您好，欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库！
中国水产科学研究院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

高通量测序与传统纯培养方法在牡蛎微生物群落分析中的应用对比

文献类型： 中文期刊

作者： 曹荣 1 ; 张井 2 ; 孟辉辉 1 ; 赵玲 1 ; 刘淇 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

2.温州市农业科学研究院

关键词： 高通量测序;牡蛎;微生物群落结构

期刊名称： 食品科学

ISSN： 1002-6630

年卷期： 2016 年 37 卷 24 期

页码： 137-141

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示牡蛎体附着的微生物群落结构特征,采用Illumina Hi Seq高通量测序技术对牡蛎的细菌种类进行了分析,并与传统纯培养方法的分析结果进行对比。结果表明,牡蛎体附着的细菌以变形菌门(Proteobacteria,77.5%)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria,72.3%)为主;在目的分类水平上,弧菌目(Vibrionales,49.3%)、交替单胞菌目(Alteromonadales,12.2%)占优势;在科的分类水平上,主要是弧菌科(Vibrionaceae,36.8%)、希瓦氏菌科(Shewanellaceae,10.3%)和交替假单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae,7.2%);在属的分类水平上,弧菌属(Vibrio,28.3%)、希瓦氏菌属(Shewanella,10.3%)、交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas,7.2%)比例相对较高。高通量测序分析结果中,丰度前3位的菌属与纯培养鉴定的结果一致,但比例有所差异。

  • 相关文献

[1]基于病毒宏基因组技术侦测牡蛎体内病毒. 黄晟,姜敬哲,王江勇,许新. 2017

[2]基于高通量测序的牡蛎冷藏过程中微生物群落分析. 曹荣,刘淇,赵玲,孟辉辉. 2016

[3]牡蛎中副溶血弧菌荧光定量PCR检测方法的建立及其初步应用. 林强,李宁求,付小哲,刘礼辉,石存斌,吴淑勤. 2010

[4]红海湾浅海滩涂牡蛎养殖模式的研究. 张汉华,梁超愉,吴进锋,邱丽华,王江勇. 2001

[5]广东沿岸牡蛎体内总汞含量变动趋势及其健康风险评价. WANG Xue-feng,王学锋,JIA Xiao-ping,贾晓平,CHEN Hai-gang. 2011

[6]牡蛎超声波清洗工艺的初步研究. 张敬峰,费星,沈建,郑晓伟,秦小明,章超桦. 2011

[7]大鹏澳牡蛎养殖对浮游植物种群结构的影响研究. 张玲,李政菊,陈飞羽,江涛,吕颂辉,江天久. 2015

[8]广东沿岸牡蛎体内HCHs的时空分布特征. 王清云,甘居利,陈海刚,马胜伟,张喆,蔡文贵,贾晓平. 2013

[9]南海北部沿岸牡蛎体内PCBs的时空分布特征及评价. 王清云,甘居利,陈海刚,马胜伟,张喆,蔡文贵,贾晓平. 2013

[10]广东沿海牡蛎体Ni含量水平及其时空变化趋势. 贾晓平,林钦,蔡文贵,李纯厚. 2000

[11]牡蛎酶解工艺及其药理活性研究进展. 蔡树杏,王锦旭. 2019

[12]基于种特异性PCR及线粒体基因标记的天津沿海牡蛎物种多样性研究. 黄津伟,张天喆,高燕,吴弘,高雨,闫春财,胡利莎. 2019

[13]气相色谱法测定牡蛎中多溴联苯醚. 刘奇,柯常亮,莫梦松,陈洁文,刘卓坚,黄珂. 2019

[14]钦州湾牡蛎线粒体16 S rRNA基因片段核苷酸序列分析. 蒋伟明,陈秀荔,赵永贞,陈晓汉,江世贵,李咏梅. 2008

[15]牡蛎养殖过程中副溶血弧菌与水质因子间的关系. 林强,李宁求,付小哲,刘礼辉,石存斌,吴淑勤. 2012

[16]南海北部沿岸海域近江牡蛎体中的三氯杀螨醇. 李娟,贾晓平,甘居利. 2012

[17]1997～2010年广东沿岸牡蛎体Cr时空变化及健康风险评价. 马胜伟,陈海刚,王增焕,蔡文贵,方晓辉,贾晓平. 2013

[18]海产源多重耐药共生菌的耐药表型及耐药基因分析. 吴书香,李丽倩,姚琳,王联珠,曲梦,李风铃,谭志军,江艳华,王鹏. 2023

[19]华南沿海牡蛎重金属含量特征及其风险评估. 王增焕,林钦,王许诺,李刘冬. 2011

[20]广东省主要养殖贝类体微量元素含量及其风险分析. 王许诺,陈成桐,王增焕. 2016

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国水产科学研究院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台