科研产出
全基因组选择在山羊育种中的应用研究进展
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：全基因组选择(genome-wide selection, GS)是一种基于基因组数据的育种方法，通过分析遗传标记和性状的关系，预测个体的遗传值和表型值，从而实现精准选育。随着高通量测序技术的发展，全基因组选择成为了现代畜禽育种的重要手段，在山羊育种中展现了巨大的潜力和应用前景。研究人员通过全基因组选择精确地评估山羊的繁殖性能，提高繁殖效率；同时通过筛选优良基因型，改良山羊的生长发育、肉品质等性状，以获得更高的经济效益。作者主要介绍了全基因组选择的原理和方法，并针对山羊的繁殖性能、生长性状和肉品质等关键性状的应用研究展开论述；讨论了全基因组选择在山羊育种中的优势和挑战，并对全基因组选择在山羊育种中的应用与未来发展趋势进行了总结与展望，以期为山羊育种的进一步发展提供一定的参考和理论支撑。
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树莓组织培养及快繁体系的建立
《种子 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：以红树莓、黑树莓、掌叶覆盆子为试验材料,选取茎段、茎尖和叶片作为外植体,建立树莓组织培养快繁体系.结果表明,适宜获得树莓无菌苗的外植体是茎段和茎尖,三种树莓丛生芽诱导最佳培养基为MS+6-BA(1.0~2.0)mg/L+NAA(0.1~0.2)mg/L;最佳愈伤出芽培养基为MS+6-BA(5.0 mg/L)+NAA(0.2 mg/L);红树莓增殖培养的培养基为 MS+6-BA(0.5~1.0)mg/L+NAA(0.2 mg/L);黑树莓增殖的培养基为 MS+6-BA(1.0 mg/L)+NAA(0.05~0.1)mg/L;掌叶覆盆子增殖的培养基:MS+6-BA(1.0 mg/L)+NAA(0.2 mg/L).以 1/2 MS+IBA(1.0 mg/L)为培养基诱导生根.炼苗在0.05%KMnO4杀菌条件下,在V粘土∶V泥炭土=1∶1的基质中进行.
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基于MobileNet V2的辣椒果实炭疽病识别及其应用
《贵州农业科学 》 2024 北大核心
摘要：[目的]构建基于MobileNet V2的辣椒炭疽病果实分类识别模型,开发移动端辣椒果实炭疽病识别系统,在田间离线状态下实现辣椒果实炭疽病的实时诊断,为及早防控辣椒炭疽病奠定基础.[方法]以朝天椒品种辣研101号为研究对象,首先对辣椒在体、离体状态下的健康果实和炭疽病果实图像进行数据扩充,然后将MobileNet V1、MobileNet V2和EfficientNet-B0模型参数大小相近的轻量级网络进行迁移学习,通过参数微调提取辣椒果实特征,对比图像分类效果,最后将识别精度最高的MobileNet V2网络移植到手机端.[结果]MobileNet V2网络在健康和炭疽病辣椒果实测试集上的查准率最高,达97.31%,单张图片识别时间最短,为75 ms,具有占用内存小、识别速度快及精准度高等优点.[结论]通过MobileNet V2网络模型的移植和应用,辣椒炭疽病识别系统可在田间离线状态下实现辣椒果实炭疽病的实时诊断.
关键词： 辣椒 朝天椒 辣研101号 炭疽病 机器视觉 图像识别 轻量级网络 APP
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不同改良方式协同黑麦草对煤矸石堆场生态修复效果
《草业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了探究基质改良和植被恢复在煤矸石堆场生态修复中的可行性，本研究使用甲酸钠作为煤矸石杀菌剂，并将菌渣、磷石膏和酒厂污泥按不同比例添加到煤矸石中制成不同的植生基质，以种植黑麦草(Lolium perenne)进行植被恢复试验，同时监测其基质渗滤液的理化特性、黑麦草生长状况以及基质的微生物群落结构。结果表明：1)不同植生基质均能显著提高煤矸石渗滤液的pH，并显著降低渗滤液中总Fe、Mn、Cu等重金属浓度。其中，添加5%菌渣和20%酒厂污泥的综合效果最佳。2)菌渣、磷石膏和酒厂污泥的添加均能显著促进黑麦草的生长，其中添加5%菌渣、10%磷石膏和20%酒厂污泥的煤矸石基质中黑麦草生物量最大。黑麦草植株内重金属均满足《饲料卫生标准》(GB 13078-2017)中饲料原料的限值。3)基质改良后细菌群落多样性和相对丰度明显增加。甲酸钠杀菌明显改变了细菌群落结构，其余改良方式中，变形菌门、放线菌门、厚壁菌门、绿弯菌门和拟杆菌门为主要优势细菌门。综上，添加5%菌渣和20%酒厂污泥对煤矸石中污染物溶出具有最佳控制效果，同时可快速恢复煤矸石基质植被，具有较好的生态和经济效益。
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SfAp参与调控白背飞虱的翅发育
《昆虫学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】Apterous(Ap)属于LIM结构域家族的发育调控蛋白。本研究旨在探究Ap基因在白背飞虱Sogatella furcifera翅发育中的作用。【方法】基于白背飞虱基因组和转录组数据库，采用RT-PCR验证SfAp的cDNA序列并进行生物信息学分析；利用RT-qPCR检测SfAp在白背飞虱不同发育阶段(1-5龄若虫和雌雄成虫)和成虫不同组织(头、胸、腹、足、翅、体壁、脂肪体和肠道)中的表达量；通过RNAi技术靶向沉默3龄若虫SfAp后观察白背飞虱的生长发育情况，并统计RNAi后的存活率、总死亡率和翅畸形率，采用RT-qPCR测定翅发育信号通路关键基因(鞣化激素基因SfBurs-α和SfBurs-β、 Hippo信号通路基因SfHippo和SfSal、 Wnt信号通路基因SfWg、 Hedgehog信号通路基因SfHh和SfDpp及SfHOW)的表达量。【结果】克隆获得了白背飞虱SfAp(GenBank登录号：PP901867)的开放阅读框，长1 287 bp,编码428个氨基酸的蛋白质，其编码蛋白质预测的分子量为47.41 kD,理论等电点为8.99, SfAp含有典型的LIM保守结构域；SfAp与褐飞虱Nilaparvata lugens的NlAp亲缘关系最近，氨基酸序列一致性达84.86%。发育表达谱结果显示，SfAp在4龄若虫前表达量较高，随后逐渐下降，到5龄第3天若虫期表达量显著升高，成虫羽化后表达量下降；组织表达谱结果表明，SfAp在成虫胸部中表达量最高，其次是在腹部、脂肪体和肠道中高量表达。显微注射dsSfAp导致羽化成虫表现出翅不伸展及畸形，并且翅发育相关基因SfBurs-α,SfBurs-β,SfHippo,SfSal,SfWg,SfHh,SfDpp和SfHOW的表达也被显著抑制。【结论】SfAp通过影响翅发育信号通路关键基因的表达量，进而影响白背飞虱的翅伸展及发育过程。
关键词： 白背飞虱 LIM结构域家族 发育调节蛋白 Ap基因 表达谱分析 翅发育
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辣椒PIN基因家族鉴定及其在果柄离区和根系发育中的表达分析
《西北植物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定和分析辣椒PIN基因家族成员的特征及其在果柄离区和根系发育中的表达情况，为解析CaPINs功能及辣椒新品种培育提供候选基因。【方法】通过辣椒全基因组筛选鉴定PIN基因，并开展生物信息学分析，对这些基因在果柄离区和根系发育中进行表达分析。【结果】在辣椒基因组中鉴定出9个PIN基因家族成员，命名为CaPIN1-CaPIN9,分布于7条染色体上，CaPIN9未锚定。CaPINs蛋白的氨基酸数为358～654 aa,分子质量为39 251.05～71 170.91 D,等电点为6.40～9.38,且多数成员为稳定蛋白。CaPINs成员间具有明显的共线性，与番茄具有较近的遗传关系。CaPINs基因包含大量生长、环境及激素响应元件。转录组数据分析表明辣椒CaPINs的表达具有组织特异性。荧光定量PCR结果显示，CaPINs在不同果柄离区和根系发育中有不同程度表达。【结论】辣椒CaPINs特异性参与果柄离区形成与根系生长发育，可作为辣椒易脱柄品种培育和根系遗传改良的重要候选基因。
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益蝽不同发育阶段的形态特征
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文采用体视镜对益蝽Picromerus lewisi各虫态的形态特征进行了观察.结果表明:益蝽卵粒为圆形或卵圆形,卵块呈长方形,卵壳表面具金属光泽,呈金黄色,假卵盖圆形,破卵器三角状,在假卵盖的外域成一环.1~2龄若虫暗红色,无翅芽;3龄若虫黑色,4龄若虫浅褐色;5龄若虫淡土黄色,翅芽黑褐色.成虫体黑褐色,前翅革片端半部及膜片基部淡黄色或黄白色;小盾片上部的粗刺顶端呈二分叉状;腹部气门淡黄褐色;足黑色,多细毛.雄虫腹部近三角形,雌虫腹部似卵圆形;雌成虫腹下第3~6节中央有4个黑斑,初呈小黑点,渐大至宝塔状大黑斑,雄成虫腹下第3~6节中央有4个黑斑,初呈小三角,渐大至摇铃状大黑斑.
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蔬菜叶象甲为害苗期烟草在我国的首次报道
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为鉴定最近在贵州省黔西南州兴仁市烤烟育苗大棚里陆续发现为害烟苗的未知象甲,通过查询文献并测定该害虫的COⅠ基因片段序列进行鉴定.结果表明,该未知象甲鉴定为蔬菜叶象甲Listroderes difficilis Germain,国内首次报道为害烟草.描述了蔬菜叶象甲的形态特征、寄主植物与分布、习性与为害特点及防控措施等,对该虫害的识别与科学防控具有重要的参考价值.
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二穗短柄草不同发育时期转录组分析
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究不同生长期二穗短柄草在光周期途径中的分子调控机制，为二穗短柄草种质资源保育、新品种选育与开发利用提供理论依据。【方法】以二穗短柄草植株幼苗期(YMQ)、分蘖期(FNQ)、孕穗期(YSQ)和抽穗期(CSQ)叶片为材料，采用转录组学测序技术对差异表达基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)功能富集分析，揭示植物二穗短柄草在长日照条件下的生理适应机制。【结果】检测获得12 542个响应长日照胁迫的差异表达基因，其中，对比组合YMQ vs FNQ、FNQ vs YSQ和YSQ vs CSQ依次有5085个、2744个和4713个差异表达基因；GO富集发现差异表达基因显著富集在类囊体、核糖体亚基和细胞质核糖体等通路；KEGG富集发现差异基因显著富集在光合作用-天线蛋白和核糖体等通路；编码单核苷酸多态性(coding Single nucleotide polymorphism, c SNP)分析发现变异碱基总数为25 880个，其中转换和颠换的碱基总数分别为18 148个和7732个；4个时期共发现56个光周期途径基因，光周期差异表达基因主要富集在细胞质外体(RNase复合物)、光受体活性、核外体(RNase复合物)和昼夜节律-植物等通路；光周期途径关键基因GI、PRR1、PRR95、ELF4和COL3比FT、COL5、LHY、RUP1、HY5和COL9提前表达。【结论】在二穗短柄草不同发育时期中光周期关键基因表达差异显著，此结果可为进一步研究二穗短柄草开花的分子调控机理奠定基础。
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