科研产出
菠萝MADS-box基因家族的生物信息学分析
《基因组学与应用生物学 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本研究采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数量、外显子和内含子组成情况、编码蛋白的基本特性及系统进化树的分析。结果表明,菠萝基因组中有40个MADS-box转录因子,且基因结构分析表明8个菠萝MADS-box基因符合植物MADS-box基因的典型结构,具有6个内含子和7个外显子;27个菠萝MADS-box转录因子编码氨基酸在200~300个之间,其中最小的Ac MADS40仅有104个氨基酸组成,最大的Ac MADS08由436个氨基酸组成;40个MADS-box蛋白中有31个偏碱性,4个显酸性,5个呈中性;二级结构分析结果表明,6个MADS-box蛋白无规卷曲所占比例最高,Ac MADS02α-螺旋和无规卷曲都为25个,β-转角为5个;其余33个菠萝MADS-box蛋白均以α-螺旋所占比例最高;亚细胞定位预测结果表明,大多数MADS-box蛋白定位于细胞核,其他零星分布于其他细胞器;保守基序查找分析表明,包含基序1和基序2的MADS-box蛋白所占比率均在85%以上,说明基序1和基序2是菠萝MADS-box蛋白中的重要保守基序;系统进化树分析表明,属于Ⅰ型的菠萝MADS-box基因有14个,属于Ⅱ型的菠萝MADS-box基因有26个,且可细分为11个亚组,除了FLC和AGL15这两个亚组中没有菠萝MADS-box的成员,其他9个亚组均有菠萝MADS-box基因的分布。
关键词： 菠萝 MADS-box 生物信息学 序列特征 系统进化树
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光照对荔枝果实着色和花色素苷生物合成影响的分子机制研究
《园艺学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：以‘桂味’荔枝为试材,花后45 d用双层牛皮纸对整个果穗进行完全遮光处理,14 d后(采收前7 d)解除遮光,比较遮光和解除遮光处理果皮着色以及花色素苷生物合成途径中LcUFGT等8个结构基因和调控基因LcMYB表达的变化,探索光照调控荔枝果实花色素苷合成和着色的分子机制。研究发现:遮光处理显著抑制了果皮花色素苷的合成,延缓了果实的正常着色;解除遮光后,花色素苷迅速合成,7 d后呈现荔枝典型的红色;遮光处理抑制了花色素苷生物合成途径中LcUFGT等8个重要结构基因和调控基因LcMYB1的正常表达;解除遮光后LcUFGT和LcMYB1等基因的表达量均有不同程度的增加,其中LcDFR、LcF3'H、LcUFGT和LcMYB1的表达与花色素苷含量的变化规律基本一致。可见,荔枝果皮花色素苷积累和着色依赖光照,花色素苷生物合成途径中主要的结构基因和转录因子都可以被光诱导,其中LcDFR、LcF3'H、LcUFGT和LcMYB1可能在光照调控荔枝果实色泽形成中扮演更为重要的角色。
关键词： 荔枝 光照 着色 花色素苷 结构基因 MYB转录因子
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胡椒碱提取与纯化工艺的研究
《中国调味品 》 2017 北大核心
摘要：采用乙醇浸提法提取胡椒中的胡椒碱,通过单因素和L_(16)(4~5)正交实验,确定了最佳提取工艺条件:提取温度为65℃,乙醇浓度为75%,料液比为1∶30,提取时间为0.5h,提取次数为3次。通过静态和动态实验,确定了大孔树脂分离胡椒碱的最佳工艺条件:树脂种类为AB-8,上柱浸提液浓度为1.1mg/mL,pH值为6,洗脱液为体积分数75%、pH值为5的乙醇溶液,胡椒碱纯度由浸提液的16.46%上升到69.32%。最后,通过C_(18)层析柱对大孔树脂纯化的胡椒碱粗品进一步纯化,用90%乙醇洗脱,经HPLC测定纯化后粗品中的胡椒碱纯度上升为81.26%。
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海南岛主要类型土壤剖面有效硒的分布
《江苏农业科学 》 2017 北大核心
摘要：为揭示土壤有效硒在海南岛主要土壤类型剖面上的分布迁移规律及其影响因素,以便合理开发利用富硒土地资源。采用野外采样调查、室内分析和地理信息系统(简称GIS)作图相结合的方法,在分析不同土壤不同剖面土层土壤有效硒含量的基础上,研究土壤有效硒含量与土壤有机质含量和p H值的相关性。结果表明,海南岛西北地区土壤有效硒含量最低,东北地区最高;海相沉积物和沉积岩发育的土壤中有效硒含量低于其他成土母质发育的土壤;海拔高度也是影响土壤有效硒含量的因素,随着海拔升高,砖红壤和水稻土土壤有效硒增量明显高于其他土壤类型;水稻土改为旱地和园地后土壤有效硒含量明显提高;土壤有机质含量有助于提高各土壤有效硒含量,而土壤酸碱度的作用则相反。
关键词： 海南岛 土壤类型 有效硒含量 相关性 土壤剖面 土壤有机质
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鸭坦布苏病毒对雏鸭的致病性研究
《黑龙江畜牧兽医 》 2017 北大核心
摘要：为了解鸭坦布苏病毒(DTMUV)的致病性,试验以1×10~4 EID_(50) DTMUV剂量肌肉注射5日龄樱桃谷雏鸭,采用生化指标检测试剂盒对血清样品进行生化指标检测,采用荧光定量PCR方法检测排毒情况、组织载毒量和细胞因子的变化情况。结果表明:DTMUV对肝脏、肾脏、心脏和肌肉组织都有严重损伤;DTMUV可以在肝脏、脾脏、肺脏、脑中增殖,并于攻毒后第5天在肝脏和脑中达到高峰,于攻毒后第9天后在肺脏和脾脏中达到高峰,且脑、肝脏、脾脏中病毒含量最高;攻毒后第1天DTMUV就可引起脾脏中γ干扰素(IFNγ)、α干扰素(IFNα)、白细胞介素6(IL-6)、β干扰素(IFNβ)、白细胞介素1β(IL-1β)、Toll样受体7(TLR-7)、白细胞介素2(IL-2)、主要组织相容性复合体Ⅰ型(MHC-Ⅰ)、主要组织相容性复合体Ⅱ型(MHC-Ⅱ)细胞因子过度表达,在脑中第1,2,3天均引起促炎性细胞因子IL-6、IL-2的过度应答。
关键词： 鸭坦布苏病毒(DTMUV) 生化指标 病毒载量 细胞因子 致病性
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海南省冬瓜炭疽病菌对嘧菌酯的敏感基线及抗药性监测
《中国蔬菜 》 2017 北大核心
摘要：对海南省11个市(县)冬瓜炭疽病的发病情况进行调查,并采用生长速率法测定89个冬瓜炭疽病菌菌株对嘧菌酯的敏感性。结果表明,各调查点冬瓜均受到不同程度的炭疽病为害;89个冬瓜炭疽病菌菌株对嘧菌酯的敏感性差异较大,平均EC_(50)值为(42.485 3±29.762 0)μg·m L~(-1);EC_(50)最大值是儋州的DS3-7菌株,高达129.135 1μg·m L~(-1);EC_(50)最小值是临高的LB3~(-1)4菌株,仅为0.671 4μg·m L~(-1);89个冬瓜炭疽病菌菌株中,共有嘧菌酯低抗菌株8株,中抗菌株74株,高抗菌株7株。
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高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析
《园艺学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。
关键词： 茄子 高温胁迫 内参基因 表达稳定性 实时荧光定量PCR
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香蕉中噻唑膦残留分析方法研究
《热带作物学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：建立香蕉中噻唑膦的超高效液相色谱串联质谱法(UPLC-MS/MS)残留测定方法。香蕉样品采用乙腈提取和PSA+C18分散固相萃取,采用UPLC-MS/MS多反应模式(MRM)进行分析测定。噻唑膦在添加水平0.01~1.0 mg/kg范围内,平均回收率为94.3%~107.5%,相对标准偏差为7.9%~11.0%。采用外标法定量,方法的检出限为0.001μg/m L,定量限为0.005 mg/kg。该方法简单、准确、重复性较好且节省溶剂,适用于香蕉中噻唑膦的残留检测。
关键词： 噻唑膦 香蕉 分散固相萃取 超高效液相色谱串联质谱法 残留
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