科研产出
基于ISSR和SRAP分子标记的黄精种质遗传多样性研究
《中草药 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：目的 研究黄精Polygonati Rhizoma居群遗传多样性,为黄精药材资源保护和新品种培育提供依据.方法 以4个居群22个种源47份黄精种质资源为材料,选用14条ISSR和11对SRAP分子标记进行多态性检测、遗传多样性比较和聚类分析,揭示黄精种质的遗传多样性及地理分布特征.结果 ISSR引物和SRAP引物分别扩增出186和142条清晰带数,其中多态性条带数分别为185和140,多态性比率(percentage of polymorphic bands,PPB)分别为99.46%和98.59%;遗传多样性分析显示,ISSR和SRAP标记下基因分化系数(Gst)分别为0.279 9和0.231 6,即黄精遗传变异主要发生在种群内,居群间基因流(Nm)分别为1.2864和1.659 3,遗传相似系数在0.053 3~0.948 1和0.032 8~0.967 7.聚类结果显示,相同黄精药材基原种质聚在一起,ISSR和SRAP标记分别将黄精居群分为5和3大类群,且以ISSR标记的聚类结果更符合实际地域分布.结论 黄精种质遗传多样性丰富,ISSR和SRAP标记可适用于黄精亲缘性鉴定,研究结果可为黄精资源的保护和育种提供一定参考.
关键词： 黄精 分子标记 遗传多样性 种质资源 ISSR SRAP
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比较基因组学分析鱼源荧光假单胞菌的致腐和适应性
《水产学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探究荧光假单胞菌的强致腐和环境适应性,实验通过分析2株海水鱼源荧光假单胞菌的蛋白酶活性和挥发性盐基氮(TVB-N)的形成,并采用比较基因组学方法解析致腐和适应机制.结果显示,荧光假单胞菌PF07和PF08在冷藏鱼汁中的蛋白酶活性强,积累较多TVB-N.经全基因组测序、组装和功能注释后,得到PF07基因组长度为6.13 Mb,GC含量61.4%.通过泛基因组分析可知,PF07与PF08核心基因共4980个,独特基因分别有516和470个.COG和KEGG注释显示2株致腐菌基因组中参与氨基酸代谢基因占比最高,PF07独特基因参与无机离子转运代谢居多.碳水化合物活性酶CAZy注释表明,2株荧光假单胞菌基因组中糖苷转移酶与糖苷水解酶基因均占比最高,还鉴定得到大量分解碳水化合物、蛋白质和脂质等多种底物的酶和相关蛋白基因,特别有碱性金属蛋白酶AprA、多胺ABC转运蛋白渗透酶PotC、精氨酸与鸟氨酸脱羧酶等多种降解蛋白酶.另外,2株致腐菌分布有rpoS、rpoN和rpoD多种σ因子.2株鱼源荧光假单胞菌表现出强的致腐性,研究通过比较基因组学方法解析荧光假单胞菌分布多种编码蛋白酶和腐胺形成的氨基酸代谢基因、分解糖原和脂肪的基因及环境适应调控因子.本研究从基因水平初步揭示了荧光假单胞菌强分解蛋白质等多种底物的分子基础,有助于深入探究该菌的代谢特征和致腐机制.
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西瓜NCED基因的鉴定及其对枯萎病和脱落酸的表达模式分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：脱落酸(abscisic acid,ABA)是植物生长发育和逆境胁迫所必需的一种重要的植物激素,而9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是催化植物ABA合成的关键限速酶,在植物对干旱、高盐及病原菌等逆境的响应过程中发挥十分重要的作用.然而,目前还没有报道对西瓜中的ClNCED基因进行分离和鉴定.本研究在西瓜基因组中利用生物信息学技术共鉴定出10条ClNCED基因,预测并分析了这10条ClNCED基因的基因结构、染色体位置、亚细胞定位等基本信息及在西瓜不同组织器官、ABA和枯萎病处理下的表达模式.亚细胞定位预测发现大部分西瓜ClNCED蛋白主要被定位在叶绿体和细胞质中.利用不同物种的NCED蛋白进行进化分析发现西瓜ClNCED蛋白聚类在5个亚族中.亚族Ⅳ是西瓜特异亚族,只包含一对串联重复基因ClNCED09和ClNCED10编码的蛋白.在所有西瓜ClNCED基因中,只有一半有内含子,内含子数由5~12不等.另外,我们还利用荧光定量PCR(RT-qPCR)对ClNCED基因的时空表达模式进行分析,发现一半的西瓜ClNCED基因为特异表达基因,并且大部分在雄花中优势表达.此外,我们从ClNCED基因的启动子中发现了许多重要的顺式作用元件,这些元件与激素和逆境相关,对西瓜ClNCED基因在喷施ABA及接种尖孢镰刀杆菌后的表达水平进行分析,发现绝大部分ClNCED基因能响应ABA处理,同时还鉴定到多个响应枯萎病的ClNCED基因,这也为今后西瓜ClNCED基因的功能鉴定及相关的抗病分子育种提供重要的理论依据.
关键词： 西瓜;9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED);脱落酸(ABA);基因表达;进化分析
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不同环境下栽培密度对向日葵生物量及产量的影响
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：向日葵(Helianthus annuus L.)是世界四大油料作物之一,育种家们将提高向日葵产量作为主要育种目标.向日葵产量是受多因素影响的复杂性状,在本研究中通过在浙江省嘉兴市海宁市和浙江省湖州市2个不同环境下对2个向日葵品种'浙葵1号'和'龙葵杂10号'设计栽培密度试验,调查现蕾期、花期和成熟期向日葵的生物量和产量,探究环境、基因型、栽培密度及其交互作用对向日葵生物量和产量的影响.结果发现环境对向日葵生物量和产量性状均有显著影响.栽培密度试验显示在海宁试验基地2个向日葵品种的生物量在现蕾期及成熟期受栽培密度显著影响,在湖州试验基地仅'龙葵杂10号'的生物量在花期存在显著差异.海宁基地'浙葵1号'的90株产量在不同栽培密度下存在显著差异,除湖州基地的'浙葵1号',2个品种折合亩产在不同栽培密度下均存在显著性差异.同时对向日葵生物量和产量性状进行了相关性分析,结果显示3个生育时期下的部分生物量性状与产量性状显著相关,并且在现蕾期阶段生物量性状间的相关性最紧密,除9 cm2叶片鲜重外,其他生物量性状间均呈显著正相关.多因素方差分析结果显示环境、基因型、环境与基因型交互在现蕾期、花期以及成熟期均对生物量性状有显著影响,而栽培密度在现蕾期对4个生物量性状有显著影响,而在花期和成熟期只对侧茎鲜重有显著影响.在产量性状方面,环境、栽培密度以及环境与基因型交互、基因型与密度交互对其有显著影响.以上结果表明在实际生产中需要根据不同品种在不同环境下的发育表现,适当调整栽培密度以达到高产目的.
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茶树不同叶位碳氮氢氧稳定同位素分布及变化特征
《核农学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探究茶树不同叶位的传统稳定同位素分布及其随时间的变化特征，本研究以龙井43#品种茶树为研究对象，采用元素分析-同位素比值质谱仪（EA-IRMS）对不同叶位叶片的碳同位素(δ13C)、氮同位素(δ15N)、氢同位素（δ~2H）和氧同位素(δ18O)进行分析。结果表明，随叶位自上向下递增，叶片中δ13C、δ15N和δ~2H显著贫化，而δ18O呈现相对较弱的贫化，且第2～第5叶位叶片的同位素比值最高（21.0‰～25.0‰）,相邻叶位的同位素分馏系数差异不大。此外，随着采样时间的变化和环境气候影响，前三叶位叶片的δ13C和δ15N总体呈现富集特征，而δ~2H和δ18O出现先贫化后富集的变化特征。本研究结果为探究茶树不同叶位茶叶传统稳定同位素的分布提供了数据支撑，也为研究茶叶分馏机制和数据库构建奠定了基础。
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水产源大肠杆菌耐药可移动遗传元件Ⅱ型整合子的结构特征及适应性代价
《中国食品学报 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：为分析水产源大肠杆菌耐药可移动遗传元件Ⅱ型整合子的结构特征及适应性代价,采集了浙江省市售南美白对虾、牡蛎和大黄鱼样品各200份,分离鉴定大肠杆菌,分析其耐药特征和Ⅱ型整合子携带情况.利用竞争试验和流式细胞术等方法,比较携带Ⅱ型整合子的大肠杆菌在无抗环境和抗生素亚抑制浓度下适应性代价的差异.结果表明,分离到的278株大肠杆菌中,有28株多重耐药菌携带Ⅱ型整合子,其结构均含功能缺陷型整合酶,其中27个含典型耐药基因盒dfrA1-sat2-aadA1,1个含非典型基因盒dfrA1-catB2-sat2-aadA1.在无抗LB培养条件下,上述两类Ⅱ型整合子的选择系数S依次为-0.068和-0.117,均小于0,表明携带Ⅱ型整合子的大肠杆菌在无抗环境下存在适应性代价.在抗生素亚抑制浓度(40%MIC和20%MIC)下,两类Ⅱ型整合子的选择系数S均大于0,适应性良好.综上,Ⅱ型整合子在水产源大肠杆菌中已有一定比例,且低浓度抗生素有利于其维持和富集,从而促进其有效应对外界抗生素压力,以及在细菌间传播扩散.
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两种红火蚁监测方法应用效果的比较
《环境昆虫学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：红火蚁Solenopsis invicta是全国农业、林业和进境植物检疫性有害生物,是世界自然保护联盟收录的最具有破坏力的入侵生物之一.高效精准监测红火蚁在其防控中尤为重要,而诱饵诱集是监测红火蚁的有力措施,相对诱饵的筛选和改进,诱集器方面研究则较为滞后.本文对"透明塑料瓶+火腿肠"(PS)和"新型诱集器+火腿肠"(TS)这两类诱集器的红火蚁诱集效果进行比较分析.结果表明,下午1:30至3:30时段,PS处理透明塑料瓶在放置5 min之后存在明显的升温效应,伴随着诱集到的红火蚁数量明显减少,诱集到红火蚁的诱饵比例也下降明显,较TS处理下降了43.6%.而且,TS的投放时间和回收耗时均明显比PS的短;在复杂的荒地生境中,投放的诱集器数量越多,PS的诱集器回收率则越低;当投放的诱集器达到90个时,PS处理回收率为92.34%,而TS处理为98.67%.综合上述分析,诱集方法TS由于诱饵开放、诱集和标示一体、稳定性好等特点在应用效果上较PS有优势,适用面更广,今后还需对其进一步完善和改进并应用于红火蚁的调查监测.
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杨梅衰弱病发生测报模型的建立
《浙江大学学报(农业与生命科学版) 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为开发杨梅衰弱病的关键防控技术，掌握杨梅衰弱病发生规律，迫切需要建立对该病的发生测报模型。本研究于2018—2020年在浙江省9地各选择一个衰弱病发生较轻的杨梅果园，随机选取病树，进行病情级数调查以及土壤和叶片营养元素、营养生长和果实品质参数测定。结果发现：杨梅衰弱病的病情指数与病树周围土壤有效硼、有效磷、速效钾含量，叶片中的锌、钾、锰、硼含量，营养生长的梢长、梢粗、叶长、叶宽，果实中可滴定酸含量、单果质量、可溶性固形物含量、维生素C含量等因子之间具有较显著相关性。选取较容易测量的梢长和叶宽与病情指数进行拟合，利用SPSS软件进行数据分析，成功建立了杨梅衰弱病的发生测报模型，最终得到杨梅衰弱病的预测预报方程Y=-0.058X1-5.255X2+165.35（R~2=0.64,P=0.02）。随机选择3个果园样本进行准确率检测，得到预测模型的准确率均大于90%。该测报模型的建立为杨梅衰弱病的测报及防控奠定了一定的基础。
关键词： 杨梅衰弱病 病情指数 土壤理化性质 叶片营养元素 营养生长 果实品质
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番鸭盲肠真菌菌群结构及其发育性变化研究
《动物营养学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究番鸭盲肠真菌菌群结构及其生长发育过程中真菌菌群多样性的变化.试验选用1日龄健康番鸭70只,饲养70 d,分别在番鸭1、3、7、14、28、42和70日龄时,每组随机选取6只番鸭,屠宰取盲肠内容物,提取盲肠内容物中真菌DNA进行测序分析.结果表明:在门水平上,1~70日龄番鸭的盲肠中子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)均为优势菌门.在属水平上,3~7日龄番鸭的盲肠中赤霉菌属(Gibberella)、念球菌属(Candida)和小戴维霉属(Davidiella)为优势菌属,14~28日龄番鸭的盲肠中赤霉菌属和念球菌属为优势菌属,70日龄番鸭的盲肠中以红酵母菌属(Rhodotorula)、毛芽孢子菌属(Trichosporon)和赤霉菌属为优势菌.42~70日龄番鸭盲肠中的真菌菌群种类比1~28日龄多.综上所述,番鸭盲肠中的真菌菌群种类会随着日龄的增加而逐渐丰富多样,这为番鸭肠道真菌菌群与生长发育关系的研究奠定了理论基础.
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