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“沪农灵芝1号”聚酮合酶特异性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 龚明 1 ; 鲍大鹏 1 ; 唐传红 1 ; 张劲松 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室

关键词： 灵芝;比较基因组分析;次级代谢;PKS;通路富集分析

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 1-5+99

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对"沪农灵芝1号"(简称沪灵芝)(Ganoderma lucidum SH)等10个代表性的担子菌物种进行全基因组次级代谢物(secondary metabolite,SM)簇分析,结果显示沪灵芝聚酮合酶(polyketide synthases,PKS)的骨架基因以及SM簇的数量分别为5和3,高于其它物种,并且都位于支架的末端。通过生物信息学分析发现,PKS7和9的SM簇只在沪灵芝中分布;只有PKS7的SM簇(PKS7簇)的骨架基因具有完整的I型PKS功能模块;只有PKS7簇的骨架基因具有单拷贝直系同源性;PKS7簇的功能注释基因在不饱和脂肪酸生物合成通路中富集。这些结果表明PKS7簇为沪灵芝特异性的SM簇,可能代表了沪灵芝抗逆性强的分子特征。

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