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运用SSR分子标记分析蛹虫草遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 何华奇 1 ; 刘敏祥 1 ; 汪滢 1 ; 茅文俊 1 ; 鲍大鹏 1 ;

作者机构： 1.安徽科技学院生命科学学院;国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 蛹虫草;Simple Sequence Repeats(SSR);遗传相似系数(GS);聚类分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2017 年 11 期

页码： 2195-2202

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以蛹虫草全基因组为模板查找Simple Sequence Repeats(SSR)位点并设计筛选引物进行聚类分析。从100对SSR引物中选出30对多态性高、重复性好的SSR引物,共获得215条多态性条带。根据遗传相似系数(GS)采用不加权成对群算术平均法(UPGMA)进行遗传相似性聚类:材料间GS值的变化范围为0.527~0.995,以GS值为0.761水平可将46株蛹虫草分为6类;菌株亲缘关系与地域来源有一定相关性,且栽培菌株多为同一品种。

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