文献类型： 中文期刊

作者： 杨沁閻 ¹ ; 李巧珍 ² ; 向泉桔 ¹ ; 尚晓冬 ² ; 章炉军 ² ; 辜运富 ¹ ;

作者机构： 1.四川农业大学资源学院

2.上海市农业科学院食用菌研究所/农业农村部应用真菌资源与利用重点开放实验室/国家食用菌工程技术研究中心

关键词： 香菇子实体;农艺性状;GWAS;SNP;候选基因

期刊名称： 四川农业大学学报

ISSN： 1000-2650

年卷期： 2024 年 42 卷 006 期

页码： 1280-1291

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为有效利用分子辅助育种技术提高香菇产量，挖掘定位SNP位点与候选基因。【方法】以“沪香F2”自交后代的100株菌株为研究对象，采用全基因组重测序获得供试菌株的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）数据，结合在栽培过程中统计的子实体产量相关性状表型数据，开展单性状全基因组关联分析（genome wide association study, GWAS）。【结果】定位到产量性状相关的主效区间位于1号染色体2 585 129～4 051 693区段，共有1 306个显著SNP位点；定位到与菇蕾性状中一潮平均蕾数关联的29个SNP显著位点，与一潮现蕾天数性状关联的199个SNP显著位点；定位到与菌棒品质性状中的软硬度性状关联的109个SNP显著位点，与转色性状关联的29个SNP显著位点；筛选到与产量性状相关的12个候选基因，与菇蕾性状相关的10个候选基因，与菌棒品质性状相关的2个候选基因。【结论】首次利用GWAS分析香菇单亲本群体，为改良香菇产量提供有效的候选分子标记，有利后续分子辅助育种开展，同时为后续功能基因精细定位奠定了基础。