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不同激素处理下青花菜lncRNA内参基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 冯鹏宇 1 ; 裴徐梨 1 ; 焦鹏 1 ; 唐征 2 ; 荆赞革 1 ; 徐胜光 1 ; 宋立晓 3 ; 杞汝春 1 ; 徐谦 2 ;

作者机构: 1.昆明学院农学与生命科学学院

2.温州科技职业学院农业与生物技术学院

3.江苏省农业科学院农产品质量安全与营养研究所

关键词: 青花菜;内参基因;长链非编码RNA;qRT-PCR;激素处理

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2025 年 53 卷 010 期

页码: 36-42

收录情况: 北大核心

摘要: 为了筛选青花菜不同激素处理条件下稳定表达的内参基因,为青花菜lncRNAs相关分子研究提供参考,通过qRT-PCR技术检测不同激素处理的青花菜中16个候选内参基因的表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件分析内参基因的稳定性和最适内参基因的数目,再通过RefFinder网站综合评估内参基因,最终确定理想的内参基因。结果表明,XLOC_007087、XLOC_015579和XLOC_008536基因的CT值变化范围最小。GeNorm算法认为XLOC_008536在6-BA、ABA、IAA、NAA处理中表达稳定性较好;XLOC_037050在MEJA、SA处理中表现的稳定性较好。NormFinder计算出NAA、ABA处理下XLOC_037050最稳定;6-BA处理下,基因XLOC_021473最稳定;MEJA处理下,最稳定的基因为XLOC_010342;SA处理下,XLOC_034687最稳定;IAA处理下,XLOC_029328最稳定。BestKeeper显示,在6-BA、MEJA处理下,表达最稳定的基因是XLOC_007087;NAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_015579;ABA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_012179;SA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_010342;IAA处理下,表达最稳定的基因为XLOC_007980。3个软件的分析结果不尽相同,RefFinder综合分析结果显示,在NAA和ABA处理下适宜的内参基因为XLOC_037050;MEJA处理下适宜的内参基因为XLOC_010342;6-BA处理下适宜的内参基因为XLOC_021473;SA处理下适宜的内参基因为XLOC_034687;IAA处理下适宜的内参基因为XLOC_007980。4个软件综合分析认为,在不同激素胁迫中适宜的内参基因组合为XLOC_008536和XLOC_007087。

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