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基于SNP分型的香菇交配型AS-PCR鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 张美彦 1 ; 宋春艳 1 ; 于海龙 1 ; 谭琦 1 ; 徐珍 1 ; 王瑞娟 1 ; 章炉军 1 ; 尚晓冬 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点实验室

关键词： 香菇;交配型;单核体;SNP;AS-PCR

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2019 年 002 期

页码： 1-9,2

收录情况： 北大核心

摘要： 目前食用菌的交配型鉴定通常采用单核体两两交配后镜检观察锁状联合的方式进行,工作量大,耗时长且易产生人为误检.本研究以香菇(Lentinula edodes)菌株"申香215"为例,通过对需鉴定交配型的单核体的双核体亲本菌株进行基因组重测序,获得双核体交配型A和B因子区域的序列比对信息,对交配型因子等位基因内部的SNP位点进行统计分析,选择合适位点设计引物,采用等位基因特异PCR(Allele-specific PCR,AS-PCR)技术,根据扩增结果可快速确定单核体的交配型并排除双核体和杂合体.用该方法鉴定香菇单核体的交配型,提高了鉴定效率和准确率,该方法可作为分子标记辅助育种的一种手段,为食用菌遗传育种工作提供新的技术支撑.

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