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基于RAD-seq技术分析边鸡保种群体的遗传进化

农业生物技术学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:边鸡(Gallus gallus)是我国珍贵的地方鸡遗传资源.从分子水平上探究边鸡保种群的遗传多样性和分子遗传进化,对该品种资源的保护具有重要意义.本研究利用简化基因组测序(restriction-site associated DNA sequence,RAD-seq)检测边鸡群体的SNP标记,通过计算遗传统计量,分析比较边鸡群体与其他地方鸡种群体的遗传差异,并对进化过程中受到选择的基因进行功能注释.结果在边鸡保种群体中鉴定出SNP标记319723个,保种群体的观察杂合度(observed heterozygosity,Ho)为0.193,核苷酸多样度(Pi)为0.231,近交系数为0.167,近交水平相对较高.连锁不平衡分析表明,边鸡群体各等位基因不存在强烈的连锁不平衡现象.模型聚类结果表明,边鸡与大骨鸡、安义瓦灰鸡及狼山鸡聚为一类,亲缘关系较近.对鉴定出的前200个受到强烈选择的基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与KEGG注释分析,这些差异基因主要富集在代谢、神经受体—配体的相互作用、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、血管内皮生长因子等信号通路.基因功能分析的结果有助于了解边鸡的抗寒、耐缺氧、繁殖力、神经系统发育和抗逆性等特殊性状形成的分子机理,为我国地方鸡种的遗传进化、种质特性评价及品种保护提供理论依据.

关键词: 边鸡 简化基因组测序(RAD-seq) 选择信号 遗传进化 种质特性评价

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山西左云县采煤区人工湿地冬季沉积物细菌群落多样性

微生物学通报 2019 北大核心 CSCD

摘要:【背景】人工湿地处理煤炭矿井废水效果显著,而关于人工湿地沉积物的细菌群落结构和特征研究较少。【目的】阐明人工湿地净化采煤区废水的效应和细菌群落结构及特征。【方法】对山西省左云县采煤区人工湿地不同采样点水质进行监测,利用高通量测序技术对人工湿地沉积物中细菌16S rRNA基因V3-V4区进行测序,分析沉积物中细菌群落组成。【结果】采煤区废水流经人工湿地后水质得到有效改善,其中生化需氧量(Biochemical oxygen demand,BOD5)、化学需氧量(Chemical oxygen demand,CODCr)、总氮(Total nitrogen,TN)、总磷(Total phosphorus,TP)去除率分别达到76.2%、93.4%、73.4%和99.3%;测序共获得2 832个操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs),共753个属,分布于51个门的150个纲;4个采样点中优势菌门为变形菌门(Proteobacteria,50%-64.7%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,15.8%-21.2%),变形菌门中优势菌纲为β-变形菌纲和γ-变形菌纲,其中M1、M2、M3中富含氨氮氧化细菌的β-变形菌纲和γ-变形菌纲丰度最高;M4沉积物细菌OTU最多,多样性最高;沉积物特有优势菌属Sulfurimonas、Sulfuricurvum的相对丰度与NH4+-N的含量显著负相关,Azoarcus菌属相对丰度与TN存在显著正相关,Novosphingobium菌属相对丰度与TP含量存在显著正相关。【结论】煤矿废水流经人工湿地可得到有效的净化,细菌多样性在人工湿地生态功能中起到了决定作用。

关键词: 人工湿地沉积物 细菌群落 16S rRNA基因多样性

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固碳微生物菌株的分离鉴定及其固碳能力测定

生物技术通报 2019 北大核心 CSCD

摘要:利用微生物回收和固定CO2气体的生物固碳方法,成为解决"温室效应"这一重大环境问题的焦点,本研究目的是分离筛选固碳微生物菌株。利用无碳源无机培养基从活性污泥、沼液和设施土壤中分离筛选出以CO2为碳源的菌株24株,选取其中生长较快的8株菌进行cbbL基因、形态观察、生理生化反应测定和16S rDNA测序分析,将测序结果在BlAST数据库中比对,进行固碳菌株的分子鉴定,并对其菌体含量和RubisCO酶活性进行比较。选取RubisCO酶活性最高的菌株C2-8R,进行土壤施用试验,通过土壤RubisCO酶活性的测定,确定分离筛选的固碳菌的固碳能力。研究表明,可通过无碳源培养基进行固碳微生物菌株的筛选,筛选的固碳菌分别隶属于假单胞菌属和嗜甲基菌属,并可通过RubisCO酶活性来反映微生物的固碳能力。

关键词: 固碳微生物菌株 cbbL基因 16S rDNA RubisCO酶活性

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施磷对干旱胁迫下苦荞生长及磷素吸收分配的影响

干旱区资源与环境 2019 北大核心 CSCD CSSCI

摘要:以苦荞(Fagopyrum tataricum L.)为试验材料,试验设水、磷二因素,采用完全随机设计盆栽试验,研究不同水分处理下施磷对苦荞生长、磷素吸收分配及产量的影响,为干旱区苦荞高产、稳产栽培提供水肥管理的理论依据。结果表明:1)在干旱胁迫(W2)条件下,苦荞株高、茎粗、叶面积、地上部干重、根系表面积、平均直径、根体积、总根长和根干重均明显降低;根系SOD、POD、MDA、可溶性糖和脯氨酸含量显著提高;根、茎部位磷素积累量随施磷量增加而增多,而叶、花部位在P2水平下达到最高;花簇数、单株粒重、千粒重和产量均显著降低。2)相同水分条件下,施磷对苦荞地上和地下部分的生长均有促进作用,并显著增加了W2条件下根系主根长,且均表现为P2(0. 2g·kg~(-1))水平效果最优;随施磷量的增加,根系可溶性糖和脯氨酸含量为先下降后上升,MDA含量逐渐降低,SOD、POD活性与苦荞产量及各构成要素均呈先升后降的趋势,P2(0. 2g·kg~(-1))处理显著提高苦荞产量。结论:适量施磷有利于提高苦荞植株抗旱性,促进植株生长发育和产量形成。在本试验条件下,P2(0. 2g·kg~(-1))处理在干旱胁迫下更利于苦荞生长与产量的形成。

关键词: 苦荞 干旱胁迫 施磷 磷素积累 产量

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城市古树名木综合价值货币化评估研究—以北京市古树"遮荫侯"为例

干旱区资源与环境 2019 北大核心 CSCD CSSCI

摘要:当前对于城市古树名木历史文化内涵、景观价值等挖掘尚不深入,价值评价标准并不完善、合理,在实际问题出现时,并不能提供很好的指导。在此背景下,以北京市北海团城古树"遮荫侯"为例,从历史文化价值、景观价值、生态价值三个方面构建古树名木综合价值货币化评估体系,采用层次分析法确定三方面价值重要性的比例关系,采用回归分析法、9分位比率法、调整系数的确定方法计算历史文化价值,并根据三方面价值重要性的比例关系,来间接对景观价值、生态价值进行量化,三方面价值相加,即为最终要得到的古树名木综合价值。结果显示:历史文化价值、景观价值、生态价值三者重要性的比例关系为11.84:3.28:1,历史文化价值的评估值为3037680元,景观价值的评估值为841519元,生态价值的评估值为256561元,综合价值的评估值为4135760元。评估结果可为北京市古树名木管理保护的投入、损失案件的计算提供依据。

关键词: 城市古树名木 货币化评估 历史文化价值 景观价值 生态价值

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滴灌施肥对盐碱土壤盐分运移及草木樨生长的影响

灌溉排水学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:【目的】探究不同滴灌施肥条件对土壤盐分运移及对植物生长规律的影响。【方法】在大同盆地以草木樨为试验材料,以当地施肥习惯(N、P_2O_5、K_2O施量分别为180、90、36 kg/hm2)作为传统施肥量,设置5种不同的施肥水平,分别为传统施肥量的0%、40%、70%、100%、130%,分析了不同滴灌施肥水平下土壤电导率、pH值的变化情况及其对植物生长的影响。【结果】当施肥量为40%与70%时,滴头处溶质受淋洗作用较为明显,土壤电导率降幅较大;当施肥量为100%与130%时,表层土壤电导率较大,随土壤深度的增加而减小;土壤pH值随种植时间的延长得到一定的降低;70%处理下草木樨平均株高最高(138.6 cm),同时在此处理下0~100 cm土层土壤平均电导率为299μS/cm,平均pH值为7.73。【结论】N、P_2O_5、K_2O施量分别为126、63、25.2 kg/hm2时土壤电导率与pH值较小,同时草木樨生长最好。

关键词: 草木樨 土壤盐分 滴灌 盐碱土

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发酵苹果渣对獭兔生长性能、养分消化率、小肠黏膜形态及分泌型免疫球蛋白A浓度的影响

动物营养学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:本试验旨在研究发酵苹果渣对獭兔生长性能、养分消化率、小肠黏膜形态及分泌型免疫球蛋白A(SIgA)浓度的影响。试验共选用96只、45日龄的健康獭兔,随机分为4组,每组4个重复,每个重复6只(公母各占1/2)。4组獭兔分别饲喂含0(对照,CK组)、9.6%(A组)、19.2%(B组)和28.8%(C组)发酵苹果渣的试验饲粮。预试期15 d,正试期50 d。结果显示:与CK组相比,C组獭兔平均日增重提高了14.69%(P <0.05),料重比降低了6. 63%(P <0. 05),腹泻率降低了19.64%(P<0.05); C组獭兔饲粮干物质、有机物、粗蛋白质和粗纤维消化率分别提高了6.11%(P<0.05)、5.19%(P<0.05)、7.26%(P<0.05)和13.10%(P<0.05); C组獭兔空肠的绒毛长度和肠壁厚度分别增加了59.82%(P<0.05)和41.83%(P<0.05),同时十二指肠的隐窝深度降低了30.52%(P<0.05)。添加不同水平的发酵苹果渣对獭兔小肠中SIgA浓度无显著影响(P>0.05)。综上所述,在饲粮中添加28.8%的发酵苹果渣可以通过提高养分消化率,改善小肠黏膜形态来提高獭兔的生长性能,并可降低腹泻率,且对小肠中SIgA浓度无不良影响。

关键词: 发酵苹果渣 獭兔 生长性能 养分消化率 小肠黏膜形态

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种植密度对不同玉米品种茎秆性状及产量的影响

中国农业大学学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:为探索晋南地区玉米适宜的栽培品种和种植密度,以‘先玉335’、‘郑单958’和‘浚单20’3个玉米品种为试验材料,设置7个密度处理,4.50、5.25、6.00、6.75、7.50、8.25和9.00万株/hm2,分析小麦-玉米一年两熟制条件下,不同种植密度对晋南夏玉米茎秆及产量等性状.结果 表明:随着玉米种植密度的增加,株高和稳位高均增加,茎粗减小,倒伏率呈现增加趋势.同密度条件下,‘郑单958’的倒伏率低于‘先玉335’和‘浚单20’.‘先玉335’、‘郑单958’和‘浚单20’在种植密度为7.50、8.25和9.00万株/hm2获得最大产量分别为1 1034、8 668和8 456 kg/hm2.随着种植密度增加,玉米单位面积穗数增加,而穗长、穗粗、行粒数和百粒重均降低,但对穗行数的影响不显著.综合茎秆性状和产量结果看,‘先玉335’种植密度为6.75~8.25万株/hm2时,可取得较好生产效益.

关键词: 夏玉米 品种 密度 茎秆性状 产量及构成因素

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抗旱优质高产稳产小麦新品种—长6990

麦类作物学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:长6990是山西省农业科学院谷子研究所用自育的抗旱、大穗、大粒中间材料03-6564做母本、山西省农科院作物科学研究所育成的优质丰产品种晋太170做父本进行杂交,后代在水、旱地两种条件下交叉选育,于2011年稳定出圃。2012年度在旱地和水地鉴定中均表现突出,2013年度进入品比试验。2016年12月通过山西省审定,

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玉米抗虫研究进展

中国农学通报 2019 CSCD

摘要:玉米是一种粮、饲和工业兼用的重要作物,随着生物能源、畜牧业以及生物制药等行业对玉米的需求不断增长,中国玉米需求量日益增长.伴随城镇化步伐的加快,农村劳动力不断减少,田间管理粗放,常年连作,玉米虫害呈现上升趋势,加剧了农药的使用量和降低玉米的产量和品质.为了缓解中国玉米虫害和降低农药的使用,笔者归纳了玉米虫害的主要种类、危害,防治办法和优缺点;综述了国内外玉米抗虫鉴定筛选,抗虫基因研究,以及转基因抗虫玉米的研究进展,以期为中国抗虫玉米遗传育种奠定理论基础.

关键词: 抗虫 转基因 Bt 农药残留 食品安全

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