科研产出
两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用
《园艺学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：用两种常用的 SNP 分型方法,等位基因特异性 PCR 法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对 16 个柚栽培品种和 8 个柚杂种后代材料进行了 7 个 SNP 位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将 24 个样本分成了 22 种基因型。值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系。可见,AS-PCR 和 HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定。AS-PCR 法是一种准确、低成本的 SNP 分型方法,适合普通实验室使用,惟对 PCR 反应体系要求严格。HRMA 分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高。
关键词： 柚 单核苷酸多态性 等位基因特异性 PCR 高分辨率熔解曲线分析 基因分型
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桑叶不同极性溶剂提取物的总多酚含量与抑菌活性
《蚕业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：用不同极性溶剂萃取桑叶粉中的活性物质,分别获得乙酸乙酯提取物、正丁醇提取物和水提取物。采用琼脂打孔扩散法评价桑叶各极性溶剂提取物的抑菌效果,结果表明桑叶不同极性溶剂提取物对供试革兰阳性菌和革兰阴性菌均有一定的抑制作用,其中乙酸乙酯提取物的抑菌活性显著高于其它溶剂提取物,对大肠杆菌(Escherichia coli)的最低抑菌浓度为6.3mg/mL,对金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、沙门氏菌(Salmonella sp.)的最低抑菌浓度均为12.5 mg/mL。测定乙酸乙酯提取物中的总多酚质量比为(11.91±0.67)mg/g,显著高于其它溶剂提取物,表明桑叶不同极性溶剂提取物的抑菌活性与其总多酚的含量成显著剂量效应关系(P<0.05)。
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丁醚脲在柑橘及其土壤中的残留及消解动态
《农药学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：建立了丁醚脲在柑橘及橘园土壤中残留测定的超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)检测方法,研究了其在柑橘和土壤中的消解动态及最终残留。样品采用乙腈提取,N-丙基乙二胺(PSA)净化,UPLC-MS/MS检测。结果表明:在0.01、0.1和1 mg/kg 3个添加水平下,丁醚脲在柑橘全果、果肉和果皮中的回收率在84%~89%之间,相对标准偏差(RSD)为2.6%~7.2%,在土壤中的回收率为83%~86%,RSD为2.2%~5.6%;在广东、广西和福建3地柑橘及土壤中,其消解半衰期分别为3.7~4.4 d和4.1~5.4 d,表明丁醚脲消解较快;采用500 g/L丁醚脲悬浮剂(SC),分别按有效成分500和750 mg/L的剂量于幼果期开始施药,施药2~3次,施药间隔期为10~14 d,距最后一次施药后21 d采样测定,柑橘果肉中丁醚脲的残留量均<0.01 mg/kg,全果中的最终残留量均低于我国制定的丁醚脲在柑橘中的最大允许残留限量(MRL)标准(0.2 mg/kg)。
关键词： 丁醚脲 柑橘 残留 超高效液相色谱-串联质谱
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2012年广东花卉产业发展形势与对策建议
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：近年来,广东省花卉生产和销售实现了较快增长,花卉产业区域格局基本形成,产业结构趋于合理。然而,在花卉产业全球化的大背景下,广东作为全国十大花卉产区和全国最大的花卉集散地,面临着前所未有的冲击,传统花卉生产的萎靡、自主培育品种的缺乏、花卉物流体系的落后等极大地制约了广东花卉的发展。阐述了2012年广东花卉产业总体种植与销售情况,并分析了广东省花卉供需及价格状况,对未来广东花卉产业的发展提出了对策与建议。
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二斑叶螨cDNA文库的构建及鉴定
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为研究二斑叶螨发育相关基因的功能,利用TRIzol试剂提取二斑叶螨总RNA,通过SMART技术构建cDNA文库。利用SMART IVTMOligonucleotide和CDSIII/3′PCR Primer为引物,在反转录酶作用下,合成cDNA第1链,利用LD-PCR方法合成cDNA第2链。合成的双链cDNA经酶切回收后,再连接pDNR-LIB载体,转化大肠杆菌感受态细胞Trans 5α,检验库容量和重组效率,并采用PCR方法检测插入cDNA片段的大小。结果表明,构建的二斑叶螨cDNA文库的库容量为3.54×106CFU/mL,重组效率达95.8%,插入片段长度在0.3~2.0 kb之间。构建的二斑叶螨cDNA文库质量良好,能够为进一步研究二斑叶螨基因的功能奠定基础。
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1株根结线虫拮抗放线菌新种的分离与鉴定
《微生物学杂志 》 2013 CSCD
摘要：从海南东寨港红树林底泥中分离到206株放线菌。利用24孔板法进行抗线虫活性筛选,获得根结线虫拮抗菌HA11166。该菌株16S rDNA序列与Nocardiopsis trehalosi VKM Ac-942T相似性最高(98.3%),并在系统发育树上聚为同一分支,二者DNA-DNA杂交率38.8%。形态和生理生化特征也表现出一定差异。基于表型与分子特征,鉴定菌株HA11166为Nocardiopsis属新种,命名为东寨港拟诺卡氏菌(Nocardiopsis dongzhaigangensis sp.nov.)。
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猪蓝耳病病毒分离纯化及Nsp2序列分析
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：对广东省几个地区发生疑似PRRSV感染的猪场送检的502份血清进行RT-PCR检测。将检测到的阳性血清接种到Marc-145细胞上并连续传代4~5次,收获出现明显细胞病变(CPE)的样品,利用蚀斑试验克隆纯化PRRSV。根据高致病性PRRSV Nsp2基因缺失区的两端保守区设计了1对引物区分经典PRRSV和高致病性PRRSV。研究结果表明,成功分离到12株PRRSV并纯化出2株病毒。从502份血清样品中检测到156份阳性血清,PRRSV感染阳性率达32%,经鉴定均为高致病性PRRSV变异株。对分离毒株的Nsp2基因序列进一步分析,发现此次分离株Nsp2基因与VR-2332株(70.7%~74.6%)的核苷酸同源性较JXA1株(87.1%~100%)偏低;在系统进化树上分离株与JXA1变异株亲缘关系比较近,而与VR-2332株亲缘关系比较远。说明广东省地区普遍存在PRRSV的感染,并且病毒出现了不同程度的变异。
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利用SNP和EST-SSR分子标记鉴定荔枝新种质御金球
《分子植物育种 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用自主开发的荔枝SNP和EST-SSR两种分子标记技术,对近年发掘的荔枝优稀种质御金球进行分子鉴定,明确其与现有的363份荔枝种质的亲缘关系,以探索其是否为新种质,并揭示亲本来源,为进行新品种保护提供分子证据.结果表明,13对EST-SSR引物在364份种质中共产生122条谱带,其中多态性条带112条(91.8%);筛选出的17对SNP引物均表现为二等位性.御金球与363份荔枝种质的演化分化系数介于0.043~1.924之间,遗传相似性系数介于0.123~0.877之间.可见,御金球与现有的363份荔枝种质在分子水平上存在差异,证实御金球为一份全新荔枝种质.通过对该种质与22份疑似亲本进行EST-SSR和SNP分析,并结合表型资料及品种起源信息,初步认为御金球是杂交后代,且母本为糯米糍,父本为焦核怀枝的可能性最大.SNP分型技术首次成功地用于荔枝新种质御金球的亲本来源鉴定,为今后荔枝种质的鉴别提供了可借鉴手段.
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粤北稻区稻纵卷叶螟的虫源地分析
《应用昆虫学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：根据曲江地区12年稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis Guenée的历史虫情资料,挑选了31个代表性的发蛾高峰日,利用HYSPLIT轨迹分析平台对其迁飞峰次进行轨迹分析,结果表明:粤北稻区稻纵卷叶螟早期迁入虫源地主要分布在海南及两广南部稻区,其中5月大多分布在海南及雷州半岛,6月主要分布在两广南部稻区;夏季迁出虫源的降落地分布在长三角稻区及安徽稻区;秋季回迁虫源的虫源地主要分布在安徽南部及长三角稻区,少部分来自浙南及闽北;秋季迁出虫源的降落地主要集中在海南南部和越南北部稻区;随着时间的推移,其早期迁入虫源地的时空分布由南向北依次偏移,存在明显的季节性差异,而夏秋季迁出虫源降落地和秋季回迁虫源地的时空分布没有明显的季节性差异。本研究初步明确了粤北地区稻纵卷叶螟南北往返迁飞的虫源衔接关系。
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侵染垂花悬铃花的木尔坦棉花曲叶病毒分子特征研究
《植物病理学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：垂花悬铃花曲叶病是近期在广东发现的一种新病害,病株表现为叶片向上卷曲,叶脉肿大,叶脉变深绿色等症状。PCR检测结果显示,该病样中均存在菜豆金色花叶病毒属病毒。基因克隆及序列分析结果表明,该病毒分离物(GD11)DNA-A全长为2 737 nt,具有菜豆金色花叶病毒属病毒基因组典型特征,为闭合环状单链DNA,编码6个ORFs;该序列与木尔坦棉花曲叶病毒(CLCuMV)各分离物序列的相似性均大于89.0%,其中与G6、Okra06及GX1等分离物序列的相似性大于99.0%。该病毒分离物也伴有卫星DNAβ分子,其全长为1 348 nt,与CLCuMV各分离物的DNAβ序列相似性大于85.0%,其中与G6、Okra06及GX1等DNAβ的序列相似性均大于99.0%。因此,侵染广东垂花悬铃花的病毒分离物属于CLCuMV,且与入侵我国的朱槿分离物G6、黄秋葵分离物Okra06及棉花分离物GX1亲缘关系很近。本文首次报道了CLCuMV及其卫星β复合侵染垂花悬铃花。
关键词： 垂花悬铃花曲叶病 木尔坦棉花曲叶病毒 DNA-A 卫星DNAβ
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