科研产出
双锯鱼(Amphiprion)胚胎不同发育阶段和成鱼不同组织中内参基因的筛选及应用
《海洋与湖沼 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：双锯鱼(Amphiprion)亦称为海葵鱼,又称为小丑鱼,是一类经济价值较高的海水观赏鱼。目前国内在双锯鱼的胚胎发育、人工饲养以及形态学观察等方面已经取得了有效成果,但在分子生物学水平上对其基因表达的研究较少。为了筛选出适用于双锯鱼胚胎不同发育阶段以及成鱼组织的内参基因,分析酪氨酸酶(TYR)基因的表达情况,以眼斑双锯鱼(A.ocellaris)和白条双锯鱼(A.frenatus)为材料,利用实时定量聚合酶链式反应(qPCR)对18SrRNA、GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因)、Ef-1α(转录延伸因子基因)和β-actin(β-肌动蛋白基因)这4个候选内参基因的表达水平进行检测,同时通过geNorm和Norm Finder软件对其稳定性进行评估,最后以合适的内参基因作为参考,研究TYR mRNA的表达水平。结果表明,在双锯鱼胚胎的不同发育阶段,18S和β-actin的表达量相对于其他基因较为稳定;在双锯鱼的不同组织中,稳定性依次为18S>β-actin>Ef-1α>GAPDH。以18S作为内参基因时分析发现TYR基因的表达在双锯鱼胚胎发育过程中呈先上升后下降的趋势,在体节期表达量最高;在双锯鱼各组织中均有表达,且在眼、尾和红皮中表达量最高。
关键词： 双锯鱼 内参基因 TYR基因 qPCR geNorm Norm Finder
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珠江口万山群岛海域春季渔业资源群落结构特征及其与环境因子的关系
《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：万山群岛海域是我国传统渔场之一,但目前对于该海域的渔业资源状况缺乏深入了解,特别是岩礁性渔业资源数据非常缺乏。本研究于2021年春季在该海域开展了底拖网和三重刺网作业调查,对渔业资源群落组成、优势种及数量分布、生物多样性进行了分析,结果显示:调查共鉴定出渔业生物220种（三重刺网187种,底拖网52种）,隶属于15目72科137属,其中,鱼类和甲壳类分别为176种和38种,分别占总种类数的80.0%和17.3%;相对重要性指数（IRI）分析表明（IRI≥1000为优势种）,三重刺网调查优势种为云斑海猪鱼（Halichoeres nigrescens）和黄斑蓝子鱼（Siganuscanaliculatus）,而底拖网调查优势种为竹筴鱼（Trachurusjaponicus）、短吻鲾（Leiognathus brevirostris）和赤鼻棱鳀（Thryssakammalensis）;三重刺网与底拖网作业渔获的Shannon-Wiener多样性指数（H’）平均值分别为2.50和1.35, Margalef丰富度指数（D）平均值分别为5.85和2.52, Peilou均匀度指数（J’）平均值分别为0.77和0.54;渔业资源群落特征与水温和硅酸盐浓度呈不同程度的正相关性。总体而言,万山群岛三重刺网调查发现的渔业资源种类数和多样性要明显高于底拖网,两种调查方式的渔业资源种类组成差异也较大,万山群岛岩礁性渔业资源丰富,但经济价值较高的岩礁性渔业资源量较少。
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信号分子AI-2对副溶血性弧菌四环素耐药基因接合转移的影响
《食品安全质量检测学报 》 2022 北大核心
摘要：目的 探讨信号分子AI-2对海产品中分离的副溶血性弧菌四环素耐药基因接合转移的影响作用.方法 分别构建经AI-2处理和未经AI-2处理的副溶血性弧菌和大肠埃希氏菌的接合反应体系,通过菌落计数法测定不同浓度AI-2对副溶血性弧菌四环素耐药基因接合频率的影响,采用逆转录实时荧光定量聚合酶链式反应法测定不同浓度AI-2对接合转移调控相关基因转录水平的影响.结果 副溶血性弧菌Vp2015094和Vp2016058的四环素耐药基因可以通过接合作用转移至大肠埃希氏菌K12中,15、30μmol/L浓度AI-2能显著提高Vp2015094的接合频率(P<0.05),6、15、30μmol/L浓度AI-2能极显著提高Vp2016058的接合频率(P<0.01),30μmol/L浓度AI-2能显著提高Vp2015094的接合转移调控相关基因traF的转录水平以及Vp2016058的接合调控相关基因traF、trbB的转录水平(P<0.05).结论 AI-2能增强副溶血性弧菌四环素耐药基因的接合转移,表明AI-2能促进细菌耐药基因的扩散,为建立基于群体感应的细菌耐药性控制技术奠定基础.
关键词： 副溶血性弧菌;信号分子AI-2;四环素耐药基因;接合转移
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尼罗罗非鱼traf6基因表达谱及信号转导（英文）
《水生生物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)是一种重要的接头蛋白,在Toll样受体/白细胞介素-1受体(TLR/IL-1R)超家族所触发的信号通路中起重要作用,与先天性免疫密切相关。文章研究了尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus) traf6的表达模式和初步的功能。在健康鱼中, traf6转录本广泛表达于所有受检组织中,在血液中表达水平最高,在肝脏中最低。在不同的胚胎发育阶段也检测到traf6的表达。在无乳链球菌体内感染后,大多数受检组织中traf6 mRNA的表达量上调。此外, LPS、Poly I:C和S. agalactiae可显著诱导尼罗罗非鱼巨噬细胞traf6的表达。此外,在HEK293T细胞中过表达表明, TRAF6分布于细胞质中,可显著提高NF-κB的活性。免疫共沉淀(Co-IP)实验表明, TRAF6可与IRAK1(白细胞介素-1受体相关激酶1)相互作用, IRAK1在TLR/IL-1R信号通路中也起重要作用。在体内, TLR2、TLR21和TLR13b的过表达可上调traf6 mRNA的表达水平,表明TRAF6参与了TLR2、TLR21和TLR13b介导的信号转导,提示TRAF6在病原体入侵的免疫应答中起重要作用。
关键词： 尼罗罗非鱼 肿瘤坏死因子受体相关因子6 表达谱 免疫反应 NF-κB活性 信号转导
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哈维弧菌flhF和CU052_26825缺失株的构建及其生物学特性
《广东海洋大学学报 》 2022
摘要：[目的]研究哈维弧菌(Vibrio harveyi)345的GTP结合蛋白编码基因flhF和未知功能基因CU052_26825的生物学功能.[方法]利用同源重组技术构建V.harveyi 345的flhF和CU052_26825的缺失突变株,比较野生株和突变株的生长、运动性、胞外酶活性、耐药性等生物学特性以及对花鲈(Lateolabrax japonicus)的毒性.[结果]基因flhF和CU052_26825的缺失均不影响菌株的生长、运动性、胞外蛋白酶活性、对H2O2和Cu2+的压力感应、对铁的吸收利用、对大多数被测抗生素的抗性以及对花鲈的毒性;但flhF和CU052_26825缺失后对氯霉素和氟苯尼考两种氯霉素类抗生素均更加敏感.此外,flhF缺失后,细菌生物膜形成能力显著增强.[结论]flhF和CU052_26825均参与调控哈维弧菌对氯霉素类抗生素的耐药性,flhF还参与调控哈维弧菌生物膜形成.
关键词： 哈维弧菌;基因敲除;flhF;CU052_26825;生物学特性;氯霉素类耐药性
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北极茴鱼形态性状对体重影响效果分析
《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探明北极茴鱼（Thymallus arcticus）形态性状与体重的关系,以1+～3+龄北极茴鱼为研究对象,测定了体重（Y）和体厚（X1）、眼间距（X2）、体长（X3）、体高（X4）、头长（X5）、眼径（X6）、吻长（X7）、尾柄长（X8）、尾柄高（X9）等9个形态性状,利用相关分析、通径分析和多元回归分析等方法,筛选出影响北极茴鱼体重的主要形态性状,并建立回归方程。结果显示:（1）不同年龄阶段,与北极茴鱼体重显著相关（P<0.05）的形态性状种类不同,且数量也随着年龄的增加而降低。（2）通径分析在1+～3+龄北极茴鱼中分别保留了4、4和2个形态性状,1+龄北极茴鱼中体长（X3）的直接作用最大（0.345）,尾柄高（X9）的间接作用最大（0.745）;2+龄北极茴鱼中体高（X4）的直接作用最大（0.473）,体厚（X1）的间接作用最大（0.378）;3+龄北极茴鱼中体厚（X1）的直接作用最大（0.635）,尾柄高（X9）的间接作用最大（0.344）。（3）通径分析保留的形态性状对1+～3+龄北极茴鱼体重的总决定系数较高,分别为0.943、0.778和0.997。（4）多元回归分析拟合出1+龄北极茴鱼形态性状（Xi）与体重（Y）回归方程为Y=-90.510+15.345X1+3.638X3+10.473X4+16.884X9,2+龄北极茴鱼形态性状（Xi）与体重（Y）回归方程为Y=-142.449+29.023X1+81.082X2+27.126X4-47.376X7,3+龄北极茴鱼形态性状（Xi）与体重（Y）回归方程为Y=-228.922+75.063X1+107.864X9。本研究丰富了北极茴鱼基础生物学数据,同时为将来人工养殖利用过程中北极茴鱼的选择育种提供待选形态性状。
关键词： 北极茴鱼 形态性状 体重 相关分析 通径分析 回归分析
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桑沟湾沉积物有机质的碳氮稳定同位素分析及其来源解析
《渔业科学进展 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究分析了桑沟湾表层沉积物的粒度、总有机碳(TOC)、总氮(TN)、碳和氮稳定同位素(δ13C和δ15N)的时空分布特征,估算了贝藻生物沉积对近海沉积物有机质的贡献.结果显示,桑沟湾沉积物成分组成以粉砂为主,且粒径分布与海水养殖和水动力学条件密切相关;TOC、TN的季节变化和平面分布均呈相似性,数值上总体表现为春季最高,秋季最低,季节差异不大,在贝藻、鱼贝和贝类养殖区域出现较高值;而613C和δ15N的季节变化和平面分布有较大差异.从相关性分析可以看出,TOC和TN呈极显著正相关(r=0.955,P<0.001),表明桑沟湾表层沉积物的TOC和TN具有同源性.根据对δ13C和C/N的综合分析表明,贝类生物沉积、海带(Saccharina japonica)和土壤有机质是桑沟湾沉积物有机质的主要来源.采用三元混合模型估算得到贝类生物沉积贡献率为67.52%,土壤有机质贡献率为26.47%,海带贡献率为5.97%.研究表明,海洋贝藻生物沉积对近海碳埋藏具有显著影响.
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基于江苏省河蟹主产区气象因子的产量BP神经网络预测
《农学学报 》 2022
摘要：为提高江苏河蟹主产区产量预测能力,以此为基础制定科学合理的河蟹养殖发展规划,本研究对河蟹主产区附近设立的7个观测台站2013—2017年的气象数据和该区产量数据进行了采集,利用插值法补足少量缺失值,通过主成分分析选取了最能代表江苏省河蟹主产区特点的5个主成分作为研究对象建立BP神经网络,探索其用于江苏省河蟹主产区产量随气象因子变化的规律.结果表明,通过PCA主成分分析降维处理后数据的大部分特点能被BP神经网络学习到,预测值与真实之间的相关系数为0.82267,具备一定的模拟气象因子数据与产量之间的关系的能力.
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三沙湾养殖衍生有机物沉降对多毛类优势种营养生态特征的影响
《海洋渔业 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解三沙湾网箱养殖活动的底栖生态环境效应，利用碳、氮稳定同位素(δ13C和δ15N)示踪结合数学模型方法分析区域内养殖衍生有机物（aquaculture-derived organic matter, AOM）沉降对5种底栖数量优势物种（多毛类的欧努菲虫Onuphis eremita、角海蛹Ophelina acuminata、索沙蚕属一种Lumbrineris sp.、丝异须虫Heteromastus filiformis和不倒翁虫Sternaspis scutata）营养生态特征的影响。结果表明，AOM （包括残饵和粪便）、颗粒有机物和底栖微藻是三沙湾底栖优势物种的潜在食源，各类食源δ13C和δ15N均有显著差异（Kruskal-Wallis检验，P＜0.001）。底栖优势物种的营养级存在显著差异（Kruskal-Wallis检验，P＜0.001）,杂食性索沙蚕属一种和欧努菲虫营养级最高，两者分别为2.79和2.78;底泥食性丝异须虫、角海蛹和不倒翁虫分别为2.62、2.41和1.81。AOM是底栖优势物种的重要食源，对欧努菲虫、角海蛹、索沙蚕属一种、丝异须虫和不倒翁虫的食物贡献率分别为（68.4±17.2）%、（61.7±22.0）%、（54.9±13.4）%、（36.4±8.3）%和（18.3±13.2）%;底栖微藻也为底栖优势物种的重要食源。综上，AOM已是三沙湾底栖生物的重要食源，养殖活动存在较为显著的底栖生态环境效应；自然水域内底栖生物营养生态特征受多种因素影响，食源结构和摄食习性影响三沙湾底栖物种营养级。
关键词： 三沙湾 网箱养殖 底栖生态效应 大型底栖动物 多毛类
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基于MSC.404(96)决议的船舶直升机平台消防设施配置变化分析
《船舶工程 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：结合中国水产科学研究院水产渔业机械研究所100000吨级游弋式养殖工船的直升机平台设计，详细分析了国际海事组织MSC.404（96）决议对船舶直升机平台泡沫灭火设施配置要求的变化，为后续船舶直升机平台的设计提供参考。
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