科研产出
结球甘蓝遗传多样性的SSR分析
《江苏农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用62对SSR引物对36个结球甘蓝种质材料进行了遗传多样性分析.结果表明,有40对SSR引物在36个种质材料间表现为多态性.共检测到146个等位基因位点,每对引物的等位基因位点变幅为2-7个,平均为3.65个,有效等位基因数为127.88个,平均为3.20个.每个SSR位点的多态信息量(PIC)变化范围为0.182-0.832,平均为0.644.36个种质材料问遗传相似系数变幅为0.473~0.815,平均为0.720.UPGMA聚类分析结果显示,在相似系数为0.62的水平上可将36个甘蓝种质材料聚为三大类群,利用SSR分子标记可以从DNA水平上进行结球甘蓝遗传多样性分析.
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生防菌Bs916合成脂肽抗生素泛革素的操纵子结构功能及生物活性
《中国农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确枯草芽胞杆菌Bs916(Bacillus subtilis 916)分泌的脂肽化合物Fengycin操纵子的结构、功能和生物活性,阐明枯草芽孢杆菌Bs916防治真菌病害的分子作用机制。【方法】在Bs916全基因组测序基础上,采用LA-PCR方法克隆Fengycin的操纵子Fen;通过生物信息学方法分析Fen操纵子的遗传特征;运用基质辅助解离质谱法测定Fen操纵子合成的脂肽类化合物中同系物的分子量;采用同源重组方法构建Fengycin突变株BSFG;通过抑菌活性和溶血活性试验测定突变株BSFG的生物活性。【结果】克隆到Bs916基因组DNA中全长约37.67 kb的Fen操纵子,含有5个开放阅读框架分别编码FenA、FenB、FenC、FenD和FenE多功能复合酶;与Bs168对应Fen操纵子的同源性为65%。根据该操纵子特征推测其编码的脂肽类化合物为Fengycin;Fen操纵子负责合成的Fengycin包含5个变异体,分属于两类不同同系物。同系物1的质子化峰分子量分别为1 449.8、1 463.9、1 477.9;属于相差1个(-CH2)亚甲基的同系物,一级结构为[cyclo-([cyclo-(Glu-Orn-Tyr-Thr-Glu-Ala-Pro-GlnTyr-β-amino fatty acid)];同系物2的质子化峰分子量分别为1 491.9和1 505.9,也属于相差1个(-CH2)亚甲基的同系物,相对于同系物1其第6位的Ala氨酸残基变为Val氨酸残基。生物活性测定结果表明突变株BSFG抗菌活性相对于野生型菌株Bs916得到显著下降,但溶血活性的变化不明显。【结论】本研究克隆了生防菌Bs916中合成Fengycin的完整操纵子,通过对操纵子生物信息学分析和生化试验鉴定了Fengycin的5种变异体的化学结构,并阐明了脂肽Fengycin是Bs916抗真菌活性的重要因子之一。
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甘蓝型油菜丙酮酸激酶基因RNA 干扰载体的构建
《江苏农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用基因芯片技术,从油菜中鉴定了一个油分积累优势表达基因即丙酮酸激酶(Pyruvate kinase, PK)基因.为构建甘蓝型油菜PK 基因的RNA 干扰(RNAi)载体,通过设计引物克隆了PK 基因长498 bp 的siRNA 靶序列,连接到pEASY鄄T1 载体上,采用Not I 和Xho I 酶切,酶切产物连接到RNAi 平台载体pHurricane 的Not I 和Xho I 位点,通过多重PCR 鉴定证实载体构建成功,然后将上述PK 基因反向重复框克隆到加入napin 启动子的pCAMBIA1390 表达载体相应的酶切位点上,构建具有种子特异性表达的PK 基因的RNAi 载体.限制性内切酶酶切证实载体构建成功,为进一步研究PK 基因参与决定油菜油分积累的分子机理和代谢调控奠定了基础.
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茶树根系内生真菌与根际土壤真菌的季节多样性分析
《南京农业大学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：从不同季节的茶树根系和根际土壤中分离得到真菌2 019株,包括茶树根系内生真菌826株、根际土壤真菌1 193株。采用分子生物学鉴定方法,对rDNA-ITS区段进行扩增及分析,共鉴定出13个属28种真菌,其中茶树根系内生真菌12种,根际土壤真菌20种。对不同季节分离得到的真菌进行多样性分析,结果表明:春、夏、秋季分离出茶树根系内生真菌种类分别为12、11、12;3个季节Shannon-Wiener多样性指数差异不明显;而均匀度指数夏季最高,秋季次之,春季最低。春、夏、秋季分离出根际土壤真菌种类分别为18、17、20;3个季节Shannon-Wiener多样性指数及均匀度指数差异均不明显。根际土壤真菌与根系内生真菌比较,春、秋两季Shannon-Wiener多样性指数和均匀度指数差异明显且根际土壤真菌高于根系内生真菌;夏季两者差异均不明显。
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桃品种特异性荧光SSR分子标记数据库构建
《果树学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】选择通用的荧光SSR分子标记建立桃种质资源基因型数据库便于进行种质特异性鉴定、资源交换、管理和利用。【方法】根据48个SSR标记对国内外669份桃品系的遗传多样性测试结果,从中选择出一部分多态信息含量较高、适合品种鉴别的标记,采用不同荧光标识组合在ABI 3130测序仪测试,为了使不同批次的测试结果准确可靠,6~8个参照品种纳入每次的测试中。【结果】用16个SSR标记基本可以判断品种的特异性,它们可以用4种荧光标识进行标记,便于分为4组在ABI遗传分析仪上测试。目前数据库包含641份材料,基因型一致的品系多为同一品种突变体和自交系演化的地方品种。文中列出了100份中国代表性种质资源分子标记数据库,并建议8个中国品系为参照。对17个桃品种进行系谱验证发现,我国资源圃所育成的7个品种系谱信息正确,但日本桃品种系谱信息与文献出现偏差。【结论】应用16个多态性高的SSR荧光标记可以构建精确的桃品种分子指纹数据库,测试方法及结果对品种特异性和系谱鉴定提供重要的参考,推动资源分子指纹数据库标准化建设工作。
混合水解对打捆麦秸水解产酸的影响
《环境工程学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为研究混合水解对麦秸水解产酸的影响,以猪粪、厨余和蔬菜废物为原料,研究其分别与麦秸混合水解产酸的特性,分析了水解过程中pH值、COD、SCOD和VFAs的变化。结果表明,除麦秸+蔬菜废物最佳出料时间为3~9 d外,麦秸、麦秸+厨余垃圾、麦秸+猪粪水解液最佳出料时间均为3~7 d,7 d后水解液COD浓度下降;将蔬菜废物与麦秸混合水解,水解液pH值降低幅度最大,水解液中总有机酸浓度最高,pH值最低为5.31,有机酸浓度最高达6.46 g/L,且水解液中SCOD浓度、SCOD/COD比值最大;添加猪粪明显促进了麦秸有机物的水解溶出,麦秸单位干物质水解率和产酸率较对照分别提高了43%~134%和50.53%,但对提高水解液SCOD浓度、SCOD/COD比、TVFA浓度、降低水解液pH值的效果不如蔬菜废物;添加厨余垃圾的效果介于猪粪和蔬菜废物之间。从促进麦秸水解产酸的角度,以添加猪粪的效果最好。
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棉花水通道蛋白序列生物信息学初步分析
《浙江农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：水通道蛋白(aquaporin,AQP)是高效转运水分子的膜内在蛋白,在调控植物的水分关系中有重要作用,和抗旱性能紧密相关。为初步评价分析棉花AQP序列资源,对网上最新且仅有的52条棉花AQP序列进行分子聚类,同时将其进行多序列比对及亚细胞定位,结果表明:棉花AQP大致分为7类,具有丰富的多样性,AQP基因在跨膜转运以及光合中起重要作用。另外,来自水稻、大豆、玉米、拟南芥的328条AQP序列和52条棉花AQP序进行分子聚类,结果表明:有48条棉花AQP和大豆聚为一类,遗传距离较接近。
基于SSH2架构的农村信息服务系统的设计与实现
《江苏农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用互联网等现代信息技术,为农民提供高效便捷、简明直观、双向互动、个性化的农村综合信息服务。根据用户需求和当地农业特色,系统基于SSH2架构,后台采用MySQL数据库,在Eclipse环境下开发了面向广大农民应用的农村信息服务系统。实现了子站点生成、信息采集和智能推送,安全管理一体化和一站式,与农村信息一体机终端配合。农村信息服务系统可直接为广大农民提供信息浏览、技术查询、远程诊断、远程教育等功能。
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干燥工艺对慈菇脆片品质的影响
《食品科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：研究热风干燥、微波干燥、真空微波干燥、热风-微波干燥4种不同的干燥方式对慈姑脆片物理性质、营养成分、微观结构的影响。结果表明:热风干燥对慈姑脆片色泽影响不大,但慈姑脆片硬度脆度差;微波干燥和真空微波干燥慈姑脆片硬度脆度适中,但色泽及风味较差;热风-微波干燥慈姑脆片色泽最好,硬度和脆度适中,慈姑脆片的感官品质最佳,多酚保留率较高;热风-微波干燥体现较好的膨化效果可能与形成更均匀多孔状的组织结构有关。
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犬瘟热病毒单克隆抗体夹心ELISA检测方法的建立
《中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第八届全国会员代表大会暨第十五次学术研讨会论文集 》 2013 CSCD
摘要：为建立方便快捷的犬瘟热病毒(CDV)检测方法,本实验运用杂交瘤细胞融合技术,建立了4株分泌抗CDV单克隆抗体(MAb)的杂交瘤细胞株,分别命名为A2、F7、H4和G12。相加ELISA试验显示4株MAb作用于CDV不同的抗原表位。选取相加指数较高的两株MAbG12和A2分别作为捕获抗体和酶标抗体,建立检测CDV的夹心ELISA检测方法,并对实验条件进行了优化。结果显示,该方法与CPV、CPIV、CAV-1、CCV等犬类病毒无交叉反应,敏感度为5μg/mL,变异系数小于6%。用该方法与RT-PCR方法同时检测57份临床样品,两种方法的符合率为100%。本实验建立的单抗夹心ELISA方法具有特异、...
