科研产出
基于SNP标记的3个翘嘴鲌养殖群体的遗传多样性和选择特征分析
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为评估翘嘴鲌（Culter alburnus）养殖群体的遗传多样性水平,探究其遗传特征及群体间的遗传差异,本研究利用全基因组重测序（whole genome resequencing,WGS）技术,对来自浙江太湖（TH）、广东清远（QY）和江苏扬州（YZ）的三个养殖群体进行了深入分析。总共鉴定出23156699个高质量SNPs位点,变异位点主要位于基因间区域（47.21%）和内含子区域（39.37%）。三个群体的SNP标记均显示为低度多态性（PIC<0.25）。太湖、清远、扬州三个群体的近交系数分别为0.1923、0.0631和-0.0280。群体结构分析表明,太湖群体形成了独特聚类,而清远和扬州群体在遗传上则受到了多个祖先群体的影响。连锁不平衡衰减图（LD decay）显示,太湖群体的衰减距离最大,衰减速度最慢。遗传分化指数(Fst)和基因流（Nm）均表明,太湖群体与其他群体间存在明显分化。通过基于遗传分化系数(Fst)和核苷酸多样性（π）的选择性扫描分析,以清远和扬州群体为参考群体,在太湖群体中分别鉴定到了572个和602个选择性基因,涉及能量代谢、氧化应激和炎症反应等生物过程,最多选择的区域位于chr 3和chr 7上。综上所述,三个翘嘴鲌养殖群体的遗传多样性水平均较低,其中太湖群体的遗传多样性最低,受到较强的人工选择和近亲繁殖影响,清远群体与扬州群体则显示出频繁的基因交流。本研究可为翘嘴鲌养殖群体的育种选育及种质资源的保护和管理提供基础数据。
关键词： 翘嘴鲌 全基因组重测序 育种选择 遗传变异 选择性清除
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黄海细纹狮子鱼卵巢发育的组织学观察
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：细纹狮子鱼(Liparis tanakae)是黄海生态系统的优势种，阐明其种群繁殖规律是揭示优势种维持机制的前提，也是深层次认知生态系统结构与功能的基础。本研究采用石蜡切片和HE染色法对其卵巢各发育阶段进行了组织学研究，详细描述了各时相卵母细胞的形态和卵径分布特征，并分析了细纹狮子鱼的产卵类型。结果显示，细纹狮子鱼卵母细胞发育可分为6个时相：第Ⅰ时相为刚从卵原细胞分化为卵母细胞时期，细胞体积小，细胞核占比较大；第Ⅱ时相，卵母细胞增大，细胞周围出现一层滤泡膜；第Ⅲ时相，细胞质中出现卵黄泡，卵黄开始积累，质膜与滤泡膜间出现放射带，滤泡膜变为2层；第Ⅳ时相，卵黄开始填充卵黄泡，并逐渐结成卵黄小板；第Ⅴ时相，卵黄融成单一大卵黄球，细胞核溶解；第Ⅵ时相卵母细胞退化，卵黄被逐渐吸收形成空腔，部分卵母细胞形态不规则。细纹狮子鱼卵巢发育分为6期，不同发育时期各时相卵母细胞的组成比例不同。其中，Ⅳ期卵巢内卵径呈单峰分布，优势粒径组为0.90～1.00 mm，主要由第Ⅲ、Ⅳ时相卵母细胞组成；Ⅴ期卵巢内卵径呈单峰分布，优势粒径组为1.70～1.80 mm，主要由第Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ时相卵母细胞组成，第Ⅴ时相卵母细胞增多；Ⅵ期卵巢卵径呈双峰分布，优势粒径组主要集中于0.50～0.70 mm和1.10～1.20 mm，处于小生长期的卵母细胞和退化的卵母细胞比例较高。细纹狮子鱼卵巢发育模式为非同步型分批产卵类型。研究结果揭示了细纹狮子鱼卵巢发育规律及特点，为进一步丰富该鱼的繁殖生态学提供了理论参考。
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拟穴青蟹苗种MCRV检测方法的建立及应用
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：拟穴青蟹(Scylla paramamosain)苗种携带青蟹呼肠孤病毒(mud crab reovirus, MCRV)对后期养殖具有极大的风险。培育无MCRV苗种，从源头切断该病毒传播，已成为当前青蟹养殖中亟待解决的关键问题。为提高青蟹苗种MCRV检测的灵敏度，本研究选择MCRV的高表达基因VP11作为靶标，设计特异性引物和Taq Man-MGB探针，以标准品质粒和RNA为模板，通过优化反应体系和反应程序，建立了一种适用于青蟹苗种MCRV检测的TaqMan-MGB实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法，能够实现对MCRV的精准检测。在1×10～8～1×10～1 copies/μL标准品质粒(或dsRNA)的范围内，起始模板浓度对数值与反应循环数间呈良好的线性关系，最低可精确定量10 copies标准品质粒或dsRNA/反应的样品，该方法最低理论检测极限为2.5 copies标准品质粒/反应。以青蟹双顺反子病毒(MCDV)、对虾白斑综合症病毒(WSSV)、十足目虹彩病毒(DIV1)、虾肝肠胞虫(EHP)及副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)核酸样品作为模板进行检测，均未产生特异性扩增。该检测方法对质粒和dsRNA样品的变异系数分别为1.40%和0.98%，具有良好的重复性和稳定性。使用该方法和SYBR Green qRT-PCR方法同时对14份不同发育阶段蚤状幼体进行检测，MCRV检出率分别为78.57%和57.14%。上述研究结果表明，该检测方法稳定性好、特异性强、灵敏性更高，适用于不同发育阶段青蟹幼体的MCRV检测，可为无MCRV青蟹苗种的生产提供关键技术支撑。
关键词： 拟穴青蟹 MCRV 检测方法 TaqMan qRT-PCR 苗种
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大口黑鲈源迟缓爱德华氏菌的分离鉴定及中草药的体外抑菌试验
《中国预防兽医学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为明确扬州地区桂鲈渔业养殖场大口黑鲈(Micropterus salmoides)出现体表、鳍条充血、肛门红肿等症状的致病原,并了解该病原的药敏性及对中草药的敏感性等,本研究从患病大口黑鲈的肝脏和肠道组织中分离纯化得到一株优势菌,命名为LYG221206株.采用LB固体培养基培养后可见圆形、光滑、湿润且边缘整齐的灰白色(略透明)的菌落;经革兰氏染色后镜检可见,分离菌为革兰氏阴性菌,呈短直杆状;经生理生化鉴定结果显示分离菌与标准株迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)特征一致;通过16S rRNA基因的PCR扩增并测序进一步表明分离菌为E.tarda.对分离菌株LYG221206进行回归试验,结果显示,该分离菌对大口黑鲈的半数致死量(LD50)为1.54×106 cfu/mL,且可从感染组患病大口黑鲈肝脏及肠道组织再次分离获得与分离菌形态及生化特征一致的菌株.通过Kirby-Bauer(K-B)纸片扩散法检测分离菌株LYG221206对9种抗菌药物的敏感性,结果显示,分离菌对强力霉素、恩诺沙星等6种药物敏感,对新霉素和复方新诺明2种药物中介,对多粘菌素1种药物耐药.采用平板打孔法测定分离菌LYG221206对36种单方中草药及10种复方中草药的敏感性,根据2倍稀释法测定中草药对分离菌的最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC).结果显示,分离菌对五味子、五倍子和石榴皮极度敏感,对丁香等6种中草药高度敏感,对赤芍等5种中草药中度敏感,对夏枯草等22种中草药不敏感.测得五味子与五倍子对分离菌的MIC和MBC分别为15.63 mg/mL和31.25 mg/mL;诃子等7种中草药对分离菌的MIC为31.25 mg/mL~62.50 mg/mL,MBC为62.50 mg/mL~125.00 mg/mL;黄连对分离菌的MIC为125.00 mg/mL,MBC为125.00 mg/mL~500.00 mg/mL;赤芍等中草药对该菌的MIC和MBC均为250.00 mg/mL~500.00 mg/mL.在复方中草药中,分离菌对五味子+石榴皮等5种复方中草药极度敏感;对五味子+丁香等5种复方中草药高度敏感.测得五味子+石榴皮等5种复方中草药对分离菌的MIC为15.63 mg/mL,MBC为31.25 mg/mL~62.50 mg/mL;五味子+地榆等5种复方中草药对该菌的MIC为31.25 mg/mL~62.50 mg/mL,MBC为62.50 mg/mL~125.00 mg/mL;上述结果首次表明单方中草药中五味子、五倍子的抑菌效果最好,复方中草药中五味子+石榴皮、五味子+五倍子、五味子+地榆、石榴皮+五倍子、石榴皮+丁香复方中草药的抑菌效果较好.本研究为E.tarda引起的大口黑鲈疾病的防控提供参考依据.
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聚己二酸/对苯二甲酸丁二醇酯/淀粉复合单丝的人工海水降解性能
《水产学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]开发可降解渔具材料,解决因丢失渔具造成的"幽灵捕捞"和"白色污染"问题. [方法]采用熔融纺丝法制备聚己二酸/对苯二甲酸丁二醇酯(PBAT)单丝与PBAT/淀粉复合单丝,对比分析不同人工海水降解环境下降解5 个月的PBAT单丝和PBAT/淀粉复合单丝热力学、力学性能、降解失重率、红外光谱和微观结构变化,研究温度、pH对 2 种单丝的降解性能的影响. [结果]淀粉的添加使得PBAT复合单丝熔融温度(Tm)移向低温,结晶熔融峰变宽;力学性能上,单丝的断裂强力有一定的下降,但结节强力保持率由 63.86%提升到 97.56%,初始阶段 2 种单丝样品的红外光谱吸收峰出现的位置与纯PBAT及纯淀粉特征峰位置大体一致.PBAT/淀粉复合单丝的降解性能显著提升,平均失重率增量达 4.92%,单丝表面的侵蚀加重,孔洞裂隙加深;从环境因素角度分析,2 种材料的降解速率随着降解环境中温度升高与pH的增加而加快. [结论]本实验系统研究了PBAT/淀粉复合单丝的海水降解性能,可为渔用降解新材料的开发与应用提供参考.
关键词： 渔具材料 聚己二酸/对苯二甲酸丁二醇酯(PBAT) 淀粉 海水降解 失重率线性拟合 微观形貌
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水产养殖鱼类粪便的特性、影响因素及基于营养调控的优化处理
《上海海洋大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：随着集约化水产养殖尤其是工厂化循环水养殖系统（Recirculating aquaculture systems,RAS）的迅猛发展，养殖水体中固体废物的高效管理已成为关键挑战。在RAS中，悬浮固体的去除效率不仅直接决定系统的运行效能，更关乎其长期稳定运行。作为养殖水体中固体废物的主要来源，鱼类粪便的物理成形性与水中稳定性是实现养殖用水高效循环利用的关键前提。而且，粪便的过度累积不仅会直接损害鱼类鳃部及体表健康，还会通过加剧微生物竞争、促进氨氮与活性磷等营养盐异常积累，引发水体富营养化与生态系统功能失衡。本研究系统梳理了养殖鱼类粪便物理化学特性、关键影响因素及营养调控策略的最新研究成果。研究发现，鱼类粪便的水中稳定性、沉降速率和颗粒形态等物理特性存在显著种间差异，并受养殖环境与饲料组成的双重调控；尽管粪便化学组成与饲料存在同源性，但其营养成分存在显著差异，其中氮、磷等元素的高度富集是造成水体污染的主要诱因。在营养调控策略方面，饲料优化作为源头治理的核心路径，可通过调整营养成分、添加蛋白酶、植酸酶等外源酶制剂提升营养消化率；借助黏合剂与浮力调节剂优化粪便物理性状；以及利用益生菌、功能性寡糖等添加剂调节肠道微生态，间接改善粪便组成。尽管当前研究已取得阶段性进展，但针对不同养殖模式与品种的特异性研究仍有待加强。本研究旨在为创新饲料技术研发、推动水产养殖业绿色可持续发展提供系统性理论依据。
关键词： 粪便特性 粪便清除效率 营养调控 养殖鱼类 工厂化水产养殖
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麻醉运输对松江鲈成活率和生理生化指标的影响
《水产科技情报 》 2025 北大核心
摘要：为探究适合于松江鲈(Trachidermus fasciatus)的运输模式，采用模拟运输和实际运输验证相结合的方法，比较了使用2种麻醉剂(5 mg/L丁香酚、40 mg/L MS-222)、不同运输时长(0、4、8 h)和不同运输密度(30、50、70 g/L)条件下松江鲈的成活率，分析了在模拟运输试验中各项水质指标和鱼体生理生化指标。结果显示：(1)当运输密度在30 g/L时，松江鲈运输成活率最高，达100%;(2)用5 mg/L丁香酚麻醉能显著降低运输水体中的氨氮质量浓度和菌落总数，维持较好的水质；(3)麻醉运输可以降低松江鲈体内谷草转氨酶、肌酐和皮质醇的活性；(4)在较低运输密度(30 g/L)条件下，采用质量浓度为5 mg/L的丁香酚进行麻醉，松江鲈的运输成活率最高。
关键词： 松江鲈 丁香酚 MS-222 运输 成活率 生理 水质
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基于RAA-CRISPR/Cas13a的鲤春病毒血症病毒快速检测方法的建立
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：鲤春病毒血症病毒(spring viremia of carp virus, SVCV)是一种高致病性病原，对鲤科鱼类造成巨大危害，被世界动物卫生组织列为必须通报疫病。2002年，鲤春病毒血症(spring viremia of carp,SVC)在中国首次检出后，迅速在全国蔓延，给我国鲤鱼养殖业造成巨大威胁。因此，我国农业农村部将其列为二类动物疫病。迄今为止，早期、快速、准确的诊断仍然是控制其传播和流行的重要手段。本研究基于CRISPR/Cas13a系统结合重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided amplification, RAA)，通过对GenBank上登录的SVCV全基因序列比对，针对SVCV聚合酶L基因高度保守的区域设计了一组RAA扩增引物和相应cr RNA；建立了一种可用于SVCV现场快速检测的RAA-CRISPR/Cas13a的方法，可以覆盖SVCV的4种不同基因型(Ia、Ib、Ic和Id)。按照世界动物卫生组织推荐的检测方法验证程序，经实验验证该检测方法有较好的重复性，最低检出限为115 copies/μL，与其他病原之间不发生交叉反应。通过对实验室分离保存的60份来自进出境水生动物疫病监测、国内重大水生动物疫病监测以及攻毒实验的样本进行检测，RAA-CRISPR/Cas13a检测结果与实时荧光定量PCR、套式RT-PCR和病毒分离培养结果完全一致，诊断灵敏度和诊断特异性均达到100%。采用本研究建立的方法在4个不同实验室开展比对，在相同条件下对20份样本进行检测，4个实验室的检测结果一致。结果表明，本研究建立的方法重现性良好，为首次采用CRISPR-Cas13a系统进行SVCV检测的研究，对SVCV快速诊断和防控具有重要现实意义。
关键词： 鲤春病毒血症病毒 恒温扩增 CRISPR 重组酶介导等温核酸扩增技术
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近岸区红树林对堤前设计波浪要素的影响
《科学技术与工程 》 2025 北大核心
摘要：为量化评估红树林消浪区对近海岸线的防护效果，基于广东台山镇海湾红树林工程示范区域，采用现场观测、理论分析、模型试验以及数值分析相结合的方法开展红树林消浪区与波浪相互作用过程研究，从波高方向统计特征、波高年极值统计特征等角度开展红树林消浪特性的验证与分析，从而实现了对红树林消浪机理以及消浪效果统计特征的总结。研究结果表明：基于刚性柱群绕流理论的植被消浪基本理论体系对于红树林类型植被的适用性较强，且相关消浪理论能够与基于波浪能量谱的数值计算模型进行适配融合；采用物理模型试验开展植被消浪过程研究，并与采用植被消浪经验公式的数值模拟结果进行比对，充分论证了本文研究所采用的植被消浪经验公式可靠性；进一步的数值模拟计算结果表明红树林可以从统计角度显著降低各个方向大浪的出现频率，在强浪向上红树林的消浪效果随着不同重现期的波高增加而显著加大，在常浪向和强浪向不一致的情况下，红树林的消浪率随着不同重现期的波高增加无显著增加趋势。
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