科研产出
虎耳草表型特征多样性分析
《植物研究 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了全面理解虎耳草（Saxifraga stolonifera）的种内多样性，探讨种下分类的可能性，为资源保护及创新利用提供参考，对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录，通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法探讨该种的表型性状多样性。结果表明：（1）数量性状变异系数为0.05～0.67，质量性状多样性指数为0.19～1.39，居群间斑纹分布式样和叶色多样性水平高，匍匐茎分枝数和叶长宽比分别为最不稳定和最稳定的性状。（2）数量性状和导出性状变异系数普遍较大、质量性状的多样性指数普遍较高及各主成分的贡献率较分散，因此不宜仅仅依靠形态特征对该种进行种下分类。（3）虎耳草居群间各性状相关性存在差异，叶长和叶宽、下长花瓣长和下短花瓣长、下长花瓣宽和下短花瓣宽等性状相关性显著。（4）基于形态聚类结果可将国产虎耳草分为3个分支，并表现出一定的地域性，其中分支Ⅰ由8个西南居群、2个华东居群和3个西北居群组成；分支Ⅱ由4个华东居群、4个华中居群、4个西南居群和1个西北居群组成，这一类表型的虎耳草分布广泛；分支Ⅲ由10个华中居群、6个西南居群和1个华东居群组成。
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牛肉红朱橘种质表型性状和果实内在品质多样性分析
《种子 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了解牛肉红朱橘种质性状遗传多样性，本研究以24份牛肉红朱橘特异种质为材料，选取37个表型性状和果实内在品质性状进行遗传多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明，牛肉红朱橘果实性状多样性较为丰富，其中果顶形状、果面颜色、种子数、种子重量和单果重等性状变异程度较高。相关性分析表明，果实表型间呈显著正相关，但与可溶性固形物和可滴定酸含量等呈极显著负相关。聚类分析将24份牛肉红朱橘种质分为两大类，分别作为以果实外观品质和内在品质为目标性状的育种材料。主成分分析提取前5个主成分，其累积贡献率达82.257%。
关键词： 牛肉红朱橘 种质资源 表型性状 果实品质 遗传多样性
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西葫芦种皮纤维素合成酶基因CpCesA的克隆及表达分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：裸仁西葫芦因其种皮退化无需脱壳而备受关注,纤维素是植物细胞壁的主要组成成分,是影响西葫芦种皮形成的重要因素,而纤维素合成酶(CES)在植物纤维素合成过程中起关键作用.为深入探究西葫芦CpCesA基因对种皮形成的调控机制,本研究通过克隆获得CpCesA的基因序列,利用生物信息学方法分析其结构和编码蛋白的理化性质.利用实时荧光定量PCR检测种皮不同发育时期和西葫芦不同组织部位CpCesA的表达模式.通过克隆获得CpCesA开放阅读框序列全长2952 bp,生物信息学分析表明,其编码的蛋白质在葫芦科作物中有很强的保守性,且具有纤维素合成酶家族蛋白的保守结构域,属于质膜蛋白.实时荧光定量PCR结果显示:在种子发育过程中,CpCesA在裸仁西葫芦种皮中的表达量比有壳西葫芦普遍显著偏低,有壳西葫芦在授粉后10 d CpCesA表达量达到最高,而裸仁西葫芦则在授粉后20 d达到最高后开始下降.不同品种种皮发育相同时期、同一品种不同发育时期CpCesA表达量表现均不同,这表明CpCesA与西葫芦种皮的发育和形成有着密切关系.组织表达分析表明,CpCesA在两种西葫芦叶片、茎、根、花瓣等不同组织中均有表达,茎和根中表达量高且差异极显著,具有组织表达特异性.本研究为进一步研究纤维素影响西葫芦种皮发育的机理提供参考依据.
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不同造型白化绿茶滋味化学成分及感官品质分析
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析不同造型白化绿茶滋味化学成分及感官品质的差异,为开发白化茶树品种产品制定适宜的工艺流程提供参考依据.[方法]以白化茶树品种白叶1号鲜叶为原料,采用瓶式炒干机、双锅曲毫机和理条机3种设备分别制成卷曲形、颗粒形和松针形白化绿茶,运用高效液相色谱法(HPLC)等方法检测茶叶常规品质成分、氨基酸组分和儿茶素组分,采用主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)和层次聚类分析(HCA)筛选关键特征品质成分,通过感官审评方法评价茶叶品质并分析其与特征成分的相关性.[结果]颗粒形白化绿茶茶多酚含量17.69%、酚氨比2.70,显著低于松针形和卷曲形(P<0.05,下同),鲜甜味氨基酸总量23.16 mg/g、茶氨酸含量18.14 mg/g、谷氨酸含量1.26 mg/g、天冬氨酸含量1.74 mg/g、丙氨酸含量0.13 mg/g、苏氨酸含量0.33 mg/g、缬氨酸含量0.26 mg/g,均显著高于松针形,同时鲜甜味氨基酸占比最大(84.74%)、苦味氨基酸占比最小(11.23%).多元统计分析表明,不同造型白化绿茶差异品质成分主要有茶氨酸、谷氨酸、苏氨酸和甘氨酸4个鲜甜味氨基酸,异亮氨酸、酪氨酸、组氨酸、赖氨酸和精氨酸5个苦味氨基酸,甜略带苦味的脯氨酸和滋味未知的半胱氨酸,儿茶素没食子酸酯(CG)、表儿茶素没食子酸酯(ECG)和茶多酚3个酚类物质以及游离氨基酸和酚氨比;颗粒形白化绿茶的游离氨基酸总量及CG、茶氨酸、谷氨酸、苏氨酸、组氨酸和异亮氨酸含量明显高于松针形和卷曲形.感官审评总分以颗粒形(92.83分)和松针形(92.34分)显著高于卷曲形(84.43分),滋味因子得分以颗粒形(28.15分)最高、松针形(27.65分)次之,外形、汤色和香气因子得分均以颗粒形和松针形显著高于卷曲形,叶底因子得分以松针形(9.23分)最高.滋味因子与半胱氨酸、ECG、CG呈显著正相关,与精氨酸、酪氨酸、赖氨酸和脯氨酸呈极显著(P<0.01)或显著负相关.[结论]颗粒形白化绿茶鲜甜味氨基酸占比大,茶多酚含量和酚氨比较低,酯型儿茶素总量适中,在3种造型中滋味品质和综合品质最佳;松针形白化绿茶酯型儿茶素总量最高,苦味氨基酸总量最低,叶底得分最高,滋味得分次高,感官综合品质优于卷曲形.
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基于SSR分子标记的紫苏种质资源遗传多样性及群体结构分析
《种子 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了明确不同紫苏种质的遗传基础和群体的亲缘关系，本研究利用19对SSR分子标记对不同地理来源的141份紫苏资源进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明，19对SSR分子标记扩增出80条多态性条带，平均每对引物4.26条，多态性指数（PIC）变幅在0.331 1～0.845 7之间，平均为0.620 6,多态性条带占比85.10%。利用UPGMA法对141份紫苏进行分子聚类，遗传相似系数（GS）介于0.478 7～0.948 9之间，平均为0.709 9,在GS=0.696处将供试材料分为三类。通过Structure群体结构分析，将供试材料分为三大类，其中68.8%的紫苏种质资源遗传背景比较单一，31.2%的资源拥有混合血统，其遗传背景较为复杂。
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固相萃取-超高效液相色谱-串联质谱法快速测定鸡粪中37种抗菌药物的含量
《分析科学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：建立了固相萃取-超高效液相色谱-串联质谱法（SPE-UPLC-MS/MS）快速测定鸡粪中37种抗菌药物含量的方法。鸡粪经冻干制备，80%乙腈（含0.1%甲酸）提取，Oasis PRiME HLB通过式固相萃取净化后，利用UPLC-MS/MS测定抗菌药物含量。结果表明，37种抗菌药物浓度在0.40～200.0ng/mL范围内线性关系良好，相关系数（R2）大于0.996,检出限（LOD）为1μg/kg,定量限（LOQ）为4μg/kg。37种抗菌药物在3个浓度添加标水平（LOQ、5倍LOQ、10倍LOQ）下的回收率为63.5%～104.2%,批内相对标准偏差为1.47%～10.5%,批间相对标准偏差为2.39%～14.2%。所建立方法准确、快速、灵敏、稳定，可实现鸡粪中37种抗菌药物的同时快速测定。
关键词： 鸡粪 固相萃取 超高效液相色谱-质谱/质谱 抗菌药物
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红肉火龙果HpHXK基因克隆、表达及酶学特性分析
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析红肉火龙果催化己糖磷酸化糖酵解途径关键酶—己糖激酶（Hexokinase,HXK）基因的克隆、表达及酶学特性，为研究HXK基因在果实可溶性糖积累过程中的作用机制及提高红肉火龙果果实品质提供理论依据。【方法】以红肉火龙果紫红龙的成熟茎组织及花后20、23、25、27和30 d的果实为研究对象，通过转录组测序获得HXK蛋白序列，反转录PCR克隆HXK基因，使用ExPASy、Plant-PLoc、Phobius和SMART等在线工具对HpHXK蛋白进行生物信息学分析，利用Clustal W进行氨基酸序列多重比对，采用MEGA 7.0邻接法（Neighbor-joining,NJ）构建系统发育进化树；构建pGEX-4T-HpHXK载体并转化至烟草叶片；分析HpHXK基因在不同组织中的表达模式并利用比色法测定重组蛋白的酶活性。【结果】HpHXK基因开放阅读框（ORF）长度为1410 bp，编码469个氨基酸残基。生物信息学分析表明，HpHXK蛋白相对分子量为52.47 kD，理论等电点（pI）为5.42，该蛋白具有HXK特征结构域。系统发育进化树结果显示，HpHXK序列与水稻、拟南芥、苹果、梨、葡萄和枇杷的HXKs聚为一类。HpHXK基因在花后20 d果实中的相对表达量最高，显著高于花后25、27和30 d果实及成熟茎（P<0.05）。亚细胞定位结果显示，HpHXK蛋白定位于细胞质和细胞膜。聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）检测结果显示，经异丙基硫代-β-D-半乳糖苷（IPTG）诱导后，重组质粒表达产物与预期相对分子质量一致，表明成功获得HpHXK重组蛋白。HpHXK蛋白对葡萄糖[米氏常数（Km）=0.61mmol/L]的亲和力高于果糖（Km=2.92 mmol/L）。【结论】HpHXK蛋白具有HXK家族保守结构域，在红肉火龙果果实发育期间，HpHXK基因负向调控果实可溶性糖积累，在细胞质中催化以葡萄糖为主的己糖磷酸化。
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Biolog代谢表型技术解析小菜蛾肠道细菌河生肠杆菌的生物学特性
《环境昆虫学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：河生肠杆菌Enterobacter amnigenus为小菜蛾Plutella xylo.stella幼虫肠道优势可培养格兰氏阴性细菌,本文系统地阐述了河生肠杆菌在养分需求和环境适应力上的生物学特性.采用Biolog代谢表型技术,系统地研究了 E.amnigenus的碳、氮、磷、硫需求及其在各种环境下的适应力.河生肠杆菌具有广泛的营养需求,可代谢38.42%的供试碳源、98.42%的供试氮源,以及100%的硫源和100%的磷源;高效代谢的碳源和氮源分别为有机酸类和糖类、及氨基酸类和肽类化合物.它表现出95种生物合成途径.河生肠杆菌具有广泛的环境适应力,能分别在高达6.5%氯化钠、5%硫酸钠、6%氯化钾、20%乙二醇、6%甲酸钠、4%尿素、10%乳酸钠、50 mmol/L苯甲酸钠(pH5.2)、200 mmol/L 磷酸钠(pH7.0)、100 mmol/L 硫酸铵(pH8.0)、100 mmol/L 亚硝酸钠和 100 mmol/L 硝酸钠的渗透溶液中生长,而不能在11%~12%的乳酸钠渗透溶液中生长;其适应pH值范围为4.5~10.0,最适约为9.0.在多种氨基酸的作用下,河生肠杆菌具有脱羧酶和脱氨酶活性.小菜蛾肠道细菌河生肠杆菌具有广泛营养需求特性、渗透压与pH环境适应力.
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贵州地方芥菜型油菜主要农艺性状的遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了探明贵州芥菜型油菜的遗传变异情况，并筛选具有优良性状的材料作为核心种质资源，该研究以242份贵州地方芥菜型油菜资源为研究对象，利用株高、一次分枝数、千粒重等表型性状，进行遗传多样性的评价、主成分分析和类群划分。分析结果表明：(1)贵州芥菜型油菜的株高、一次分枝数、主花序长、全株有效角果数等15个表型数量性状具有较大的标准差及变异系数，表型变异系数介于10.27%～33.66%之间。(2)主成分分析将15个数量性状简化为产量相关因子、分枝相关因子、主花序相关因子、角果相关因子，累计贡献率为68.29%。(3)在欧式距离为10处，可将贵州芥菜型油菜资源划分为高产、中产、低产3个类群。研究结果表明，贵州芥菜型油菜遗传多样性丰富，该研究结果为贵州芥菜型油菜种质资源的保护和利用提供了重要的理论依据。
关键词： 贵州 芥菜型油菜 遗传多样性 主成分分析 聚类分析
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基于转录组的3种缬草SSR位点信息比较分析
《江苏农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为研究3种缬草SSR分子标记的差异，开发相应的引物用于缬草的鉴定及分子育种。本研究采用Excel和MISA软件对3种缬草转录组中SSR位点数据进行分析，利用Primer 3.0软件随机设计SSR引物，并进行PCR扩增及琼脂糖凝胶电泳验证引物的有效性和SSR的多态性。结果显示，缬草Valeriana officinalis L.(VOL)、Valeriana officinalis var.iatifolia Miq.(VOI)及Valeriana officinalis var.officinalis Linn.(VOO)的转录组数据分别包含29 462、40 840和29 280个序列总数(Unigene),这些Unigene分别包含7 515、8 046和7 330个SSR位点。3种缬草的SSR位点的发生频率为25.50%、19.71%、25.05%,平均距离为4.16 kb、4.20 kb、4.22 kb。SSR单碱基重复基元的主要类型为A/T型，占SSR总数的41.76%、41.30%、38.50%。VOL、VOI、VOO 3种缬草的独有重复基元数量分别是44种、45种、25种。随机设计的引物扩增SSR的有效率为77.78%,具有SSR高多态性的引物占比55.56%。总之，3种缬草的SSR位点具有分布密度高、出现频率高、重复基元类型多等特点，多态性好，可为3种缬草后续的鉴定及分子育种提供理论依据。
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