科研产出
半滑舌鳎Dorsalin-1-1ike基因的克隆与表达
《中国水产科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：Dorsalin-1是骨形态发生蛋白(bone morphogenetic proteins,BMPs)家族成员,在调控脊椎动物神经系统的发育中具有重要作用.目前,国内外有关脊椎动物Dorsalin.1的研究报道十分有限.本研究克隆了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevisl Dorsalin-1-like基因的cDNA序列,并分析了Dorsalin.1-likemRNA在半滑舌鳎成鱼的组织表达差异及其在早期发育阶段的表达水平变化.研究结果表明,半滑舌鳎Dorsalin.1-like基因cDNA全长为1961bp,包括了153bp的5'非翻译区(5'UTR)、编码419个氨基酸的1260bp的开放读码框(ORF),以及548bp的3'非翻译区(3'UTR).同源性分析和分子进化聚类分析结果显示,半滑舌鳎Dorsalin.1-like与红鳍东方纯(Taleifugu rubripes)、尼罗罗非鱼(Oreochromisniloticus)等的同源性最高,并与之共同聚为鱼类Dorsalin.1分支.此外,Dorsalin.1-likemRNA在半滑舌鳎成鱼的13个组织中具有广泛的分布,并在心脏组织中表达量最高,在肝、脊髓等组织中次之.在半滑舌鳎早期发育阶段(卵期、仔鱼、稚鱼、幼鱼)中,Dorsalin.1.1ike在卵期中的胚胎期表达量最高,其次为前期仔鱼期.上述实验结果表明,Dorsalin-1在调控卯期和仔鱼期的早期发育中具有重要作用,并可能通过调节神经系统的发育进而参与心脏、骨骼等组织的发育调控.本研究旨在揭示Dorsalin-1-like基因在调控半滑舌鳎早期神经系统发育的重要作用,并为筛选半滑舌鳎骨骼发育的调控因子奠定理论基础.
关键词： 半滑舌鳎 Dorsalin-1 1ike mRNA表达 早期发育 骨骼发育 神经系统
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半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)双链RNA依赖的蛋白激酶R(PKR)基因克隆和实时定量表达分析
《海洋与湖沼 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用RACE方法克隆了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)PKR基因(CsPKR),获得了CsPKR全长cDNA序列为2907bp,其中包含1959bp的开放阅读框,100bp的5′非编码区和848bp的3′非编码区。保守结构域分析显示推导的CsPKR氨基酸在N端存在两个特异的dsRBD(dsRNA binding domain dsRBD)结构域,在C端具有多个保守的激酶活性位点,包括ATP结合位点和底物配体结合位点,以及活性环结构A-loop。系统进化树分析显示鱼类、两栖类、鸟类及哺乳类的PKR具有共同的进化起源,CsPKR与牙鲆PKR的亲缘关系最为密切。荧光定量PCR结果显示,CsPKR基因在健康鱼多个组织中广泛表达,在脑中的表达最高,头肾中表达最低。经鳗弧菌和淋巴囊肿病毒分别感染后,CsPKR基因在免疫相关组织中呈现上调表达趋势,其中感染鳗弧菌12h后在血液中表达量较对照组上升了9.28倍,在感染淋巴囊肿病毒24h后,在肝脏中的表达达到最大,为对照组的9.97倍。以上结果暗示CsPKR基因在半滑舌鳎响应细菌和病毒免疫应答中起重要作用。
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鲈鲤仔鱼的异速生长模式
《动物学杂志 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用实验生态学方法研究了鲈鲤(Percocypris pingi pingi)仔鱼(0～57日龄)的异速生长模式。结果显示:鲈鲤仔鱼全长由慢速生长到快速生长的转折点为25日龄;其多数外部器官均具有异速生长特点,头部和尾部的生长快于躯干部,均在22～27日龄出现生长拐点;眼径在14～15日龄较早出现生长拐点,促使眼睛充分发育,以提高早期仔鱼开口期摄食外源食物的能力;吻长在33～34日龄出现生长拐点,促进了口的充分发育,以适应不同的饵料环境;胸鳍、背鳍、尾鳍、臀鳍和腹鳍分别在13～14日龄、31～32日龄、32～33日龄、38～39日龄、43～44日龄出现生长拐点,除胸鳍和尾鳍外,其余各鳍的鳍条均在拐点处分化完全,即鲈鲤仔鱼的游泳能力已得到大幅提高。研究表明,鲈鲤仔鱼的异速生长模式,保证了各重要功能器官的充分发育,以适应多变的环境,有效地保障了其早期的生存,可为育苗生产和野生早期资源的保护提供技术支撑。
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产胸苷磷酸化酶短乳杆菌融合菌株的构建及其特性
《食品与发酵工业 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用紫外加热灭活双亲原生质体技术对短乳杆菌原生质体进行融合,考察短乳杆菌原生质体制备、再生及融合的影响因素,并对短乳杆菌融合子产酶能力和遗传稳定性进行了研究。结果表明:短乳杆菌在含0.6%甘氨酸发酵培养液培养至对数生长期,2 mg/mL溶菌酶于37℃恒温水浴酶解脱壁2 h,原生质体制备率和再生率可达95%和48%;20 W紫外灯距离20 cm照射50 min,60℃处理短乳杆菌原生质体60 min,原生质体的灭活率几乎为100%;将双亲灭活的原生质体用40%PEG6000,30℃恒温融合10 min,筛选融合子F15并进行5次传代测试其胸苷磷酸化酶活均在1.500 U/mg湿菌体,较亲本酶活提高了50%。
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水生呼肠孤病毒基因组研究进展
《动物医学进展 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：水生呼肠孤病毒隶属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属,可感染多种淡水或海水水生动物并造成不同程度危害,严重影响了水产养殖业健康发展。水生呼肠孤病毒基因组为分11个节段的双链RNA,推测编码12种结构多肽。论文综述了近年来水生呼肠孤病毒基因组序列测定及其应用的研究进展,为进一步了解水生呼肠孤病毒基因组的多样性,推测其编码蛋白的功能及检测方法的建立,基因工程疫苗的研制,以及抗病毒研究提供借鉴和参考。
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三沙湾浮游动物生态类群演替特征
《生态学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：根据2010年6月—2011年5月三沙湾海域5个航次海洋综合调查资料,对三沙湾浮游动物种群特征进行分析,并与我国不同纬度海湾生态类群结构进行比较。探讨三沙湾海域浮游动物生态类群季节变化特征及其受水团季节变化的影响。研究结果表明:4月和5月三沙湾海域主要受到浙闽沿岸流影响,生物多样性H'指数分别为2.03和2.02;种类数分别仅为17种和19种,明显低于6月、8月和10月;浮游动物生态类群以暖温带近海种为主;优势种种类数少,单一优势种优势性明显,4月中华哲水蚤丰度占浮游动物总丰度的65.03%;群落结构特征与同期我国长江口浮游动物区系特征相似。6月三沙湾海域受到浙闽沿岸流和台湾暖流共同影响,同时因闽北雨季导致大量大陆径流汇入,使得该月浮游动物种群结构复杂,生物多样性指数和种类数全年最高,为3.12和45种,与5月相比,种类更替明显,物种更替率为69.39%;亚热带近海种丰度百分比最高(73.03%),亚热带外海种种类数百分比次之(48.89%),是海域浮游动物生态类群由以暖温带近海种为主向以亚热带外海种为主的过渡时期。8月和10月浙闽沿岸流消失,三沙湾海域受台湾暖流控制,海水温度和盐度升高,生物多样性指数和种类数均略低于6月;生态类群结构以亚热带外海种为主;优势种特征表现为种类数多而各个优势种丰度较低;浮游动物群落结构特征与南海北部海域浮游动物组成极为相似。
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杭州湾大金山岛潮间带近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)的种群鉴定及分布动态
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：于2011年5月和9月对杭州湾北岸大金山岛潮间带区牡蛎种群数量开展了生态调查,通过16S rDNA基因序列分析发现,分布于潮间带区的鲜活牡蛎全部为近江牡蛎(Crassostrea ariakensis);5月近江牡蛎平均密度和生物量分别为941(±106)个/m2和13 006(±1 509)g/m2,9月近江牡蛎平均密度和生物量分别为821(±69)个/m2和14 124(±1 470)g/m2,两个月份间近江牡蛎的平均密度和生物量均没有显著性差异;在种群大小频率构成中,以壳高(SH)介于40~45 mm的群体最多;5月和9月可收获牡蛎(SH≥70mm)的平均密度分别达到26个/m2和55个/m2。
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罗非鱼无乳链球菌C5a肽酶的克隆及原核表达质粒构建
《华中农业大学学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为进一步了解无乳链球菌表面蛋白C5a肽酶scpB基因免疫表位及毒力作用基团的相关信息,通过提取罗非鱼无乳链球菌基因组DNA,利用特异性引物PCR扩增出scpB基因的全长开放阅读框(ORF)。结果表明,该基因包括3 405 bp的ORF,可编码1 134个氨基酸,与已报道的人源无乳链球菌ScpB的氨基酸同源性达99.74%。利用生物信息学软件DNAstar、Clustal X 2.0和MEGA 5.05及在线分析工具ExPASy ProtParam、NCBIProten blast及Conserved Domain等对推导的氨基酸序列进行分析,结果显示罗非鱼无乳链球菌scpB基因编码的氨基酸序列含有3个催化三联体(catalytic triad)位点、7个假定活性位点(putative active site)、2个特异位点(spe-cific hits),以及4个超家族结构(2个肽酶超家族结构Peptidases-S8-S53 superfamily、1个类纤连蛋白超家族结构DUF1034 superfamily和1个鞭毛钩蛋白超家族结构FlgD-lg superfamily);并且该氨基酸序列有多个抗原表位,推测ScpB蛋白应具有较强的免疫原性,可作为候选的蛋白疫苗成分。将该片段插入原核表达载体pET32a(+),转入大肠杆菌BL21(DE3),挑取阳性克隆,经PCR、酶切及测序鉴定表明成功构建原核表达载体pET32a(+)/scpB。
关键词： 罗非鱼 无乳链球菌 C5a肽酶 克隆 原核表达质粒
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两种环境胁迫下果寡糖对罗非鱼血液中皮质醇及血糖的影响
《广东农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了研究在两种环境胁迫条件下果寡糖(FOS)对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)血液中皮质醇(COR)及血糖(GLU)的影响,在含有6%的中草药饲料中分别添加0 g/kg(对照组)、1 g/kg(A试验组)、3 g/kg(B试验组)和5 g/kg(C试验组)的果寡糖投喂尼罗罗非鱼,进行为期90 d的饲养试验。饲养试验结束后,一部分试验鱼进行致病菌胁迫试验,对试验鱼腹腔注射0.1 mL浓度为1.0×106CFU/mL的无乳链球菌(Streptococcus agalactiae);另一部分试验鱼进行连续48 h的拥挤胁迫(35 g/L水体)试验,分别在0、3、12、24、36、48 h取血样分析其血液中COR及GLU含量。致病菌胁迫试验结果表明,各个组的血液COR及GLU含量在胁迫后前24 h内显著提高,其中A组和B组与对照组相比差异显著;在第24 h各个组都达到了最大值,但随着时间的推移各组中COR及GLU含量逐渐下降,并慢慢恢复至与对照水平保持稳定。拥挤胁迫试验结果表明,在试验前,各组鱼血液中COR及GLU含量无明显差异,试验后3 h,所有组鱼的血液COR及GLU含量都显著上升,上升趋势持续至第12 h和第24 h,其中A组和B组与对照组相比差异显著,C组与对照组相比略低,随后各个组COR及GLU含量开始下降,最终与对照水平保持稳定。由此可见,添加1～3 g/kg的FOS可以有效提高罗非鱼机体的免疫调节能力,缓解鱼类在受到外界刺激引起剧烈的生理变化。
关键词： 罗非鱼 果寡糖 拥挤胁迫 致病菌胁迫 皮质醇 血糖
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珠江水产品中滴滴涕和六六六残留特征及风险评价
《生态毒理学报 》 2013 CSCD
摘要：以珠江河口水生食物链较顶端的鱼类和虾类作为研究对象,利用气相色谱(GC-ECD)法检测分析了有机氯农药滴滴涕(DDTs)和六六六(HCHs)及其单体在这些水生动物体内的残留水平和特征,以期为珠江流域水生生物生态风险评价提供基础资料和科学依据。结果显示,鱼类肌肉中的DDTs含量(以湿质量计)范围为未检出(nd)～42.73μg.kg-1(平均值为7.61μg.kg-1),在虾类肌肉中的含量范围为nd～9.51μg.kg-1(平均值为1.97μg.kg-1);鱼类肌肉中的HCHs含量范围为nd～1.71μg.kg-1(平均值为0.62μg.kg-1),在虾类肌肉中的含量范围为nd～0.86μg.kg-1(平均值为0.56μg.kg-1)。鱼类肌肉中DDTs和HCHs的残留均值高于虾类,而鱼类和虾类体内DDTs的残留量均高于HCHs的残留量。HCHs、DDTs的单体分别以γ-HCH、p,p'-DDT的含量最高,而且近期都有新的污染源输入。所采集的水产品中DDTs、HCHs残留量尚低于我国的无公害水产品质量安全标准要求(GB18406.4),亦低于日本、欧盟等发达国家和地区相关的最大残留限量,因此,DDTs、HCHs通过膳食的暴露暂时不会对该地区的人体健康产生危害。
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