科研产出
基于Web GIS的中国外来入侵物种地理分布信息系统的设计与开发
《福建农业学报 》 2016 北大核心
摘要:以中国外来入侵物种及其安全性考察取得的原始调查数据为基础,针对外来入侵物种调查协作中数据管理与共享利用等方面的需求,完成了系统技术架构、数据库及系统功能设计,开发实现了入侵生物分布调查数据查询、属性数据浏览、专题图生成、地图操作等功能。本文分析了入侵生物的主要数据来源、描述了基于物种编目的数据模型、介绍了基于SOA架构的Web GIS技术方案及系统的主要功能,并对系统的优势、不足及今后拓展应用的方向进行讨论。
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H9N2亚型AIV福建分离株血凝素蛋白的特征
《中国兽医学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:H9N2亚型禽流感病毒(AIV)已在多个国家多种禽类中检测到,由于H9N2亚型AIV的低致病力特征,导致其在疫病防控中不被重视,目前该病在全世界范围内不断进化和流行。为明确H9N2亚型禽流感病毒(AIV)福建分离株血凝素基因编码蛋白的特征,丰富福建省H9N2亚型AIV分子流行病学信息。本研究通过选取NCBI数据库流感病毒资源库(influenza virus resource)中所有28株H9N2亚型AIV血凝素基因编码蛋白(仅选择有完整ORF毒株),其中鸡源22株和鸭源6株,通过分析其左侧结合域、右侧结合域和血凝素蛋白裂解位点的氨基酸特征,并通过和H9N2亚型AIV代表株来绘制相互之间遗传进化树。分析发现,28株H9N2亚型AIV福建株相互之间氨基酸同源性在90.5%~99.5%之间。从血凝素蛋白切割位点的氨基酸序列特征来看,所有H9N2亚型AIV血凝素裂解位点氨基酸序列均为非连续碱性氨基酸。血凝素蛋白切割位点为PARSSR↓GLF的毒株均处于H9N2亚型AIV的H9.4分支上H9 Y280分支的下部(H9.4.0分支、H9.4.1分支和H9.4.2分支),而血凝素蛋白切割位点为PSRSSR↓GLF的毒株均处于H9N2亚型AIV的H9.4分支上H9 Y280分支的上部(H9.4.3分支、H9.4.4分支、H9.4.5分支和H9.4.6分支),提示我们可根据H9N2亚型AIV血凝素裂解位点氨基酸序列特征,将我国H9N2亚型AIV分为2个大的基因亚群。对226位氨基酸位点研究发现,除5株鸭源H9N2亚型AIV早期分离株(A/Muscovy duck/Fujian/CL/1997、A/duck/Fujian/MH/2003、A/duck/Fujian/FQ107/2007、A/duck/Fujian/T7/2007和A/duck/Fujian/T14/2007)此处为Q,其他所有毒株均为L。该结果说明,鸡源H9N2亚型AIV在进化的过程中也可直接获得和人源受体结合位点能力,具有直接跨种感染的潜力。通过分析研究发现,福建地区H9N2亚型AIV基因亚群复杂,应加强对该区域H9N2亚型AIV的分子流行病学调查和生物学特性研究。
关键词: H9N2亚型禽流感病毒 血凝素 福建 遗传进化 分子特征
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‘白芽奇兰’施肥效应及其氮磷钾适宜用量研究
《茶叶学报 》 2016
摘要:为探讨平和县白芽奇兰品种的施肥效应及其推荐施肥量,在该县茶叶主产区设置了定位2年的氮磷钾化肥和有机肥田间肥效试验。系统聚类分析表明,根据茶青产量水平,可将茶园分为"高"、"中"、"低"产3种类型,其空白区和平衡施肥的茶青产量均值具有显著水平差异。施用氮磷钾化肥和有机肥的茶青平均增产13.9%、5.5%、11.3%和11.6%,其中高产茶园的氮磷肥增产效果大于中、低产茶园,但钾肥和有机肥在低产茶园的增产效应明显高于"高"产茶园。高、中产茶园施用氮肥的净增收高于磷钾肥和有机肥,在低产茶园施用氮钾肥和有机肥的净增收大致相当,磷肥的施肥效益最低。对茶青增产效应和净增收的分析表明,茶园的氮磷钾化肥和有机肥的适宜施用量平均分别为N 347kg·hm~(-2)、P2O5105kg·hm~(-2)、K_2O 116kg·hm~(-2)和商品有机肥3750kg·hm~(-2),高、中产茶园要重视合理施用氮钾肥,在低产茶园上要特别重视有机肥和化肥的配合施用。
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福建省品牌猪肉建设与发展
《猪业科学 》 2016
摘要:猪肉是我国居民肉类消费的主要种类,随着经济社会的发展和居民生活水平的提高,老百姓对食品质量、安全的要求和认知及对猪肉的口味、安全性的要求也不断提高;随着大家对肉类消费需求和消费观念的转型升级,群众在消费猪肉的时候已开始注重品质和品牌,消费者的品牌意识将成为猪肉消费的必然趋势。不少养殖
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茉莉花JsGGPPS基因的克隆及生物信息学与表达分析
《福建农业学报 》 2016
摘要:牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(Geranylgerany pyrophosphate synthase,GGPPS)是萜烯类香气物质合成途径中的关键酶。采用RT-PCR和RACE相结合的方法,克隆了茉莉花牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因的全长cDNA(命名为JsGGPPS,GenBank登录号AIY24421.1),采用实时荧光定量PCR技术分析JsGGPPS基因在茉莉花开放过程中的表达模式。结果表明,JsGGPPS全长cDNA为1 410bp,含1 083bp完整的开放阅读框(ORF),其推导的氨基酸序列包含360个氨基酸,属于trans-isoprenyl diphosphate synthases(IPPS)和class I terpene cyclases家族,含链长控制区(CLDR)、2个天冬氨酸富集区以及其他保守区。JsGGPPS基因与独行菜Lepidium apetalum、橡胶草Taraxacum kok-saghyz的同源性分别为91%、86%。实时荧光定量PCR结果表明,茉莉花开放过程中JsGGPPS基因在晚上18:00时表达量较低,呈上调趋势,在22:00时达到最高,呈下调趋势,在翌日2:00时表达量最低,与茉莉花释香趋势相似,为深入研究茉莉花萜烯类香气物质代谢途径奠定基础。
关键词: 茉莉花 萜烯类 香气 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶 克隆 表达分析
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猪伪狂犬病毒 gB 基因序列分析
《福建农业学报 》 2016 北大核心
摘要:2011年以来我国多省免疫猪伪狂犬病毒 gE 基因缺失苗猪场出现变异型猪伪狂犬病毒(PRV)感染,经典猪伪狂犬病毒疫苗(Bartha-k61)对该病无法提供100%有效保护,已有研究发现变异型 PRV 和经典 PRV gE 基因存在特征性变异。为明确变异型 PRV gB 基因特征,本研究对 GenBank 中登录的部分 PRV 代表株 gB基因进行分析比较。结果表明,我国经典型和变异型 PRV 在 gB 蛋白氨基酸编码区第395位、453位、562位和739位存在特征性差异,但不同来源 PRV gB 基因的核苷酸和氨基酸同源性分别在98.1%~100%和96.1%~100%。从相互之间的遗传进化关系可以看出,PRV 遗传进化出现两个大的遗传分支,呈现明显的地域性。新发变异型和经典型 PRV 在中国 PRV 遗传进化分支上呈现各自独立进化小分支;我国近年分离的貉源和约克夏梗犬源与新发变异型 PRV 则处于同一进化小分支。
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草莓叶黄素循环关键酶基因VDE和ZEP的克隆与分析
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:叶黄素循环在逆境胁迫中对植物光系统起着重要的保护作用。紫黄质脱环氧化酶(VDE)和玉米黄质环氧化酶(ZEP)是调控叶黄素循环的关键酶。本研究采用RT-PCR和RACE技术率先从草莓中克隆获得VDE和ZEP基因。VDE基因c DNA全长1 842 bp,ORF为1 467 bp,编码489个氨基酸;ZEP基因c DNA全长2 325 bp,ORF为1 980 bp,编码660个氨基酸。生物信息学分析表明草莓VDE与ZEP基因所编码的氨基酸序列与蔷薇科的苹果、桃和梅等植物的亲缘关系较近。荧光定量分析发现VDE和ZEP基因在草莓根、茎、叶、花、果实中皆有表达,说明二者均为组成型表达基因,并且叶片中基因的表达量最高而根中最低,推测与其在草莓叶黄素循环调控的作用有关。
关键词: 草莓 叶黄素循环 紫黄质脱环氧化酶(VDE) 玉米黄质环氧化酶(ZEP)
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2个再生稻品种机械化生产的产量构成分析
《厦门大学学报(自然科学版) 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:为探索再生稻机械化生产的增产途径,在潭香稻谷专业合作社对甬优2640和佳辐占两品种的双季产量及其构成进行分析,结果表明:甬优2640矮秆抗倒,穗大粒密,双季产量分别为(10 598±1 433)和(10 126±1 527)kg/hm2;佳辐占熟期短,适应闽北安全生长期短的气候生态,双季产量分别为(7 006±1 399)和(6 443±1 357)kg/hm2.再生稻产量由单位面积(m2)穗数、每穗粒数、结实率和千粒质量4个因素构成.2个品种的结实率和千粒质量变异小,与产量无显著相关性;单位面积穗数和每穗粒数变异大,与产量呈显著或极显著正相关,且由此二者组成的单位面积总粒数的变异更大,与产量的相关性更高,对增产的贡献率>0.97,是决定产量的主要因素;而单位面积总粒数与单位面积穗数、每穗粒数呈显著或极显著正相关,其中头季与单位面积穗数的相关度更高,再生季与单位面积穗数、每穗粒数的相关度差距不大.因此,提高再生稻机械化生产的产量主攻方向是扩增单位面积总粒数,而扩增单位面积总粒数必先扩增单位面积穗数和每穗粒数,其中头季侧重扩增单位面积穗数,再生季兼顾扩增单位面积穗数和每穗粒数.
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‘芙蓉李’转录组SSR信息分析与分子标记开发
《果树学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:【目的】明确‘芙蓉李’转录组SSR总体特征,开发SSR引物,为李种质资源多样性分析和品种鉴定等奠定基础。【方法】采用MISA分析‘芙蓉李’转录组SSR位点信息,利用Primer3设计引物,并随机选择40对引物对8个李品种进行多态性分析。【结果】在‘芙蓉李’转录组中,共检测到7 601个SSR位点,分布于5 434条Unigene,SSR位点出现频率为54.51%(SSR位点数7 601与大于1 kb的Unigene数13 944的比值)。其中,单核苷酸重复是主要类型,占总SSR的42.19%。其次是二、三核苷酸重复,分别占总SSR的37.72%和18.48%。A/T和AG/CT是单核苷酸和二核苷酸的优势重复基元。对7 601个SSR位点设计出4 235对SSR引物。随机选择40对引物进行PCR扩增,其中17对在8个李品种中表现出多态性。【结论】李转录组数据是开发SSR标记的有效来源,开发的SSR标记可为李种质资源遗传多样性分析等提供了丰富的候选标记。
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