科研产出
mRNA序列与相应UTR中内含子序列的相互作用
《内蒙古大学学报(自然科学) 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:UTR区中的内含子对基因的表达调控过程发挥着重要的作用,它通过与相应mRNA的序列匹配方式发生相互作用并实现对基因的表达调控.采用Smith-Waterman算法进行局域比对,获得UTR区中的内含子与相应mRNA序列之间的最佳匹配片段.分析6个物种mRNA序列上最佳匹配片段的序列特征及匹配频率的分布规律,并分析这种相互作用分布的普适性.结果发现:最佳匹配片段的配对率和平均长度分布与siRNA和miRNA的结合特征一致; UTR区中的内含子与相应mRNA序列上的UTR序列存在较强的相互作用,低GC片段倾向与3′UTR区作用,而高GC片段倾向结合到5′UTR区.结论表明最佳匹配片段的序列特征符合RNA-RNA相互作用的一般规律,内含子序列应该是一类调控基因表达的功能片段.UTR区中的内含子与mRNA序列是协同进化的,通过相互作用完成应有的功能.
关键词: mRNA 内含子 局域比对 最佳匹配片段 G+C含量
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放牧强度对短花针茅荒漠草原甲虫群落分布格局的影响
《生态学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:放牧对脆弱的荒漠草原生态系统有着重要影响,且随放牧强度及持续时间不同而变化.鞘翅目昆虫是环境监测与生物多样性变化的指示生物.利用巴氏罐诱法对短花针茅荒漠草原不同放牧强度草地的甲虫群落组成和多样性进行调查,探究放牧对荒漠草原甲虫群落的影响.结果表明:(1)步甲科、金龟科为短花针茅荒漠草原甲虫群落优势类群,埋葬甲科、芫菁科、拟步甲科和花金龟科为常见类群.(2)放牧强度增加不利于维持更多的捕食性甲虫;对照和轻度放牧样地可维持更多的腐食性甲虫.(3)甲虫数量随放牧强度增加而递减;群落多样性以重度放牧草地最大,轻度放牧草地最小;群落优势度为对照、中度、重度显著高于轻度放牧草地.各甲虫类群在不同放牧强度草地出现时间、高峰期均不同.(4)对照、轻度、重度放牧样地的甲虫优势类群群落结构不同于其他生境,但均与中度放牧样地存在相似性.轻度、中度、重度放牧样地的甲虫稀有类群群落结构不同于其他生境,但均与对照样地存在相似性.(5)甲虫群落个体数与植物群落物种丰富度、盖度、植物平均高度、生物量呈显著正相关.Shannon-Wiener多样性指数、Margalef丰富度指数均与植物群落物种丰富度、生物量显著负相关.研究结果为荒漠草原甲虫多样性保护提供参考依据.
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复合菌培养物及酵母 β-葡聚糖对肉羊生长性能与免疫功能的影响
《动物营养学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:本试验旨在研究复合菌培养物及酵母β-葡聚糖对肉羊生长性能与免疫功能的影响.试验选取50日龄断奶健康公羔羊105只,随机分为3组,每组5个重复,每个重复7只羔羊.对照组饲喂全混合日粮(TMR),试验Ⅰ组在TMR中添加复合菌培养物(前期添加量为50 g/kg,中期与后期添加量为70 g/kg),试验Ⅱ组在TMR基础上额外添加酵母β-葡聚糖(75 mg/kg),试验期共137 d,其中预试期7 d,正试期130 d.在试验第1、30、60、90和130天空腹称肉羊体重,测定生长性能指标,并且在试验第1、30、60和90天采集血样,测定免疫指标.结果表明:1)与对照组相比,试验Ⅰ组和Ⅱ组平均体重分别提高了10.02%和5.05%(P<0.05),屠宰率分别提高了1.29%和1.10%(P>0.05),料重比分别降低了10.33%(P<0.05)和4.21%(P>0.05).2)与对照组相比,试验Ⅰ组血清中酸性磷酸酶活性和溶菌酶含量显著提高(P<0.05),试验Ⅰ组血清中免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)、白细胞介素-lβ(IL-lβ)、白细胞介素-2(IL-2)、白细胞介素-6(IL-6)、干扰素-γ(INF-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、CD+3含量及CD+4/CD+8显著提高(P<0.05),试验Ⅱ组血清中IgG、IgM、IL-lβ含量显著提高(P<0.05).综上,复合菌培养物和酵母β-葡聚糖二者均可以显著提高肉羊平均体重;复合菌培养物显著提高肉羊的特异性免疫、非特异性免疫功能及降低料重比;酵母β-葡聚糖显著提高肉羊的特异性免疫功能.
关键词: 复合菌培养物 酵母β-葡聚糖 肉羊 生长性能 免疫功能
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燕麦种质资源矿质元素的多样性分析
《作物杂志 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:为了明确燕麦种质资源矿质元素含量的多样性,采用原子吸收分光光度法测定了燕麦种质铜(Cu)、铁(Fe)、锌(Zn)、镁(Mg)和钙(Ca)元素的含量,进行遗传变异、聚类和相关分析.结果表明:供试材料的Cu、Fe、Zn、Mg和Ca元素含量具有丰富的多样性,平均多样性指数为2.022,平均变异系数为29.775%.筛选到Cu含量高的种质有休眠燕麦、加5、坝莜1号、YS0404、v5和v18;Fe含量高的种质有太丰、夏莜麦、9418、蒙燕2号和shadow;Zn含量高的种质有ハヤテ和坝莜9号;Mg含量高的种质有ハヤテ和莜麦4400;Ca含量高的种质有v18、鉴19和白燕7号.Zn、Fe、Mg的含量均较高的种质有ハヤテ、6518、加9、MARION、坝莜8号、晋燕2004、坝莜9号和品五.燕麦种质Cu与Zn含量呈显著正相关,Ca与Fe含量间呈极显著负相关.
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手掌参多糖提取物对氧化应激舍饲肉羊生产性能、抗氧化机能及肉品质的影响
《畜牧兽医学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:本试验旨在研究手掌参多糖提取物对氧化应激舍饲肉羊生长性能、肉品质及抗氧化应激作用的影响,为手掌参及其提取物的深入研究与开发提供依据.试验选用20只6月龄体重为(35.0±4.0) kg的健康雄性小尾寒羊,随机分为两组,每组10只羊,分别为试验组和对照组.整个试验期42 d,一共分为3个阶段,前15 d为空白期,中间15 d为处理期,后12 d为造模后观测期.处理期第1天开始,对照组饲喂基础日粮,试验组饲喂在基础日粮内添加30 mg·kg-1手掌参粗多糖提取物的颗粒饲料.在处理期第15天时,对各组试验羊只按体重(BW)一次性腹腔注射Diquat(敌草快)溶液10 mg·kg-1,制造氧化应激模型,进入造模后观测期.在整个试验期第1、15、30、33、36、39和42天晨饲前空腹称重并采血,分离血清,测定血清中的抗氧化指标(SOD、GSH-Px、T-AOC、MDA).在试验期第42天,每组随机选取5只羊屠宰后采集肉样,检测肉品质相关指标.试验结果显示,舍饲肉羊日粮中添加手掌参多糖提取物可显著提高肉羊平均日采食量(P<0.05),且当机体遭受氧化应激时,日粮中添加手掌参多糖提取物的试验处理组平均日采食量、平均日增重以及抗氧化酶含量等指标恢复较快,羊肉滴水损失显著降低,羊肉剪切力显著提高(P<0.05).试验结果证明,手掌参多糖提取物可提高肉羊生产性能,且能缓解氧化应激造成的生产性能和抗氧化性能下降的问题,具有一定的抗氧化应激作用.
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线虫核糖核蛋白基因外显子连接序列与其内含子的相互作用
《内蒙古大学学报(自然科学) 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:剪接后的内含子与相应mRNA序列之间存在序列匹配关系,它们参与基因的表达和调控过程.为了揭示两者之间的序列匹配特征,对线虫核糖核蛋白基因的外显子连接序列与相应内含子序列采用Smith-Waterman局域比方法得到它们的最佳匹配片段,分析了外显子连接序列上的匹配频率F值分布.发现:1)连接点两侧匹配频率分布有明显的差异,显示出了外显子的边界.2)第一内含子和长内含子在外显子连接序列上的分布偏好与其他内含子有明显区别.3)对第一内含子而言,高GC含量的最佳匹配片段在外显子连接序列上表现出明显的偏置,在外显子上游EJC结合区域的匹配频率出现极小值分布.结果 表明:EJC和内含子在与外显子序列结合的过程中存在相互竞争和相互协作的关系,内含子序列与编码序列是协同进化的,通过相互作用完成应有的功能.
关键词: 内含子 外显子连接序列 局域比对 相互作用 外显子连接复合体
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蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:[目的]对蒙农红豆草花瓣转录组微卫星SSR特征进行分析,为开发新的分子标记及探明各类性状的遗传机制研究奠定基础.[方法]以蒙农红豆草突变群体中浅色花瓣和紫红色花瓣(对照)为试验材料,通过Illumina HiSeqTM 2000对其进行高通量测序和组装,利用MISA软件对其所有Unigene进行SSR搜索,并对SSR分布及其序列特征进行分析.[结果]在蒙农红豆草转录组数据中共获得53 009条Unigene,其中6 202条Unigene上分布了8 175个SSR位点,每5.86 kb就有1个SSR位点;重复基元数量以三核苷酸为主(49.13%),二核苷酸次之(22.07%);在284种重复基元中以AG/CT类型最高(16.16%),其次为AAG/CTT(14.30%);三核苷酸基元重复次数种类最多(11种),二核苷酸次之(10种).随着基元重复次数的增加,核苷酸数量减少.蒙农红豆草SSR长度为12~441 bp,主要集中在12~24 bp,其中具有高度多态性潜能的SSR(长度≥20 bp)有3 130条(38.29%).[结论]蒙农红豆草SSR位点出现频率高、基元类型丰富、分布密度大、多态性潜能高,在红豆草基因定位和分子标记辅助育种等方面具有较大的应用价值.
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基于SPEI_KC的华北平原小麦玉米周年干旱特征分析
《农业工程学报 》 2020 EI 北大核心 CSCD
摘要:华北平原是中国重要的冬小麦和夏玉米(麦玉)生产基地,同时也是水资源紧缺的区域,农业生产极易受到干旱的影响.该研究在标准化降水蒸散指数(Standardized Precipitation Evapotranspiration Index,SPEI)的基础上,引进作物系数(KC)改进SPEI指数,并基于改进后的SPEI_KC指数从作物生长季尺度、关键生育期尺度以及麦玉周年尺度分析1961—2017年华北平原冬小麦-夏玉米周年干旱的时空分布和变化特征.结果表明:1)SPEI_KC指数在华北平原麦玉周年干旱评估中的适用性优于SPEI_TW指数(采用Thornthwaite公式计算的SPEI指数)和SPEI_PM指数(采用Penma-Monteith公式计算的SPEI指数):在(实际)有旱(指数)评估为有旱情况下,SPEI_KC指数在代表气象站点的平均准确率为76.13%,较SPEI_TW指数、SPEI_PM指数均有提高;在无旱评估为无旱情况下,SPEI_KC指数准确率为85.67%,较SPEI_TW指数、SPEI_PM指数分别均有提高.2)小麦关键生育期和小麦生长季的空间分布均呈轻旱在河北北部较高,重旱在研究区中部较高分布,玉米关键生育期和玉米生长季干旱频率的空间分布均呈中旱在河北北部较高,重旱在山东西部较高分布.总体来说,研究区的东南部干旱频率小于西北部,山东半岛地区和河北中部旱情较轻,河南省干旱严重.3)年代际干旱程度总体呈略微减小的趋势,具体表现为大部分研究尺度的轻旱发生频率增加,所有研究尺度的中旱和重旱发生频率减小;小麦关键生育期、小麦生长季以及玉米生长季的干旱频率减小,玉米关键生育期和麦玉周年尺度干旱频率增加.研究结果能够为正确认识气候变化背景下该地区干旱分布和变化,进而采取合理措施应对气候变化提供理论依据.
关键词: 干旱 作物 降雨 SPEI 作物系数 华北平原 麦玉生长季
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外保温塑料大棚表冷器-风机集放热系统性能分析
《农业机械学报 》 2020 EI 北大核心 CSCD
摘要:为调节外保温塑料大棚的室内气温,设计了一套通过表冷器-风机与室内空气进行热交换的表冷器-风机集放热系统(TSFU系统).根据测试,TSFU系统在晴天和多云天的放热量Qr分别为(433.0±48.6) MJ和(199.3±0.1) MJ系统性能系数(COP)分别达到2.9和3.1,可将室内气温分别提高(2.5±0.4)℃和(1.1±0.3)℃,且加温成本较燃气热风炉节约了40.2%.根据模拟分析,将系统表冷器-风机的全热交换效率和表冷器-风机数量分别提高至0.44和20时,可分别使晴天Qr增加(67.4±14.9)%和(76.1±14.7)%,多云天Qr增加(14.9±7.6)%和(17.0±4.5)%,COP达到3.6±0.6以上.若将蓄水池中的水体积提高到52 m3,可使多云天Qr和COP分别提高(31.7±20.3)%和1.0±0.7但晴天Qr和COP未得到改善;将水体积减小至13 m3时,晴天Qr未受影响,但使多云天Qr和COP显著减小.因此,可使用TSFU系统调节外保温塑料大棚的室内温度.
关键词: 塑料大棚 表冷器-风机 外保温 空气余热 集放热性能
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鄂尔多斯高原西部降水量变化特征分析-以鄂托克旗为例
《甘肃农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:[目的]探求鄂尔多斯高原西部降水量的变化特征.[方法]根据鄂托克旗气象站1961~2018年(58 a)的逐日降水观测数据,运用线性倾向估计法、Mann-Kendall突变检验法、累积距平法和小波分析法对研究区的降水量变化特征进行了分析.[结果]鄂尔多斯高原西部1961~2018年年降水量总体呈上升趋势,降水量以1.2 mm/10a的速率增加;春季、秋季和冬季降水量分别以1.3 mm/10a、2.0 mm/10a和0.4 mm/10a的速率增加,夏季降水量以2.5 mm/10a的速率减少.研究区年降水量在1989年发生突变,春季和夏季、秋季、冬季降水量分别在2001年、2008年、1970年发生突变.年降水量存在着25 a、12 a、19 a和5 a的第一、第二、第三和第四主周期变化,各季节同样存在着多个时间尺度的周期变化.[结论]根据不同时间尺度的主周期变化,该区未来几年将进入降水量偏丰时期,据此可适当调整区域主栽作物紫花苜蓿的灌溉制度,以达到合理的利用水资源的目的.
关键词: 鄂尔多斯高原西部 降水量变化特征 Mann-Kendall突变检验法 累积距平法 小波分析法 紫花苜蓿
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