科研产出
甘蓝型油菜FAF基因家族鉴定并挖掘分枝形成相关成员
《农业生物技术学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:FAF基因家族是植物界特有的转录因子之一,具有调节分生组织大小的作用.为研究甘蓝型油菜(Brassica napus)中FAF基因对分枝形成的影响,本研究对甘蓝型油菜FAF家族成员进行了全基因组鉴定和生物信息学分析;以3个多分枝材料和3个少分枝材料为研究对象,提取不同生育期组织部位的总RNA,利用qPCR对BnFAF基因进行了表达模式分析.结果显示,甘蓝型油菜中共有17个BnFAF基因,分布在13条染色体上;基于氨基酸序列的相似度,参考拟南芥(Arabidopsis)FAF基因将BnFAF基因分为Ⅰ~Ⅳ共4个亚家族;基因结构、蛋白结构鉴定表明Ⅳ家族成员的分化较大,而其余亚家族内成员相对保守.qPCR分析发现,BnFAF4-4和BnFAF4-7的表达模式一致,且在多分枝材料薹期茎、上部腋芽和中部腋芽中的相对表达量显著高于少分枝材料,推测这些基因可能影响分枝的形成.本研究为进一步利用FAF基因改良甘蓝型油菜分枝性状提供了理论指导.
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不同富集植物与小麦间作对镉吸收转运的影响
《中国土壤与肥料 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:为探究不同富集植物与小麦间作对镉(Cd)吸收转运的影响,分析单间作种植模式下植物的Cd吸收转运差异,设置了小麦分别与龙葵、苋菜、黑麦草的单间作盆栽试验.结果表明,相对于单作小麦,与龙葵、苋菜间作的小麦地上部Cd含量分别显著增加1.35、1.34倍,根部分别显著增加46.3%、25.9%,与黑麦草间作的小麦地上部Cd含量显著增加1.30倍;另外,与龙葵间作的小麦地上部Cd累积量增加1.13倍,与苋菜和黑麦草间作的小麦各部分Cd累积量显著降低.
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鼠伤寒沙门氏菌LT2 Hfq与fadL、ompN、ybfM mRNA 5'UTR结合位点的预测与验证分析
《福建农林大学学报(自然科学版) 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:通过5'RACE技术分析fadL、ompN、ybfM mRNA的5'UTR,并筛查fadL、ompN、ybfM mRNA 5'UTR中Hfq结合偏好型基序(ARN)n.利用λ-Red同源重组酶和FLP重组酶系统构建fadL、ompN、ybfM基因(ARN)n基序缺失基础上的lacZ基因融合菌株,运用P22噬菌体转导技术构建相应的hfq基因缺失菌株,通过β-半乳糖苷酶试验检测重组菌株的蛋白水平.结果显示,fadL中筛选出ARN-1(AAAAAA)、ARN-2(AAAAATAAT),其缺失降低了fadL的蛋白表达量,分别降低72%、56%;ompN中筛选出ARN-1(GTTTTT)、ARN-2(TCTTTT)、ARN-4(TTTGCT),其缺失提高了ompN的蛋白表达量,分别提高了1.29、1.30、1.07倍,ARN-3(ATTATT)缺失使ompN的蛋白表达量降低了10%;ybfM中筛选出ARN-1(AAGAGG)、ARN-2(AGCAAT)、ARN-3(AGTAAA)、ARN-4(AAAAATAGT)、ARN-5(AACAGAAAG),其缺失均增加了ybfM蛋白水平变化,分别为4.20、3.99、10.90、227.00、46.00倍.结果表明,ybfM、ompN、fadL中(ARN)n位点不同缺失能导致ybfM、ompN、fadL表达水平出现上调或下调,部分(ARN)n序列缺失可影响Hfq对相应靶基因蛋白水平调控作用.
关键词: 沙门氏菌 λ-red同源重组系统 伴侣蛋白Hfq 外膜蛋白
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贵州省野生桑果实品质指标的主成分和聚类分析
《果树学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:[目的]评价贵州省15份野生桑种质资源果实品质,筛选综合品质优良的资源,为果桑新品种选育提供参考.[方法]以15份贵州野生桑资源为试材,测定单果质量、硬度、色泽等7个感官和pH值、出汁率、可溶性固形物含量等8个营养品质指标,并采用主成分分析和聚类分析对其品质指标进行综合评价.[结果]不同野生桑资源果实品质之间存在显著差异,提取的5个主成分累积贡献率达87.998%,可以较好地反映桑椹品质的综合信息.聚类分析将15份野生果桑资源分为了两大类,分类结果与主成分综合得分结果基本一致.[结论]果2、果11、果24、果33等可作为贵州优良果桑种质资源加以利用.
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FaGST基因过量表达获得拟南芥转基因植株
《贵州农业科学 》 2022 北大核心
摘要:[目的]探明FaGST基因的功能和分子调控机制,为其后期的抗性利用与研究提供科学依据.[方法]利用前期构建的pCAMBIA1300-35S空载体和pCAMBIA1300-35S-FaGST过表达载体,将其转化感受态(DH5α)细胞后导入农杆菌GV3101,利用花序侵染法转化拟南芥,通过潮霉素(Hyp)进行筛选、PCR鉴定,并利用实时荧光定量PCR检测其表达量.[结果]FaGST基因成功导入拟南芥中,获得6株空载体转基因拟南芥植株和8株转FaGST基因拟南芥植株;8株转基因拟南芥植株的FaGST基因表达量为1.31~2.06,较野生型拟南芥植株表达量(1.00)显著或极显著提高.[结论]成功获得拟南芥转基因纯合植株,FaGST基因在拟南芥植株中已过量表达.
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生物絮团系统中不同养殖比例对松浦镜鲤营养及生理指标的影响
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:[目的]研究喀斯特山区生物絮团系统中池塘不同养殖比例对主养鱼松浦镜鲤肌肉营养成分、消化酶活性、抗氧化指标及血清生化指标的影响,为生物絮团的生产应用提供理论依据和数据支撑.[方法]在池塘生物絮团系统中设置3种不同养殖比例,即松浦镜鲤与鲢鱼、鳙鱼和草鱼按照80∶20、75∶25、70∶30投放鱼苗,养殖190 d时比较不同养殖比例浦镜鲤的肌肉营养成分、消化酶活性和抗氧化酶活性.[结果]不同养殖比例间松浦镜鲤肌肉成分差异不显著(P>0.05).前肠和后肠的消化酶活性不同养殖比例间差异不显著,均以75∶25的较高;中肠的消化酶活性中,75∶25的蛋白酶活性显著高于70∶ 30,与80∶ 20间差异不显著,其他消化酶活性无显著变化;肝脏抗氧化指标中,丙二醛含量75∶ 25显著高于70∶ 30(P<0.05),与80∶ 20间差异不显著;超氧化物歧化酶活性3个处理间差异不显著,但以75∶25的最高.血清生化指标除75∶25血清白蛋白含量显著高于70∶ 30和80∶20外(P<0.05),其他指标间差异不显著.[结论]生物絮团系统中,松浦镜鲤与其他鱼类按照75∶25投放时的蛋白酶活性、抗氧化能力、免疫能力高于其他处理.松浦镜鲤与鲢鱼、鳙鱼和草鱼按75∶25的投放比例较适宜松浦镜鲤生长.
关键词: 生物絮团 养殖比例 松浦镜鲤 肌肉成分 抗氧化活性 血清生化指标 消化酶活性
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贵州省油菜育成品种系谱分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:农作物品种系谱蕴含亲本来源、亲缘关系等大量信息,对揭示品种演变规律并最终指导育种实践具有重要意义.为了阐明贵州省1930-2019年油菜育成品种系谱关系,并提炼出核心亲本和骨干亲本.本研究对贵州省过去90年间油菜育成品种的信息进行搜集整理,运用相关性和分层聚类分析、系谱溯源分析以及分子标记聚类分析等方法,明确了贵州省90年间共育成油菜品种124个,其中在贵州省审定的油菜品种可明显分为早熟和中晚熟2类,随着育种进程的发展,品种的生育期、株高、一次有效分枝数、单株角果数和角粒数等5个性状均呈显著升高趋势,至"十二五"后呈现降低趋势;而千粒重则呈现减小趋势,含油量和单产则一直持续得到提升.124个品种源自133个祖先亲本,其中'Oro'、'胜利油菜'、'Marnoo'和'甘蓝型油菜737'等10个祖先亲本属于核心亲本;直接亲本共有149个,包含'117A'和'甘蓝型油菜737'等5个骨干亲本.本研究发现,单株有效角果数和角粒数对贵州省育成品种的单产贡献较大,在现有育种基础上,提高千粒重可能是实现单产突破的有效途径;直接亲本中,'117A'、'中双2号'和'甘蓝型油菜737'适合选育母本,而'黄籽双低94-2'和'中双4号'比较适合选育父本.本研究结果为未来油菜种质创新和育种提供重要参考信息.
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缓效和速效氮配施对春玉米产量、养分积累及氮肥利用的影响
《玉米科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:为研究稳定性缓释肥与尿素配施的玉米增产增效效应,采用田间试验,设5种处理,CK(不施肥)、NPK(习惯施肥)、80%C(80%缓释肥)、60%C+20%Ub(60%缓释肥+20%尿素基肥)和60%C+20%Ut(60%缓释肥+20%尿素追肥).结果 表明,60%C+20%Ut处理能够增加有效行粒数和百粒重,显著提高春玉米产量,达10256 kg/hm2.各处理玉米整株养分含量和积累量均表现出氮>钾>磷,玉米养分积累量以玉米子粒和叶的氮积累量最高,分别为153.87、106.76 kg/hm2;玉米茎对K的积累量最多,以60%C+20%U处理最高,为83.75 kg/hm2;60%C+20%Ub和60%C+20%Ut处理均能提高氮肥农学效率、偏生产力、表观利用率和氮收获指数;在经济效益上,60%C+20%Ut处理的纯收入最高.综上,在贵州黄壤区氮肥减量20%下的缓释肥和尿素配施更能促进玉米高产,达到减氮增产增效的目标.
关键词: 春玉米;氮肥运作;产量;肥料利用效率
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鼠伤寒沙门氏菌LT2 Hfq与fadL、ompN、ybfM mRNA 5′UTR结合位点的预测与验证分析
《福建农林大学学报(自然科学版) 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:通过5′RACE技术分析fadL、ompN、ybfM mRNA的5′UTR,并筛查fadL、ompN、ybfM mRNA 5′UTR中Hfq结合偏好型基序(ARN)n.利用λ-Red同源重组酶和FLP重组酶系统构建fadL、ompN、ybfM基因(ARN)n基序缺失基础上的lacZ基因融合菌株,运用P22噬菌体转导技术构建相应的hfq基因缺失菌株,通过β-半乳糖苷酶试验检测重组菌株的蛋白水平.结果显示,fadL中筛选出ARN-1(AAAAAA)、ARN-2(AAAAATAAT),其缺失降低了fadL的蛋白表达量,分别降低72%、56%;ompN中筛选出ARN-1(GTTTTT)、ARN-2(TCTTTT)、ARN-4(TTTGCT),其缺失提高了ompN的蛋白表达量,分别提高了1.29、1.30、1.07倍,ARN-3(ATTATT)缺失使ompN的蛋白表达量降低了10%;ybfM中筛选出ARN-1(AAGAGG)、ARN-2(AGCAAT)、ARN-3(AGTAAA)、ARN-4(AAAAATAGT)、ARN-5(AACAGAAAG),其缺失均增加了ybfM蛋白水平变化,分别为4.20、3.99、10.90、227.00、46.00倍.结果表明,ybfM、ompN、fadL中(ARN)n位点不同缺失能导致ybfM、ompN、fadL表达水平出现上调或下调,部分(ARN)n序列缺失可影响Hfq对相应靶基因蛋白水平调控作用.
关键词: 沙门氏菌 λ-red同源重组系统 伴侣蛋白Hfq 外膜蛋白
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薏苡黑粉菌基因组测序揭示其物种分类及适应性进化
《菌物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:以薏苡黑粉菌病瘿为研究对象,采用固体和液体培养方法对薏苡黑粉菌进行分离纯化培养和形态观察;利用Illumina、Pacbio测序和Hi-C辅助基因组组装技术对黑粉菌进行测序、组装和注释,分析其基因组结构和组成特征。通过与其他6个黑粉菌物种基因组进行比较基因组学研究,分析薏苡黑粉菌的基因家族进化和系统发育关系。在pH 7的固体PDA和液体PDB培养基中实现了薏苡黑粉菌的纯化培养,固体培养菌落表现为白色、表面隆起、具褶皱,较湿润且不透明的形态特征。Illumina、Pacbio和Hi-C组装结果显示,薏苡黑粉菌具有20对染色体(2n=40),基因组大小20.093 417 Mb,GC含量53.81%;共预测和注释到7 476个蛋白编码基因和164个非编码基因,占整个基因组长度的61. 02%和0. 285 3%;查找到3 674个散在重复序列和8 139个串联重复序列,分别占整个基因组长度的2.7544%和1.6054%。同源基因家族聚类显示,7个黑粉菌物种Ustilagocoicis、U. bromivora、U. maydis、U. hordei、Sporisoriumreilianum、S. scitamineum和S. graminicola的编码基因被聚类为6999个基因家族,其中共有基因家族5 379个。薏苡黑粉菌包含5 339个单拷贝基因、105个多拷贝基因、89个特异基因、752个其他基因和188个未分类基因。基因家族进化和系统发育聚类表明,薏苡黑粉菌U. coicis在~60.9MYA分化出来,与雀麦黑粉菌U. bromivova、大麦坚黑粉菌U. hordei聚为一支,表现为更近的亲缘关系;而玉米黑粉菌U. maydis在~66. 6 MYA分化出来与3个孢堆黑粉菌物种S. scitamineum、S. graminicola和S. reilianum聚为一支。
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