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基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异

文献类型： 中文期刊

作者： 杨驰 1 ; 马璐 1 ; 肖冬来 1 ; 江晓凌 1 ; 刘晓瑜 1 ; 林衍铨 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心

关键词： 绣球菌;基因组;测序;单核苷酸多态位点;小片段插入缺失

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 3246-3255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求。绣球菌新品种‘SP-A’是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究。本研究利用高通量测序技术,对‘SP-A’全基因组进行测序,获得了1.58Gb高质量测序数据,Q30达到95.55%。与‘闽绣1号’参考基因组平均比对率为76.86%,平均覆盖深度为28X,基因组覆盖度为93.51%,共检测到273587个单核苷酸多态位点,40772个小片段插入缺失位点,这些变异共导致了7954个基因变异。研究初步揭示了‘SP-A’的基因组特征,为相关分子标记筛选及辅助育种、遗传分析和功能基因克隆提供了重要的分子标记资源。

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