科研产出
草莓9–顺式–环氧类胡萝卜素双加氧酶基因FaNCED的克隆及表达分析
《园艺学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：采用RT-PCR和RACE技术从草莓果实中克隆ABA合成途径中关键基因FaNCED,该cDNA全长2228bp,具有完整的开放阅读框(ORF),共1827个碱基,编码609个氨基酸。序列分析表明,FaNCED编码的氨基酸序列与其他植物的NCED蛋白有很高的同源性。系统进化树分析显示,草莓NCED与同为蔷薇科的湖北海棠聚为一类,与橙、柠檬、温州蜜柚、葡萄等非跃变型果实NCED蛋白亲缘关系较近。实时荧光定量PCR分析发现,FaNCED基因在草莓根、茎、叶、花萼和果实中都有表达;在果实成熟过程中FaNCED的表达出现两次高峰,分别在大白果期和红果期,且在红果期表达量最高,并与ABA积累相吻合;FaNCED在果实采后1d表达略有下降,之后急剧上升,ABA含量变化与FaNCED基因的表达基本一致。FaNCED可能参与调控ABA的合成并在草莓成熟中起一定作用。
关键词： 草莓 9–顺式–环氧类胡萝卜素双加氧酶 NCED 脱落酸 ABA 基因 表达
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闽北果园生态系统大气氮湿沉降研究
《江西农业学报 》 2012
摘要：研究了2011年3月至2012年2月期间闽北果园生态系统中大气氮素湿沉降浓度、沉降量的变化规律。结果表明:监测期间降水中总氮(TN)、无机氮(TIN)、溶解有机氮(DON)、铵态氮(NH4+-N)和硝态氮(NO3--N)的平均浓度分别为2.11、1.07、1.04、0.65和0.42 mg/L。湿沉降氮量有明显的季节性变化,春、夏季高,秋、冬季低。TN年沉降量为23.19 kg/hm2,其中NH4+-N、NO3--N和DON年沉降量分别占TN年沉降量的30.60%、20.02%和49.38%。
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不同猪粪渣添加量对竹荪中各类氨基酸含量的效应分析
《福建农业科技 》 2012
摘要：应用多元统计成分分析法,对不同猪粪渣添加量栽培的竹荪中各类氨基酸总量的7个主要指标进行了主成分分析,结果表明:竹荪的鲜味氨基酸总量与甜味氨基酸总量、支链氨基酸总量、儿童氨基酸总量和必需氨基酸总量呈极显著正相关;甜味氨基酸总量与支链氨基酸总量、儿童氨基酸总量和必需氨基酸总量呈极显著正相关;支链氨基酸总量与儿童氨基酸总量和必需氨基酸总量呈极显著正相关;芳香族氨基酸总量与必需氨基酸总量呈极显著正相关;儿童氨基酸总量与必需氨基酸总量呈极显著正相关。主成分分析结果表明,原7个各类氨基酸含量指标综合为2个主成分,即综合效应因子及硫氨基酸总量效应因子,其累积贡献率可达99.81%。根据主成分方程计算出各处理的主成分得分和综合得分,排序第一的为猪粪渣用量为30%的处理。
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李果实蛋白质的营养评价与聚类分析
《福建果树 》 2012
摘要：采用国际上通用的氨基酸评分(AAS)、必需氨基酸指数(EAAI)、氨基酸比值系数分(SRCAA)等营养评价方法,对8种李(木奈)进行了蛋白质营养评价,并采用组间连接聚类法对8种供试材料进行了聚类分析。结果表明:李果实中氨基酸总量丰富,必需氨基酸占氨基酸总量的比例平均为20.23%;由氨基酸评分和氨基酸比值系数可知,甲硫氨酸和胱氨酸为第一限制氨基酸;8种李中三月李的必需氨基酸指数最高,其次为芙蓉李、红玫瑰李、黑琥珀李;8种李的必需氨基酸比值系数分均可达50以上。结果显示李果实蛋白质具有较高的营养价值。聚类分析将8种李分为3类,黑琥珀李、红玫瑰李、芙蓉李、三月李为一类且综合评价最好。
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副猪嗜血杆菌肽聚糖相关脂蛋白(PalA)的序列分析及三维结构建模
《畜牧兽医学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为深入研究副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)肽聚糖相关脂蛋白(Peptidoglycan-associated lipo-protein,palA)的生物学特性,设计了一对特异性引物,应用PCR方法来扩增Hps palA的全基因序列,进行克隆和测序。采用生物信息学方法,对Hps的palA基因核苷酸及其编码氨基酸序列进行比对,选取其中的血清学5型分离株,对其PalA蛋白的分子结构、理化性质及结构功能域、蛋白质二级结构等重要参数进行了预测和分析,并对PalA蛋白的三级结构进行了同源建模。结果显示,PCR扩增出462bp的目的片段;测序结果显示出不同血清型Hps之间palA基因核苷酸序列相似性有一定的差异,而所对应的氨基酸序列却差异很小;密码子偏爱性分析表明palA基因主要偏好GCA和AAA;PalA蛋白的理论等电点为6.28,偏弱酸性;PalA蛋白的二级结构以α螺旋、不规则卷曲和延伸链为主要构件;Hps的PalA蛋白的氨基酸序列与流感嗜血杆菌Pal蛋白的相似性为71.97%,以Pal蛋白结构为模板成功构建了Hps的PalA蛋白三维结构分子模型,该PalA蛋白三维结构与Pal蛋白相似,也含有肽聚糖结合口袋区,主要由第80位的酪氨酸(Tyr)、第39位的苯丙氨酸(Phe)和第84位的亮氨酸(Leu)组成。Hps的PalA蛋白的成功建模为PalA蛋白功能的深入研究提供了参考依据。
关键词： 副猪嗜血杆菌 肽聚糖相关脂蛋白 序列分析 同源建模
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猪流行性腹泻病毒SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
《中国兽医科学 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：参考GenBank上登录的猪流行性腹泻病毒(PEDV)株的ORF3基因序列保守型片段设计特异性引物,建立了检测PEDV的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法。在4.32×102～4.22×107copies范围内,它有很好的线性关系,其扩增相关系数为0.999,扩增效率为99%,扩增产物的熔解曲线只出现1个特异峰,无引物二聚体,熔解温度为82.23℃±0.19℃。它对传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒、猪细小病毒、猪流感病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、伪狂犬病病毒、猪瘟病毒均检测不到荧光信号,表明其特异性强。该方法的组内变异系数为0.05%～0.87%,组间变异系数为0.32%～1.24%,重复性好。结果表明,建立的SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR为PEDV早期感染的诊断及定量分析提供了新的方法。
关键词： 猪流行性腹泻病毒 SYBR GreenⅠ 荧光定量RT-PCR
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蔬菜种植元数据模型信息描述研究(英文)
《Agricultural Science & Technology 》 2012
摘要：[目的]对蔬菜种植元数据模型信息描述进行研究。[方法]针对蔬菜种植过程中品种资源、农田环境、病虫害防治和田间管理等数据在采集、管理和分析时出现的数据标准不一致、数据格式多样、数据共享效率低等问题,在分析蔬菜种植各环节需涉及的数据基础上,以XML/XML Schema为技术手段,提出蔬菜种植元数据描述方案,构建蔬菜种植元数据模型。[结果]建立了蔬菜种植元数据模型,利用XML Schema技术实现了对蔬菜种植元数据模型的信息描述。整个元数据模型拥有7个一级数据分类,包含800多个信息描述点,能够完整记录与蔬菜种植相关的品种资源、种植环境、田间管理和病虫害防治等信息。[结论]为蔬菜GAP管理、设施蔬菜、食品安全追溯等行业应用提供数据采集、管理和共享的标准规范。
关键词： 蔬菜种植 XML/XML Schema 元数据
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温度对加州新小绥螨发育及繁殖的影响
《福建农业学报 》 2012
摘要：在15～35℃、RH 80%～85%条件下,研究加州新小绥螨Neoseiulus(Amblyseius)californicus(Mcgregor)以二斑叶螨Tetranychus urticae Koch为猎物时,不同螨态的发育和实验种群生命表。结果表明,加州新小绥螨在此温度范围内能完成世代发育,发育历期随着温度升高而逐渐缩短。该螨能适应35℃的高温条件,雌性的发育历期最短仅为5.70d。平均产卵期和平均寿命均随着温度的上升逐渐缩短。25℃时,该螨的平均产卵量最大,达64.89粒.雌-1,净增殖率最高(48.252 5),且雌雄性比最大。15℃时内禀增长率和周限增长率均最低,分别为0.061 7和1.063 6,种群倍增时间最长(11.241 8d),35℃时内禀增长率和周限增长率均最高,分别为0.303 4和1.354 4,种群倍增时间最短(2.284 9d),但净增殖率最低(18.461 1)。
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