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草菇β-木糖苷酶活性及其编码基因xyl的转录表达研究

文献类型: 中文期刊

作者: 王孟兰 1 ; 赵妍 2 ; 黄建春 3 ; 陈明杰 4 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院食用菌研究所

2.农业部南方食用菌资源利用重点实验室

3.上海市农业遗传育种重点开放实验室

4.南京农业大学生命科学学院

关键词: 草菇;β-木糖苷酶;实时荧光定量PCR;生物信息学

期刊名称: 食品工业科技

ISSN: 1002-0306

年卷期: 2014 年 35 卷 24 期

页码: 203-207

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究首先对草菇β-木糖苷酶编码序列Xyl进行了生物信息学分析,然后以对硝基木糖苷为底物测定了不同菌株中的木糖苷酶活性,并进一步比较了木糖苷酶基因xyl在草菇不同菌株中的相对表达量。结果表明:Xyl属于糖苷水解酶第43家族,由534个氨基酸残基组成,预测分子量为58.82ku,等电点为4.99;系统进化树分析表明,Xyl的氨基酸序列与木腐菌相似性较高,最高值达到61%,且草菇与木腐菌黄孢原毛平革、毛韧革菌等亲缘关系较近,但与同为草腐菌的灰盖鬼伞遗传距离较远;草菇不同菌株的β-木糖苷酶活性测定结果显示,Vb1的β-木糖苷酶活性最高,0229的β-木糖苷酶活性与A8之间无显著性差异;Real-time PCR结果显示,Vb1的xyl基因相对表达量也最高,三个菌株的xyl基因相对表达量依次为Vb1>A8>0229。

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