科研产出
黑番鸭就巢性状差异miRNAs筛选及功能预测
《农业生物技术学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：黑番鸭(Cairna moschata)是优良的瘦肉型肉鸭,耐旱、耐粗饲,在养禽业中具有重要价值和特殊地位;但是就巢性强、繁殖力低,严重制约其产业发展.本研究分别采集就巢期和产蛋期各3只黑番鸭的卵巢组织,以TRIzol法提取卵巢组织总RNA,构建文库并分析2组miRNA的差异表达;随后对miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG分析;最后通过qPCR验证高通量测序结果的可靠性.结果显示,测序产出的原始数据(raw reads)均超过11099443条,过滤后序列所占比例均高于96.15%,可用于后续分析;经比对鉴定获得344个miRNAs,包括275个已知miRNAs和69个新发现的miRNAs;与产蛋期比较,就巢期黑番鸭卵巢组织中筛选到16个差异miRNA,其中5个上调、11个下调,并预测到440个靶基因,其中生长激素促分泌素受体(growth hormone secretagogue receptor,GHSR)、卵泡抑素(follistatin,FST)等靶基因与繁殖及卵巢发育相关,推测其对应的gga-miR-16c-5p、gga-miR-146a-3p、novel_247、novel_325等miRNAs可能与黑番鸭就巢性状相关;GO富集分析表明,与繁殖发育相关的过程有染色体组织(chromosome organization)、核染色体(nuclear chromosome)、纺锤体微管(spindle microtubule)、核酸结合(DNA binding)和核苷酸激酶活性(nucleotide kinase activity)等;KEGG通路注释结果显示,234个靶基因注释到101个信号通路上,包括Wnt和胰岛素信号通路等可能与生殖细胞增殖分化及发育相关的通路.qPCR验证结果显示,上调和下调miRNAs的相对表达量变化趋势均与高通量测序结果一致.本研究筛选了黑番鸭就巢性状关键miRNAs,为从转录或转录后调控层面分析黑番鸭就巢机制、加快高产新品系的选育提供基础资料.
关键词： 黑番鸭;就巢;卵巢;miRNA;靶基因
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太子参酸腐病病原菌白地霉的生物学特性
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确太子参酸腐病病原菌白地霉（Geotrichum candidum）FJAT-32652的生物学特性。【方法】测定白地霉在不同温度、pH值、光照、碳源和氮源培养条件下的菌落直径，以及孢子的致死温度和时长，并用显微镜观察孢子在不同培养时间的萌发情况。【结果】该病原菌生长最适温度为30℃，pH值为6，碳源为麦芽糖、乳糖和葡萄糖，氮源为硫酸铵，不同光照条件对菌丝生长无显著影响，孢子的致死温度及时长为65℃水浴10 min。病原菌孢子培养3 h开始萌发，9 h形成菌丝，繁殖方式为裂殖。【结论】明确了太子参酸腐病病原菌白地霉FJAT-32 652的生物学特性，为太子参酸腐病的后续研究提供基础数据。
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整合转录组数据鉴定大型真菌原基形成的潜在通路
《微生物学通报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[背景]大型真菌子实体发育特别是从菌丝体到原基转变的分子机制,目前仍不清楚.现有的研究大多集中在有限的真菌种类或环境因素上,但对在发育中起关键作用的基因提供的信息有限.[目的]研究大型真菌原基形成的分子机制.[方法]对11个物种及4个环境因子相关的转录组数据进行分析.[结果]与对照组相比,上调基因数量从白灵菇(Pleurotus tuoliensis)的325个到梅里克氏菌(Rickenella mellea)的2854个,下调基因数量从白灵菇的379个到圆环蜜环菌(Armillaria ostoyae)的3189个.根据gene ontology (GO)注释,前3个生物过程类别为氧化-还原过程、代谢过程和碳水化合物代谢过程.此外,细胞成分类别中膜整体成分、核、膜等显著富集.同样地,分子功能类别包括水解酶活性、氧化还原酶活性和催化活性.[结论]大型真菌在原基形成中存在可能发挥重要作用的共同通路.
关键词： 大型真菌;转录组测序;原基形成;环境因子
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茶园生物多样性控害的研究进展
《应用昆虫学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：当今茶叶安全生产面临害虫为害猖獗和农药污染的突出问题，害虫生态调控是实现农业可持续发展的重要途径之一，其核心是保护自然天敌资源，使其长期有效地调控害虫。为在茶园有效实施害虫生态管理策略，各茶区积极开展了茶树病虫害及其天敌资源的调查，在摸清茶园中天敌资源种类及其种群动态和自然控害能力的基础上，如何合理规划茶园生境布局和环境条件，以更好保护天敌资源和强化其对害虫的自然控制功能进行了积极的探索。本文对茶园生态系统生物多样性的特点进行分析，并对近年来在茶园利用生物多样性生态调控害虫方面的研究报道进行综述，以期为提升其保益控害的生态服务功能，更好地在茶园应用生态管理措施提供理论依据和实践指导。
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超甜玉米闽双色6号籽粒甜度遗传基础解析
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】本研究深入探究甜玉米甜度形成的关键基因及可能涉及到的杂种优势分子机制。【方法】以超甜玉米品种闽双色6号及其双亲为研究材料，利用生物信息学，重测序，转录组等技术对蔗糖合酶基因家族进化、甜度相关基因分型及表达模式进行分析。【结果】玉米中存在18个蔗糖合酶基因；其中，Zm0001d029087与Sh1、Sus1和Sus2/3同属一个亚家族，进化上亲缘关系较近，表明Zm0001d029087可能在籽粒糖代谢中发挥功能；在双亲与B73的变异分析中发现，Sh1、Sus1和Sus2/3均存在突变，共同构成闽双色6号的超甜特性的遗传物质基础；表达分析发现，18个基因中仅Zm0001d029087与Sh1、Sus1和Sus2/3在籽粒中有表达。进一步对4个基因在闽双色6号及其双亲中的表达进行分析，结果显示，除Sh1基因外，其他3个基因在闽双色6号中的表达显著低于双亲或之一，表明闽双色6号在糖代谢途径上存在超亲遗传的分子机制。【结论】解析了闽双色6号籽粒超甜特性的遗传特性，发现1个潜在的功能基因Zm0001d029087，并初步探究杂种优势在闽双色6号超甜特性形成中的遗传机制。
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鸭腺病毒B血清1型和血清2型双重PCR检测方法的建立及应用
《中国预防兽医学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：番鸭白肝病是2014年以来我国番鸭流行的一种新疫病,其病原为一种与鸭腺病毒B型法国GR株同源性较高的新型腺病毒,暂命名为鸭腺病毒B血清2型(DAdV-B2),将法国GR株命名为鸭腺病毒B血清1型(DAdV-B1).为建立同时检测DAdV-B1和DAdV-B2的方法,本研 究根据GenBank中DAdV-B1 fiber基因和DAdV-B2fiber1基因序列特征,分别设计了 2对特异性引物,通过优化反应条件,建立了可以同时检测这两种病毒的双重PCR方法.结果显示:优化后的PCR方法最佳退火温度为60.1℃,最适引物浓度为0.16 μmol/L;利用该方法对DAdV-B1、DAdV-B2、鸭腺病毒A型(DAdV-A)、禽腺病毒血清4型(FAdV-4)、番鸭呼肠孤病毒(MDRV)、新型呼肠孤病毒(NDRV)、番鸭源鹅细小病毒(MDGPV)、番鸭细小病毒(MDPV)和禽坦布苏病毒(ATUMV)等检测,结果显示,该方法仅对DAdV-B1和DAdV-B2有特异性扩增,对其他鸭临床常见病原均无扩增,特异性较强.将DAdV-B1 fiber和DAdV-B2 fiber1质粒标准品等体积混合并作10倍倍比稀释后作为模板,利用该双重PCR方法检测,结果显示,该方法对DAdV-B1fiber和DAdV-B2fiber1质粒标准品的最低检测限分别为175拷贝/μL和163拷贝/μ.L,对DAdV-B2的最低检出滴度为1×101TCID50,敏感性较高.批内和批间的重复性试验检测结果均一致,重复性好.利用该双重PCR与单一PCR方法同时对64份临床样品检测,结果显示二者的符合率为100%,其中DAdV-B2的阳性率为79.7%(51/64),DAdV-B1的阳性率为4.7%(3/64).以上结果表明本研究建立的双重PCR方法特异性较强、敏感性较高和稳定性较好,为DAdV-B1和DAdV-B2的临床鉴别检测及其分子流行病学调查提供了技术手段.
关键词： 鸭腺病毒B血清1型 鸭腺病毒B血清2型 fiber基因 fiber1基因 双重PCR
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酿酒酵母菌剂等温干燥曲线及其存活率干燥动力学
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为高活力酿酒酵母直投式发酵剂的研发提供理论和技术支持。【方法】以酿酒酵母JH301为研究对象，采用沸腾炉热风干燥技术制备菌剂，研究不同温度下酿酒酵母沸腾炉热风干燥过程水分含量、菌存活率的变化及其相关性，建立酿酒酵母菌剂等温干燥曲线及其存活率干燥动力学模型，并采用核磁共振技术考察酵母菌沸腾炉热风干燥过程水分迁移分布规律。【结果】（1）酿酒酵母菌剂沸腾炉热风干燥过程等温干燥曲线符合Henderson指数函数模型M=a×EXP（b×T）,a、b均为与干燥温度W相关的常数。（2）随着干燥过程菌剂水分含量的下降，菌存活率呈先平缓下降后快速下降趋势，存在菌存活率拐点水分阈值。在拐点水分阈值前后，菌存活率干燥动力学模型分别符合模型y前=a前x+b前、y后=a后x+b后，a、b均为与温度（W）相关的常数。y前与y后的交叉点即为菌存活率拐点水分阈值，菌存活率拐点水分阈值与干燥温度呈正相关，菌存活率与细胞结合水的逃逸速率呈负相关。（3）菌存活率拐点水分阈值的最低干燥温度理论值为41.2℃。通过对模型参数预测与验证，适宜的干燥温度为42℃，时间为20 min，菌剂水分含量为（5.24±0.12）%，菌存活率可达（48.24±0.15）%。【结论】通过调控热风干燥过程酿酒酵母结合水的逃逸速率，可提高菌存活率。
关键词： 酿酒酵母菌剂 菌存活率 水分阈值 沸腾炉热风干燥 水分分布
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豆大蓟马消化道形态及超微结构
《昆虫学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]本研究旨在明确豆大蓟马Megalurothrips usitatus各个发育阶段消化道形态和超微结构.[方法]运用激光共聚焦显微镜和透射电子显微镜技术观察豆大蓟马若虫、预蛹、蛹和成虫期消化道形态和超微结构.[结果]豆大蓟马消化道由前肠、中肠、后肠及马氏管组成.1龄若虫、2龄若虫、预蛹、蛹、雌成虫和雄成虫的消化道平均长度分别为1 642.65±158.68,2 233.68±133.76,1 264.39±92.43,1 169.81±59.48,2 380.32±196.67和 1 344.31±143.29 μm.前肠分为咽、食道、嗉囊和贲门4个部分,肠壁由外向内分别为肌上皮细胞外层、肌肉层、上皮细胞层和角质层.1和2龄若虫前肠有大量囊泡,角质层不明显.预蛹、蛹和成虫前肠细胞角质层较厚,肌肉也较发达.中肠分为前中肠、中中肠和后中肠3个部分,由外向内分别为肌细胞层和上皮细胞层,靠近肠腔的一侧特化成微绒毛结构.1龄若虫前中肠细胞含有储备物质;2龄若虫前中肠细胞含有髓鞘样结构以及较多的类自噬泡结构;预蛹和蛹中肠细胞含有球晶;成虫前中肠和中中肠细胞含有基底迷路.后肠由回肠和直肠2部分组成,各个发育阶段均具有发达的肌肉层和角质层.马氏管没有肌肉层,上皮细胞包含线粒体、粗面内质网、基底迷路、紧密连接等细胞器或结构.预蛹和蛹的马氏管基部未观察到基底迷路结构,但预蛹马氏管细胞内分布有多泡体.此外,蛹期马氏管细胞质中观察到球晶.[结论]豆大蓟马各个发育阶段的消化道形态结构有明显差异.本研究根据消化道不同部位的形态组成,对其功能进行了推测.研究结果将为进一步解析蓟马类昆虫消化道形态和功能分化提供实验依据.
关键词： 豆大蓟马;生长发育;消化道;比较形态学;透射电子显微镜
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鸭骨形态发生蛋白SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR检测方法的建立
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】旨在建立一种检测鸭骨形态发生蛋白（BMPs）mRNA转录水平的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RTPCR检测方法。【方法】根据GenBank中BMP1、BMP2、BMP3、BMP4、BMP5、BMP6、BMP7、BMP8a、BMP10和BMP15的核苷酸序列设计并合成特异性引物进行PCR扩增，产物回收后克隆至pMD-18-T载体，构建阳性重组质粒作为标准品，优化SYBR GreenⅠ荧光定量PCR反应条件，建立其标准曲线，对建立的方法进行特异性、敏感性和重复性试验。【结果】建立的BMP1、BMP2、BMP3、BMP4、BMP5、BMP6、BMP7、BMP8a、BMP10和BMP15基因实时荧光定量检测方法特异性强，无引物二聚体及非特异性产物，熔解曲线为单峰，相关系数R2均大于0.998，组间和组内变异系数均小于1%。应用该方法检测BMPs基因在半番鸭组织中的表达水平，结果显示，BMP1、 BMP2、 BMP5和BMP7基因在心脏中表达量较高，分别为5.5×10~4、 1.1×10~5、 5.1×10~5和7.7×10~5拷贝·μL-1; BMP6和BMP10基因在肝脏中表达量较高，分别为7.5×10~4和7.6×10~3拷贝·μL-1；而BMP3、 BMP4、BMP8a和BMP15分别在法氏囊、胸腺、喙和脾脏中表达量最高，分别为1.5×10~5、2.1×10~4、1.8×10~3和3.3×10~3拷贝·μL-1。【结论】本研究建立的实时荧光定量PCR方法特异性强、重复性好，为检测鸭BMPs表达水平提供了技术手段。
关键词： 鸭 骨形态发生蛋白（BMPs） 荧光定量PCR SYBR GreenⅠ
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种植模式和坡位对茶园土壤细菌群落结构及功能类群的影响
《生态学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：茶树（Camellia sinensis L．）种植是亚热带丘陵山区主要的土地利用类型，茶园种植模式是影响土壤细菌群落结构的主要人为因素。为揭示种植模式和坡位对土壤细菌群落结构和功能的影响，选取两种不同种植模式（常规和有机种植模式）和3个坡位（上、中、下坡位）表层土壤（0—20cm）为对象，采用野外调查、Illumina Miseq高通量测序和PICRUSt2功能预测相结合的研究方法，研究不同种植模式和坡位下土壤细菌群落结构和功能特征，阐明土壤理化性质对土壤细菌群落结构的影响，预测土壤细菌功能特征。研究结果表明：（1）与常规种植模式相比，有机种植模式茶园土壤细菌Alpha多样性有所降低，其中中坡位常规茶园土壤细菌Sobs和Simpson指数显著高于有机茶园（P<0.05）；从坡面尺度看，两种种植模式下土壤细菌Alpha多样性指标均以中坡位最高，其中常规茶园中坡位土壤细菌Ace和Simpson指数均显著高于下坡位（P<0.05）。（2）各样地茶园土壤细菌共获得29个门82个纲190个目316个科517个属929个种，主要细菌优势门为绿弯菌门（Chloroflexi）、放线菌门（Actinobacterita）、变形菌门（Proteobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）。土壤细菌群落优势属以AD3、热酸菌属（Acidothermus）、norank＿f＿＿norank＿o＿＿Elsterales和norank＿f＿＿Xanthobacteraceae为主。（3）主坐标分析（PCoA）显示，不同种植模式的茶园土壤细菌群落结构存在明显差异，常规种植模式下不同坡位之间的土壤细菌群落结构有显著差异（P<0.05），有机种植下不同坡位之间的土壤细菌群落结构无显著差异。置换多元方差分析（PERMANOVA）结果表明不同种植模式的土壤细菌群落结构差异显著（P<0.05），而不同坡位土壤细菌群落结构无显著差异（P>0.05），说明种植模式对茶园土壤细菌群落结构的影响更大。组间群落差异分析（LEfSe）表明，57个差异物种对种植模式非常敏感，不同种植模式富集了不同的细菌类群。（4） PICRUSt2功能预测共获得6个一级功能层和46个二级功能层，表现出功能上的丰富性，土壤细菌群落在代谢、遗传信息处理和环境信息方面功能活跃。有机种植模式提高了土壤细菌碳水化合物代谢、氨基酸代谢、膜运输、信号转导、脂质代谢及外源生物降解与代谢功能。（5）相关分析和冗余分析结果表明，土壤碱解氮、速效磷、全磷、全钾和pH是影响土壤细菌群落丰度和多样性的主要影响因子。总体而言，有机种植模式改变了茶园土壤细菌群落结构和代谢功能，增加土壤有益细菌的数量，有利于保持茶园土壤可持续的生态环境。
关键词： 有机茶园 坡位 细菌群落组成 高通量测序 PICRUSt2功能预测
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