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山葡萄成熟果皮cDNA文库的构建及ESTs初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李凤 1 ; 杨成君 2 ; 李波 3 ; 王军 4 ; 刘海峰 5 ;

作者机构: 1.东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室延边大学农学院中国农业大学食品科学与营养工程学院

2.东北林业大学林学院

3.黑龙江省农业科学院科研处

4.中国农业科学院特产研究所

5.东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室延边大学农学院

关键词: 山葡萄;cDNA文库;表达序列标签

期刊名称: 植物生理学通讯

ISSN: 0412-0922

年卷期: 2010 年 46 卷 12 期

页码: 1232-1236

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以山葡萄成熟果皮为材料,采用Creator~(TM) SMART~(TM) cDNALibraryConstruction技术构建了cDNA文库。经鉴定,文库的库容量为1.001×10~6,重组率为94.1 1%,插入片段在0.25~1.9 kb。经随机测序,获得935个有效ESTs,聚类拼接后得到636条单基因簇(unigenes),包括107个重叠群(contigs)和529个单拷贝(singlets)。这些数据为今后山葡萄功能基因分离克隆和功能基因组学研究奠定了基础。

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