科研产出
葡萄全基因组SSR分析和数据库构建
《南京农业大学学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用Perl语言开发了用于探寻基因组SSR的程序SSRFinder,并利用其从法国国家基因测序中心(Genoscope)公布的欧亚种葡萄(Vitis viniferaL.)黑比诺品系PN40024的基因组序列中检索到114 520个SSR。其中含单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复单元的SSR数目分别为37 648(32.9%)、30 123(26.3%)、18 705(16.3%)、14 566(12.7%)、3 492(3.0%)和9 986(8.7%)个。在各类SSR中,不同核苷酸组成的重复单元频率间存在较大的差异,其中富含A/T重复单元的SSR频率最高,而富含C/G重复单元的SSR频率最低。SSR在基因组上主要分布在基因间隔区,其次是基因的非翻译区,在编码区的分布密度最小。三核苷酸和六核苷酸SSR在翻译区的分布密度明显高于其他类型的SSR。利用这些SSR序列共设计出80 065(69.9%)对SSR引物。另外,本研究开发了一个基于Web界面的SSR数据库DGSSR,收录和注释全基因组与EST的SSR,并提供了查询界面,网址为http://www.yaolab.sh.cn/ssr。
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农艺措施对线状匍匐茎藨草发生的影响
《上海农业学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：在摸清线状匍匐茎藨草田间发生消长动态和分布型的基础上,开展了不同茬口模式、翻耕深度等农艺措施对线状匍匐茎藨草出苗影响的研究。结果表明:线状匍匐茎藨草在水稻播种后即出苗,3个月内持续快速增长,每周平均增加391.57株/m~2;线状匍匐茎藨草在田间呈集群分布;与水稻-麦子-水稻茬口相比,西瓜-麦子-水稻茬口可减少线状匍匐茎藨草发生量85%以上;线状匍匐茎藨草随土层翻耕深度的增加发生数量逐渐减少,使用农机具田间翻耕深度14～16 cm较浅耕(8～10 cm)可减少线状匍匐茎藨草发生量64.4%。
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甘蓝细胞质雄性不育类型的分子鉴定
《上海农业学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：为鉴定几种来源不同的甘蓝细胞质雄性不育材料的类型,获得与其不育性状相关的特异序列,基于同源序列的候选基因法,通过检索NCBI核苷酸及蛋白质数据库获得orf138和orf224开放阅读框序列,依据其保守序列设计2对引物,对甘蓝的5个不育系及其保持系进行PCR扩增。orf138引物在5个甘蓝雄性不育系中均扩增出749 bp的片段,同源性比对发现这5个不育材料的特异片段与萝卜Ogu CMS所具有的Oguorf138基因同源度达100%,表明这几个来源不同的甘蓝细胞质不育材料同属萝卜细胞质不育类型。
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杏鲍菇主要农艺性状与单菇产量的相关分析及通径分析
《安徽农业科学 》 2009 北大核心
摘要：[目的]探究影响杏鲍菇产量的几个主要农艺性状与单菇鲜重之间的关系。[方法]对影响杏鲍菇单菇产量的主要农艺性状菌盖直径、菌柄直径、菌柄长度、菌盖厚度、干物质含量与单菇鲜重之间的关系进行相关性分析及通径分析,最后通过多元逐步回归分析。[结果]得到了单菇鲜重(Y)与菌盖直径(X1)、菌柄长度(X3)以及干物质含量(X5)之间的最优回归模型:Y=-2.496+2.026X1+0.486X3+5.124X5。[结论]为杏鲍菇遗传育种以及增产增收奠定了基础。
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氟铃脲对番茄晚疫病的防治作用
《植物保护 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：通过药效试验发现氟铃脲对番茄晚疫病有一定的防治效果。室内离体试验结果表明,氟铃脲对番茄晚疫病菌的EC50为65.69μg/mL;盆栽试验结果表明,6.25~200μg/mL氟铃脲对番茄晚疫病均表现出一定的预防效果;田间小区试验200μg/mL氟铃脲对番茄晚疫病的防效达到了64.42%。
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田间斜纹夜蛾成虫饲毒后垂直传毒对其后代的影响
《安徽农业科学 》 2009 北大核心
摘要：[目的]通过TDM模型研究田间斜纹夜蛾成虫当代饲毒后,对子代种群的毒力。[方法]在田间以3种浓度斜纹夜蛾核型多角体病毒感染斜纹夜蛾成虫,分析病毒对斜纹夜蛾幼虫致死的浓度效应和时间效应。[结果]结果表明,子1代斜纹夜蛾从孵化开始,第5天日死亡率最高,且随着病毒浓度的升高,LT50值减小,在稀释浓度为200倍时,LT50值为8.9928,在稀释浓度为50倍时,LT50值为6.4256。[结论]病毒虫瘟1号对斜纹夜蛾成虫当代饲毒后,对子代也有明显的控制效果。
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11株鸡新城疫病毒强毒株的分子特性
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：选取2002～2007年从上海市分离鉴定的11株鸡新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)强毒株,克隆其融合蛋白(Fusion,F)基因片段,测序后登录GenBank,序列号分别为NDV 022433(EU258661)、022435(EU258662)、0210149(EU258653)、0210154(EU258654)、0210227(EU258656)、0210252(EU258658)、03024(EU258637)、04011(EU258639)、05013(EU258640)、07011(EU258642)和07023(EU258643)。序列分析结果显示:上述分离株的F基因扩增片段为1 654 bp,编码551个氨基酸,其核苷酸序列同源性为94.6%～100%,推导的F蛋白氨基酸序列同源性为93.0%～100%;各分离株F蛋白裂解位点序列均为112R-R-Q-K-R-F117,为基因Ⅶ型NDV强毒株。系统发育分析表明:这11株NDV分离株之间的遗传距离较近,而与传统疫苗株B1、La Sota、V4和F48E9的遗传距离较远。此外,这11株NDV强毒株均具有大多数鹅源NDV毒株特有的973和1 249 nt RsaⅠ位点。
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早熟优质草莓新品种‘久香’
《园艺学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：‘久香’草莓(Fragaria×ananassa Duch.)属于短日性品种。结果早,丰产,风味浓郁,较抗白粉病。在上海地区,果实成熟期较主栽品种‘丰香’晚4～7d。繁苗容易。果实鲜食加工兼用。
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消费者对安全食品的认知及购买行为分析——基于上海市生鲜食品消费的调查
《中国农学通报 》 2009 北大核心
摘要：通过上海市生鲜食品消费的调查数据考察了消费者对安全食品的认知及购买行为。研究表明,消费者对安全食品的关注及认知程度均较高,但是了解的程度不深。在对影响安全食品的认知及购买行为的因素分析中,性别、年龄、婚否、收入、家庭规模、对安全食品的关切度等变量均影响了消费者对安全食品的认知及购买行为。最后提出政府应加大安全食品的宣传、加强安全食品消费市场的培育、对安全食品的生产与经营进行补贴等建议。
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定性PCR技术及卡那霉素对8个番茄品种的转基因检测
《基因组学与应用生物学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用定性PCR技术对8个不同番茄品种中外源基因35S启动子、NPTⅡ基因和NOS终止子进行检测。实验结果表明,阳性对照可以稳定扩增到预期的大小片段,而待检测品种和阴性对照则没有扩增到预期产物。利用100mg/L的卡那霉素对8个不同番茄品种的种子进行萌发试验,再用50mg/L的卡那霉素对番茄外植体(子叶和下胚轴)进行抗性验证,结果显示卡那霉素抗性筛选实验结果与定性PCR结果一致。本文通过对这两种检测方法的优缺点进行研究分析及比较,初步建立了一个对不同品种番茄进行转基因检测的体系。
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