科研产出
基于图像特征的植物形态相似度算法
《中国图象图形学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：目的研究不同植物形态之间的相似度是有效区分植物种类或科属的一个重要依据。目前的植物形态相似度计算方法,大多只考虑了植物拓扑结构或者外围轮廓等几何形状方面的相似性,而未涉及叶片颜色、冠层叶片的稠密状态及株型的松散状态等因素。因此,基于植物图像的形状特征和颜色特征,本文提出一种基于图像特征的植物形态相似度计算方法。方法首先,获取图像的轮廓特征和区域特征。轮廓特征用植物枝条的松散程度表示,具体包括植物的高宽比、轮廓四边形和第1个1级侧枝的高度;区域特征用叶片稠密度表示,计算叶片所占整个包围矩形面积的比例。其次,获取图像的颜色特征,使用基于HSV和YUV颜色空间的颜色直方图,统计图像的颜色分布。最后,利用信息熵分析数据的离散程度,据此确定各部分对应的权重大小,加权得到总体的相似度值。结果实验在人工采集的数据集上进行,得出松散度、稠密度和颜色对应的权重分别为0.62、0.17和0.21。在此基础上得到的相似度计算结果符合实际,可以有效度量植物之间的相似程度。同时,将提出的算法应用于图像检索,并与常见的5种方法进行比较。实验得出该算法查准率都在0.747 7以上。在同一查准率水平下,相比于其他方法,查全率也都处于较高水平。尤其在相似度阈值大于0.8时,查准率可以达到0.910 8以上。另外,该方法对植物图像缩放不敏感,同类植物的相似度依然接近于1。结论本文提出的植物形态相似度算法,结合了形状特征和颜色特征,计算结果符合人的视觉感受。与其他方法相比,可以更有效区分植物种类或科属。算法主要适用于背景单一的单株植物图像,可为研究植物形态的相似性提供技术参考。
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亚临界水对柑橘果胶流变学特性和分子质量的影响
《中国食品学报 》 2019 EI 北大核心 CSCD
摘要：为了探究食品加工中的亚临界水对柑橘果胶的作用规律,本文研究不同温度处理后果胶流变学特性和分子质量的变化。研究发现随着亚临界水温度的升高和处理时间的延长,果胶溶液从假塑性流体逐渐变为胀塑性流体,表观黏度逐渐下降;柑橘果胶分子质量逐渐减小,数均分子质量最低达23.7 ku,重均分子质量最低达44.5 ku,果胶降解度分别可达80.5%和71.7%;果胶溶液中还原糖的含量逐渐增高,总糖水解度可达75.1%。此外,在特定温度下,果胶大分子的降解速率不随时间的变化而变化。这些发现说明食品加工用的高温高压杀菌产生的亚临界水对柑橘果胶大分子结构具有较大的影响,值得开展深入研究。
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油用牡丹脂肪酸脱氢酶基因FAD3密码子偏好性分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：本研究以油用牡丹的脂肪酸脱氢酶FAD3基因为研究对象,运用Codon W和CUSPS等研究FAD3基因的密码子使用偏好性及组成特征.研究表明,油用牡丹FAD3基因的ENc值为55.58,该基因密码子选择偏性较弱,GC含量为0.457,密码子第3位碱基的GC含量为0.420,油用牡丹FAD3基因有18个偏好使用的密码子,其中约72.22%(13个)的密码子以A/T结尾;聚类结果分析表明,基于FAD3基因密码子相对使用度RSCU和CDS序列的分类结果一致,均能将单子叶植物和双子叶植物区分开;与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较,油用牡丹与烟草基因组密码子的使用偏性更为接近,烟草更适合作为FAD3转基因的受体.本研究结果为FAD3基因选择适合的受体和提高该基因的表达水平提供参考依据.
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不同毛色獭兔皮肤中黑色素沉积及毛囊发育规律
《西北农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：旨在研究不同毛色成年獭兔在毛囊再生过程中皮肤黑色素沉积以及毛囊发育规律.选用2月龄黑色、白色、青紫蓝色、海狸色、蛋白青色和蛋白黄色獭兔各3只,分成6组,定期采集不同生长时期(拔毛后第7天、14天、21天、28天和35天)的皮肤组织,制作石蜡切片.利用光学显微镜观察不同时期皮肤中黑色素含量及毛囊生长情况,并利用Simple western全自动蛋白表达分析技术检测黑色素合成的限速酶-酪氨酸酶(Tyrosinase,TYR)在拔毛后不同时期獭兔皮肤组织中的蛋白表达水平.结果发现,拔毛后7~21 d,毛囊处于生长期;21~28 d,毛囊由生长期进入退化期;在35 d左右时,毛干脱落,毛囊处于休止期.不同毛色獭兔的毛囊均分布在皮肤真皮层中,且不同时期毛囊在真皮层中的深浅不同;不同毛色獭兔皮肤组织在不同时期黑色素含量不同,均在14~21 d黑色素沉积量达到最高,28~35 d时,沉积量逐渐减少;TYR蛋白在不同时期的不同毛色皮肤组织中均表达,且均在21 d时表达水平最高.由此表明,毛囊再发育过程中,经历生长期、退化期和休止期.在不同时期不同毛色獭兔皮肤组织中黑色素含量变化趋势一致,黑色素合成的限速酶TYR在不同毛色獭兔皮肤中蛋白表达水平均最高,与黑色素沉积情况一致.
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大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸含量研究
《动物营养学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸(SCFA)含量的异同.试验选取3头体重为(121.00±2.89) kg的180日龄大约克母猪,采集其十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠内容物,提取微生物基因组DNA进行高通量测序分析其菌群结构,并测定SCFA含量.结果表明:从十二指肠至结肠中细菌总数、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)均在显著增加(P<0.05).相对于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠的菌群物种组成更丰富,多样性及均匀程度更高(P<0.05).在门水平上,厚壁菌门在各肠段菌群中均占绝对优势,相对丰度其次的门在十二指肠、空肠和回肠中为变形菌门(Proteobacteria),而在盲肠和结肠中为拟杆菌门;在属水平上,厚壁菌门的乳杆菌属、SMB53、梭菌属(Clostridium)以及变形菌门的弧菌属(Vibrio)为十二指肠、空肠和回肠中相对丰度较高的属;而厚壁菌门的乳杆菌属(Lactobacillus)、SMB53、链球菌属(Streptococcus)以及拟杆菌门的普氏菌属(Prevotella)是盲肠和结肠中相对丰度较高的属.相比于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠中的乳杆菌属、弧菌属、葡萄球菌属(Staphylococcus)和不动杆菌属(Acinetobacter)相对丰度显著降低(P<0.05),而瘤胃球菌属(Ruminococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、普氏菌属、粪球菌属(Coprococcus)、颤螺菌属(Oscillospira)、罗氏菌属(Roseburia)、毛螺菌属(Lachnospira)和粪杆菌属(Faecalibacterium)等SCFA产生菌的相对丰度显著升高(P<0.05).beta多样性分析表明,十二指肠、空肠和回肠中的菌群结构相似性较高,盲肠和结肠两者之间菌群相似度较高,且与小肠段显著不同(P<0.05),同时盲肠和结肠内容物中的SCFA含量显著高于小肠段(P<0.05).由此可见,大约克猪小肠和大肠中的菌群结构存在显著差异,小肠中以厚壁菌门和变形菌门为主,大肠中菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为主.大肠段拟杆菌属、普氏菌属、魏斯氏菌属(Weissella)、罗氏菌属、密螺旋体属(Treponema)和瘤胃球菌属等典型SCFA产生菌的相对丰度较高,同时其SCFA含量也较高,二者呈显著正相关.
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金华地区10个江南牡丹观花及油用品种的SSR分析
《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：研究金华地区10个江南牡丹观花和油用品种的遗传多样性,以便为供试材料的利用和品种选育工作提供理论参考.本研究采用SSR分子标记技术,用10对引物分析了10个江南牡丹品种50份材料的遗传多样性.结果表明:10对引物在50份材料中共扩增出103个位点,其中多态性位点为93个;供试的50份材料的遗传相似系数为0.751 9~0.972 3,平均遗传相似系数为0.847 6;其中大富贵和黑楼亲缘关系最近(相似系数为0.972 3),垫江红和云芳亲缘关系最远(相似系数为0.751 9).聚类分析表明,在遗传距离为0.21处,10个江南牡丹品种可分为2个大的分支;第一个大的分支包括'红芙蓉'(HFR)、'一品红'(YPH)、'玉楼春'(YLC)、'垫江红'(DJH)共4个品种20份材料,第二个大的分支由'大富贵'(DFG)、'黑楼'(HL)、'富贵粉'(FGF)、'凤丹'(FD)、'脂玉'(ZY)、'云芳'(YF) 6个品种30份材料组成.研究结果表明,这10个江南牡丹品种总体遗传多样性较高,各品种之间的亲缘关系为后续杂交育种工作提供理论参考方面具有重要的指导意义.
关键词： 金华 江南牡丹(Paeonia suffruticosa) 观花及油用 SSR
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基于Dickeya dadantii特有标志基因检测甘薯茎腐病菌
《植物病理学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：甘薯细菌性茎腐病是由达旦提狄克氏菌(Dickeya dadantii)引起的一种检疫性病害,近年来在我国多地发生,严重威胁我国甘薯产业的发展.建立特异灵敏的检测D. dadantii的方法对于鉴定检疫病原菌、田间监测病原菌和防控病害有重要意义.本研究对Dickeya属菌株的全基因组序列进行比较基因组学分析,筛选到D. dadantii特有的标志基因,针对标志基因设计引物,其中针对编码登录号为WP077245517未知蛋白基因的1对引物Dad1-F(5'-CATATCAACCAGACCAGCCGTT-3')和Dad1-R(5'-CGGCCTGCTTTTAAACAACGTATTA-3')能只从D. dadantii扩增到167 bp目的片段.由此建立了特异灵敏的常规PCR和实时荧光定量PCR检测D. dadantii的方法,为鉴定检疫甘薯茎腐病病原菌和田间监测病害提供了有效方法.
关键词： 软腐病 甘薯茎腐病 狄克氏菌 保守标志蛋白 种特异基因
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几种动物生鲜肌肉组织样品DNA提取方法的比较研究
《浙江农业学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：比较不同提取原理的试剂盒对动物生鲜肌肉组织DNA提取效果,为日常肉制品掺假检测与监测选择合适的DNA提取方法提供参考.以生鲜牛肉、羊肉、猪肉、鸡肉和鸭肉为试验材料,采用改良CTAB法、蛋白酶K法、SDS法和快速萃取法等原理的8种不同方法来提取组织样品DNA,并对提取DNA的完整性、浓度、纯度、试验耗时和后续实时荧光定量PCR检测等指标进行评价.结果表明,8种提取方法均可用于常见动物源性肌肉DNA的提取.与改良CTAB法相比,原理为蛋白酶K法、SDS法和快速萃取法的试剂盒避免了有机试剂的使用,且操作耗时短.实际操作中,可优先选择基于蛋白酶K法和SDS法的试剂盒进行DNA提取,其提取的DNA纯度和总量高,盐残留少,对实时荧光定量PCR的抑制少,满足肉制品掺假检测与监测的核酸提取需求.
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基于贝叶斯最大熵和辅助信息的土壤重金属含量空间预测
《浙江大学学报(农业与生命科学版) 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：预测土壤重金属空间分布对于识别高污染区域、进行污染来源解析和制定预防控制策略具有重要意义.本文选取浙江省杭州市为研究区,以土壤母质类型作为辅助信息,通过贝叶斯最大熵(Bayesian maximum entropy,BME)法,预测土壤重金属的空间分布,并与传统的克里金方法的预测结果进行比较.结果表明:BME在土壤重金属含量空间预测方面精度更高,其残差分布区间、平均绝对误差和均方根误差更小.研究区内重金属污染风险相对较低,其平均值均低于二级土壤环境质量标准值,但镉和砷的含量高于当地背景值,分别是背景值的1.59倍和1.31倍.铅和汞在该研究区东北部的城市地区含量较高,城市化、工业化和交通运输可能是其污染来源;镉和砷在西南部和中西部农村地区含量较高,农业活动可能是其污染来源.此外,镉在中东部还存在一块明显的高含量区域,这与当地矿业活动密切相关.铬主要受自然因素的影响.
关键词： 土壤重金属 土壤母质 贝叶斯最大熵法 克里金法 空间分析
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不同分子量辛烯基琥珀酸蜡质玉米淀粉酯的制备及其性能
《食品工业科技 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：以蜡质玉米淀粉为原料,辛烯基琥珀酸酐(OSA)为酯化剂,β-淀粉酶为酶解剂,制备了不同分子量辛烯基琥珀酸蜡质玉米淀粉酯(OSAS),并测定了其理化特性.结果表明:不同分子量(1.0*10~4~2.0*10~5 Da)OSAS的黏度在0.0035~0.0010 Pa·s范围内随分子量下降显著(P<0.05)降低,糊透明度自28.6%降低至23.1%,凝沉性和膨胀度也均随分子量降低而下降;辛烯基琥珀酸酐对蜡质玉米淀粉的酯化作用主要发生在蜡质玉米淀粉颗粒表面,酶解处理不会引入新基团.本研究初步揭示了OSAS分子量与其理化性质间的相互关系.
关键词： 辛烯基琥珀酸酐 蜡质玉米淀粉 酯化 酶解 性能 结构
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