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乳酸和过氧乙酸对蜡样芽孢杆菌生物膜的抑制作用及其机制

微生物学通报 2025 北大核心 CSCD

摘要:【背景】近年来,蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)侵袭力不断增强,感染宿主范围不断扩大,而其生物膜的形成与侵袭力和毒力息息相关。【目的】对蜡样芽孢杆菌的生物膜形成能力进行了鉴定,并探究了乳酸(lactic acid, LA)和过氧乙酸(peroxyacetic acid, PAA)对B. cereus生物膜的抑制机理。【方法】通过分析生物膜抑制生长曲线、生物膜代谢活性、胞外基质成分(多糖和蛋白质)含量、形态及相关基因表达,来评估LA和PAA对蜡样芽孢杆菌生物膜形成作用的影响。【结果】蜡样芽孢杆菌可生成生物膜。LA和PAA对B. cereus的最小抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)分别为0.252%、0.030%。生长曲线表明,1/2 MIC、MIC浓度的LA、PAA可显著抑制B. cereus生物膜的形成。由CCK-8法检测生物膜代谢活性可知,MIC浓度的LA和PAA使B. cereus生物膜的代谢活性分别降低了61.02%和69.27%。同时,由硫酸-苯酚法及考马斯亮蓝法对蜡样芽孢杆菌胞外多糖及胞外蛋白检测结果可知,MIC浓度的LA、PAA处理组的胞外多糖分别降低了64.34%和79.14%,胞外蛋白质分别降低了78.96%和80.52%。通过结晶紫染色对生物膜进行显微镜下观察,结果显示1/4 MIC下的LA、PAA即可抑制蜡样芽孢杆菌生物膜的生成。另外,通过实时定量PCR确定,MIC下的LA、PAA显著抑制了蜡样芽孢杆菌生物膜相关基因(gapB, pgm, flgE, SigB, abrB,calY, sipW, tasA)的表达。【结论】LA、PAA可以作为安全的抗生物膜剂来抑制蜡样芽孢杆菌的生物膜形成。

关键词: 蜡样芽孢杆菌 生物膜 乳酸 过氧乙酸 抑菌机制

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养分专家系统在内蒙古玉米、向日葵和马铃薯推荐施肥中的应用与验证

植物营养与肥料学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:[目的]针对内蒙古地区农民盲目施肥导致的作物产量潜力无法充分发挥、肥料利用率低下及土壤养分失衡等现状,采用基于产量反应和农学效率的养分专家系统,在内蒙古地区开展玉米、向日葵和马铃薯的推荐施肥田间试验,与农民习惯施肥相比较,验证该系统在提升内蒙古地区的产量、经济效益和养分利用率方面的可行性.[方法]于 2017-2023 年在内蒙古玉米、向日葵、马铃薯主产区开展 146 个田间验证试验,每个试验包括 5 个处理:基于养分专家系统的推荐施肥处理(NE),农民习惯施肥处理(FP),以及基于NE的不施氮肥(N)、不施磷肥(P)和不施钾肥(K)处理,从产量、净效益、养分吸收和肥料利用率等方面比较NE处理与FP处理间的差异.[结果]NE处理显著提高了玉米、向日葵和马铃薯的产量及经济效益(P<0.001),与FP处理相比,产量分别增加了1166、235、2433 kg/hm2,经济效益分别增加了1546、1572、2582元/hm2.NE系统平衡了氮、磷、钾肥用量,尤其提高了钾肥施用量,增加了玉米和向日葵的肥料投入成本,因此其经济效益的增加全部源自产量的提高.NE处理的平衡施肥提高了成熟期作物养分累积量,与FP处理相比,玉米、向日葵和马铃薯的N累积量分别增加了 8.4%、9.1%和 9.9%,P累积量分别增加了 8.1%、6.6%和 10.9%,K累积量分别增加了 11.5%、9.9%和 11.5%.产量和养分累积量的增加显著提高了NE处理的养分利用效率,与FP处理相比,玉米、向日葵和马铃薯的氮肥回收率(REN)分别提高了 4.6、13.6 和 14.3 个百分点,磷肥回收率(REP)分别提高了 7.6、8.7 和 7.1 个百分点;氮肥农学效率(AEN)分别提高了 3.2、2.1 和 17.4 kg/kg,磷肥农学效率(AEP)分别增加了 12.6、4.0 和 27.9 kg/kg.马铃薯的钾肥回收率(REK)提高了 13.8 个百分点,钾肥农学效率(AEK)提高了 8.7 kg/kg.[结论]基于产量反应和农学效率的养分专家系统,在内蒙古地区玉米、向日葵和马铃薯上开展的推荐施肥,可平衡氮、磷、钾肥用量,增加作物产量和净效益,同时提高养分吸收和肥料利用率,在保障粮食安全、提高农业生产效率方面将发挥重要作用.因此,这种推荐施肥方法适用于内蒙古小农户种植体系.

关键词: 养分专家系统 产量反应 农学效率 养分利用率 经济效益

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前列腺素D2和TLR2/TLR4/NLRP3在大肠杆菌感染奶牛骨髓源巨噬细胞中的作用

中国兽医学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:运用RNA测序(RNA-seq)技术解析大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)感染奶牛骨髓源巨噬细胞的mRNA表达谱,并通过基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,鉴定差异表达基因的生物学功能及其参与的信号通路。结果显示,E.coli感染诱导了4 522个差异表达基因,其中2 141个基因表达上调,2 381个基因表达下调。这些基因主要涉及炎症反应,且TLR2、TLR4、NLRP3及PTGS2在其中发挥重要作用;使用PGD2抑制剂处理E.coli染奶牛骨髓源巨噬细胞进行转录组测序显示TLR2和TLR4的基因表达显著下调。q-PCR验证结果与RNA-seq数据一致。结果表明,TLR2、TLR4和NLRP3与PGD2的相互调控共同影响奶牛子宫内膜炎,这为深入理解奶牛子宫内膜炎的病理机制及其防治提供了重要的分子依据。

关键词: E.coli 奶牛骨髓源巨噬细胞 转录组 模式识别受体 前列腺素D2

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基于SNP标记的胡麻种质资源遗传多样性分析

西南农业学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:[目的]评价269份不同地理来源的胡麻种质资源的遗传多样性,为胡麻种质创新提供依据.[方法]对269份胡麻种质材料进行Hiseq测序开发SNP数据,并进行遗传多样性和群体机构分析.[结果]获得1.3684 Tb有效序列数据,与胡麻参考基因组平均比对率为96.32%,碱基GC含量平均值为38.57%.平均测序深度为12.55 X;通过过滤(deep>=4,miss<0.2,MAF>0.01)检测到1069 106个SNPs,分布在15条染色体上,平均密度为每千碱基2.87个SNP.按花冠形状269份胡麻种质分为漏斗形群体(47)、五角星形群体(117)、碟形群体(93)、轮形群体(12)4个群体.5个地理来源的品种在4个群体中的分布分析结果表明,中国西北品种主要集中在漏斗形群体和碟形群体中,中国华北品种主要集中在碟形群体中,欧洲和亚洲品种主要集中在五角星群体中.群体结构分析表明,最佳分群K值为9,LD衰减数值为15 Kb.[结论]胡麻花冠形状与当地的育种目标和胡麻重要农艺性状有一定关联,有利于形态标记辅助选择.

关键词: 胡麻 种质资源 遗传多样性 SNP标记

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基于多种模型的湖羊生长繁殖性状GWAS分析

中国畜牧杂志 2025 北大核心 CSCD

摘要:本研究旨在通过全基因组关联分析挖掘与湖羊生长繁殖性状相关的候选基因及位点.采集鄂尔多斯某畜牧场的湖羊个体共 396 只的血样提取DNA,基于Ovine illumina 50K SNP(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)芯片进行基因分型,根据湖羊个体记录的初生重、断乳重、断奶前平均日增重、产羔数的表型信息,通过R包GAPIT的GLM、MLM、FarmCPU、BLINK模型进行全基因组关联分析.根据得到的显著SNP基于Oar_v4.0 绵羊参考基因组进行基因注释,通过GO-KEGG富集分析、NCBI数据库以及查找文献对候选基因进行功能注释.结果发现,对于绵羊的复杂数量性状多位点模型FarmCPU、BLINK比单位点模型GLM、MLM具有更高的检测灵敏度.多个模型共挖掘到 2 个基因组潜在显著水平与初生重相关的SNP位点,2 个基因组潜在显著水平与断乳重相关的SNP位点,8 个基因组潜在显著水平与平均日增重相关的SNP位点,8 个基因组显著水平与平均日增重相关的SNP位点,1 个基因组潜在显著水平与产羔数相关的SNP位点,同时上述位点均达到染色体显著水平.经过基因注释,共发现 26 个可能与湖羊生长繁殖性状相关的候选基因,富集分析和功能注释发现RASA2、KCNJ 6、ESPL1、ITGB7、CSAD、PCDH15、CNN1、ZNF704、ELOF1、ZNF653可作为影响湖羊平均日增重的候选基因,ST6GAL2可作为影响湖羊初生重的候选基因,LAMA2可作为影响湖羊产羔数的候选基因.本研究发现了部分与湖羊生长繁殖相关的候选基因,对提升湖羊品种选育效率、优化绵羊品种选育方法提供了一定的理论依据和技术支撑.

关键词: 全基因组关联分析 湖羊 生长性状 繁殖性状 候选基因

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内蒙古地区不同畜种的特色生鲜奶营养成分比较研究

动物营养学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:本试验旨在比较研究内蒙古地区骆驼奶、马奶、山羊奶和绵羊奶等特色生鲜奶的常规营养成分、氨基酸和脂肪酸等营养指标的差异。采集骆驼奶26批次、马奶10批次、山羊奶11批次、绵羊奶5批次;其中,骆驼奶采自阿拉善盟、巴彦淖尔和锡林郭勒,马奶采自锡林郭勒盟和巴彦淖尔,山羊奶采自呼和浩特、乌兰察布和巴彦淖尔,绵羊奶采自呼和浩特、乌兰察布和巴彦淖尔。测定骆驼奶、马奶、山羊奶和绵羊奶中常规营养成分、氨基酸和脂肪酸含量。结果表明:1)绵羊奶中乳脂率、乳蛋白率、总固体含量和非脂乳固体含量显著高于骆驼奶、马奶和山羊奶(P<0.05),马奶中乳糖含量显著高于山羊奶、骆驼奶和绵羊奶(P<0.05)。2)绵羊奶中8种必需氨基酸(EAA)、9种非必需氨基酸(NEAA)及总氨基酸(TAA)含量均显著高于骆驼奶、马奶和山羊奶(P<0.05)。山羊奶中EAA/TAA和EAA/NEAA显著高于马奶和绵羊奶(P<0.05)。马奶中鲜味类氨基酸(谷氨酸、天冬氨酸)含量显著高于骆驼奶、山羊奶和绵羊奶(P<0.05),山羊奶中甜味类氨基酸(甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、脯氨酸)含量显著高于骆驼奶和马奶(P<0.05),绵羊奶中芳香族类氨基酸(酪氨酸、苯丙氨酸)含量显著高于马奶(P<0.05)。3)山羊奶和绵羊奶中短链脂肪酸(SCFA)含量显著高于骆驼奶和马奶(P<0.05),山羊奶中中链脂肪酸(MCFA)含量显著高于骆驼奶、马奶和绵羊奶(P<0.05),骆驼奶中长链脂肪酸(LCFA)含量显著高于马奶、山羊奶和绵羊奶(P<0.05)。山羊奶中饱和脂肪酸(SFA)含量显著高于骆驼奶、马奶和绵羊奶(P<0.05),马奶中不饱和脂肪酸(UFA)和多不饱和脂肪酸(PUFA)含量显著高于骆驼奶、山羊奶和绵羊奶(P<0.05),绵羊奶中单不饱和脂肪酸(MUFA)含量显著高于马奶和山羊奶(P<0.05),马奶中PUFA/SFA及n-3 PUFA和n-6 PUFA含量显著高于骆驼奶、山羊奶和绵羊奶(P<0.05)。绵羊奶中共轭亚油酸(CLA)含量最高显著高于骆驼奶、马奶和山羊奶(P<0.05)。由此可见,绵羊奶中常规营养成分和CLA含量高于骆驼奶、马奶和山羊奶,山羊奶和绵羊奶中SCFA含量高于骆驼奶和马奶,马奶中n-3 PUFA和n-6 PUFA含量高于骆驼奶、山羊奶和绵羊奶,骆驼奶中LCFA含量高于马奶、山羊奶和绵羊奶。

关键词: 内蒙古地区 特色生鲜奶 乳成分 氨基酸 脂肪酸

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胡葱黄条病毒内蒙古洋葱分离物全基因组扩增与序列分析

植物病理学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:通过高通量测序技术对内蒙古洋葱产区病毒发生情况进行鉴定,测序结果鉴定到胡葱黄条病毒(shallot yellow stripe virus, SYSV)的发生,随后对161份样品中进行RT-PCR的鉴定,34份样品SYSV阳性,发病率高达21.1%;采用RT-PCR结合RACE技术获得了2条SYSV全基因组序列,分别命名为21IM_AlCe1和21IM_AlCe2。序列分析结果表明,21IM_AlCe1和21IM_AlCe2长度均为10 429 nt,均编码一个含3401 aa的多聚蛋白。21IM_AlCe1和21IM_AlCe2在氨基酸水平上一致率为99.4%;21IM_AlCe1和21IM_AlCe2均与吉林分离物SPVG-JL的氨基酸一致率最高(95.8%和95.7%)。重组分析发现,21IM_AlCe2具有1个显著重组事件。基于完整CP基因的核苷酸序列构建的系统发育进化树结果显示分组与分离物的地理起源存在密切相关性,所有分离物在进化上可以聚为3个亚组。基于完整CP基因的遗传多样性分析结果表明,SYSV分离物受地理分布的影响表现出较高的遗传多样性,其中中国和越南SYSV分离物最为显著。

关键词: 胡葱黄条病毒 全基因组序列 系统发育分析 重组分析 遗传多样性分析

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网络药理学视角下绿原酸对绵羊羔羊肠道腹泻的作用机制

动物营养学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:本研究基于网络药理学和分子对接技术,旨在探讨绿原酸缓解绵羊羔羊肠道腹泻的作用机制。通过TCMSP、Pharm Mapper和Swiss Target Prediction数据库预测绿原酸的潜在作用靶点,并结合Gene Card和OMIM数据库获取绵羊羔羊腹泻的潜在靶点。构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并筛选出核心靶点。并通过DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,揭示绿原酸调控的生物过程和信号通路,之后采用分子对接技术检验对接稳定性。结果表明:绿原酸缓解绵羊羔羊肠道腹泻的潜在靶点有36个,其中核心靶点有7个,分别是半胱天冬酶3、连环蛋白β1、表皮生长因子受体、前类淀粉蛋白质、原癌基因酪氨酸蛋白激酶、G1/S-特定周期蛋白D1和肝细胞生长因子受体。GO功能和KEGG通路富集分析显示,靶点作用包括25种生物过程、11种细胞组分和8种分子功能,富集到黏着斑、黏附连接、丝裂原活化蛋白激酶、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B等39条通路。分子对接结果显示,绿原酸与核心靶点的结合能均小于-25.12 kJ/mol。综上所述,本研究筛选了绿原酸缓解绵羊羔羊腹泻的作用靶点和相关通路,为绿原酸作为绿色饲料添加剂在绵羊羔羊养殖中的应用提供了理论依据。

关键词: 绿原酸 绵羊羔羊 肠道腹泻 网络药理学 分子对接

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赤霉素浸种对盐胁迫下甜菜种子萌发及幼苗生理特性的影响

种子 2025 北大核心 CSCD

摘要:为探究赤霉素浸种对盐胁迫下甜菜种子萌发及生理特性的影响,阐明赤霉素浸种对盐胁迫的缓解作用,以甜菜单胚品种‘NT39106’为试验材料,研究不同浓度梯度(0、50、100、150、200、250、300 mmol/L NaCl)盐胁迫对甜菜种子萌发的影响。结果表明,随着盐浓度增加,甜菜种子发芽率、发芽势及萌发指数均呈下降趋势,而萌发抑制率呈上升趋势,尤其盐胁迫浓度≥150 mmol/L时,各项萌发指标均显著降低。赤霉素浸种能有效缓解150 mmol/L和200 mmol/L盐胁迫对甜菜种子萌发的抑制作用,显著提高了种子发芽率、发芽势、发芽指数及活力指数。盐胁迫下甜菜幼苗生长受到明显抑制,经过赤霉素浸种明显促进了甜菜幼苗的生长,增加了幼苗鲜重和平均芽长,同时提高了甜菜中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)活性和可溶性糖含量,降低了丙二醛(MDA)的积累。综上所述,赤霉素浸种可能通过增强抗氧化酶活性、清除活性氧以及累积可溶性糖,从而提高了甜菜种子萌发期抵御盐胁迫的能力,促进种子萌发和幼苗生长。

关键词: 甜菜 赤霉素 种子萌发 盐胁迫

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水分胁迫下燕麦萌发期转录组分析

西北农业学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:为了解燕麦在萌发期应对水分胁迫的调控机理,以前期筛选的强抗旱性燕麦品种为试验材料,利用转录组测序技术研究水分胁迫对燕麦萌发期基因表达的影响.通过Illumina高通量测序平台对PEG-6000溶液模拟干旱条件下的燕麦萌发期种子进行转录组测序,以等体积蒸馏水处理为对照,结果6个样品共获得78.12 Gb的Clean data,各样品的Q30均大于92.8%.共鉴定到12 405个差异表达基因,其中,上调表达基因有5 110个,下调表达基因有7 295个;上调表达基因显著富集在丙烷、哌啶和吡啶生物碱的生物合成及类黄酮生物合成途径上,而下调表达基因显著富集在苯丙烷的生物合成和光合作用途径上;筛选出6个功能基因(分别是查尔酮合成酶、β葡萄糖苷酶、细胞色素P450、胚胎发育晚期富含蛋白、水通道蛋白和海藻糖-6-磷酸磷酸酶编码基因)与4个调节基因(WRKY、MYB、bZIP和NAC),作为进一步验证的候选基因.

关键词: 燕麦 水分胁迫 转录组 基因挖掘

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