中国明对虾Dscam基因的克隆及其在免疫致敏(类免疫)诱导反应中的表达分析

曹家旺; 孟宪红; 孔杰; 史晓丽; 栾生; 罗坤; 董丽君; 陈宝龙; 《水产学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：为了研究对虾免疫致敏过程中Dscam基因的表达规律,实验采用同源克隆和RACE技术获得了中国明对虾Dscam基因c DNA全长序列,并对该序列进行生物信息学分析。结果显示,中国明对虾Dscam基因的c DNA全长为6 624 bp,其中包括171 bp的5′端非编码区,459 bp的3′端非编码区,开放阅读框的长度为5 994 bp,编码1 996个氨基酸。推测该基因编码的蛋白含有一个信号肽、10个Ig结构域、6个FNIII功能区、1个胞质尾区和1个跨膜结构域。同源性分析及系统进化分析表明,Dscam基因与节肢动物的Dscam基因首先聚为一类,且与凡纳滨对虾的同源性最高,为92.4%。连续投喂6 d热灭活白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)饵料来诱导免疫致敏反应,在0、6和12 d及二次感染后的12、24、48、72和168 h分别取样,用RT-PCR的方法检测中国明对虾Dscam的相对表达量。结果显示,诱导感染组Dscam基因在第12天开始上调,且与阴性对照组和未诱导感染组差异显著;二次感染后24 h,Dscam基因的相对表达量达到最大值,与阴性对照组和未诱导感染组差异显著;48 h后基因表达量开始下降,但表达量仍高于阴性对照组和未诱导感染组。实验表明,中国明对虾存在Dscam基因,并在免疫致敏过程中发挥重要作用。

关键词： 中国明对虾 Dscam基因 免疫致敏 表达分析

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达氏鲟gpr54基因的克隆及Kisspeptin注射对其表达的影响

岳华梅; 叶欢; 阮瑞; 刘志刚; 李创举; 《水生生物学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：G蛋白偶联受体54(GPR54,G protein-coupled receptor 54)是kisspeptin(Kiss)的受体蛋白。Kisspeptin/GPR54系统通过调节促性腺激素释放激素(Gn RH)的活性来参与鱼类生殖调控。为了研究Kisspeptin/GPR54系统对达氏鲟(Acipenser dabryanus)Gn RH的调控功能,克隆得到达氏鲟2个gpr54基因的全长c DNA序列,命名为dsgpr54-1及dsgpr54-2,分别编码379和368个氨基酸。氨基酸序列比对及进化树分析表明,达氏鲟Gpr54与四足动物Gpr54序列一致性较高,亲缘关系较近。荧光定量PCR研究发现,dsgpr54-1的转录本在精巢、卵巢、下丘脑、垂体、中脑及端脑等组织中均有表达,且在下丘脑中转录水平最高;而dsgpr54-2仅在脑组织中转录,且在垂体、中脑及下丘脑中表达丰度均较高。为了研究Gpr54是否可以与其配体Kisspeptin结合调控下丘脑中gnrh基因的表达,分别合成了达氏鲟Kiss-1和Kiss-2的核心十肽(10 nmol/L、1000 nmol/L),腹腔注射到9月龄达氏鲟。结果表明,不同浓度Kiss-1、Kiss-2注射均引起gpr54基因表达量升高,并且10 nmol/L Kiss-2注射能够显著促进dsgpr54-2的表达(P<0.05)。另外,不同浓度Kiss-1注射均造成了gnrh转录水平的下降;而10 nmol/L Kiss-2注射使得gnrh1表达量上升,而gnrh2的表达量下降,1000 nmol/L Kiss-2注射则引起gnrh1表达量的下降,gnrh2的表达量没有显著变化。上述研究结果表明,达氏鲟gpr54基因均能与其配体kiss-1、kiss-2相结合,但表现出一定的受体-配体选择性差异。Kiss-1、Kiss-2通过激活Gpr54的活性,调控下丘脑中gnrh基因的表达,且其调控功能存在差异。

关键词： 达氏鲟 GPR54 组织分布 多肽注射

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云纹石斑鱼和鞍带石斑鱼及其杂交后代遗传性状分析

唐江; 田永胜; 李振通; 成美玲; 陈张帆; 毛东亮; 马文辉; 王晓梅; 李文升; 翟介明; 李波; 《农业生物技术学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：微卫星标记是鱼类遗传多样性分析的有效方法,本研究利用石斑鱼(Epinephelus sp.)近缘种的27对微卫星引物,分析鞍带石斑鱼(E.lanceolatus)(♂)、云纹石斑鱼(E.moara)(♀)及其杂交子一代云龙斑的遗传性状,其中有25对SSR标记在云龙斑中检测到多态性。通过Popgene32软件计算有效等位基因数(effective alleles number,Ne),期望杂合度(expected heterozygosity,He),观测杂合度(observed heterozygosity,Ho),香侬信息指数(Shannon index,I),Nei氏遗传距离(genetic distances,Nei),多态信息含量(polymorphism information content,PIC),总体近交系数(overall inbreeding coefficient,Fit),群体内近交系数(inbreeding coefficient in population,Fis)及遗传分化系数(genetic differentiation coefficient,Fst)等遗传多样性参数,分析群体间的遗传变异情况。结果表明,在3种石斑鱼群体中,云纹石斑鱼平均有效等位基因数最多(2.8926),云龙斑次之(2.8010),最小的是鞍带石斑鱼(2.0564)。云纹石斑鱼、鞍带石斑鱼和云龙斑共3个群体的平均观测杂合度分别为:0.6046、0.5661和0.5010,平均多态信息含量分别为:0.579 8、0.5446和0.342 0。3个群体总近交系数为0.150 8,群体间遗传分化系数为0.067 7,表明有93.23%的遗传变异来自群体内个体间的差异,6.77%的遗传变异来自群体间,群体间近交系数为-0.072 2,群体间基因流(Nm)为2.396 3。基于Nei's遗传距离构建UPGMA聚类分析,显示云龙斑与云纹石斑鱼遗传相似度较高,遗传距离较近。本研究结果在分子水平上为杂交品种云龙斑的杂种优势性状形成及杂交种质鉴定提供了遗传基础。

关键词： 鞍带石斑鱼 云纹石斑鱼 杂交后代 遗传性状 微卫星

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中国水产养殖环境氮磷污染现状及未来发展思路

刘国锋; 徐跑; 吴霆; 徐增洪; 徐刚春; 《江苏农业学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：中国水产养殖业发展迅速,但受土地、环境、技术和人工等资源的限制,目前已经到了发展的瓶颈期。本研究总结过去近40年来水产养殖业快速发展带来的水环境氮磷污染负荷和环境效应,以及相应的养殖水体治理措施,提出了新型水产养殖模式的优势。未来水产养殖业在"提质增效、减量增收、绿色发展、富裕渔民"的总目标下,必须转变生产方式,调整生产结构,通过持续深化渔业供给侧结构性改革,从苗种、饲料、技术、装备、机制和生产模式等方面着手,提高水产养殖的技术水平,提升渔民增收致富的能力和水产品品质,为中国水产养殖业的可持续发展奠定坚实的基础。

关键词： 水产养殖 污染物 水环境 水质净化 养殖模式

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黄海大头鳕0龄幼体分布及其与环境因子的关系

张人元; 卞晓东; 单秀娟; 金显仕; 关丽莎; 《水产学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：大头鳕是广泛分布于太平洋北部沿岸海域的重要经济和生态种,研究其幼体的生物学特性和分布有助于了解大头鳕的种群动态。本实验根据2016年6月、8月、10月、12月在黄海进行的渔业资源和环境调查数据,研究了黄海大头鳕种群幼体的生长规律;并运用广义可加模型(GAM)方法,分析了该海域大头鳕幼体分布及其与环境因子的关系。结果显示,黄海大头鳕幼体为正异速增长,体质量增长较快,b值为3.316 1。黄海大头鳕0龄幼体主要在底层盐度31.7~33.3、底层水温6.6~12.1°C、深度35.8~87.2 m、底质为细粉砂或黏土质软泥底质的海域中生活。研究表明,大头鳕幼体分布的季节变化与黄海冷水团的季节演变过程具有同步性。对大头鳕幼体密度有显著影响的环境因子依次为底层水温、底质、底层盐度,而深度对大头鳕幼体密度的影响不显著。

关键词： 大头鳕 生长 分布特征 环境因子 广义可加模型

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优质翘嘴红鲌健康养殖技术

吴慧; 李全杰; 《科学养鱼 》 2018

摘要：翘嘴红鲌俗称白条、太湖白鱼。笔者摸索出了一种翘嘴红鲌的健康养殖技术,产出的鱼风味绝佳、品质上乘,可与野生翘嘴红鲌媲美,现分享以供广大养殖同仁参考。一、营造健康的养殖环境营造优质养殖环境在于提供适宜的池塘底泥与水质环境。在底泥处理方面:首先在鱼种放养前15~20天抽干池水,清除其中过多淤泥。然后用60~75千克/亩生石灰吸水化开后泼洒全池进行消毒。清塘后曝晒3天以上再向池塘中加水,过程中注水口用40目的筛绢布进行过滤,以拦截野

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斑节对虾GPx3a基因的分子克隆及表达分析

刘伟; 赵超; 范嗣刚; 王鹏飞; 闫路路; 邱丽华; 《海洋科学 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPx)是生物体内重要的抗氧化酶,能防止过氧化氢对生物体的氧化应激。该研究利用RACE技术获得了斑节对虾(Penaeus monodon)GPx3a(PmGPx3a)的全长c DNA序列,进行了相关生物信息学分析。作者利用荧光定量PCR方法研究了PmGPx3a在斑节对虾不同组织的表达情况。探究了PmGPx3a在不同胁迫条件下(盐度、重金属和细菌)的表达情况。结果表明PmGPx3a c DNA全长1135 bp,其中开放阅读框(ORF)长651 bp,预测编码216个氨基酸。PmGPx3a推导的氨基酸序列与其他动物的GPx3a氨基酸序列具有高度一致性。实时定量PCR结果显示,在高低盐胁迫下,PmGPx3a在肝胰腺中相对表达量都为上升的(p<0.05)。在铜、锌、铬胁迫中,鳃中的PmGPx3a的相对表达量总体呈现下降趋势,在肝胰腺中呈现上升趋势。在哈维弧菌(Vibrio harveyi)刺激下,PmGPx3a在血淋巴中的相对表达量总体呈现上升趋势,24 h后表达量最大,显著高于对照组2.2倍(P<0.05)。以上研究结果表明,PmGPx3a基因参与了斑节对虾对环境胁迫和氧化应激的适应性反应。

关键词： 斑节对虾(Penaeus monodon) 谷胱甘肽过氧化物酶 盐度胁迫 重金属胁迫 细菌刺激

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基于长片段PCR扩增的牡蛎疱疹病毒基因组高通量测序

史杰; 白昌明; 李晨; 蔡生力; 王崇明; 《水产学报 》 2018 北大核心 CSCD

摘要：为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列,并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系,利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术,获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA;再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示,ZK2001与参考基因组相比存在328个SNP位点,SNP和序列插入/缺失变异是导致Os HV-1基因组序列变异的主要变异类型。系统发育分析结果显示,ZK2001变异株与分离自我国的Os HV-1变异株亲缘关系最近,与分离自欧洲的Os HV-1μvar及其相关变异株的亲缘关系最远,说明中国和欧洲分布Os HV-1间存在因地理隔离导致的遗传分化。研究表明,基于长片段PCR的DNA富集技术,可以有效地扩增和富集冷冻样本中Os HV-1基因组DNA,并应用于高通量测序。Os HV-1不同变异株基因组序列数据的获取和积累,将为其基因组尺度的基因变异、株系演化和系统发育关系等研究提供重要基础。

关键词： 栉孔扇贝 高通量测序 长片段PCR 牡蛎疱疹病毒

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基于EMD-IGA-SELM的池塘养殖水温预测方法

施珮; 袁永明; 匡亮; 李光辉; 张红燕; 《农业机械学报 》 2018 EI 北大核心 CSCD

摘要：为了有效指导工厂化水产养殖,提高水产养殖过程中水体温度预测的精度和稳定性,在分析水体温度影响因素的基础上,提出基于经验模态分解(EMD)、改进遗传算法(IGA)和改进极限学习机(SELM)相结合的水温预测模型(EMD-IGA-SELM)。首先,通过综合天气指数的计算完成异常和缺失数据的校正;利用皮尔森相关分析计算各影响因子与水温之间的相关度,从而确定预测模型的输入输出量;选择Softplus函数代替Sigmoid函数组成SELM,并引入混沌序列改进标准遗传算法,获得SELM的最佳初始权值和阈值;最后,采用EMD方法将原始水温时序数据进行多尺度分解,在各分量中对IGA-SELM训练建模,并叠加求和各分量预测值,从而完成水温序列的预测。将EMD-ELM和GA-BP模型的预测结果与EMD-IGA-SELM进行对比,结果表明,EMD-IGA-SELM取得了较好的预测精度,评价指标平均绝对误差、平均绝对百分比误差和均方根误差分别为0. 123 3℃、0. 004 3和0. 147 8℃,能够满足水产养殖的生产需要,可为池塘水质管理和调控提供决策支持。

关键词： 水产养殖 水温预测 极限学习机 改进遗传算法 经验模态分解

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浅析科研财务助理制度

罗瑛; 《农业科研经济管理 》 2018

摘要：针对"把科研人员逼成会计"等问题,政府要求改革科研项目资金管理方式,提出了建立科研财务助理制度,让科研人员专心从事科学研究。但如何真正实现"让专业的人做专业的事",把科研人员从繁琐的事务中解放出来,需要深思、研究和探讨,从而落实科研财务助理制度。

关键词： 科研单位 科研财务助理 制度

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