科研产出
半滑舌鳎抗缪勒氏管激素(AMH)基因的克隆及组织表达分析
《中国水产科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:本研究克隆了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)AMH基因并对其进行表达分析。该基因cDNA序列开放阅读框长为1 563 bp,编码蛋白含520个氨基酸。该蛋白含有TGF-β超家族的特征序列,包含1个AMH-N区域和TGF-β结构域,并在C端生物活性区含有9个保守的半胱氨酸残基。系统进化分析表明,半滑舌鳎AMH和所有鱼类AMH聚为一簇,与鲽形目相似性最高。实时定量结果表明,AMH基因在半滑舌鳎不同组织中有差异表达,在正常雄鱼和伪雄鱼性腺中表达量最高。胚后不同时期性腺的实时定量结果表明,性腺分化之前AMH在精巢中相对表达量较低,70 dph(days post hatching)达到最高峰,而在卵巢中呈现先升高后下降的趋势,预示AMH基因可能在半滑舌鳎性腺发育中起重要作用。较正常雄鱼后代而言,AMH基因在伪雄鱼后代的雄鱼和伪雄鱼性腺中的表达都有升高的趋势,而在雌鱼中无明显差异,也预示其可能参与半滑舌鳎的性反转过程。
关键词: 半滑舌鳎 抗缪勒氏管激素(AMH) 克隆 表达 实时定量


鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株外膜蛋白A基因的克隆及其生物信息学分析
《中国生物制品学杂志 》 2013 CSCD
摘要:目的克隆鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)基因,并进行生物信息学分析。方法根据已发表的细菌ompA序列,通过比对保守区域(88~107 bp,988~1 007 bp)设计简并引物,通过PCR技术从鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株扩增ompA基因核心序列,采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)法扩增ompA基因全长及其上下游序列;应用Vector NTI 9.0对ompA序列进行拼接,应用Vector NTI 9.0、SignalP 3.0对OmpA蛋白的基本参数、信号肽等进行预测分析;通过Blastn分析嗜水气单胞菌GYK1株ompA基因序列与其他菌种ompA序列的同源性,并构建系统进化树及对其蛋白的三维结构进行分析。结果ompA基因全长为2 004 bp,其中包括ORF 1 059 bp,编码352个氨基酸,5′端侧翼序列271 bp,3′端侧翼序列574 bp;OmpA蛋白相对分子质量约37 900,等电点为4.94,OmpA蛋白序列N-末端的前20个氨基酸残基为信号肽序列;根据22种细菌的OmpA蛋白序列构建的系统进化树显示,嗜水气单胞菌GYK1株与嗜水气单胞菌SSU株的亲源关系最近,相似性达95.5%;三维结构分析表明,OmpA蛋白N-末端功能区是由8个反向平行的β-折叠片构成的β-折叠桶;OmpA蛋白Asn25~Ala205片段4个环区的平均柔性显著高于其余部位的柔性。结论成功克隆了鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株ompA基因,并对OmpA蛋白的相关生物信息学进行了分析,为嗜水气单胞菌呈递外源蛋白基因工程疫苗的研究奠定了基础。


青龙斑高位池人工育苗技术研究
《江苏农业科学 》 2013 北大核心
摘要:2011年6月至2012年8月开展8批次青龙斑(斜带石斑鱼♀×鞍带石斑鱼♂)室外高位池人工育苗试验,共购买受精卵5.3 kg,平均孵化率为38.49%,共孵出仔鱼224万尾。其中6批育苗成功,仔鱼经过28~35 d培育,共培育出体长2.0~4.5 cm的鱼苗20.14万尾,仔鱼平均育苗存活率为7.99%。通过试验总结了青龙斑高位池人工育苗技术;阐述了育苗设施、操作管理、环境条件、鱼苗不同发育阶段的饵料、水质调控及饵料生物培育等;讨论了青龙斑人工育苗中关键技术及各时期的主要问题。


长江口中华鲟幼鱼血液水分、渗透压及离子浓度的变化规律
《水产学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:为研究长江口中华鲟幼鱼盐度适应过程及其调节规律,将7月龄幼鱼直接转入0(淡水对照)、5、10和15等4个盐度组中养殖32 d,分别在第0.5、1、2、4、8、16和32天检测幼鱼血液水分、血清渗透压和血清Na+、Cl-、K+的浓度,结果显示,实验过程中,淡水和盐度5组中华鲟幼鱼血液各项指标始终保持一致,未呈现显著性差异。盐度10和15组,中华鲟幼鱼血液水分含量呈先下降后上升趋势,下降程度与盐度呈正相关,16 d时各组幼鱼血液水分无显著性差异。中华鲟幼鱼转入盐度10和15条件下,其血清渗透压与Na+和Cl-浓度的变化趋势一致,表现为先上升后下降,最后达到新的平衡;而血清K+浓度的变化趋势与血清渗透压和Na+、Cl-离子不同,呈现先下降后趋于平稳的趋势。研究表明,中华鲟幼鱼与其他广盐性鱼类一样,其盐度适应过程可分为2个阶段,即临界期和调整期。


海洋脂肪酶ADM47601固定化方法的研究
《海洋与湖沼 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:采用海藻酸钠、壳聚糖、聚乙烯醇和明胶等材料,进行对脂肪酶ADM47601的固定化研究。结果表明,使用壳聚糖固定化脂肪酶,在最优条件为2%(W/V)壳聚糖,10%NaOH,1%乙酸,0.25%戊二醛,每克载体添加840U脂肪酶时,最大固定化酶活力回收率为87.06%。使用海藻酸钠-明胶固定化脂肪,在最优固定化条件下,最大固定化酶活力回收率为54.45%。使用聚乙烯醇固定化脂肪酶,在最优固定化条件下,最大固定化酶活力回收率为33.22%。使用海藻酸钠固定化脂肪酶,在最优固定化条件下,最大固定化酶活力回收率为17.11%。对比四种不同固定化酶方法,脂肪酶活力回收率高度高低顺序为:壳聚糖吸附交联法>海藻酸钠明胶协同包埋法>聚乙烯醇-硼酸法>海藻酸钠包埋法。


脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)不同地理群体的生化遗传分析
《海洋与湖沼 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳方法,进行了中国北方沿海的河北渤海湾、山东莱州湾、山东胶州湾和江苏海州湾4个脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)地理群体间的生化遗传差异分析.结果表明,12种同工酶共有16个基因座位,其中Ldh-1、Adh-1、Sdh-1、s-Mdh-1、Gcdh-1和Me-1共6个座位表现为多态;平均每个座位等位基因有效值Ae=1.22911.3009,平均预期杂合度He=0.13300.1675,平均观察杂合度Ho=0.17970.2474,遗传距离D=0.00500.0345;聚类分析表明,渤海湾群体和莱州湾群体亲缘关系最近,其次为胶州湾群体与海州湾群体.本研究结果表明,脊尾白虾遗传多样性处于较高水平,种质资源状况良好,有利于其种质资源的保护开发及遗传改良.


水产物联服务系统设计与开发
《渔业现代化 》 2013 北大核心
摘要:物联网技术已经开始应用于水产业,然而生产者对现代渔业生产方式转变的认识不够、生产设备投入成本大、传感设备与生产设施设备的性价比差、采集数据不稳定、日常维护难,以及缺乏适用于水产的智能决策技术和工程设备技术等诸多因素阻碍了物联网技术在水产业中广泛应用与成长速度。主要介绍水产物联服务系统的基本设计思想、主要功能及其实现方法,旨在探讨如何快速构架基于物联技术的各种水产事务处理应用系统,以改进以往系统成本高、设备落后、更新换代难、无智能决策技术、生产不适用等缺点,满足水产各行业不同层次物联技术应用的需求。


长洲水利枢纽鱼道功能的初步研究
《水生态学杂志 》 2013 北大核心
摘要:鱼道是解决水坝阻隔鱼类上溯的重要途径之一,过鱼效果的监测是其科学运行的重要环节。2011年和2012年4-6月对试运行阶段的长洲水利枢纽鱼道进行了监测采样;共计采集到鱼类30种,主要优势种类为银飘鱼(Pseudolaubuca sinensis)、歺又鱼(Hemiculter leucisclus)、瓦氏黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、赤眼鳟(Spualiobarbus curriculus)、鲮(Cirrhinus molitorella)、日本鳗鲡(Anguill japonica),青鱼(Mylopharyngodon piceus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙(Aristichthys nobilis)也有出现;体长60~870 mm的个体可以通过鱼道上溯;鱼道中鲢体重达1.5 kg,鲤(Cyprinus carpio)、鲶(Schilbe intermedius)体重达到2.8 kg,采集到最大规格的种类为鳡(Elopichthys bambusa),体长达870 mm,体重7 061 g。监测数据表明,长洲水利枢纽鱼道具有较好的过鱼功能,但监测中未采集到西江重要的洄游性鱼类广东鲂(Megalobrama hoffmanni)。从不同批次监测到的鱼类种类组成及规格上分析,鱼道运行效果明显受水文变化的影响,其运行及效果监测需要充分考虑水文状况及西江鱼类的生态习性。


鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析
《淡水渔业 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析。Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达到显著性相关(P<0.05),12个标记达到极显著性相关(P<0.01)。在38个相关标记中,有27个标记与体重相关,25个标记与体厚相关,14个标记与体重、体厚均相关。对同一标记的不同基因型之间进行多重比较,找到了与两种经济性状相关的基因型。将与性状相关的38个标记与斑马鱼(Da-nio rerio)基因组序列进行BLAST同源性比对,找到10条相似性高且功能已知的EST-SSRs序列(E 关键词:
鲫(Carassius auratus)
EST-SSRs
体重
体厚
同源比对
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1997~2010年广东沿岸牡蛎体Cr时空变化及健康风险评价
《海洋环境科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:通过1997~2010年对广东沿岸17个采样点牡蛎体内Cr含量进行连续的监测工作,分析了粤东、珠江口和粤西沿岸海域牡蛎体内Cr的时空分布特征,应用单因子指数法和HQ风险系数评价了牡蛎体Cr含量的健康风险。结果表明,广东沿海牡蛎样品中Cr的未检出率为17.5%,Cr的浓度范围为ND~1.27×10-6,总体平均值为0.23×10-6,从总体看其出现频率呈明显的偏正态分布(P<0.05)。1997~2006年期间,牡蛎体内Cr的年际变化呈现逐渐降低的趋势,从2006年后略微上升;其空间分布特征表现为珠江口>粤东>粤西。单因子指数和非致癌性风险指数评价结果均小于1,表明广东沿岸牡蛎未受到Cr污染,食用不会对人体具有致癌性风险。

