科研产出
基于sRNA的脊尾白虾对低温胁迫的响应研究
《海洋渔业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：由于季节更替或天气骤变，水温骤降时有发生，养殖虾类很容易受到低温胁迫，sRNA分析可为其抗逆分子机制的探索提供新的技术手段。研究了低温胁迫对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)微小核糖核酸Micro RNA(mi RNA)及其对应靶基因表达的影响，筛选可能与低温调控关联的mi RNA，对体质量(1.27±0.15) g的脊尾白虾进行低温(0℃)处理4 h，对照组水温维持在25℃，sRNA测序得到20.45M bp过滤序列。通过比对获得55个保守的miRNA和9个非保守的miRNA。定量低温胁迫脊尾白虾miRNA表达丰度筛出11个显著上调的miRNA，其中dme-miR-100-3p miRNA上调幅度最大，其次为dme-miR-2491-5p miRNA。599个靶基因差异表达显著，GO分类发现差异表达miRNA对刺激反应、生物调节、粘附、催化活性和代谢过程等靶基因调控显著；COG分类发现差异表达miRNA对蛋白周转和伴侣蛋白、碳水化合物和氨基酸运输和代谢等靶基因调控显著；KEGG富集分析发现靶基因二氢硫辛酯脱氢酶和乳酸脱氢酶在糖酵解/糖异生、丙酮酸代谢、氨基酸代谢和降解等通路得到富集，而靶基因钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶在Wnt信号通路、钙信号通路和ErbB信号通路等得到富集。结果表明，低温环境下差异表达miRNA和相关靶基因在脊尾白虾的跨膜信号转导、蛋白质代谢和碳水化合物代谢等环节的调控中发挥着重要作用，因而推测低温通过脊尾白虾miRNA上调细胞糖酵解和三羧酸循环途径促进体内蛋白质和碳水化合物等底物分解供能来适应逆境。研究结果可为进一步探究脊尾白虾低温胁迫下miRNA差异表达及其功能奠定基础。
全文链接
请求原文
基于生态通道模型的铁港春秋季生态系统对比研究
《海洋渔业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：根据2021年春季和秋季铁港渔业资源与生态环境现场调查数据，利用Ecopath with Ecosim （EwE 6.5）,构建了两个季节铁港港湾生态能量通道模型，分析了两个季节之间铁港港湾生态系统的结构和能量流动特征。设定春季为16个功能组，秋季为20个功能组，涵盖铁港港湾生态系统能量流动的整个过程。结果表明，秋季的能量转化效率远高于春季，秋季各功能组营养级水平及营养转化效率比春季均有上升。春季和秋季生态系统总能流分别为11 419.57 t·km-2·a-1和7 314.99 t·km-2·a-1,各功能组营养级范围分别在1.00～3.66和1.00～4.34,均以牧食食物链为主要能流通道。浮游植物是系统能量的主要贡献者，高营养级功能组在生物量、生产量和能量流动方面占比较小，秋季渔业资源组份平均营养级在Ⅱ和Ⅲ之间。浮游植物、大部分底栖生物等处在能量流动关键位置的生物对多数功能组起到积极作用。综上所述，春季和秋季铁港港湾生态系统的能量利用率较低，仍有较多剩余生产量未被充分利用，其生态系统处于不成熟的发育阶段。
全文链接
请求原文
解冻温度和冷冻保护剂对中华鲟精原干细胞超低温冷冻保存效果的影响
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：中华鲟(Acipenser sinensis)是我国一级重点保护水生动物,其精原干细胞等种质资源冷冻保护技术尚不完善.本研究在前期建立的匙吻鲟(Polyodon spathula)精原干细胞冷冻保存液配方基础上,研究解冻温度、抗氧化剂和抗冻蛋白对中华鲟精原干细胞冷冻保存效果的影响,以期建立高效的中华鲟精原干细胞超低温冷冻保存方法.研究结果表明,实验设置的解冻温度(20、25、30 和 40℃)中 25℃组冷冻保存效果最佳:解冻后细胞数目为(3.86±0.51)×105,细胞存活率可达(96.36±0.53)%;比较不同浓度组(500、1000 和 1500 mg/L)的谷胱甘肽、抗坏血酸和α-生育酚等3种抗氧化剂对中华鲟精原干细胞冷冻保存效果的影响,结果显示,冷冻保存液中添加1000 mg/L α-生育酚的实验组,解冻后得到的细胞数目最多(7.64±0.34)×105,显著高于其他抗氧化剂添加组,细胞存活率可达(92.82±0.72)%;通过比较不同浓度(0.1、1.0 和 10 μg/mL)的两种类型抗冻蛋白(AFPⅠ和 AFPⅢ)对中华鲟精原干细胞的冷冻保存效果,发现添加了 1.0 μg/mL AFPI的实验组解冻效果最好,解冻后得到的细胞数目为(6.85±0.19)×105,显著高于其他实验组,细胞存活率为(86.89±0.73)%.综上所述,中华鲟精原干细胞冷冻保存的最佳解冻温度为 25℃,1000 mg/L α-生育酚作为抗氧化剂,和 1.0 μg/mL AFPI作为抗冻蛋白对其冷冻保存效果最佳.
关键词： 中华鲟 精原干细胞 超低温冷冻保存 解冻温度 抗氧化剂 抗冻蛋白
全文链接
请求原文
许氏平鲉对慢性高温胁迫响应的转录组学分析
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探索许氏平鲉（Sebastes schlegelii）高温胁迫条件下基因表达水平的变化,利用Illumina Hiseq 4000测序平台分别对许氏平鲉高温处理组（温度由18℃缓慢升至27℃后养殖5d）和常温对照组（18℃下养殖）的鳃、肝和肠道组织进行了转录组测序。以|log2fold change|≥1和FDR（false discovery rate,错误发现率）<0.05作为显著差异表达基因（DEGs）筛选条件。在鳃组织中,共筛选出306个DEGs,其中96个基因显著上调,210个基因显著下调;在肝脏组织中,共筛选出806个DEGs,其中382个基因显著上调, 424个基因显著下调;在肠道组织中,共筛选出343个DEGs,其中162个基因显著上调, 181个基因显著下调。3个组织共表达的DEGs有12个。GO功能注释分析结果显示,鳃组织中的DEGs较多富集在蛋白水解作用、胞外区、结构分子活性、受体调节器活性、受体配体活性等功能中;肝组织中DEGs较多富集在脂肪代谢过程、细胞氨基酸代谢过程、细胞质、氧化还原酶活性等功能中;肠道组织中DEGs较多富集在氧化还原过程、胞外区、辅因子结合等功能中。运用逆转录实时荧光定量PCR （RT-qPCR）对10个DEGs的表达量进行验证,结果显示, RT-qPCR结果与转录组分析结果一致,表明转录组分析可靠。本研究为解析许氏平鲉对慢性高温胁迫应激反应的分子机制提供了转录水平上的参考数据。
全文链接
请求原文
构建多元化食物供给体系:渔业潜力空间与中国方案
《农业经济问题 》 2024 北大核心 CSSCI
摘要：树立和落实大农业观、大食物观，渔业作为重要热量和优质蛋白的食物来源，在中国构建多元化食物供给体系中如何制定方案已成为当前亟待研究的重要问题。本文旨在为制定中国渔业方案提供政策依据。首先，从数量、营养、大农业、资源环境四个维度分析了渔业在构建多元化食物供给体系中的潜力空间；其次，依据渔业发展依托的陆地、海洋、陆海交界的资源环境承载空间和渔业产业链价值链的升级空间，全面系统研判挖掘渔业潜力空间存在的压力与挑战；最后，提出中国制定渔业方案，应立足国内陆海统筹整个国土资源空间，放眼世界拓展利用国际规则国际资源，促进渔业可持续发展、优化多元食物供给体系。
关键词： 大农业观大食物观 多元化食物供给体系 渔业潜力空间 可持续发展 中国方案
全文链接
请求原文
澄湖鱼类群落结构特征及多样性分析
《大连海洋大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究澄湖鱼类群落结构特征及多样性特征，于2022—2023年进行4个季度的鱼类调查，并分析了该湖泊鱼类群落结构及多样性特征。结果表明：本次共调查到鱼类37种，隶属于5目7科27属，包含外来物种1种、杂交种1种，鲤科鱼类为优势类群，共28种，鱼类物种组成以定居性、杂食性鱼类为主；鳙(Hypophthalmichthys nobilis)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、刀鲚(Coilia nasus)、似鱎(Toxabramisswinhonis)和似鳊(Pseudobramasimoni)为全年优势种；生物多样性分析显示，Shannon-Wiener多样性指数和Pielou均匀度指数均为春季最高，Margalef丰富度指数为秋季最高；ABC曲线分析显示，澄湖全年整体处于相对稳定状态，秋季生物量-丰度曲线发生交叉，表明秋季澄湖受到轻微干扰。研究表明，澄湖鱼类多样性处于较高水平，鲢、鳙增殖提高了澄湖鱼类群落结构的多样性和稳定性。
全文链接
请求原文
Hi-GLMM的应用对提高疾病性状基因组关联分析检测效率的影响
《东北农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为降低计算复杂度，研究提出一种基于广义线性混合模型新型简化算法——分层广义线性混合模型（Hi-GLMM）。采用基因组最佳线性无偏预测方法（GBLUP）对正态基因组变量估计，获得基因组估计育种值（GEBVs），通过广义最小二乘方法在全基因组范围内逐个关联检验每个标记的加性效应。模拟与实际结果表明：Hi-GLMM可有效控制统计错误，提高二分类性状基因检测效率，并成功检测到与多种疾病显著相关的遗传位点。
关键词： 分层广义线性混合模型 基因组最佳线性无偏预测 基因组估计育种值 二分类性状
全文链接
请求原文
