科研产出
非洲猪瘟病毒荧光定量PCR的建立及4种检测试剂盒的比较
《江苏农业科学 》 2021 北大核心
摘要：为评估目前常用商品化非洲猪瘟荧光定量PCR检测试剂盒,参考OIE推荐的非洲猪瘟病毒（ASFV）荧光定量PCR方法合成引物和探针,建立非洲猪瘟病毒qPCR检测方法（OIE-qPCR）;并与市面4种ASFV检测试剂盒进行了比较。以人工合成的ASFV p72基因TA克隆重组质粒为阳性标准品,OIE-qPCR可以检测到10～102 copies;而4种ASFV荧光定量PCR检测试剂盒中,进口试剂盒TF-qPCR能检测到10 copies,进口试剂盒ID-qPCR和国产试剂盒QD-qPCR能检测到10～102 copies,而国产试剂盒LY-qPCR能检测到102 copies。对健康猪组织样及临床模拟样品的检测结果显示:OIE-qPCR与4种检测试剂盒之间的符合率为92.60%～99.03%。其中,阳性样品CT值的相关系数为0.988～0.997（Perason法）,表明各试剂盒之间相关性良好;但在检测病毒核酸含量较低的样品时,各试剂盒结果之间存在一定差异,其中,TF-qPCR试剂盒显示更高的阳性检出率,ID-qPCR试剂盒和LY-qPCR试剂盒次之。本研究为临床选用非洲猪瘟病毒快速检测试剂盒提供了依据。
关键词： 非洲猪瘟病毒 检测 荧光定量PCR 灵敏性 稳定性 敏感性
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海蓬子皂苷甲调控SHP/STAT信号通路抗肝癌的研究
《中国药理学通报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：目的 研究海蓬子皂苷甲(bigelovii A,BA)诱导细胞凋亡的作用及其机制.方法 使用MTT实验检测BA对肿瘤细胞增殖的抑制作用;流式细胞仪分析BA对细胞凋亡的影响;Western blot分析p-STAT3、STAT3、p-STAT5、STAT5、SHP-1、SHP-2的表达.结果 20和40μmol·L-1 BA可诱导HepG2细胞发生凋亡,具有剂量依赖性.10、20和40μmol·L-1 BA可抑制IL6诱导的STAT3和STAT5磷酸化,但酪氨酸磷酸酶抑制剂过钒酸钠可逆转该抑制作用,且20μmol·L-1 BA能激活蛋白酪氨酸磷酸酶SHP-1和SHP-2.结论 BA可能通过SHP-1/SHP-2和STAT3/STAT5通路诱导HepG2细胞凋亡.
关键词： 海蓬子皂苷甲 HepG2细胞 细胞凋亡 含SH2结构域的蛋白酪氨酸磷酸酶 信号传导与转录激活因子 白介素6
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33个杨柳品种指纹图谱构建
《南京林业大学学报(自然科学版) 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】构建杨树与柳树优良品种的指纹图谱,对不同品种进行准确鉴定。【方法】利用柳树EST-SSR标记对33个杨树与柳树优良品种进行通用性检测及基因分型,通过核心引物间的组合构建品种指纹图谱。同时采用非加权组平均法进行聚类,分析各品种间亲缘关系。【结果】12个EST-SSR标记共扩增出97条等位片段,每个位点等位基因数5～13个不等,平均为8.1个。12个位点的多态信息含量（PIC）变化范围为0.637 2～0.834 8,平均为0.781 7。优选的3对核心引物中,SALeSSR0340与SALeSSR0346组合可完全区分12个杨树品种,而SALeSSR0259、SALeSSR0340与SALeSSR0346的组合可完全区分所有的33个品种。聚类分析显示33个品种间的遗传相似系数为0.68～0.96,并分成杨属与柳属两大类,与传统的杨柳科系统分类学一致。各品种间亲缘关系聚类结果与遗传背景相吻合。【结论】对33个杨柳树优良品种进行指纹图谱构建与亲缘关系分析,表明EST-SSR标记可有效反映品种间的差异,建立的基因分型体系准确、高效,可为杨树与柳树品种鉴定、保护与推广工作提供科学依据。
关键词： 杨树 柳树 SSR标记 指纹图谱 亲缘关系 基因分型
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基于玉米50K芯片分析鲜食玉米温-热带杂种优势模式及其育种利用
《江苏农业科学 》 2021 北大核心
摘要：利用基于Illumina平台的玉米MaizeSNP50 （50 K）芯片对90份鲜食玉米自交系材料进行SNP基因分型,获得11 100个高质量SNP变异位点。通过这些位点可以将具有不同遗传背景的90份鲜食玉米资源划分为四大类群,分别为热带糯玉米群（31份）、热带甜玉米群（15份）、温带糯玉米群（11份）、温带甜玉米群（33份）,并对其群体遗传结构进行PCA分析,二者结果与自交系谱系来源保持一致。以上述温、热优势群划分结果为依据,现已知15个自主选育鲜食玉米品种的组配模式为温、热带优势群间杂交,且各品种在农艺性状、品质、抗性等方面均表现出较强的杂种优势,该温-热杂优模式为今后鲜食玉米品种选育提供了新方向。
关键词： 温热带鲜食玉米 SNP基因分型 类群划分 杂优模式 玉米育种
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农业领域本体构建方法研究 -以番茄病虫害为例
《情报探索 》 2021
摘要：[目的/意义]提出一种农业领域的本体构建方法(手工+机器学习法),构建番茄病虫害的领域本体,旨在为番茄病虫害信息检索系统、诊断系统等平台的开发提供支撑.[方法/过程]首先,利用叙词表、文献资料确定本体类及层次和属性,构建初始本体框架;其次,通过机器学习从文献资料和网页信息中抽取相关实例;最后,通过本体描述语言将本体类、属性和实例形式化.[结果/结论]提出的本体构建方法可以初步实现农业领域本体的半自动、高效构建,命名实体识别的准确率为82.51%,关系的抽取准确率达到了86.32%.
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LC-MS测定不同品种小麦中氨基酸含量及PCA分析
《生物加工过程 》 2021 CSCD
摘要：小麦是世界第二大粮食作物,为人体主要蛋白的来源之一。高蛋白含量的小麦育种,同时改善其必需氨基酸的比例是当前研究热点。本文中,笔者采用LC-MS测定小麦中游离和水解氨基酸含量,并利用主成分分析（PCA）法对37个不同品种小麦中游离和水解氨基酸进行综合评价。结果表明,37个小麦品种中游离和水解氨基酸种类无差异,但是含量差异较大。PCA分析表明游离氨基酸3个主成分累积贡献率达到82.17%,水解氨基酸4个主成分累积贡献率为78.19%,可以代表小麦中游离和水解氨基酸的主要趋势,扬辐麦5号、扬大180、扬麦13、镇麦168和望水白的游离和水解氨基酸综合评价均较高,为氨基酸品质较优的品种。
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大蒜伴生对连作西瓜生长、产量及品质的影响
《江西农业学报 》 2021
摘要：大棚西瓜由于连年种植,严重影响了西瓜的产量和品质,尤其是枯萎病,导致西瓜死苗减产,严重的甚至绝产.采用田间试验方法,以大蒜-西瓜伴生栽培模式为研究对象,设西瓜单作、大蒜(苗期伴生)-西瓜、大蒜(全生育期伴生)-西瓜等3个处理,伴生后统计枯萎病的发病率,以及测定西瓜的株高、蔓长、干鲜重、果实形态指标、产量及品质.结果表明:大蒜伴生后,生长前期植株的蔓长和叶片数略有减少,与对照相比差异不显著,生长后期植株的地上、地下干鲜重均比单作增加,差异显著;西瓜枯萎病发病率比单作显著减少;西瓜的单瓜重和产量增加;果实形态指标的中心糖、边糖、纵径、横径增加;皮厚减少,果实的可溶性蛋白、可溶性糖均比单作增加,VC、亚硝酸盐、总酸降低,与对照相比差异显著.大蒜伴生西瓜后,显著抑制了西瓜枯萎病的发病率,促进了植株生长、提高了单瓜重和产量,改善了西瓜果实形态指标及品质,一定程度上减轻了西瓜连作障碍,在西瓜绿色优质可持续栽培方面有一定指导意义.
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作物耐湿性生理及分子机理研究进展
《大麦与谷类科学 》 2021
摘要：湿害是影响作物产量及品质的重要因素之一。本文综述了湿害胁迫对作物无氧呼吸、抗氧化系统、不同激素含量等生理生化指标的影响及作物耐湿分子机理的研究进展,旨在为进一步揭示作物耐湿生理、分子机理及筛选和培育耐湿作物新品种提供参考。
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裂谷热病毒Gn蛋白主要抗原区的串联表达和多克隆抗体制备
《中国动物检疫 》 2021
摘要：裂谷热(Rift Valley fever,RVF)是由裂谷热病毒(Rift Valley fever virus,RVFV)引起的一种烈性人兽共患传染病.RVFV囊膜蛋白Gn可诱导产生中和抗体,是RVFV检测方法和疫苗研究的重要抗原靶标.本研究通过分析蛋白抗原位点信息,构建包含Gn蛋白两个主要抗原区域的重组表达载体,随后将质粒转化至BL21感受态细胞,以IPTG诱导重组蛋白表达并优化蛋白表达条件,通过Western Blot鉴定重组蛋白;将重组蛋白免疫BALB/c小鼠,制备多克隆抗体,并以ELISA、Western Blot、IFA检测多克隆抗体的反应性.结果显示:诱导表达的Gn重组蛋白分子质量约为45 kDa;蛋白表达条件优化为IPTG终浓度0.25 mmol/L,诱导时间5 h;Western Blot鉴定发现蛋白成功表达.通过ELISA测定小鼠三免后血清抗体,结果发现抗体效价大于1:51200;Western Blot检测显示,制备的多抗血清能与重组蛋白发生反应;进一步的IFA检测结果表明,制备的多克隆抗体可与真核质粒转染细胞中表达的Gn蛋白反应.本研究获得的Gn重组蛋白及制备的多克隆抗体为后续RVFV检测方法的建立奠定了基础.
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稻曲病病菌Zn2(Ⅱ)Cys6型转录因子UvZC1基因的克隆及功能分析
《江苏农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确Zn2（Ⅱ）Cys6型转录因子UvZC1在稻曲病病菌中的功能,利用CRISPR-Cas9结合同源片段双交换的方法,诱导野生型菌株Jt209发生UvZC1基因缺失突变。结果显示,与Jt209相比,UvZC1基因缺失突变体的生长速率和分生孢子量均显著下降,且突变体中部分与稻曲病病菌其他产分生孢子相关基因表达量发生变化;此外,该基因的缺失导致突变体对十二烷基硫酸钠（SDS）更敏感,而对氧化胁迫的耐受性增强;在稻曲病病菌接种水稻后24 h、48 h的侵染早期,UvZC1基因的表达量明显上升,但基因缺失突变体接种水稻后形成的稻曲球数量与野生型之间没有差异。综上所述,UvZC1基因参与稻曲病病菌营养生长、分生孢子产生和侵染水稻过程,还与稻曲病病菌细胞壁的完整性和响应氧化胁迫相关。
关键词： 稻曲病病菌 Zn2（Ⅱ）Cys6转录因子UvZC1 基因敲除 基因功能 致病性
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