科研产出
大型养殖工船氧锥设计与运行效果试验
《渔业现代化 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：保证养殖水体适宜的溶氧浓度对养殖鱼类的健康生长至关重要.为满足养殖工船超大封闭水体及高密度养殖的需氧要求,以氧锥作为研究对象,建立氧锥尺寸模型,根据双膜理论与菲克定律以及增氧机增氧能力试验标准,开展氧锥增氧性能试验.结果显示:氧锥出口的溶氧质量浓度能达到40 mg/L,超饱溶氧接近400%,实现超高溶氧饱和度;在氧气进气量为7.6 m3/h,氧锥操作压力为0.07~0.25 MPa条件下,增氧能力受操作压力影响不明显,但是最佳进气量范围受操作压力影响显著.操作压力越大,当氧气进气量增大时,越不容易形成大气泡析出水面,从而保持较高的氧气利用率;在氧气进气量大于6.5 m3/h,操作压力为0.07~0.25 MPa,每个养殖舱配置1个氧锥能满足养殖舱氧量需求.该研究为大型养殖工船增氧设备的工程设计及稳定高效运行提供了基础数据.
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基于全基因组重测序的拟鳄龟遗传多样性及遗传结构分析
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】从全基因组水平开展拟鳄龟养殖群体遗传多样性及群体遗传结构分析，评估养殖拟鳄龟的种质资源状况，为拟鳄龟种质资源的开发与利用及促进其养殖产业健康发展提供参考依据。【方法】分别从肇庆高要市活道镇荣杰龟鳖专业合作社（RJ）、肇庆市滋源龟鳖养殖专业合作社（ZY）和肇庆市四会肇庆盛科农业发展有限公司（SK）各采集30只拟鳄龟，通过对3个拟鳄龟养殖群体90个样本进行基因组重测序，基于全基因组单核苷酸多态性（SNP）进行系统发育进化树分析和主成分分析，从基因组水平评估养殖拟鳄龟遗传多样性及群体遗传结构。【结果】基于形态性状比例参数的聚类分析结果显示，3个拟鳄龟养殖群体分为两大分支，SK群体与RJ群体先聚类在一起，然后与ZY群体聚合。在3个拟鳄龟养殖群体中共检测出708112个SNPs位点，过滤筛选后获得220950个高质量纯合SNPs位点和440435个高质量杂合SNPs位点。3个拟鳄龟养殖群体的单核苷酸密度均为0.01 SNP/kb，核苷酸多样性（π）为0.00166～0.00171，多态信息含量（PIC）为0.151～0.154，观测杂合度（Ho）为0.171～0.205，近交系数（FHOM）分布在0.0571～0.1110；不同群体间的遗传分化系数（Fst）在0.0056～0.0138，基因流（Nm）在-0.2486～-0.2466。基于全基因组SNP构建的系统发育进化树显示，3个拟鳄龟养殖群体整体上可分为两大分支，第一分支主要由RJ群体和SK群体组成，第二分支主要由ZY群体组成，与形态聚类分析结果基本一致。主成分分析也发现，3个拟鳄龟养殖群体间的相互距离较近，且存在相互交叉现象。【结论】3个拟鳄龟养殖群体遗传多态性较低，遗传背景不够丰富，群体间遗传分化程度低，推测具有相似的遗传背景，来源于同一引种群体。因此，在今后的育种工作亟需引入新的种质资源，为种质创新提供更丰富的遗传基础。
关键词： 拟鳄龟 全基因组重测序 遗传多样性 遗传结构 SNP位点
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鲮源嗜水气单胞菌的分离鉴定、生物学特性及防控药物筛选
《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】近年来，广东省多个规模化养殖场的鲮鱼出现体表出血、腹水和肠炎等症状，明确鲮(Cirrhinus molitorella)暴发性死亡的病原菌种类及其生物学特性，筛选能有效抑制病原菌的药物或微生态制剂，为鲮鱼气单胞菌败血症的科学防治提供指导。【方法】从患病鲮鱼的肝脏和肾脏等部位分离纯化细菌，通过16S rRNA、gyrB基因测序及生理生化特征分析进行细菌鉴定，通过毒力基因PCR检测和人工感染试验分析分离菌株的致病性，利用纸片扩散法评估分离菌株的耐药性，通过拮抗抑菌试验分析3株经实验室筛选、验证并保藏的贝莱斯芽孢杆菌(Bacillu velezensis)对分离菌株的抑菌效果，采用微量二倍稀释法评估12种中草药对分离菌株的抑菌和杀菌效果。【结果】根据分离菌株的形态特征、生物学特性，结合16S rRNA、gyrB基因序列分析结果，确定分离菌株为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)。毒力基因PCR检测结果显示，分离菌株均携带act、aer、alt、ahyB、eprCAI、fla、gcaT、ast、lip和exu毒力基因，属于广泛流行的毒力基因Ⅰ型菌株。回归感染试验结果表明分离菌株均具有较强致病力。药物敏感性试验结果显示，分离菌株对氨基糖苷类、四环素类、喹诺酮类、磺胺类和氯霉素类等抗生素敏感，对中草药单体姜黄素敏感度较高。贝莱斯芽孢杆菌WLYS23、CYS06和LF01菌株对分离菌株均具有较强的抑菌活性。【结论】引起鲮鱼死亡的病原菌为嗜水气单胞菌，含有10种毒力基因，具有高致病性，推荐选用多西环素、恩诺沙星或氟苯尼考进行科学防治。此外，3株贝莱斯芽孢杆菌对分离菌株具有较好的抑菌效果，可作为鲮鱼气单胞菌败血症潜在的生防益生菌，具有广泛的应用前景；中草药单体姜黄素对分离菌株的抑菌效果较好，推荐作为防控嗜水气单胞菌的绿色候选药物。
关键词： 嗜水气单胞菌 致病性 拮抗活性 药物敏感性 绿色防控
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深度学习在鱼类识别、计数、追踪方面的应用研究进展
《大连海洋大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：人工识别鱼类的方法需要直接接触鱼体，传统机器学习方法需要人工提取特征并设计图像向量化方法，而深度学习方法能够从输入数据中获得高级特征，进而挖掘数据的分布规律。使用深度学习方法识别鱼类能够解放人力、规避主观识别的倾向性、减少鱼类应激反应，对发展智慧渔业和精准养殖有积极推动作用。本研究综述了深度学习在鱼类识别任务上的应用研究，针对研究中遇到的识别问题，提出未来应推广统一的成果检测标准以明确研究方向，不断提高应用研究水平以扩展实用性更强和智能化更高的应用任务，解决设备和模型间的接口兼容问题以增强科研人员在设备和模型选择上的灵活性，以期为使用深度学习方法研究鱼类识别任务提参考依据。
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野生和养殖青海湖裸鲤临界游泳速度比较及其与体征的关系
《水生生物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究野生和养殖青海湖裸鲤游泳能力差异,以及游泳能力与体征的关系,研究以青海湖裸鲤为研究对象,利用游泳隧道装置,采用流速递增法,对青海湖裸鲤的野生群体和人工养殖1龄、2龄、3龄群体进行临界游泳速度测定。结果显示,野生组的绝对临界游泳速度(76.17±5.42) cm/s与养殖1龄组(74.59±7.75) cm/s、养殖2龄组(77.58±4.16) cm/s相比差异不显著(P>0.05),但显著低于养殖3龄组(85.99±7.70) cm/s(P<0.05),养殖2龄组与养殖3龄组的绝对临界游泳速度没有显著差异(P>0.05)。野生组(3.11±0.38) BL/s的相对临界游泳速度显著低于养殖1龄(7.10±0.83) BL/s、2龄(4.86±0.26) BL/s、3龄组(4.78±1.37) BL/s (P<0.05),养殖1龄组的相对临界游泳速度显著高于养殖2龄组和养殖3龄组(P<0.05),养殖2龄组和养殖3龄组的相对临界游泳速度没有明显差异(P>0.05)。临界游泳速度与形态学特征的关系表明,绝对临界游泳速度与全长、体长、头长、体高、体厚、尾柄长、尾柄高、体重无显著相关性,相对临界速度与形态学特征存在显著负相关性。研究表明,在相同年龄,养殖青海湖裸鲤与野生群体相比表现出更强的游泳能力。研究结果可为青海湖裸鲤的人工养殖管理和过鱼通道的建设提供科学依据。
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湖北省稻虾养殖模式下小龙虾农药残留与风险评估
《华中农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了摸清湖北省稻虾综合养殖模式下小龙虾农药残留情况，调查了湖北省稻虾综合养殖区19种农药的残留水平，并根据残留结果分析小龙虾农药来源，对稻田小龙虾的生态风险和膳食风险进行了评估。结果显示：在选取的22个稻虾养殖采样点中，水体中共检出3种农药，分别是β-六六六，δ-六六六和异狄氏剂，其中7个采样点为生态高风险，但多是由早期环境残留所致。小龙虾样品中共检出4种农药，其来源与水稻施药有关，其次与小龙虾投入品饲料也有一定的关系。根据小龙虾膳食风险值排序，依次为六氯苯>HCHs>滴滴涕s>二甲戊灵，膳食摄入风险在0.002%～0.206%，因此调查的湖北省稻田养殖中小龙虾农药残留水平在安全范围内，但仍要持续关注农药的多途径暴露和长期暴露对小龙虾的潜在膳食风险。
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江苏镇江长江豚类省级自然保护区长江江豚种群分布与水下噪声的关系探究
《水生生物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究长江江豚种群分布与水下噪声的关系,研究于2021年江苏镇江长江豚类省级自然保护区针对长江江豚自然种群和水下噪声进行了3个水期连续调查。结果表明保护区目视调查长江江豚数量共计46头次声学拖曳式水下高频声音事件记录仪记录数量共33头,固定式水下高频声音事件记录仪记录发声事件共2253次,其种群分布具有明显的时空差异;水下噪声强度较高,均方根声压级(SPLrms)中值为133.80 dB re 1μPa90%声压级在125.77—137.42 dB re 1μPa,比水下背景噪声平均高11.50 dB,差值最大可达31.12 dB,水下噪声也具有明显的时空差异;将长江江豚种群分布与水下噪声强度叠加分析,显示二者呈明显的负相关关系,此外人类活动产生的水下噪声24h累计加权声暴露级(SELcumw)超过长江江豚暂时性听力阈移（TTS）的阈值,长时间暴露在高强度噪声下,可能会使其听力下降,甚至造成永久性的损伤。研究可为减缓水下噪声污染提供数据指导,为保护区长江江豚保护和栖息地修复工作提供数据支撑。
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现代化海洋牧场增养殖方式及用海分类体系探讨
《南方水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：海洋牧场是海洋渔业升级转型的主要方向之一，受到国内外广泛关注。随着现代化海洋牧场增养殖方式的日益多样化与复杂化，海洋牧场用海类型与用海方式也呈立体化、多样化的发展趋势，亟需系统梳理海洋牧场用海分类体系，为现代化海洋牧场用海要素保障提供技术依据。在深入剖析现代化海洋牧场概念内涵的基础上，系统梳理了海洋牧场增养殖方式及其用海分类体系。依据增养殖方式，现代化海洋牧场可分为海洋增殖场、海洋养殖场、海洋养护场等二级类型3类和三级类型13类；依据用海开放程度，可分为开放型海洋牧场、半封闭型海洋牧场、封闭型海洋牧场等二级类型3类和三级类型9类。在海域使用分类基础上，根据现代化海洋牧场用海实际情况，提出了养殖用海、增殖用海、养护用海、垂钓用海、采捕用海等用海类型，以及网箱养殖用海、筏式养殖用海、底播养殖用海、漂浮式构筑物用海等用海方式。上述海洋牧场增养殖方式及用海分类体系可为完善现代化海洋牧场用海管理体系提供参考。
关键词： 现代化海洋牧场 增养殖方式 用海类型 用海方式 用海管理
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eDNA监测测序数据分析注释中参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备的影响-以长江中游鱼类为监测目标
《湖泊科学 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：在基于宏条形码(meta-barcoding)的eDNA监测技术中,eDNA测序数据的分析和注释是决定监测结果判断和评估精准与否的基础,而参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备是eDNA测序数据分析和注释中最为关键的3个技术环节。为厘清上述3个技术环节处理方案的影响,本研究以长江中游2组eDNA监测COI基因测序数据为分析对象,针对鱼类的检出进行3组实验来分别检验:1)不同参考数据库及物种注释算法对注释结果的影响;2)不同OTU聚类序列相似度和物种注释分类置信度(序列一致性和序列覆盖度)对注释结果的影响;3)目标数据中各物种不同序列丰富度对注释结果的影响。结果显示:1) Blast算法下,3个版本nt库注释出的物种基本一致(72%～78%),2个本地序列参考库注释出的物种也基本一致(91%～96%),这5个序列参考库注释出的物种52%～68%一致;nt库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖95%以上Blast算法注释出的物种,并比Blast算法注释出的物种多151%～443%,多出的物种大都是错误注释,本地参考数据库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖66%～85%的Blast算法注释出的物种,并存在数条只注释到科属的结果。2)OTU聚类序列相似度阈值,取值0.999比取值0.99获得的OTU多154%～209%,注释到鱼类的OTU多240%～490%;注释分类置信度阈值(Blast算法,序列一致性和序列覆盖度)从0.8到0.99注释获得的物种组成(94%以上)基本一致,OTU组成(83%以上)也基本一致,注释分类置信度阈值取0.7时注释获得的物种组成、OTU组成与取0.8及以上时注释获得的有较大差异。3)在OTU聚类序列相似度阈值为0.999、注释分类置信度阈值为0.9时,多序列数据注释所得鱼类物种数、OTU数最多,物种注释正确率最高(达81.49%),分别比单序列数据的多7%、215%和高5%。在具体eDNA测序数据的分析和注释中,可通过建立完善本地参考数据库、优化OTU聚类序列相似度和物种注释分类置信度(序列一致性和序列覆盖度)取值、增加目标数据的丰富度来提高注释结果的准确性,但受制于物种注释算法的局限性,物种注释错误和注释遗漏的问题可能将长期存在,物种注释正确率通常低于85%(基于COI基因的eDNA监测)。
关键词： 环境DNA 鱼类 宏条形码 参考数据库 OTU聚类序列相似度 物种注释分类置信度 长江中游
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大黄鱼仔、稚鱼期的脊椎骨及附肢骨生长发育研究
《海洋渔业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究大黄鱼(Larimichthys crocea)仔、稚鱼期的脊椎骨及附肢骨生长发育规律，采用软骨-硬骨双染色法对大黄鱼仔、稚鱼(1～30日龄)各发育时期的脊椎骨及附肢骨进行观察。结果表明：大黄鱼仔、稚鱼脊索呈管状，于2～5日龄仔鱼有明显分节现象，9日龄仔鱼髓弓开始分化发育，13日龄仔鱼鱼脉弓开始分化发育，脊索分节完全，17日龄仔鱼背肋和腹肋变得清晰，髓棘和脉棘也分别由髓弓和脉弓末梢延长完全形成，18日龄稚鱼脊椎骨开始发生骨化，直至27日龄稚鱼骨化完全。大黄鱼仔、稚鱼奇鳍以尾鳍、臀鳍、背鳍的先后顺序形成。尾鳍在7日龄仔鱼开始发育，第1尾下骨形成，直至13日龄仔鱼开始出现尾下骨愈合现象，尾鳍条出现，15日龄仔鱼尾上骨开始发育，直至19日龄稚鱼尾杆骨、尾上骨和尾下骨均已形成，尾鳍鳍条逐渐清晰，第3、4尾下骨之间间隙将尾鳍分为两个部分，尾鳍形态初步发育完全，27～30日龄稚鱼尾杆骨首先开始骨化，其次尾下骨及鳍条开始骨化；14日龄仔鱼时出现8个臀鳍支鳍骨，17日龄仔鱼鳍条长出8条，20日龄稚鱼出现硬棘分化，直至25日龄稚鱼臀鳍发育完全，鳍条和硬棘骨化完全；17日龄仔鱼体背出现支鳍骨1行，背鳍开始发育，至20日龄稚鱼时，第1背鳍10根硬棘均出现，第二背鳍鳍条基本出现，21～25日龄稚鱼期间，硬棘从前向后逐渐骨化，鳍条发育完全。在大黄鱼仔、稚鱼骨骼发育过程中出现了脊骨前凸、椎体融合、脉棘分叉和脉棘冗余等骨骼发育畸形的现象。研究结果可为丰富大黄鱼发育生物学理论和鱼类骨骼异常发育治疗提供理论基础。
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