科研产出
长江垂钓渔业调查研究
《水产学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解长江干流各江段在长江十年禁渔的新形势下垂钓渔业状况，2017—2018年对长江干流872位垂钓者进行了走访调查。结果表明，长江干流垂钓者以中老年人为主，钓具类型主要为手竿和海竿，占钓具总量的80%以上。在长江上游及三峡库区，垂钓者渔具年投入50%以上样本在500元以下；在长江中下游50%以上样本在1 000元以上。长江上游、三峡库区、长江中游和长江下游的垂钓者人数分别估算为2 344、4 764、4 600和6 649位，对应江段年垂钓量分别估算为45.0、294.7、171.1和478.7 t，年垂钓量占对应江段鱼类资源现存量比例分别为8.6%、2.0%、1.8%和3.6%；垂钓对长江上游渔业资源影响相对较大，需要密切关注。为引导垂钓渔业的健康、可持续发展，建议划定禁钓区、禁钓期，建立天然水域钓具、钓法的白名单制度，建立科学的管理体制，深入挖掘传统渔业文化资源、树立垂钓渔业品牌。
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低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析
《水产学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能,在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析,通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系,并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃四个组织中的动态表达特征.结果显示,鲢miR-17a-5p在不同物种间高度保守,预测出381个miR-17a-5p的潜在靶基因显著富集在硫代谢、mTOR信号通路以及萜类骨架的生物合成3个KEGG信号通路上.miR-17a-5p可与HIF-1αmRNA的3′UTR结合,并降低HIF-1αmRNA水平,低氧胁迫下miR-17a-5p的表达呈下降趋势,而HIF-1α表达则呈上升趋势;3个显著富集KEGG通路中的11个miR-17a-5p潜在靶基因在低氧胁迫过程中的不同组织中的表达,尤其是肝脏中的表达,除SGK1外,均呈显著上升趋势.研究表明,低氧胁迫下鲢各组织中miR-17a-5p的表达下调减弱了其对靶基因的抑制作用,进而导致HIF-1α、ddit4和Lrp5等响应低氧胁迫的基因表达上调.本研究为低氧胁迫下鲢miRNA的表达与调控机制提供新见解,也为培育耐低氧的鲢新品系(种)提供了参考.
关键词： 鲢 miR-17a-5p 低氧 双荧光素酶 靶基因 信号通路
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基于微生物菌群调控的枯草芽孢杆菌改善低盐发酵鱼露品质作用机制
《食品科学 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：以高产蛋白酶耐盐菌株Bacillus subtilis B-2作为鱼露发酵剂,研究加菌发酵对低盐鱼露发酵过程中微生物菌群、生物胺和氨基酸态氮(amino acid nitrogen,AAN)的影响.16S rRNA基因高通量测序结果显示,加菌发酵能够显著降低微生物群落的丰富度和均匀度,Bacillus始终占主导地位,腐败微生物丰度显著降低.加菌发酵能够显著抑制组胺、腐胺、尸胺和酪胺的生成,其含量在发酵末期较自然发酵鱼露分别下降了25.9%、35.6%、23.6%和9.3%.加菌发酵可显著增加低盐鱼露的AAN含量,发酵15 d可达1.23 g/100 mL,明显高于自然发酵鱼露(0.79 g/100 mL).相关性网络图分析结果显示,Brevibacterium、Dietzia、Paracoccus、Aequorivita、Brachybacterium丰度的下降是低盐自然发酵鱼露发酵末期微生物菌群多样性下降的主要原因;在低盐自然发酵鱼露和低盐加菌发酵鱼露中,Stenotrophomonas均与多种生物胺呈显著正相关,表明其在低盐鱼露生物胺产生中发挥核心作用.对比两种鱼露发酵末期微生物菌群和品质指标,结果显示,B.subtilis B-2代谢是加菌发酵鱼露腐败微生物种类和丰度下降、AAN含量提高以及关键生物胺含量下降的主要原因.B.subtilis B-2有望开发为鱼露专用发酵剂,用以改善低盐快速发酵鱼露的品质和食用安全性.
关键词： 低盐鱼露 微生物群落 生物胺 氨基酸态氮 相关性网络
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海洋浮游生物介导的弧菌传播扩散机制研究进展
《微生物学通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：弧菌在全球范围内广泛存在，弧菌病的暴发和流行不仅给海水养殖业造成巨大的经济损失，还严重威胁人类健康。一些弧菌可以通过与环境中浮游植物和浮游动物的相互作用提高自身存活率和环境持久性，并进行跨海域传播。本文综述了海洋浮游生物作为部分弧菌物种储库的作用及影响因素，以及气候变化和人类活动等因素驱动下浮游生物间接介导的弧菌传播扩散特性；并重点介绍了弧菌特定的结构、代谢途径和次级代谢产物在其与浮游生物互作过程中发挥的独特作用及其机制；提出今后应从分子层面深入解析浮游生物与弧菌的相互作用机制，从全球尺度阐释浮游生物介导的弧菌跨海域传播机制，建立弧菌疾病传播预测模型和预警系统，为浮游生物介导的弧菌传播扩散风险的防控提供重要信息。
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中国鱼类基因组编辑育种研究现状及存在问题与展望
《水产学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：该文首次系统介绍了我国鱼类基因组编辑育种的研究现状、存在问题和发展前景.首先,作者简要介绍了ZFN(Zinc Finger Nucleases)、TALEN(Transcription Activator-Like Effector Nucleases)和CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)等3种基因组编辑技术的优缺点.其次,提出了鱼类基因组编辑育种的定义和工作流程.第三,作者重点介绍了我国鱼类基因组编辑育种的主要进展.包括我国科学家建立的尼罗罗非鱼、鲤、鲫、半滑舌鳎、团头鲂、南方鲇等多种养殖鱼类基因组编辑育种技术.尤其是利用TALEN和CRISPR技术创制了雌雄反转、颜色不同的罗非鱼,通过TALEN方法创制了半滑舌鳎dmrt1基因突变、生长快速的F3雄鱼新种质,研制出无肌间刺鲫和团头鲂新种质.这些进展使我国鱼类基因组编辑育种与国际上同类研究相比,实现了从过去的跟跑到现在的并跑,甚至在某些鱼类上领跑的转变.作者最后梳理了目前鱼类基因组编辑育种研究中存在的不足和问题,并对我国鱼类基因组编辑育种的未来发展方向进行了展望,提出了今后鱼类基因组编辑育种的研究重点.该文对于推动我国鱼类基因组编辑育种的研究进程,创制基因组编辑突破性新品种具有重要意义和参考价值.
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海鲈混菌发酵工艺优化及其品质分析
《大连海洋大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为改善发酵海鲈(Lateolabrax japonicas)的风味和口感,以植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)和戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)作为外加复合菌株发酵剂,以感官综合评分为评价指标,采用单因素试验与响应面法对海鲈混菌发酵工艺条件进行优化,并进一步探究了接菌发酵对海鲈品质的影响.结果表明:海鲈的最优发酵条件为戊糖片球菌与植物乳杆菌体积比为 2 ∶ 1、接种菌量为 1.0%、发酵时间为 30 h和发酵盐添加量为 3%;在此工艺条件下,与自然发酵海鲈相比,接菌发酵海鲈的a?值由-1.89 增加至-0.94,b?值由 1.71 下降至 1.48,发酵海鲈色泽得到改善;硬度、咀嚼性和胶着性分别由 40.17 g、0.44 mJ、33.27 g增加至 223.33 g、3.29 mJ、219.30 g,发酵海鲈质地得到明显改善;接菌发酵海鲈的总酸和氨基态氮含量分别提升了 23.13%和 40.07%.研究表明,混菌发酵有利于提升海鲈的品质和口感.
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亚硝酸盐和微塑料胁迫对凡纳滨对虾鳃中免疫、解毒代谢和渗透调节相关指标的影响
《南方水产科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：鳃是对虾重要的呼吸器官，是亚硝酸盐毒性效应的主要靶器官，也是微塑料主要富集的部位之一。鳃组织参与了对虾渗透调节、氮排泄、免疫功能等生理过程，对对虾维持机体健康具有重要意义。为研究亚硝酸盐和微塑料单因素及复合胁迫对凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）鳃组织生理功能的影响，将对虾分为对照组、20 mg·L-1亚硝酸盐胁迫组（NIT）、10μg·L-1微塑料胁迫组（MP）、20 mg·L-1亚硝酸盐和10μg·L-1微塑料复合胁迫组（NM），于第14天测定对虾鳃中相关指标变化。结果显示：1)氧化应激指标丙二醛（MDA）、过氧化氢（H2O2）浓度及抗氧化酶超氧化物歧化酶（SOD）、过氧化氢酶（CAT）、谷胱甘肽过氧化物酶（GPx）活性在胁迫后发生不同程度的改变；2)解毒代谢指标细胞色素P450基因（CYP450）和谷胱甘肽S-转移酶基因（GST）相对表达水平在胁迫后发生不同程度的紊乱；3)渗透调节指标如离子转运酶液泡型ATP酶（VATP）、Na+/H+交换体7 （NHE7）、Na+/K+-ATP酶亚基α （NKA-α）、Na+/K+-ATP酶亚基β （NKA-β）、碳酸酐酶（CA）和水通道蛋白TIP4-1 （TIP4）、钙通道蛋白1 （CCP）、氯通道蛋白2 （CLC）、水通道蛋白（AQP）基因的相对表达水平在胁迫后发生不同程度的紊乱；4)细胞凋亡因子基因（CASP-3）相对表达水平在3个胁迫组均显著降低（P＜0.05）。由此推断，亚硝酸盐和微塑料胁迫会诱导凡纳滨对虾鳃中免疫、解毒代谢和渗透调节相关指标变化，进而影响其正常的生理功能。
关键词： 凡纳滨对虾 鳃 亚硝酸盐 微塑料 解毒代谢 渗透调节
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大口黑鲈amh基因全长cDNA克隆、表达及多克隆抗体制备
《水生生物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究大口黑鲈（Micropterus salmoides）抗缪勒氏管激素（amh）基因的表达及其在性腺发育中的潜在作用,研究利用RACE技术克隆得到了大口黑鲈amh基因,并制备Amh多克隆抗体,通过qRT-PCR、Western Blot分析Amh在大口黑鲈不同组织和不同发育阶段性腺中的表达模式,最后利用HE染色法和免疫组化观察不同发育阶段性腺的形态组织学变化及其与Amh表达的潜在关系。结果显示:大口黑鲈amh基因cDNA序列全长2050 bp,由24 bp5′非编码区、394 bp3′非编码区和1632 bp的开放阅读框组成,共编码543个氨基酸。amh基因mRNA在大口黑鲈11个组织中均有表达,其中雄鱼精巢中表达量最高,肌肉次之,雌鱼卵巢中表达量最高,肌肉次之。amh基因在雌雄鱼不同发育阶段的性腺中表达存在显著差异,精巢中表达量均显著高于卵巢（P＜0.05）。同时, Western Blot结果显示Amh蛋白在精巢中表达丰度较高。amh基因在精巢中的表达量呈先上升后下降的趋势,且在孵化后65d鱼精巢中其表达量达到最高（P＜0.05）,免疫组化结果显示Amh表达于早期精巢的支持细胞;孵化后135d和215d雄鱼精巢中其表达量明显下降, HE染色显示雄鱼精巢处于精子细胞生成和精子形变期, Amh主要表达于支持细胞中,精子占据精巢的绝大部分空间,支持细胞所占面积比例减少。amh基因在孵化后45d、65d和135d雌鱼卵巢中表达量较低,孵化后215d表达量上升,并且在卵母细胞的细胞膜边缘及外周的滤泡细胞和颗粒细胞检测到了Amh阳性信号。研究结果表明:在精巢中, Amh可能参与早期精巢发育;在卵巢中,其可能参与颗粒细胞和滤泡细胞发育。综上所述, Amh在大口黑鲈性腺发育中发挥着关键的调控作用。
关键词： amh 基因克隆 组织表达 多克隆抗体 性腺发育 大口黑鲈
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基于帧间深度特征差分的大西洋鲑鱼群活跃度分类模型
《农业机械学报 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：鱼群活跃度是鱼类健康福利养殖的特征性指标之一，实现鱼群活跃度细粒度分类有利于更精细地描述鱼群健康状况、评估鱼群福利水平。基于工厂化循环水养殖系统，本文建立了水下大西洋鲑鱼群活跃度细粒度分类视频数据集，并提出一种基于帧间深度特征差分的鱼群活跃度分类模型，通过引入残差连接的小型卷积神经网络提取视频帧的特征，进而在相邻帧之间做差分运算和平方运算得到视频帧间特征，最后将其输入基于外部注意力机制的分类网络IFDNet中得到视频类别。试验结果表明，本文提出的CNN-IFDNet模型分类准确率达到97.72%,F1值达到97.42%,以较低的计算复杂度实现了对水下视频鱼群活跃度的三分类。相较于实验室环境，基于真实养殖环境对鱼群活跃度所展开的算法研究实际应用性更强，可以为精细化描述鱼群的活跃度、实现智能监测鱼类健康状况提供参考，帮助养殖人员发现并排除导致鱼群活跃度异常的水质环境、病害等因素。
关键词： 鱼类健康福利养殖 鱼群活跃度 分类模型 视频分类 深度特征
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不同致死条件对冷鲜石斑鱼肉品质的影响
《上海海洋大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确致死条件对石斑鱼（Epinephelus lanceolatus）品质的影响，提高石斑鱼冷藏期间的品质，采用5种不同致死方式处理石斑鱼，Ⅰ:冰埋致死；Ⅱ:敲击头部致死；Ⅲ:活石斑鱼经温度梯度18、14、10、6℃（每个温度处理20 min）处理后致死；Ⅳ:活石斑鱼经温度梯度18、12、6℃（每个温度处理20 min）处理后致死;Ⅴ:活石斑鱼经温度梯度18、6℃（每个温度处理20 min）处理后致死，然后将石斑鱼经微冻机迅速将鱼体中心温度降到0℃,于0～4℃冷藏，测定并分析冷藏期间鱼肉的感官评价、质构特性、pH、乳酸含量、巯基含量、挥发性盐基氮（TVB-N）、菌落总数等品质评价指标的变化。结果表明，5组致死处理方式对冷藏期间鱼肉的品质影响显著，由大到小依次是感官评价和TVB-N:Ⅴ组＞Ⅰ组＞Ⅱ组＞Ⅳ组＞Ⅲ组，质构：Ⅳ组＞Ⅴ组＞Ⅱ组＞Ⅰ组＞Ⅲ组，乳酸含量和pH:Ⅴ组＞Ⅰ组＞Ⅱ组＞Ⅳ组＞Ⅲ组，巯基含量和菌落总数：Ⅰ组＞Ⅱ组＞Ⅴ组＞Ⅳ组＞Ⅲ组。说明采用梯度降温的致死处理方式明显优于敲击头部致死和冰埋致死方式，而梯度降温时的温差间隔不宜太大。综合各指标品质评价结果，Ⅲ组的致死方式最好，较小的温差降温方式使石斑鱼死亡的过程应激反应小，乳酸含量、pH和总巯基相对稳定，从而有利于贮藏过程的品质保持，比其他4组更有效延缓质构特性和巯基含量的降低，抑制微生物活性，延长鱼样保鲜期。
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