科研产出
梅、杏、桃EST同源序列特征分析及EST-SNP发掘
《南京农业大学学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要:通过生物信息学手段,下载GenBank数据库中已公布的梅、杏、桃3个物种EST序列各4 660、15 388、82 583条,利用CAP 3软件拼接后序列分别为4 456、5 595和24 243条。经比对发现,同源序列592条,同源序列的总长度为235 576 bp,平均长度和同源性分别为437.67 bp和97.50%;进行Blast比对后发现,所有同源序列中有340个具有相应的功能注释,183个为未知功能蛋白,其余69个为没有相应序列信息的新基因;在所有同源序列中共发现8 818个SNP,总频率为每SNP26.71 bp,并以转换和颠换为主。同时,对3个物种的同源序列进行两两比较发现,SNP数量明显少于这三者比较的结果。利用所有SNP对梅、杏、桃3个特种进行聚类分析,结果表明,梅、杏的亲缘关系较近,而两者与桃亲缘关系较远。
关键词: 梅 杏 桃 表达序列标签 单核苷酸多态性 发生频率
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微生物与土壤矿物相互作用的研究进展
《安徽农业科学 》 2012 北大核心
摘要:微生物体吸附于矿物表面后,其活性将发生改变,从而影响到土壤中与生物和生物分子相关的一系列土壤过程,如矿物形成与演化、土壤结构体稳定性、土壤养分有效性、土壤污染物质的毒性以及污染土壤的生物修复等。因此,研究土壤矿物、微生物相互作用,不仅有助于深入了解土壤微生物过程,而且对评估和预测土壤体系中有机污染物降解和转化的特点与动态,进而提高污染物的修复效率等有着重要的实际意义。
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聚乙烯袋包装和0℃冷藏对结球生菜品质的影响
《食品与机械 》 2012 北大核心 CSCD
摘要:研究0.02 mm和0.06 mm聚乙烯袋包装、(0±0.5)℃条件下冷藏18d对结球生菜品质的影响。结果表明,随着冷藏时间延长,失重率逐渐增高,VC、可溶性糖、可溶性蛋白等营养成分含量逐渐降低。0.06mm聚乙烯袋包装的结球生菜冷藏效果好于0.02mm聚乙烯袋包装的结球生菜,冷藏18d后0.06mm聚乙烯袋包装的结球生菜感官评价为3.4,失重率为2.15%,VC含量为25.9mg/100g,可溶性糖含量为1.22%,可溶性蛋白为53mg/100g。
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外源水杨酸处理对采后豇豆抗冷性的影响
《湖北农业科学 》 2012 北大核心
摘要:试验研究了不同浓度的外源水杨酸溶液处理对采后豇豆冷藏效果的影响。结果表明,采用水杨酸处理可以有效地抑制豇豆表面水浸状凹陷斑扩大,改善豇豆冷藏期间的贮藏品质,延缓豇豆豆荚中叶绿素的降解,抑制细胞膜透性的增加和丙二醛含量的积累,并使过氧化物酶和过氧化氢酶活性始终维持在较高水平。其中以1.0mmol/L浓度的水杨酸溶液处理的效果最佳。
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湖北省十堰地区野生板栗cpSSR遗传多样性研究
《果树学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要:为了明确神农架地区野生板栗资源遗传背景,选用4对呈现多态性的叶绿体微卫星引物,对湖北省十堰辖区内野生板栗进行了遗传结构和叶绿体单倍型分析。结果表明4个位点在4个居群的53个样本中扩增出10个等位基因。等位基因数(A)平均为2.5,有效等位基因数(Ne)平均为1.696,PIC值平均为0.312,各遗传参数值远低于核基因组对群体研究的相应值。4个等位基因从53个样本中共给出5种单倍型,既有共享率超过66%的单倍型,在房县居群中也存在稀有单倍型,其中丹江口和房县板栗天然野生居群,具有较高的单倍型多样性,杂合度分别为0.4062和0.3794,明显高于其他地区,显示两地是板栗的分布及遗传多样性中心。基于cpSSR数据,对板栗地方品种与天然野生居群间的遗传结构、关系及地方品种的起源进行了初步探讨。AMOVA分析显示,83%的cpSSR变异存在于居群之间,17%来自居群内。研究表明,十堰地区野生板栗具有较高的多样性,叶绿体单倍型分析更能直观的表现野生板栗的区域分布规律。
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