科研产出
滤食性贝类贝壳总碳、有机碳含量及其降解速率初探
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：海水养殖滤食性贝类的贝壳碳含量占其总生物质碳的63.44%～92.64%，其在固碳和碳封存中的潜力成为研究热点，然而，关于贝壳不同部位的碳含量及贝壳的碳封存效率尚不清晰。本研究于2022年9月在桑沟湾采集紫贻贝（Mytilus edulis）、栉孔扇贝（Chlamys farreri）、虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）、长牡蛎（Crassostrea gigas）、菲律宾蛤仔（Ruditapes phlippinarum）和毛蚶（Soapharca suberenata） 6种滤食性贝类，利用元素分析仪测定了贝壳不同部位（边缘、壳顶和整个贝壳）的总碳和有机碳含量，通过室内自然降解法测定了贝壳总碳和有机碳降解速率。研究结果显示，不同种类贝壳中总碳和有机碳的含量不同，6种贝壳的总碳和有机碳含量范围分别为11.31%～13.37%和0.53%～2.17%，其中，紫贻贝总碳与有机碳含量均显著高于其他5种贝类，而这5种贝壳的总碳含量无显著性差异（P>0.05），毛蚶有机碳含量显著高于其他4种贝类贝壳（P<0.05）。紫贻贝壳顶部的总碳与有机碳含量均显著低于壳边缘部分（P<0.05）；毛蚶壳顶部的有机碳含量显著低于壳边缘部分（P<0.05），其他4种贝壳各部位间的总碳、有机碳含量差异不显著（P>0.05）。贝壳总碳和有机碳的降解速率因种类而不同，有机碳含量越高，总碳的降解速率越大。6种贝壳总碳降解速率常数(k445)在0.021 9～0.080 3 a–1之间，平均值为（0.051 1±0.022 1） a–1。其中，毛蚶的总碳降解速率最大，菲律宾蛤仔的降解速率最小。贝壳有机碳k445在0.032 9～0.609 6 a–1之间。毛蚶的有机碳降解速率最大，牡蛎的降解速率最小。研究结果为评估我国海水养殖滤食性贝类的碳封存效应提供了数据支撑。
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辽东湾北部海域鱼类早期资源群落结构及其与环境因子关系
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了解辽东湾北部海域鱼类产卵现状和适宜产卵生境,基于14个航次的鱼卵、仔稚鱼调查数据,采用聚类分析、非度量多维标度排序(NMDS)、相似性百分比分析等方法解析鱼卵、仔稚鱼群落结构;采用典范对应分析及曼特尔检验等方法分析鱼卵、仔稚鱼时空分布特征及其与海表底温、海表底盐、水深、辽河月径流量和浮游生物湿重等环境因子的关系.结果显示,调查期间辽东湾北部海域共记录鱼类早期资源51种;鱼卵与仔稚鱼群落结构在年内呈现显著月间更替,各月种类更替率均不低于50%,月间平均相异性均超过71.2%;NMDS和基于月份的聚类分析结果表明鱼卵可划分为3个群组,仔稚鱼可划分为4个群组.辽东湾北部海域主要产卵期为5月下旬至7月下旬及12月,鱼类早期资源优势种不突出,主要产卵种类为方氏云鳚(Pholis fangi)、玉筋鱼(Ammodytes personatus)、(鲮)(Planilaza haematocheilus)、斑鰶(Konosirus punctatus)、鳀(Engraulis japonicus)、蓝点马鲛(Scomberomorus niphonius)、赤鼻棱鳀(Thryssa kammalensis)、黄鲫(Setipinna tenuifilis)、叫姑鱼(Johnius grypotus)和短吻红舌鳎(Cynoglossus joyneri).主要产卵场位于锦州湾至白砂湾以北的小凌河、大凌河、辽河和大辽河的河流入海口附近海域以及连山湾-太平湾以北海域.海表温、辽河月径流量和水深是影响鱼类早期资源群落结构时空变化的主要环境因子.海表温对于调查海域鱼类早期资源的时空分布具有重要影响,并主导产卵鱼种适温属性由暖温性至暖温性-暖水性向冷温性更替.黄鲫、叫姑鱼卵和斑鲦、赤鼻棱鳀、(鲮)仔稚鱼空间分布与海表温呈正相关;鳀、蓝点马鲛鱼卵和方氏云鳚、玉筋鱼仔稚鱼空间分布与海表温呈负相关.辽河月径流量主导海域盐度梯度和营养盐的丰富程度,进而间接影响鱼卵仔稚鱼时空分布.短吻红舌鳎、叫姑鱼卵和斑鰶、方氏云鳚、赤鼻棱鳀仔稚鱼与辽河月径流量呈正相关,蓝点马鲛卵和玉筋鱼仔稚鱼与辽河月径流量呈负相关.水深与水体理化特征和生物群落结构密切关联,显著影响鱼类产卵场选择.叫姑鱼、短吻红舌鳎卵和(鲮)仔稚鱼与水深呈正相关,黄鲫鱼卵和斑鰶、赤鼻棱鳀仔稚鱼分布与水深呈负相关.本研究将为辽东湾鱼类早期资源评价与保护研究积累基础数据资料.
关键词： 辽东湾 鱼类早期资源 种类组成 群落结构 环境因子 适宜产卵生境
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鱼类表型组学的发展、现状与挑战
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：鱼类表型组学是在基因组水平上系统研究鱼类表型信息的学科，通过对鱼类表型特征、基因组信息及环境条件之间的联合分析，揭示鱼类应对环境变化的响应及适应机制，可为鱼类的养殖生产实践提供有价值的信息和指标。将鱼类表型组学与基因组学相结合是提高养殖鱼类选择育种效率的有效途径。相较于基因组学研究的快速发展，鱼类表型组学发展相对滞后。由于鱼类特殊的水生环境、较高的养殖密度以及较强的运动能力，导致目前对鱼类表型数据的获取仍存在困难，加之研究群体规模的不断扩大，鱼类表型数据的高通量精准获取和分析更加难以实现，已成为限制鱼类表型组学研究发展的瓶颈。近年来，传感器技术和人工智能的发展为鱼类表型组学研究提供了高通量、无损且精确的方案，可显著提高鱼类表型的分型效率，成为解决这一瓶颈问题的有效方法。本文综述了表型组研究的发展历程，提出了鱼类表型组学的研究策略，整理了鱼类表型组学的研究现状、鱼类表型组数据获取的主流方法，最后提出了鱼类表型组学研究存在的问题及其应用前景，以期丰富对鱼类表型组学的认知，为提升鱼类遗传育种效率提供参考。
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三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)肥满度性状全基因组关联分析及候选基因挖掘
《海洋与湖沼 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)是我国主要的海水养殖蟹类,具有重要的经济价值。肥满度性状是蟹类重要的品质性状,其调控机制尚不明确。测定了同一养殖环境下的298只三疣梭子蟹全甲宽和体重,计算得肥满度范围0.66～1.47,符合正态分布;利用全基因组测序(WGS)技术进行个体基因分型,估计肥满度性状遗传力为0.391±0.158。基于混合线性模型进行全基因组关联分析(GWAS),挖掘到99个与肥满度性状显著相关的SNP位点,主要分布于10号、26号和41号染色体。单倍型分析结果显示, 10号染色体上存在2个强连锁的单倍型,分别包含6个和7个SNP位点,并成功验证了这13个SNP位点的可靠性。进一步分析了单倍型以及CDS区域的基因,共挖掘到lman1、adcy3和cdc6等15个可能与肥满度性状相关的候选基因。研究结果为解析三疣梭子蟹肥满度调控分子机制及良种培育提供了数据支撑。
关键词： 三疣梭子蟹 肥满度 遗传力 全基因组关联分析 候选基因
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长江口及邻近海域百陶箭虫和海龙箭虫的时空共存关系
《海洋渔业 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为阐明长江口及邻近海域百陶箭虫(Sagitta bedoti)和海龙箭虫(S.nagae)时空共存关系，基于2019年11月(秋季)和2020年5月(春季)对该海域浮游动物的调查数据，采用广义可加非线性模型(generalized additive models, GAMs)分析了百陶箭虫、海龙箭虫与环境因子之间的关系，同时利用零模型检验了百陶箭虫和海龙箭虫之间的共存格局。结果表明：秋季，百陶箭虫与温度和盐度显著相关(P<0.05),海龙箭虫与水深和温度显著相关(P<0.05);春季，百陶箭虫、海龙箭虫均与温度和盐度显著相关(P<0.05)。百陶箭虫和海龙箭虫间Pianka指数秋季实测值小于模拟值，但差异不显著(P>0.05),表明百陶箭虫和海龙箭虫之间主要受扩散限制调控机制影响；春季实测值显著大于模拟值(P<0.05),表明百陶箭虫和海龙箭虫主要受环境筛选机制影响。
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鲢粪便对湖泊沉积物N2O通量与微生物群落特征的影响
《水生生物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了解滤食性鱼类粪便对湖泊沉积物N2O排放的影响,收集千岛湖沉积物、水与鲢（Hypophthalmichthys molitrix）粪便,按照不同的配比设置3个实验组,开展为期90d的模拟封闭培养转化实验。通过分析N2O的通量特征、水和沉积物混合物的理化指标、氮代谢酶活性与微生物序列,确定影响氮转化的主要环境因素及关键微生物类群。结果表明,在鱼粪的影响下,水-气界面的N2O排放通量在45d达到最高,随后迅速下降,于45—60d由排放转化为吸收,沉积物中鱼粪的添加比例越大,培养后期对N2O的吸收量越多。鱼粪的添加会显著提高循环系统中可溶性碳与氨氮的浓度,同时降低水体中的DO,显著提高沉积物中4种相关氮转化酶的活性。沉积物的16S rRNA分析表明,添加鱼粪会显著提高沉积物中变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidota）的相对丰度,其中芽孢杆菌属（Bacillus）丰度的提高可能是使沉积物表现出更强的N2O吸收效率的主要原因,为湖泊滤食性鱼类增殖的N2O减排机制提供了理论参考。
关键词： 滤食性鱼类 千岛湖沉积物 N2O排放通量 氮循环 微生物机制 鲢
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淡水定居型刀鲚无间隙基因组组装
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：淡水定居型刀鲚(Coilia nasus taihuensis)又称为湖鲚,终生生活在淡水湖泊中,不需要进行江海洄游也能完成整个生活史过程.栖息生境的差异及长期的地理分割,使得湖鲚与洄游型刀鲚(Coilia nasus)选择了不同的环境适应性进化机制.由于目前缺乏湖鲚的基因组信息,与其环境适应相关的遗传机制缺乏系统研究.本研究以太湖的定居型个体为实验对象,通过Pacific Biosciences(PacBio)high-fidelity(HiFi)测序数据组装得到高质量基因组骨架,利用Hi-C测序数据实现基因组染色体水平的组装,结合Nanopore测序数据进行基因组补洞,最终获得完整的、无间隙的湖鲚参考基因组.湖鲚基因组大小约为834.09 Mb,contig N50高达35.45 Mb,挂载到24条染色体上,挂载率为 99.83%.基因组组装质量评估显示,BUSCO(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs)评估值为 91.90%,表明基因组组装完整性较高.基因组注释特征显示,基因组重复序列总长度为382.39 Mb,占基因组的45.85%,基因结构注释共鉴定21730个蛋白编码基因,其中21666个基因(99.71%)被功能注释.基因组共线性结果显示,刀鲚和湖鲚之间具有极高的基因组共线性比率(96.95%),共鉴定到48852个共线性区块,表明两者之间遗传关系密切.本研究为后续刀鲚适应性机制研究提供素材,为深入开展湖鲚群体遗传学研究提供重要的基因组资源.
关键词： 淡水定居型 刀鲚 无间隙基因组 基因注释 共线性分析
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基于生命周期法的凡纳对虾池塘养殖碳足迹评估
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：海产品在满足人类所需的重要蛋白质食物中发挥了重要作用，海产品在养殖过程中产生较大的碳排放，核算海产品养殖的碳足迹可以建立针对性的减排增汇措施，对实现“双碳战略”具有非常重要的意义。为了探究凡纳对虾（Penaeus vannamei）池塘养殖的碳足迹，本研究通过对山东滨州的养殖池塘进行现场监测、走访养殖企业进行实地调研以及查阅相关文献获得相关基础数据。采用从“大门到大门”的生命周期评价法，核算了山东滨州凡纳对虾养殖系统从池塘建造、养殖阶段及池塘拆除阶段的碳足迹。研究发现，生产1 kg凡纳对虾的碳足迹为5.60 kgCO2e，其中，碳的排放总量为7.69 kgCO2e，来自水体生态系统的碳吸收量为2.09 kgCO2e。主要碳源包括养殖期间肥水所用的鸡粪、配合饲料和生石灰，分别占碳排放总量的73.0%、11.3%和10.7%。建议采用控制鸡粪的使用量、精准投喂和综合养殖（如添加滤食性贝类）的方式以减排增汇、降低碳足迹。
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对虾热应激生理适应机制的研究进展
《海洋湖沼通报(中英文) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：温度是影响生物机体生理功能的重要环境因子之一，随着全球变暖进程加剧，高温胁迫诱发的热应激成为近年来国内外又一新兴课题。对虾养殖业在我国水产业有重要地位，其产量23年位居世界第一，其喜好高温但过高水温带来的热应激也会从生长发育、繁殖、生理代谢等方面产生负面影响，给对虾养殖业带来严重威胁。因此，研究热应激对对虾的影响具有重要意义。本文综述了我国主要养殖对虾品种对热应激的适应策略，以及热应激对对虾生存、机体氧化水平及肠道菌群的影响；分析了在能量代谢、热休克反应、未折叠蛋白反应方面的响应机制，以期为对虾健康养殖及新型养殖模式开发提供参考。
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采样设计对广东近海鱼类物种丰富度估计的影响
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：准确评估海洋生物多样性是渔业管理和生态保护的基础,而采样设计的优化对提升物种丰富度估计精度至关重要.本研究基于2014年8月至2015年5月广东近海四季底拖网调查数据,采用计算机模拟重抽样技术,对比分析简单随机采样(SRS)与分层随机采样(StRS)在不同站点数和采样频次下对鱼类物种丰富度估计的影响.结果表明,物种丰富度探测率在低采样站点数时呈现快速上升趋势,但随着站点数量的增加,其增速逐渐减缓.达到90%的物种探测率,全年四季采样需44个需采样站点;实现80%探测率,三季采样夏-秋-冬或夏-秋-春组合所需站点数最少,为36个.相对估计误差(REE)和相对偏差(RB)的绝对值均随站点数增加而递减.StRS的REE和RB绝对值显著低于SRS(P<0.05).剔除稀有种后,达到90%探测率所需的样站点数减少至20个,且REE和RB绝对值也显著降低(P<0.05),表明稀有种的存在增加了抽样变异性.15种采样组合的分层采样设计效应(De)均小于1,表明StRS在广东近海渔业资源调查中具有更高的采样效率,尤其在采样站点数较少时更为明显.本研究为优化广东近海渔业资源调查的采样设计提供了科学依据,建议根据监测精度需求与成本约束,合理选择站点数与季节组合.
关键词： 渔业调查 简单随机采样 分层随机采样 物种丰富度 广东近海
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