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海洋假单胞杆菌HW08基因组文库的构建及序列功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郝建华 1 ; 刘均忠 1 ; 王芳 1 ; 纪晓峰 1 ; 孙谧 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 海洋假单胞杆菌;基因组文库;序列分析

期刊名称： 湖南农业科学

ISSN： 1006-060X

年卷期： 2012 年 09 期

页码： 10-13

摘要： 通过超声波处理HW08基因组,将获得的1～2 KB DNA片段与pUC18质粒进行连接后转化,构建文库。随机筛选200个克隆进行序列测定,快速分析了海洋假单胞杆菌HW08基因组。结果表明:构建了HW08菌株的基因组部分文库,获得序列173个,包含7个载体序列和7个重叠群,其中最长重叠群为重叠群4,包含3段基因序列,分别为Chemotaxis Protein、Hypotheticalprotein和LacI family transcription regulator。重叠群3为DNA修复蛋白,其最大相似性为83%。166个序列中酶类占绝大部分,同时也包含37个新基因。

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