科研产出
烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析
《植物生理学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以栽培烟草(Nicotina tabacum)为研究对象,克隆获得1个MYB转录因子家族成员基因NtMYB44b的全长cDNA编码序列,其开放阅读框长度为1 086 bp,编码361个氨基酸。生物信息学分析表明,NtMYB44b分子质量为39.86 kDa,N端含有2个MYB的DNA保守结合域,为R2R3-MYB型转录因子。实时荧光定量PCR分析结果表明,NtMYB44b在烟草根、茎、叶、花中均有表达,尤其以根中相对表达量最高;NtMYB44b经100μmol·L~(-1)茉莉酸甲酯(MeJA)、100 mg·L~(-1)赤霉素(GA)、10μmol·L~(-1)脱落酸(ABA)处理后,分别于6、6、12 h相对表达量显著上调,而50 mg·L~(-1)水杨酸处理对该基因表达无显著影响;经100 g·L~(-1) PEG6000干旱胁迫处理后1 d,NtMYB44b相对表达量显著下调。推测NtMYB44b能对上述浓度的MeJA、GA、ABA处理以及干旱胁迫产生应答。
关键词： 烟草 NtMYB44b 基因克隆 生物信息学 表达分析
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高羊茅硝态氮转运蛋白基因NRT1.1的克隆及表达模式分析
《核农学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究高羊茅(Festuca arundinacea)硝态氮转运蛋白基因(NRT1.1)的表达模式,本研究以黔草1号高羊茅为试验材料,采用RACE和RT-qPCR技术对高羊茅NRT1.1基因的cDNA全长序列进行扩增,并对其不同胁迫处理下的表达情况进行分析。生物信息学分析发现,高羊茅NRT1.1的理论等电点为4.81,平均亲小性为0.919,含有约32.63%α-螺旋、7.63%β-转角和53.73%不规则卷曲。结果表明,NRT1.1基因的cDNA序列全长为2 328 bp,编码606个氨基酸,预测蛋白质分子量为193.9 kDa,且高羊茅NRT1.1与黑麦草NRT1.1氨基酸序列的相似性最高。RT-qPCR表达分析发现,高羊茅叶片NRT1.1受低氮处理0.5～1 h时表达量达到峰值,显著(P<0.05)高于对照组;在干旱和热处理下,NRT1.1表达量分别在6 h和12 h时达到峰值,且显著(P<0.05)高于对照组;在盐处理下,仅在6 h时NRT1.1表达量高于对照组,其余时间均受显著(P<0.05)抑制。本研究结果为解析高羊茅NRT1.1基因的表达模式提供了分子生物学基础。
关键词： 高羊茅 NRT1.1基因 RACE 实时定量PCR 胁迫
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贵州不同香型紫苏挥发油成分分析与评价
《植物遗传资源学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：挥发油是紫苏叶片中主要功效成分之一,具有显著的抑菌、消炎、抗氧化作用。本试验以18份贵州省香型紫苏种质资源为研究材料,采用水蒸气蒸馏法提取紫苏叶片中的挥发油,运用气质联用技术(GC_MS)进行挥发油成分分析。研究结果显示,不同紫苏种质之间挥发油含量及成分差异显著,挥发油提取率在0.47%～1.42%之间。紫苏的挥发性物质成分含量丰富,共鉴定出75种化学成分,主要成分为紫苏酮、胡椒酮、榄香素、紫苏醛、肉豆蔻醚、石竹稀、紫苏烯、芹菜脑、苯乙酮,按主成分进行分类,可分为F、PA、PK、PL、PT、PP 6种化学型。此外还发现几种特殊的含量较少但对香气影响较大的物质,如柠檬醛、香柠檬烯、桉油精、橙花叔醇等,使贵州紫苏资源呈现特有的芳香味道。表明贵州紫苏精油含量丰富、类型多样,研究结果可为紫苏的品质评价及临床应用提供理论参考。
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可持续生计框架下黔中岩溶山区农户生计资产差异研究——以后寨河流域为例
《干旱区资源与环境 》 2020 北大核心 CSCD CSSCI
摘要：农户生计资产的构成决定了农户生计策略及生计多样性,厘清农户生计资产是实现农村精准扶贫、可持续生计发展和实施乡村振兴战略的基础。文中运用参与式农村评价法和可持续生计框架对贵州岩溶腹地典型村进行实地调研,通过建立农户生计资产评价体系、测算生计资产综合值,比较不同类型农户生计资产的规律和差异性。研究表明:1)后寨河流域农户生计资产中物质资产、社会资产、金融资产是农户生计策略选择中最主要的资产;2)自然资产普遍偏低,社会资产和金融资产差异大;农户生计策略从农业向非农业转变过程中,金融和社会资产的推动作用较大,应着眼于以金融和社会资产为主的可持续发展能力的扶持。3)石漠化发生率影响农户自然资产和物质资产。农户生计策略的多样性有利于降低坡耕地石漠化程度,更有利于提高农户的生计资产。
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薏苡油脂合成关键基因克隆及其生物信息学分析
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]掌握薏苡二酰甘油酰基转移酶基因(ClDGAT)、内质网油酸脱饱和酶基因(ClFAD2)和硬脂酸脱饱和酶基因(ClSAD)的生物信息学特性,明确薏苡油脂代谢调控机制,为今后开展以提高薏苡含油量和改良脂肪酸组成为目标的育种研究提供理论依据.[方法]利用RT-PCR和RACE克隆薏苡油脂合成关键基因(ClDGAT、ClFAD2和ClSAD),通过染色体步移技术获得ClFAD2和ClSAD基因启动子序列,并以ExPASy ProtParam tool、SMART、TMHMM Server v.2.0和SOPMA等在线软件进行生物信息学分析.[结果]从薏苡叶片中成功克隆获得ClDGAT、ClFAD2和ClSAD基因,NCBI登录号分别为MK589802、MK589803和MK589804.其中,ClDGAT基因cDNA序列全长1842 bp,其开放阅读框(ORF)为1539 bp,编码512个氨基酸;ClFAD2基因cDNA序列全长1768 bp,其ORF为1164 bp,编码387个氨基酸,无内含子;ClSAD基因cDNA序列全长1727 bp,其ORF为1182 bp,编码393个氨基酸,有2个内含子.ClDGAT和ClFAD2为不稳定蛋白,ClSAD为稳定蛋白;ClDGAT为疏水性蛋白,ClFAD2和ClSAD为亲水性蛋白.ClDGAT蛋白含有MBOAT功能域,有9个跨膜区;ClFAD2蛋白含有2个功能域(DUF3473和FAdesaturase),有3个跨膜区;ClSAD蛋白含有FAdesaturase2功能域,无跨膜区.基于蛋白氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,ClDGAT、ClFAD2和ClSAD均与高粱对应的蛋白聚类在同一分支上,即薏苡在进化关系上与高粱的亲缘关系最近.ClFAD2和ClSAD基因启动子序列上均含有光响应元件(Light responsive element)、生长素响应元件(Auxin-responsive element)、茉莉酸甲酯响应元件(MeJA-responsive element)和ABA响应元件(ABA responsive element).[结论]ClFAD2和ClSAD基因启动子序列上含有抗逆性相关顺式作用元件和植物激素响应元件,说明ClFAD2和ClSAD基因不仅参与薏苡的籽粒发育及油脂合成,还可能与植株的抗逆响应相关.
关键词： 薏苡 ClDGAT基因 ClFAD2基因 ClSAD基因 油脂合成 顺式作用元件
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杜仲糖基转移酶基因的启动子克隆及表达分析
《农业生物技术学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：植物的糖基转移酶(glycosyltransferase, GTs)是一大类修饰次生代谢产物进行糖基化反应的酶,GTs能将光合作用产物转变为二糖、寡糖和多糖,也可催化产生一些重要产物,包括细胞壁多糖、糖蛋白和许多不同类型的小分子物质。GTs能够促使某些激素和信号分子糖基化,进而参与信号调节。为研究杜仲糖基转移酶基因(Eucommia ulmoides glycosyltransferase gene, EuCGT1)调控模式,本研究获得杜仲EuCGT1基因5'端上游1 671 bp长度片段。通过Plant CARE (http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)预测分析,发现该片段含有真核生物启动子核心元件TATA-box与CAAT-box。同时该片段还含有茉莉酸甲酯响应元件TGACG-motif、与干旱诱导的MYB结合位点(drought induced MYB binding site, MBS)、赤霉素响应元件(gibberelin responsive element, GARE)-motif、生长素响应元件(auxin response element, TGA-element)等多个诱导相关顺式作用元件。以不同长度启动子片段调控GUS基因表达分别构建植物表达载体,对转基因烟草中EuCGT1启动子的活性与功能进行探究。结果发现EuCGT1启动子核心区域主要位于该基因上游-268～-1 bp中。转基因烟草(Nicotiana tabacum'Xanthi')根、茎、叶的GUS组织化学染色和杜仲中EuCGT1基因的表达量分析发现该基因的启动子更倾向于在叶片中表达。对杜仲进行激素诱导与环境胁迫后发现EuCGT1的表达受茉莉酸甲酯、生长素、赤霉素及高盐的调控。该研究结果可为进一步揭示杜仲EuCGT1启动子的功能及该启动子介导的基因表达调控模式提供参考。
关键词： 杜仲 杜仲糖基转移酶基因(EuCGT1) 启动子 克隆 表达分析
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非市场评估视角下区域生态系统服务价值研究
《水土保持研究 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了对生态系统服务价值进行综合评价,促进区域公众生态意识的提升。基于非市场评估视角,以贵州省内县域为调查区域,开展了为期两年的区域生态资源服务价值调研工作。通过条件价值评估法探讨了公众的支付/补偿意愿,并选用广义线性回归模型,对其影响因素开展了实证分析。结果表明:民众的支付(WTP)/补偿意愿(WTA)均呈现出上升趋势,与2017年相比,2018年区域内生态系统服务的非市场价值为246.42亿元,上升了38.85亿元。而增强公众生态意识培育,熟悉相关生态政策以及提高受教育水平,将对支付意愿产生有效促进,但对补偿意愿未产生有效影响。此外,试验区的设立对于支付/补偿意愿的影响并不如预期明显,但对相关意愿金额的提升存在促进。
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澳洲坚果种质资源的SRAP分析及指纹图谱构建
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了分析澳洲坚果种质资源的遗传多样性及其亲缘关系,加速澳洲坚果种质的遗传改良和新品种选育,本研究以45份澳洲坚果为材料,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记对其基因组扩增并进行遗传多样性分析.结果表明24对引物组合中能筛选出多态性较好的引物10对,利用这10对引物在45份澳洲坚果中共扩增出63条谱带,其中多态性条带47条,多态性比率74.60%.45份澳洲坚果种质资源的遗传相似系数范围为0.587 3~0.968 3,均值0.777 8.UPGMA聚类分析表明:在遗传相似系数为0.785处可将45份澳洲坚果种质资源划分为6个类群,其中,'黔澳1号'和'黔澳3号'之间的遗传相似系数最大,高达0.968 3,说明这两种坚果资源遗传背景相似,'兴澳1号'和'黔引36'号间的遗传相似系数最小,仅为0.587 3,说明二者亲缘关系较远.本研究表明了SRAP技术适用于澳洲坚果种质资源的遗传多样性分析且45份澳洲坚果间的遗传变异较为丰富,为澳洲坚果种质资源的挖掘、遗传改良和进一步的分子辅助育种提供了科学依据.
关键词： 澳洲坚果(Macadamia) 种质资源 SRAP 遗传多样性 指纹图谱
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AM真菌对石漠化地区桑树的促生及养分调控作用
《热带作物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为确定丛枝菌根(arbuscularmycorrhizal,AM)真菌对石漠化地区植物及土壤养分化学计量特征的影响,本研究以石漠化地区经济树种桑树为研究对象,通过模拟石漠化地区季节性干旱,研究水分供应发生变化时,AM真菌对桑树幼苗和土壤中养分调控作用。为模拟石漠化地区季节性干旱,试验设置正常供水和自然干旱2个时期,每个时期均设未接种对照(-M)、接种摩西斗管囊霉(Fm)和接种根内根孢囊霉(Ri)3个处理。桑树收获后,测定植物、土壤中的C、N、P、K含量。结果表明:在正常供水、自然干旱2个时期,接菌处理对桑树幼苗的促生效果显著,干旱胁迫发生之后,Ri菌种与桑树的亲和性、促生效果均强于Fm菌种。接菌处理对桑树幼苗N、P营养改善作用尤为明显,无论水分供应条件如何,接菌处理都显著增加桑苗各部分N、P含量。对比土壤养分含量发现,接菌处理增加了土壤有效P含量,降低了土壤中C含量,正常供水条件下,接种Fm、Ri分别使得土壤C含量下降了7.00%和8.55%。对比土壤养分计量比发现,正常供水条件下,接菌处理显著提高了土壤中的碳磷比(C/P)和氮磷比(N/P);干旱胁迫条件下,接菌处理显著增加氮磷比(N/P)。综上所述,石漠地区发生季节性干旱时,AM真菌可以影响桑树对C、N、P养分吸收和分配,依据水分供应的变化和对养分资源需求的不同,调控土壤、植物体中C、N、P配比。
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杜仲类钙调蛋白基因EuCML5的克隆及表达分析
《园艺学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：在前期构建的杜仲基因组数据库的基础上,克隆得到了类钙调蛋白(Calmodulin-like protein,CML)基因EuCML5。分析发现EuCML5开放阅读框长度为282 bp,编码93个氨基酸,不含跨膜结构和信号肽,属于胞内蛋白,氨基酸序列中含有EF-Hand motif结构,在进化关系上与一些木本植物类钙调蛋白较近。实时荧光定量PCR分析发现,EuCML5在杜仲根中表达较高,茎和叶中表达较低。杜仲苗经过模拟干旱、高盐、茉莉酸甲酯、生长素处理后,EuCML5表达量有不同程度提高,表明EuCML5能够被非生物胁迫和植物生长调节剂诱导表达,并且受钙离子通道抑制剂LaCl_3和钙调蛋白拮抗剂TFP抑制。
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