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南方灵芝中一种新型免疫调节蛋白的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王莹 1 ; 高英女 1 ; 汪滢 1 ; 李燕 1 ; 唐利华 1 ; 白睿 2 ; 鲍大鹏 1 ;

作者机构: 1.国家食用菌工程技术研究中心

2.上海海洋大学食品学院

关键词: 南方灵芝;理论预测;结构特征;免疫调节蛋白

期刊名称: 食用菌学报

ISSN: 1005-9873

年卷期: 2016 年 23 卷 03 期

页码: 25-29+79

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用生物信息学方法从蛋白质基本理化特性、信号肽和亚细胞定位、分子进化与翻译后修饰位点以及蛋白质三维结构等方面,对南方灵芝(Ganoderma australe)中免疫调节蛋白c13717进行预测分析,并将c13717蛋白的分析结果与三种典型的真菌免疫调节蛋白(LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo)以及牛樟芝(Antrodia camphorata)中免疫调节蛋白ACA进行比较分析。结果发现,c13717蛋白相对分子质量为14150,N端具有信号肽,亚细胞定位于细胞外,遗传进化与ACA相近,而与LZ-8、Fip-fve和Fip-vvo较远,翻译后修饰位点较少,蛋白三维结构含有cerato-platanin(CP)结构域,不具有真菌免疫调节蛋白典型的FNIII结构,证明c13717蛋白不属于真菌免疫调节蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)家族,而属于CP蛋白家族,可能具有独特的生物活性。

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