科研产出
黑番鸭VIPR-1基因单核苷酸多态性与就巢性状的关联性分析
《浙江农业学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：VIPR-1基因是研究家禽就巢性状的重要候选基因,研究选用处在产蛋期、就巢期的黑番鸭为研究对象,通过PCR-RFLP和测序的方法,对VIPR-1基因内含子12进行多态性检测,并分析其与就巢性状之间的关系。结果表明:VIPR-1基因内含子12存在一个AfaⅠ酶切位点,该位点在内含子12的902 bp处发生了C→T的碱基突变,产生了CC,CT和TT三种基因型。通过对产蛋黑番鸭与就巢黑番鸭个体的研究,发现所测产蛋黑番鸭基因型的分布情况为CC(32),TT(40)和CT(42),就巢黑番鸭基因型的分布为CC(18),TT(40)和CT(18),经卡方独立性检验,产蛋黑番鸭与就巢黑番鸭两者之间基因型的分布差异显著(P<0.05)。表明黑番鸭VIPR-1基因第12内含子C902T突变与黑番鸭的就巢性状显著相关。
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猪伪狂犬病毒Taqman-MGB荧光定量PCR检测方法的建立及应用
《中国农学通报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：建立可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法。根据猪伪狂犬病病毒gE基因序列,设计一对特异引物和探针,通过优化反应条件,建立了可区分猪伪狂犬野毒株及基因缺失疫苗株的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法,同时验证该方法的特异性、敏感性、重复性,并对30份疑似病料进行临床检测。本研究所建立的TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法灵敏度可达2.23×10拷贝/μL,比常规PCR检测方法高100倍;与猪圆环病毒2型(PCV2)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖和呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)均无交叉反应,具有高特异性;对30份疑似病料的TaqMan荧光定量PCR和普通PCR检测阳性率分别为40%和33%,两者符合率90%。该方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可同时检测大量样品,可适合于PRV的临床诊断和流行病学调查。
关键词： 猪伪狂犬病毒(PRV) TaqMan-MGB 荧光定量PCR
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福建白兔血液生理生化指标的测定
《江西农业大学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为给福建白兔的饲养管理、品种选育、肉质研究和临床诊疗提供依据,从血液理化特性方面研究该品种的种质特征,采用全自动血液分析仪和全自动生化仪对福建白兔的血液生理生化指标进行测定,并将雌雄福建白兔进行比较。结果表明,血液生理指标中只有红细胞分布宽度(SD)表现为雌雄差异显著(P<0.05),其他指标均无显著差异(P>0.05);雌雄福建白兔生化指标中,雄兔的总胆固醇(CHOL)、低密度脂蛋白(LDL)、氯(Cl)都低于雌兔且差异极显著(P<0.01),高密度脂蛋白(HDL)、肌酐(CREA)、谷丙转氨酶(ALT)、镁(Mg)、阴离子间隙(AG)差异显著(P<0.05),其他指标均差异不显著。经过统计分析,建立了福建白兔血液生理生化参考值,为福建白兔的疾病诊断、饲养管理、保种选育等临床和科研工作提供基础资料和数据。
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利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性
《热带作物学报 》 2013 CSCD
摘要：以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,GroupⅠ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda)。
关键词： 正红菇 菌根围 真菌多样性 PCR变性梯度凝胶电泳
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杂色鲍及其杂交后代的氨基酸含量和组成分析
《中国食品学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：目的:分析日本、台湾杂色鲍及其杂交后代("东优1号")足肌和壳的氨基酸含量及组成。方法:采用水解法和磺基水杨酸提取法进行氨基酸分析,以氨基酸比值系数分(SRCAA)进行评价。结果:3种鲍足肌含有18种蛋白质氨基酸和3种非蛋白质氨基酸;其SRCAA均大于80%,且E/T、E/N符合FAO/WHO的蛋白模式;"东优1号"和日本群体足肌的EAA、总氨基酸(TAA)及其他功能性氨基酸的含量均显著高于台湾群体(P<0.05);3种鲍壳蛋白中含有18种氨基酸,"东优1号"鲍壳的TAA和EAA含量均高于双亲。结论:3种鲍足肌蛋白中的氨基酸种类齐全,比例合理,具有较高的营养价值,是一种优质的蛋白源。"东优1号"的足肌和壳在氨基酸营养方面,较好地综合了双亲的优良性状,且部分性状优于双亲。
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吡虫啉和毒死蜱对尿素氮在土壤中转化的影响
《农药学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了考察杀虫剂施用对尿素态氮在土壤中转化过程的影响,采用室内培养法,通过测定土壤铵态氮和硝态氮质量分数以及反硝化损失的动态变化,研究了在施用尿素的土壤(有效氮含量为200 mg/kg)中分别添加不同剂量的吡虫啉和毒死蜱2种杀虫剂时,杀虫剂对尿素的水解、土壤氮的硝化及反硝化过程的影响。结果表明:吡虫啉和毒死蜱各剂量处理在第3天时对尿素水解具有显著的促进作用(P<0.05)。2种杀虫剂5 mg/kg的处理,在培养前期均显著促进硝化作用,第8天时吡虫啉和毒死蜱处理的硝化率分别比尿素处理提高了5.63和4.33个百分点,随后各处理间无显著差异;10 mg/kg吡虫啉的处理对硝化作用无明显影响,而毒死蜱则仅在第3天表现出显著的抑制作用(P<0.05);2种杀虫剂50 mg/kg的处理均显著抑制硝化作用(P<0.05),第8天时吡虫啉和毒死蜱处理的硝化率分别比尿素处理降低了5.18和8.69个百分点。吡虫啉各处理均能极显著地降低氮素的反硝化损失量(P<0.01),5、10、和50 mg/kg的处理分别比尿素处理的反硝化损失量减少36.98%、39.92%和68.54%;毒死蜱5和10 mg/kg处理对氮素反硝化损失无明显影响,但50 m/kg处理表现出极显著的抑制作用(P<0.01),减少反硝化损失量39.69%。
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‘琯溪蜜柚’荧光定量PCR内参基因的筛选
《果树学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为了克隆‘琯溪蜜柚’的管家基因,并筛选合适的管家基因作为内参,【方法】以‘琯溪蜜柚’盛花期后5个不同时期的果实汁胞,以及根﹑茎﹑叶为材料,采用实时荧光定量PCR技术,分析actin1﹑β-tubulin﹑18S rRNA﹑EF1-α和Ubiquitin 5个管家基因在不同材料中的表达情况,并结合geNorm、NormFinder﹑comparative Delta-CT和BestKeeper 4种评估方法进行稳定性分析。【结果】结果表明,actin1和β-tubulin是‘琯溪蜜柚’果实发育进程中较为稳定的内参基因,而EF1-α和β-tubulin则是研究不同组织特定靶基因表达中稳定的内参基因。【结论】筛选出了‘琯溪蜜柚’最佳的内参基因β-tubulin,为今后目的基因的表达分析奠定了基础。
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黄曲条跳甲酯酶基因片段的克隆及序列分析
《应用昆虫学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：黄曲条跳甲Phyllotreta striolata(Fabricius)是十字花科蔬菜的主要害虫之一,其抗药性问题日益严重,克隆黄曲条跳甲的酯酶基因可为其抗性治理提供必要的科学依据。本文利用反转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)的方法得到一条281 bp的核酸片段,再利用3'-RACE技术获得该基因片段的3'端(1 468 bp),编码442个氨基酸。核苷酸序列同源性分析表明,与赤拟谷盗est1基因和杂拟谷盗est1基因的同源性最高,为71%(211/297),与果蝇alpha-esterase5的同源性为70%(156/222),氨基酸序列与杂拟谷盗、赤拟谷盗、果蝇的酯酶基因的同源性分别为43%(188/434)、43%(188/434)、33%(144/432)。从BLAST结果可初步推测该片段应为编码黄曲条跳甲酯酶基因的部分核苷酸序列,该序列在GenBank中的登录号为EU166919。
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分子标记辅助选择改良Ⅱ-32B的外观品质
《分子植物育种 》 2013 CSCD
摘要：本研究以优质稻品种佳辐占为供体亲本与轮回亲本Ⅱ-32B进行连续回交,采用选择回交导入法结合分子标记辅助选择技术和农艺性状选择,将粒长主效基因GS3及其他外观品质性状基因导入Ⅱ-32B中,获得4个外观品质得到明显改善的Ⅱ-32B改良株系。Ⅱ-32B改良株系的谷粒明显变得细长,粒长由原来的8.04 mm增加到8.99 mm,粒宽由3.02 mm降至2.85 mm,长宽比由原来的2.67提高到3.16。此外,垩白率和垩白度极显著降低,分别由原来的55.6%和14.3%降低至23.9%和4.6%。除千粒重极显著增加外,抽穗期、株高、有效穗、穗长、结实率等5个主要农艺性状差异不显著。通过遗传背景分析,4个改良株系的遗传背景回复率为90.7%~96.3%,其中GL2株系分别在第5和第6染色体存在一个位点未回复外,其他位点均回复,回复率达到96.3%。结果表明,采用分子标记辅助选择与田间表型选择相结合可较快速地改良杂交稻亲本的外观品质。
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猪丹毒杆菌SpaA基因的克隆与生物信息学分析
《中国兽医学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：旨在克隆猪丹毒杆菌表面保护性抗原A(surface protein A,SpaA)的编码基因,并预测该蛋白的二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨猪丹毒杆菌SpaA蛋白在免疫保护中所起的作用。首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR扩增、克隆和测序,并进行同源性比较。应用生物信息学方法,对猪丹毒杆菌SpaA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测。结果显示,猪丹毒杆菌SpaA基因全长1 881bp,编码626个氨基酸,发育进化树结果表明分离的2株猪丹毒杆菌菌株与GenBank中其他菌株在进化树中关系较远,自成一个分支。二级结构的预测结果显示该蛋白主要以无规则卷曲、α螺旋和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该蛋白有14个B细胞优势抗原表位区域、8个N-肉豆蔻酰化位点。该研究为进一步分析猪丹毒杆菌免疫机理、表位疫苗设计等奠定理论基础。
关键词： 猪丹毒杆菌 表面保护性抗原A 二级结构 B细胞抗原表位
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