科研产出
利用Y2H筛选本氏烟中与辣椒脉黄病毒P0互作的蛋白
《病毒学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：辣椒脉黄病毒（Pepper vein yellows virus,PeVYV）是一种由蚜虫传播的韧皮部限制病毒，引起辣椒叶脉黄化畸形，导致辣椒减产的主要病原之一。PeVYV编码的P0蛋白能诱导寄主产生超敏反应，导致叶片细胞坏死，但是调控超敏反应的寄主蛋白种类尚不清楚。本研究以PeVYV P0蛋白作为诱饵蛋白，采用酵母双杂交（Yeast twohybrid, Y2H）的方法筛选本氏烟内与PeVYV P0相互作用的寄主蛋白，共筛选获得16种与PeVYV P0相互作用的寄主蛋白。生物信息学分析表明这些蛋白参与了泛素蛋白酶体途径、乙酰化修饰、细胞色素生物合成、细胞防御反应、钙结合反应等过程，可能在病毒侵染中发挥重要作用。研究结果为探索PeVYV P0在病毒侵染中的致病机制及筛选新的抗病基因奠定基础。
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不同辣椒新品种产量品质的综合分析
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：以12个辣椒新品种（组合）为研究对象，按果实类型分为朝天椒和线椒两大类，以各品种农艺性状、产量、发病率、果实品质为指标，运用灰色关联分析法对各品种的综合表现进行量化评价。结果表明，生育期最短的为辣研103（141 d）,生育期最长的是瑞辣红丰（155 d）。辣研204的炭疽病发病率最低；各品种白绢病抗性表现良好，辣研103、德龙亮艳、4A×GJH2017-13未出现明显病症；辣研103的病毒病发病率显著高于其他品种，而辣研101、德龙亮艳、瑞辣红丰、黔椒8号、4A×GJH2017-13未出现明显病症。朝天椒类型中，辣研103平均单果重最大（7.26 g）,显著高于其他品种；线椒类型中，瑞辣红丰平均单果重（16.33 g）显著高于其他品种；朝天椒类型品种产量均达到16 t/hm2以上，不同品种之间差异不显著；线椒类型红辣王产量最高（34.161 6 t/hm2）,具有显著的产量优势。辣椒果实氨基酸含量整体表现为线椒类型显著高于朝天椒类型，其中瑞辣红丰的氨基酸含量最高（67.98μmol/g）;朝天椒类型辣椒素含量显著高于线椒类型，朝天椒中辣椒素含量最高的为辣研106（5.07 g/kg）,线椒中辣椒素含量最低的为红辣王（0.11 g/kg）。农艺性状、发病率、产量和品质指标的综合评价结果表明，朝天椒类灰色关联度值前三位依次为德龙亮艳、瑞辣816、德龙红艳，线椒类关联度值前三位依次为辣研204、4A×GJH2017-13、瑞辣红丰，适宜在黔北地区推广种植。
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水稻叶绿素合成途径关键基因自然变异分析
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：叶绿素是植物叶绿体内参与光合作用的重要色素，叶绿素合成是一个极其复杂的生物学过程，涉及众多基因。本研究以11个已克隆的水稻叶绿素合成途径关键基因为对象，对其基因组序列和编码区序列在水稻3 000自然群体中开展变异位点分析、单倍型分析及氨基酸变异情况分析。结果表明这11个叶绿素合成关键基因的基因组和编码区序列都存在丰富的变异，编码区有些变异位点导致氨基酸改变；单倍型分析表明编码区变异位点存在显著的籼粳分化现象。本研究将为进一步研究叶绿素合成途径关键基因的生物学功能及水稻育种提供理论依据。
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贵州兴义美花石斛基因组特征研究
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：本研究以贵州兴义浓香型美花石斛(Dendrobium loddigesii)为材料，通过染色体制片、流式细胞术和二代高通量技术相互验证，分析贵州兴义浓香型美花石斛群体染色体数量、大小、倍性等特征。结果表明，染色体制片观察到贵州兴义美花石斛染色体数量为2 n=2 x=38,流式细胞术估算贵州兴义美花石斛基因组大小为1.79 Gb,根据高通量测序估算贵州美花石斛的基因组大小为1.70 Gb,重复序列比例为62.99%,杂合度为0.65%,GC含量为33.41%,贵州兴义美花石斛属于微杂合高重复基因组，是目前已知二倍体石斛中基因组最大的石斛，可作为探究石斛属物种演化及芳香型石斛育种研究的重要参考物种。
关键词： 美花石斛 基因组 染色体制片 流式细胞术 二代高通量测序
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优质早熟薏苡新品种贵农薏5号的选育与应用
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：贵农薏5号是以兴仁小白壳为母本，安国薏苡为父本进行杂交，历经3年6代，定向选择而成的早熟、矮杆、丰产性较好的优良单株的培育品种，于2023年通过贵州省非主要农作物品种认定委员会认定。贵农薏5号属于中早熟品种，生育期144.1 d,株型直立，株高178.2 cm,种仁棕色，总苞黄白色，卵圆形，百粒重为10.77 g。在2021-2022年的区域试验中，其折合平均产量为4 568.03 kg/hm2,比对照增产576.08 kg/hm2,增产率为14.43%,具有较好的丰产性和适应性。营养成分组成合理，尤其是粗脂肪（8.18%）、类黄酮（4.25 mg/g）、三油酸甘油酯（6.86 mg/g）和总氨基酸含量（2.26 mg/g）高于对照兴仁小白壳，且与其他审定和认定薏苡品种存在基因遗传位点差异。适宜贵州海拔800～1 600 m区域春播种植。
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辣椒C2H2型锌指蛋白家族基因鉴定及其在涝胁迫下的表达分析
《江苏农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了探究辣椒C2H2型锌指蛋白家族在响应涝胁迫中的作用，本研究通过生物信息学方法对辣椒C2H2型锌指蛋白家族蛋白理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用元件进行了全面分析。结果表明，辣椒C2H2型锌指蛋白家族包含91个成员，多数成员定位于细胞核。91个成员可被分为6个亚族，不同亚族的成员基因结构存在差异。C2H2型锌指蛋白家族基因启动子区域主要包含植物生长发育元件、植物激素响应元件及逆境胁迫响应元件。对耐涝辣椒资源GC41和涝胁迫敏感型辣椒资源GC39在涝胁迫下的转录组数据进行分析，结果表明，在GC41中，CaC2H2-17、CaC2H2-87在涝胁迫处理3 d时相对表达量高，CaC2H2-17、CaC2H2-87在GC39中未表达。筛选出CaC2H2-16（Capana01g003556）、CaC2H2-32（Capana04g001616）、CaC2H2-72（Capana11g000176）、 CaC2H2-73（Capana11g000178）、CaC2H2-87（Capana12g000773）5个转录因子，这5个转录因子分别调控了419个、526个、566个、305个、480个差异表达基因。本研究结果为辣椒C2H2家族成员的功能解析及耐涝辣椒资源的分子育种提供了重要的理论依据和数据支持。
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基于重测序定位水稻株高QTL
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：株高是影响水稻产量和抗倒伏性的关键农艺性状，挖掘水稻株高相关因子，可为培育理想株型水稻品种提供理论支撑。以贵州特色稻贵州禾苟当3号和优质籼稻恢复系华占作为亲本，构建了148个重组自交系家系(RILs),结合重测序技术构建的水稻高密度遗传图谱，利用Map QTL5软件进行区间作图，对水稻株高进行了QTL定位。结果表明，在1号、3号、5号、6号、10号染色体上共检测到5个与株高相关QTL位点，分别命名为qPH1、qPH3、qPH5、qPH6和qPH10,其中，qPH1、qPH3和qPH10增效位点来自于苟当3号，而qPH5、qPH6增效位点来自于华占。最终从2年重复检测到的稳定位点qPH5(5号染色体：26.27～26.63 Mb)中筛选获得1个株高相关候选基因(OsG00076343)。
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"糖心"苹果香气物质生物合成的转录代谢联合分析
《核农学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为探究黔选3号苹果“糖心”与正常组织代谢化合物的差异，解析特征差异香气物质形成的分子机制，本研究采用气相色谱-串联质谱技术（GC-MS/MS）和Illumina高通量测序技术获得黔选3号苹果果肉“糖心”与正常组织的代谢组学和转录组学数据。转录组学分析显示，共产生1 795个差异表达基因（DEGs），其中671个下调基因、1 124个上调基因，与脂肪酸合成途径（fatty acid synthesis pathway）相关的基因有7个，与乙醇脱氢酶（ADH）相关的基因有8个。代谢组学共检测到353个香气物质，分析表明有20种差异香气物质，包含上调物质8个、下调物质12个，其中己酸乙酯和正壬醛显著上调。转录组-代谢组学联合分析结果表明，脂肪酸合成途径与乙醇脱氢酶家族中11个DEGs与己酸乙酯、正壬醛呈正相关关系，2个DEGs与己酸乙酯呈负相关关系，且MdFAD6、MdADH2、MdADH3和MdADH4在“糖心”组织特异性表达，实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明上述基因在“糖心”组织中的相对表达量显著高于正常组织，推测这些基因在苹果“糖心”组织差异香气物质合成途径中发挥了关键作用。研究结果初步揭示了“糖心”苹果香味变化的生物学基础，可为“糖心”苹果品质改良提供参考依据。
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柑橘褪绿矮缩病毒侵染尤力克柠檬诱导细胞自噬
《西南大学学报(自然科学版) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：自噬是寄主响应病毒侵染的一种重要防御机制。为明确柑橘褪绿矮缩病毒(Citrus chlorotic dwarf-associated virus, CCDaV)侵染柑橘是否引起细胞自噬反应，运用透射电镜、实时荧光定量检测、 GFP-NbATG8f荧光标记和蛋白印记等方法，结果发现，CCDaV感染尤力克柠檬15 d后，在尤力克柠檬叶片细胞质内观察到自噬小体结构的形成，自噬相关基因(ClATG3、ClATG5、ClATG7、ClATG8a、ClATG8d、ClATG8f、ClATG8g、ClATG8i、ClBeclin1、ClPI3K和ClNBRI)的表达量显著上调，且ATG8的含量是对照组的1.99倍。将CCDaV编码的6个病毒蛋白分别与GFP-NbATG8f共表达于本生烟48 h后，通过共聚焦观察到V3和V4蛋白分别与GFP-NbATG8f共表达时诱导产生的自噬小体数量显著高于对照，且游离GFP的含量也显著增加。表明CCDaV侵染可诱导尤力克柠檬产生细胞自噬反应，且病毒编码的V3和V4蛋白可能是诱导自噬的重要因子。
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基于BSA-seq技术的辣椒分枝QTL定位
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：分枝是辣椒（Capsicum annuum L.）重要的农艺性状之一，不仅影响辣椒产量的多少，也是观赏效果的重要因素。本研究以独杆辣椒（du-1）、簇生朝天椒（S16）及它们的F2代分离群体为材料，构建亲本及F2代辣椒分枝极端混池，利用BSA-seq技术，筛选辣椒分枝性状的QTLs。结果显示，SNP与InDel关联区域取其交集，得到9个与性状相关的候选区域，总长度为21.53 Mb，主要集中在1号染色体上。同时，利用BLAST软件对候选区间内编码基因进行多个数据库深度注释，共注释到121个基因，其中非同义突变基因31个，移码突变基因5个。结合候选区域内基因的GO富集和KEGG富集分析，筛选出与辣椒分枝性状相关候选基因7个。以上结果为进一步辣椒分枝性状基因克隆和分子标记辅助育种提供基础。
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