骼构成,骨环内部及骨环间存在滑道结构,为运动和摄食提供立体空间;尾部共有40～41节骨环,每节骨环均由4片菱形骨片构成,骨环向尾末端逐渐缩小,骨环间也存在滑道结构,具攀附功能。【结论】改进后的透明化骨骼染色法更适合于三斑海马骨骼染色,操作便捷,骨骼标本质量高。三斑海马具有独特的头部骨骼结构与摄食方式,自头部以下全身包被骨骼,外骨骼主要由菱形骨片构成,但构成不同部位骨环的菱形骨片数量不同;骨环内部及骨环间存在滑道结构,为三斑海马的运动和摄食提供立体空间,因此可通过胸腹部膨胀围度判断三斑海马的营养状况及雌性三斑海马的性腺发育情况。
关键词： 三斑海马 骨骼结构 骨环 菱形骨片 透明化骨骼染色法
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海洋江豚的研究概述
《渔业科学进展 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：近年来随着国家政策的重视,人们环保意识的提高,针对珍稀濒危水生野生动物,尤其是鲸类动物的保护工作受到越来越多的关注.截至目前,国内相关研究单位针对鲸类动物开展了大量研究,但研究对象主要局限在中华白海豚(Sousa chinensis)和长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis asiaeorientalis).相比较而言,在我国分布范围更广的海洋江豚得到的研究和保护远远不够,亟需开展系统深入的研究工作.鉴于此,本文对江豚的记载、分类和海洋江豚的研究进行了回顾,重点总结了海洋江豚的生态学、生物学、遗传学、声学以及摄食和繁殖等方面的研究进展,对今后的研究和保护重点提出了建议,包括注重基础研究、强化保护区建设、注重保护技术研发和加强宣传教育,以期对未来的工作提供借鉴.
关键词： 海洋江豚;分类;种群;分布
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基于主成分分析的吸鱼泵对鱼类损伤评价方法
《中国农学通报 》 2021 CSCD
摘要：采用主成分分析法建立吸鱼泵的损伤综合评价方法,为吸鱼泵的研究与改进提供装备技术参数。使用真空吸鱼泵对鲫鱼进行吸捕试验,获取鱼体损伤数据。通过测定体表损伤面积比率、24 h存活率、红细胞数量、白细胞数量、超氧化物歧化酶（SOD）活力、谷丙转氨酶（ALT）活力、肌酐（Cr）含量等多个关键指标值,采用主成分分析法进行相关性分析,建立损伤综合评价模型。结果显示:采用主成分分析法提取出3个主成分的累积贡献率达到78.232%,可反映出鱼体损伤的大部分情况;损伤评价综合评价模型:F=0.285X1+0.111X2+0.316X3+0.366X4-0.118X5+0.234X6,真空吸鱼泵对鱼的体表和内脏无显著损伤情况,综合得分-0.102,与对照组接近,表明真空吸鱼泵对鱼的损伤影响很小。研究表明,SOD活力、白细胞数和体表损伤面积比率是对损伤评价影响较大的数据指标,采用主成分分析法建立的综合损伤评价模型可以作为评价鱼损伤情况的一种可行方法,为吸鱼泵的改进研究提供了有力参考。
关键词： 真空式吸鱼泵 鲫鱼 损伤评价 主成分分析法 综合评价模型
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