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基于全基因组的金针菇光受体基因鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘建雨 1 ; 李婧霆 2 ; 陆欢 1 ; 于海龙 1 ; 宋春艳 1 ; 李巧珍 1 ; 张丹 1 ; 徐珍 1 ; 尚晓冬 1 ; 王瑞娟 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部应用真菌资源与利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心

2.上海海洋大学食品学院

关键词： 金针菇;基因鉴定;光受体;表达分析

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 759-769

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 在金针菇全基因组中鉴定到4个蓝光受体基因和1个红光受体基因。分别对5个基因的序列进行生物信息学分析，包括基因一级结构分析、保守结构分析、亚细胞定位预测以及跨膜区分析。亚细胞定位结果显示金针菇蓝光受体FfWC-1和红光受体FfPhy同时存在于细胞质和细胞核中，其他3个光受体定位于细胞质中；跨膜区分析显示5个光受体都没有跨膜区。组织表达分析FfWC-1、FfWC-2和FfCry-DASH主要在成熟菌盖中表达，FfCpl和FfPhy主要在菌丝中表达。经蓝光处理和红光处理后，5个基因的表达模式也各不相同。在金针菇基因组中未发现有VIVID基因和绿光受体基因。本结果为进一步研究金针菇乃至食用菌的光生物学特征提供了分子理论基础。

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