科研产出
"糖心"苹果香气物质生物合成的转录代谢联合分析
《核农学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为探究黔选3号苹果“糖心”与正常组织代谢化合物的差异，解析特征差异香气物质形成的分子机制，本研究采用气相色谱-串联质谱技术（GC-MS/MS）和Illumina高通量测序技术获得黔选3号苹果果肉“糖心”与正常组织的代谢组学和转录组学数据。转录组学分析显示，共产生1 795个差异表达基因（DEGs），其中671个下调基因、1 124个上调基因，与脂肪酸合成途径（fatty acid synthesis pathway）相关的基因有7个，与乙醇脱氢酶（ADH）相关的基因有8个。代谢组学共检测到353个香气物质，分析表明有20种差异香气物质，包含上调物质8个、下调物质12个，其中己酸乙酯和正壬醛显著上调。转录组-代谢组学联合分析结果表明，脂肪酸合成途径与乙醇脱氢酶家族中11个DEGs与己酸乙酯、正壬醛呈正相关关系，2个DEGs与己酸乙酯呈负相关关系，且MdFAD6、MdADH2、MdADH3和MdADH4在“糖心”组织特异性表达，实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明上述基因在“糖心”组织中的相对表达量显著高于正常组织，推测这些基因在苹果“糖心”组织差异香气物质合成途径中发挥了关键作用。研究结果初步揭示了“糖心”苹果香味变化的生物学基础，可为“糖心”苹果品质改良提供参考依据。
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澳洲坚果不同成熟度叶片的光合特性及养分积累分配
《经济林研究 》 2025 北大核心
摘要：【目的】探讨澳洲坚果叶片在不同发育阶段的光合效率及营养积累规律，从而为澳洲坚果的高效栽培及管理提供理论依据。【方法】选取了澳洲坚果新叶、中等成熟叶、成熟叶及老叶4组不同成熟度的叶片为试验材料，对叶片的叶绿素荧光参数和光合参数、总叶绿素和类胡萝卜素质量比，以及矿质营养成分进行测定。【结果】不同成熟度叶片对澳洲坚果幼苗叶片的总叶绿素质量比、类胡萝卜素质量比、光合参数及矿质元素积累具有不同的影响。结果表明，成熟叶的总叶绿素质量比、类胡萝卜素质量比最高，分别为1.45和0.24 mg/g，而新叶的最低，分别为0.99和0.18 mg/g。净光合效率最高的是成熟叶片，为14.69μmol/（m2·s），最低的是新叶，仅为2.63μmol/（m2·s）。水分利用效率最高的是中等成熟叶片，为5.74%。老叶的最大光化学量子产量最高，为0.70；而实际光化学量子产量最高的是新叶和中等成熟叶，均为0.39。叶片中矿质元素质量比最高的是钙元素，且老叶中的钙质量比显著高于其他叶片，为17.15 mg/g；其次是氮、钾、磷、镁，其质量比分别为13.53、0.97、4.15、0.96 mg/g。氮、钾、磷、镁质量比均是成熟叶片显著高于其他叶片。【结论】澳洲坚果叶片在不同发育阶段具有不同的功能分化：新叶专注于生长发育；中等成熟叶和成熟叶是光合作用的核心，在水分利用效率方面具有明显的优势；而老叶则在光保护和矿质元素重新分配中发挥作用。
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优质早熟薏苡新品种贵农薏5号的选育与应用
《种子 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：贵农薏5号是以兴仁小白壳为母本，安国薏苡为父本进行杂交，历经3年6代，定向选择而成的早熟、矮杆、丰产性较好的优良单株的培育品种，于2023年通过贵州省非主要农作物品种认定委员会认定。贵农薏5号属于中早熟品种，生育期144.1 d,株型直立，株高178.2 cm,种仁棕色，总苞黄白色，卵圆形，百粒重为10.77 g。在2021-2022年的区域试验中，其折合平均产量为4 568.03 kg/hm2,比对照增产576.08 kg/hm2,增产率为14.43%,具有较好的丰产性和适应性。营养成分组成合理，尤其是粗脂肪（8.18%）、类黄酮（4.25 mg/g）、三油酸甘油酯（6.86 mg/g）和总氨基酸含量（2.26 mg/g）高于对照兴仁小白壳，且与其他审定和认定薏苡品种存在基因遗传位点差异。适宜贵州海拔800～1 600 m区域春播种植。
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辣椒C2H2型锌指蛋白家族基因鉴定及其在涝胁迫下的表达分析
《江苏农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了探究辣椒C2H2型锌指蛋白家族在响应涝胁迫中的作用，本研究通过生物信息学方法对辣椒C2H2型锌指蛋白家族蛋白理化性质、基因结构、染色体定位、顺式作用元件进行了全面分析。结果表明，辣椒C2H2型锌指蛋白家族包含91个成员，多数成员定位于细胞核。91个成员可被分为6个亚族，不同亚族的成员基因结构存在差异。C2H2型锌指蛋白家族基因启动子区域主要包含植物生长发育元件、植物激素响应元件及逆境胁迫响应元件。对耐涝辣椒资源GC41和涝胁迫敏感型辣椒资源GC39在涝胁迫下的转录组数据进行分析，结果表明，在GC41中，CaC2H2-17、CaC2H2-87在涝胁迫处理3 d时相对表达量高，CaC2H2-17、CaC2H2-87在GC39中未表达。筛选出CaC2H2-16（Capana01g003556）、CaC2H2-32（Capana04g001616）、CaC2H2-72（Capana11g000176）、 CaC2H2-73（Capana11g000178）、CaC2H2-87（Capana12g000773）5个转录因子，这5个转录因子分别调控了419个、526个、566个、305个、480个差异表达基因。本研究结果为辣椒C2H2家族成员的功能解析及耐涝辣椒资源的分子育种提供了重要的理论依据和数据支持。
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一株基因Ⅶ型新城疫病毒L蛋白致弱突变株的拯救及其免疫效力评价
《中国兽医科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为防控流行的基因Ⅶ型新城疫，以基因Ⅶ型新城疫病毒（NDV）为骨架，将其F蛋白裂解位点氨基酸序列突变为La Sota株相应序列并且将其L蛋白第1159位赖氨酸突变为精氨酸，获救1株NDV L蛋白突变弱毒株并命名为rNDV-Fmut-LK1159R。rNDV-Fmut-LK1159R突变株在鸡胚中连续传代至第15代，突变位点能稳定遗传。rNDV-Fmut-LK1159R突变株和La Sota株分别以1×10～7EID50/羽的剂量免疫4周龄SPF鸡1次，免疫21 d后使用基因Ⅶ型NDV攻毒，攻毒剂量为1×10～5EID50/羽。结果表明，rNDV-Fmut-LK1159R突变株能显著提高SPF鸡外周血淋巴细胞内IFN-γ mRNA表达量，显著刺激机体产生体液和细胞免疫应答，且对SPF鸡提供完全免疫保护，并有效阻止排毒和抑制病毒在其脏器内复制。综上所述，rNDV-Fmut-LK1159R突变株免疫原性优良，具有成为基因Ⅶ型新城疫弱毒疫苗候选株的潜力。
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镉对牛肝成纤维细胞MT基因表达和细胞凋亡的影响
《黑龙江畜牧兽医 》 2025 北大核心
摘要：为探究镉对牛肝成纤维细胞MT基因表达及细胞凋亡的影响，试验分别用不同浓度(0.625,1.25,2.5,5,10μmol/L)镉处理牛肝成纤维细胞24 h和48 h,观察细胞形态；采用实时荧光定量PCR方法检测各处理细胞中MT基因的相对表达量，并采用流式细胞术分别检测细胞的凋亡情况和细胞周期。结果表明：随着镉处理时间和浓度的增加，牛肝成纤维细胞的损伤逐渐加剧。处理24 h,与对照(未用镉处理的牛肝成纤维细胞)相比，1.25μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量显著提高(P<0.05),2.5,5,10μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量极显著提高(P<0.01),1.25μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量显著提高(P<0.05),0.625μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量差异不显著(P>0.05);处理48 h,与对照相比，0.625,1.25,2.5,5μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量极显著提高(P<0.01),10μmol/L镉处理的细胞中MT基因的相对表达量差异不显著(P>0.05)。处理24 h,与对照相比，不同浓度镉处理的细胞凋亡率均差异不显著(P>0.05);处理48 h, 2.5,5μmol/L镉处理的细胞凋亡率显著提高(P<0.05),10μmol/L镉处理的细胞凋亡率极显著提高(P<0.01),0.625,1.25μmol/L镉处理的细胞凋亡率差异不显著(P>0.05)。处理24 h,与对照相比，10μmol/L镉处理的细胞中G1期细胞占比极显著提高(P<0.01),0.625,1.25,2.5,5μmol/L镉处理的细胞中G1期细胞占比差异不显著(P>0.05);2.5μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比显著降低(P<0.05),10μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比极显著降低(P<0.01),0.625,1.25,5μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比差异不显著(P>0.05)。处理48 h,与对照相比，0.625μmol/L镉处理的细胞中G1期细胞占比显著降低(P<0.05),5μmol/L镉处理的细胞中G1期细胞占比极显著提高(P<0.01),1.25,5,10μmol/L镉处理的细胞中G1期细胞占比差异不显著(P>0.05);0.625μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比显著提高(P<0.05),5μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比极显著降低(P<0.01),1.25,5,10μmol/L镉处理的细胞中S+G2期细胞占比差异不显著(P>0.05)。说明镉可导致牛肝成纤维细胞损伤，促进细胞中MT基因的表达，长时间(48 h)镉暴露会促进细胞凋亡，但长时间高浓度(2.5μmol/L以上)镉暴露会使MT基因表达量降低，同时高浓度镉会促进G1期细胞增殖，抑制S+G2期细胞增殖。
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甘蓝型油菜遗传图谱构建及偏分离标记分析
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：以甘蓝型紫叶油菜‘10-Zi006’为父本、绿叶油菜‘10-4438’为母本杂交，以‘10-4438’回交构建BC1作图群体并基于简化测序构建连锁遗传图谱。利用DArT-Seq技术对BC1群体进行基因分型，共获得3 404个SNP标记和5 968个in silico DArT标记，筛选高质量SNP标记构建框架遗传图谱，在此基础上，通过“固定标记位置顺序”的方法，逐步添加包含偏分离标记在内的其他SNP标记及in silico DArTs标记，利用MSTmap在线分析软件，最终构建了一张包含9 212个多态性标记、1 614个标记位点、覆盖3 616.38 cM的遗传连锁图谱，该图谱平均遗传距离2.24 c M，包含21个连锁群，覆盖甘蓝型油菜19条染色体。在构图的9 212个多态性标记中，偏分离标记(P<0.05)共计767个，占总标记数的8.33%，偏分离标记在染色体上表现为成簇分布且形成热点区域；主要分布在A2、A1、C4、C6染色体上，其中A2染色体340个多态性标记全部为偏分离标记，占总偏分离标记的44.33%。本研究为甘蓝型油菜叶片花青素含量等性状的遗传解析及改良打下了基础。
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'苟当3号'水稻叶绿体基因组特征分析
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了探明‘苟当3号’水稻叶绿体基因组特征及系统发育关系。本研究以‘苟当3号’水稻DNA为材料，使用NovaSeq测序平台进行高通量测序，并进行组装、注释、图谱构建、密码子偏好分析、SSR位点分析及系统发育树分析。结果表明：(1)‘苟当3号’水稻叶绿体基因组总长134 551 bp，由一个大单拷贝区(80 604 bp)，一个小单拷贝区(12 343 bp)，以及两个反向互补区(20 802 bp)组成。(2)在‘苟当3号’水稻叶绿体基因组中共检测到136个基因，其中90个蛋白编码基因、38个t RNA基因和8个rRNA基因。在检测出的136个基因里有21个基因含有内含子，内含子长度最长的是trn K-UUU，为2 488 bp，而内含子长度最短的是rpl16，为125 bp。(3)‘苟当3号’水稻叶绿体基因组中密码子使用频率最高的是亮氨酸，最低的是半胱氨酸，且密码子偏好A/T碱基结尾。(4)共检测到17个长重复序列和128个简单重复序列，有81.25%的简单重复序列是由A/T组成，表明大多数简单重序列位点具有A/T碱基偏好性。(5)‘苟当3号’与其他21个稻属物种叶绿体基因组的系统发育分析结果表明，‘苟当3号’与粳稻的亲缘关系更近，其次籼稻与粳稻在进化树中处于不同的分支。该研究获得了‘苟当3号’的叶绿体基因组特征信息，为‘苟当3号’的系统进化和遗传育种研究提供理论依据。
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基于SRAP标记的生姜种质资源遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了研究生姜种质资源的遗传多样性及亲缘关系，为其地方种质资源的收集、保护和创新利用提供参考依据。本研究采用SRAP分子标记技术，对来源不同的96份生姜种质资源进行遗传多样性分析，并通过POPGENE 32软件计算各个遗传多样性参数，并采用NTSYS pc-2.1软件进行种质间的UPGMA (Unweighted pair-group method,非加权组平均法)聚类分析和基于遗传一致度的群体间聚类分析。结果表明：供试96份生姜种质资源具有较为丰富的遗传多样性，利用筛选出的13对差异SRAP引物从生姜资源中扩增出多态性条带96条，多态性比率为88.89%，说明生姜种质资源的遗传变异较为广泛。根据来源相同或相近，将生姜种质资源分为13个群体，生姜资源品种间基于Nei's遗传多样性指数和Shannon多态性信息指数的分析结果表明，生姜虽为无性繁殖作物，但其具有较为丰富的遗传多样性。SRAP标记技术对生姜资源的多态性检出率水平较高，可有效揭示其遗传多样性和亲缘关系，群体内具有丰富的遗传多样性，但群体间遗传变异较小。
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贵州地方大豆种质资源7S和11S球蛋白及其亚基组分含量分析
《大豆科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为明确贵州地方大豆种质资源的贮藏蛋白组分及其亚基组分含量情况，本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）对107份大豆种质资源的7S和11S球蛋白及其亚基组分、11S/7S比值进行分析。结果表明：贵州省不同地方大豆种质资源间蛋白组分及其亚基组分含量存在明显差异；7S和11S球蛋白的平均值分别为17.35%和44.27%,变异系数分别为28.13%和15.14%,11S/7S比值范围为1.47～6.48,平均值为2.74,变异系数为29.48%;7S与11S球蛋白含量之间呈极显著负相关，7S和11S球蛋白与蛋白质、油脂含量之间无显著相关性；筛选出了11S/7S比值大于3的材料27份，11S/7S比值大于3且亚基组成完整的材料4份；蛋白亚基组分优异的材料6份，其中α亚基缺失材料3份，α′、α亚基缺失材料1份，α′、α、A3和A4亚基缺失材料1份，A3亚基缺失材料1份，这些优异资源材料可为加工专用或特殊用途大豆品种的选育和改良提供遗传基础和参考。
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