科研产出
三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)肥满度性状全基因组关联分析及候选基因挖掘
《海洋与湖沼 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)是我国主要的海水养殖蟹类,具有重要的经济价值。肥满度性状是蟹类重要的品质性状,其调控机制尚不明确。测定了同一养殖环境下的298只三疣梭子蟹全甲宽和体重,计算得肥满度范围0.66～1.47,符合正态分布;利用全基因组测序(WGS)技术进行个体基因分型,估计肥满度性状遗传力为0.391±0.158。基于混合线性模型进行全基因组关联分析(GWAS),挖掘到99个与肥满度性状显著相关的SNP位点,主要分布于10号、26号和41号染色体。单倍型分析结果显示, 10号染色体上存在2个强连锁的单倍型,分别包含6个和7个SNP位点,并成功验证了这13个SNP位点的可靠性。进一步分析了单倍型以及CDS区域的基因,共挖掘到lman1、adcy3和cdc6等15个可能与肥满度性状相关的候选基因。研究结果为解析三疣梭子蟹肥满度调控分子机制及良种培育提供了数据支撑。
关键词： 三疣梭子蟹 肥满度 遗传力 全基因组关联分析 候选基因
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长江口及邻近海域百陶箭虫和海龙箭虫的时空共存关系
《海洋渔业 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为阐明长江口及邻近海域百陶箭虫(Sagitta bedoti)和海龙箭虫(S.nagae)时空共存关系，基于2019年11月(秋季)和2020年5月(春季)对该海域浮游动物的调查数据，采用广义可加非线性模型(generalized additive models, GAMs)分析了百陶箭虫、海龙箭虫与环境因子之间的关系，同时利用零模型检验了百陶箭虫和海龙箭虫之间的共存格局。结果表明：秋季，百陶箭虫与温度和盐度显著相关(P<0.05),海龙箭虫与水深和温度显著相关(P<0.05);春季，百陶箭虫、海龙箭虫均与温度和盐度显著相关(P<0.05)。百陶箭虫和海龙箭虫间Pianka指数秋季实测值小于模拟值，但差异不显著(P>0.05),表明百陶箭虫和海龙箭虫之间主要受扩散限制调控机制影响；春季实测值显著大于模拟值(P<0.05),表明百陶箭虫和海龙箭虫主要受环境筛选机制影响。
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鲢粪便对湖泊沉积物N2O通量与微生物群落特征的影响
《水生生物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了解滤食性鱼类粪便对湖泊沉积物N2O排放的影响,收集千岛湖沉积物、水与鲢（Hypophthalmichthys molitrix）粪便,按照不同的配比设置3个实验组,开展为期90d的模拟封闭培养转化实验。通过分析N2O的通量特征、水和沉积物混合物的理化指标、氮代谢酶活性与微生物序列,确定影响氮转化的主要环境因素及关键微生物类群。结果表明,在鱼粪的影响下,水-气界面的N2O排放通量在45d达到最高,随后迅速下降,于45—60d由排放转化为吸收,沉积物中鱼粪的添加比例越大,培养后期对N2O的吸收量越多。鱼粪的添加会显著提高循环系统中可溶性碳与氨氮的浓度,同时降低水体中的DO,显著提高沉积物中4种相关氮转化酶的活性。沉积物的16S rRNA分析表明,添加鱼粪会显著提高沉积物中变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidota）的相对丰度,其中芽孢杆菌属（Bacillus）丰度的提高可能是使沉积物表现出更强的N2O吸收效率的主要原因,为湖泊滤食性鱼类增殖的N2O减排机制提供了理论参考。
关键词： 滤食性鱼类 千岛湖沉积物 N2O排放通量 氮循环 微生物机制 鲢
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淡水定居型刀鲚无间隙基因组组装
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：淡水定居型刀鲚(Coilia nasus taihuensis)又称为湖鲚,终生生活在淡水湖泊中,不需要进行江海洄游也能完成整个生活史过程.栖息生境的差异及长期的地理分割,使得湖鲚与洄游型刀鲚(Coilia nasus)选择了不同的环境适应性进化机制.由于目前缺乏湖鲚的基因组信息,与其环境适应相关的遗传机制缺乏系统研究.本研究以太湖的定居型个体为实验对象,通过Pacific Biosciences(PacBio)high-fidelity(HiFi)测序数据组装得到高质量基因组骨架,利用Hi-C测序数据实现基因组染色体水平的组装,结合Nanopore测序数据进行基因组补洞,最终获得完整的、无间隙的湖鲚参考基因组.湖鲚基因组大小约为834.09 Mb,contig N50高达35.45 Mb,挂载到24条染色体上,挂载率为 99.83%.基因组组装质量评估显示,BUSCO(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs)评估值为 91.90%,表明基因组组装完整性较高.基因组注释特征显示,基因组重复序列总长度为382.39 Mb,占基因组的45.85%,基因结构注释共鉴定21730个蛋白编码基因,其中21666个基因(99.71%)被功能注释.基因组共线性结果显示,刀鲚和湖鲚之间具有极高的基因组共线性比率(96.95%),共鉴定到48852个共线性区块,表明两者之间遗传关系密切.本研究为后续刀鲚适应性机制研究提供素材,为深入开展湖鲚群体遗传学研究提供重要的基因组资源.
关键词： 淡水定居型 刀鲚 无间隙基因组 基因注释 共线性分析
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基于生命周期法的凡纳对虾池塘养殖碳足迹评估
《渔业科学进展 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：海产品在满足人类所需的重要蛋白质食物中发挥了重要作用，海产品在养殖过程中产生较大的碳排放，核算海产品养殖的碳足迹可以建立针对性的减排增汇措施，对实现“双碳战略”具有非常重要的意义。为了探究凡纳对虾（Penaeus vannamei）池塘养殖的碳足迹，本研究通过对山东滨州的养殖池塘进行现场监测、走访养殖企业进行实地调研以及查阅相关文献获得相关基础数据。采用从“大门到大门”的生命周期评价法，核算了山东滨州凡纳对虾养殖系统从池塘建造、养殖阶段及池塘拆除阶段的碳足迹。研究发现，生产1 kg凡纳对虾的碳足迹为5.60 kgCO2e，其中，碳的排放总量为7.69 kgCO2e，来自水体生态系统的碳吸收量为2.09 kgCO2e。主要碳源包括养殖期间肥水所用的鸡粪、配合饲料和生石灰，分别占碳排放总量的73.0%、11.3%和10.7%。建议采用控制鸡粪的使用量、精准投喂和综合养殖（如添加滤食性贝类）的方式以减排增汇、降低碳足迹。
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浮标在渔业中的应用及研究进展
《海洋技术学报 》 2025 北大核心
摘要：浮标在渔业中主要被用于标示渔具的位置和预警防盗等,以及用于监测海洋环境和渔获状况,从而为渔业科学调查和保护海洋生态提供数据支撑.本文基于文献计量的方法统计2000年以来浮标技术在渔业领域的发文量并对主要进展加以分析,从浮标的形状结构、系泊方式、通信方式及供电系统等方面回顾和总结浮标技术的发展历史和现状,对当前浮标在渔业领域中应用和研究进展进行综述,分析目前浮标在渔业应用和技术方面存在的挑战及未来发展趋势,以期为渔业领域相关研究和应用提供参考,助力浮标在渔业领域发挥更大的作用.未来浮标在渔业领域将会有更大的发展空间,向着更加智能化、国产化、集成化、高效环保的可持续性方向发展.
关键词： 浮标技术 渔业 文献计量 鱼群探测 渔场环境监测 渔具定位 养殖水质监测 标示预警
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对虾热应激生理适应机制的研究进展
《海洋湖沼通报(中英文) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：温度是影响生物机体生理功能的重要环境因子之一，随着全球变暖进程加剧，高温胁迫诱发的热应激成为近年来国内外又一新兴课题。对虾养殖业在我国水产业有重要地位，其产量23年位居世界第一，其喜好高温但过高水温带来的热应激也会从生长发育、繁殖、生理代谢等方面产生负面影响，给对虾养殖业带来严重威胁。因此，研究热应激对对虾的影响具有重要意义。本文综述了我国主要养殖对虾品种对热应激的适应策略，以及热应激对对虾生存、机体氧化水平及肠道菌群的影响；分析了在能量代谢、热休克反应、未折叠蛋白反应方面的响应机制，以期为对虾健康养殖及新型养殖模式开发提供参考。
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基于主成分分析法构建尼罗罗非鱼一般抗病力的评估模型
《中国畜牧兽医 》 2025 北大核心
摘要：[目的]探讨不同群体尼罗罗非鱼抗病力的差异,并建立一般抗病力评估模型,为筛选罗非鱼对一般病原和不良环境具有整体耐受能力的抗性新表型奠定基础.[方法]以抗链球菌病选育过程中同期产苗的5个混合家系尼罗罗非鱼(A~E群体)为研究对象,检测比较了各群体共150尾鱼体的血清免疫指标,包括超氧化物歧化酶(SOD)、酸性磷酸酶(ACP)、碱性磷酸酶(AKP)、补体3(C3)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、γ-干扰素(IFN-γ)、免疫球蛋白M(IgM)及鳃部免疫球蛋白T(IgT)的变化,同时综合各免疫指标数据,采用主成分分析法和聚类分析法对各群体的一般抗病力进行建模评估.[结果]各免疫指标在不同罗非鱼群体中的变异系数为10.18%~78.17%.其中 ACP 与 AKP、C3、IFN-γ、IgT 之间,AKP 与 C3、IFN-γ、IgT 之间,C3 与 TNF-α、IFN-γ、IgT 之间,TNF-α 与 IFN-γ、IgT之间,IFN-γ与 IgT之间,IgM与 SOD之间均为显著或极显著正相关(P<0.05;P<0.01).根据方差贡献率大小排序选择前5个主成分进行分析,结果表明,其累计方差贡献率达到85.422%.在此基础上,构建罗非鱼一般抗病力的评估模型:fi=0.006Zx1+0.056Zx2+0.054Zx3+0.221Zx4+0.282Zx5+0.232Zx6+0.259Zx7+0.082Zx8.模型评估结果显示,5个尼罗罗非鱼群体的一般抗病力大小排序为:E(0.694)>D(0.537)>C(-0.052)>A(-0.475)>B(-0.704).聚类分析表明,D、E群体聚为一支,A、B、C群体聚为一支.无乳链球菌攻毒及脾脏病理切片验证发现,各群体的抗病力强弱与其模型评估的结果基本一致,即模型评估得分越高,抗病力越强.[结论]尼罗罗非鱼一般抗病力具有群体差异性,且根据其一般抗病力的差异构建抗病力评估模型具有可行性,本试验结果可为罗非鱼种质资源的开发利用和抗病遗传育种提供参考.
关键词： 尼罗罗非鱼 一般抗病力 群体差异 主成分分析(PCA) 综合评价
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采样设计对广东近海鱼类物种丰富度估计的影响
《中国水产科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：准确评估海洋生物多样性是渔业管理和生态保护的基础,而采样设计的优化对提升物种丰富度估计精度至关重要.本研究基于2014年8月至2015年5月广东近海四季底拖网调查数据,采用计算机模拟重抽样技术,对比分析简单随机采样(SRS)与分层随机采样(StRS)在不同站点数和采样频次下对鱼类物种丰富度估计的影响.结果表明,物种丰富度探测率在低采样站点数时呈现快速上升趋势,但随着站点数量的增加,其增速逐渐减缓.达到90%的物种探测率,全年四季采样需44个需采样站点;实现80%探测率,三季采样夏-秋-冬或夏-秋-春组合所需站点数最少,为36个.相对估计误差(REE)和相对偏差(RB)的绝对值均随站点数增加而递减.StRS的REE和RB绝对值显著低于SRS(P<0.05).剔除稀有种后,达到90%探测率所需的样站点数减少至20个,且REE和RB绝对值也显著降低(P<0.05),表明稀有种的存在增加了抽样变异性.15种采样组合的分层采样设计效应(De)均小于1,表明StRS在广东近海渔业资源调查中具有更高的采样效率,尤其在采样站点数较少时更为明显.本研究为优化广东近海渔业资源调查的采样设计提供了科学依据,建议根据监测精度需求与成本约束,合理选择站点数与季节组合.
关键词： 渔业调查 简单随机采样 分层随机采样 物种丰富度 广东近海
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草鱼在不同梯度碳酸盐碱度下的生理响应
《水生生物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了全面评估草鱼的耐碱性能,研究对草鱼“沪苏1号”在低（10 mmol/L,AW-10）、中（30 mmol/L,AW-30）和高（50 mmol/L,AW-50）3个NaHCO3碱度梯度胁迫7d的重要生理响应参数及鳃组织相关基因表达进行了检测和分析。结果发现:在氨氮代谢方面,随碱度升高,血氨含量呈增加态势,AW-50组含量显著升高,但中、低碱度组和淡水对照组无显著差异（P>0.05）,血清尿素氮含量均低于淡水对照组。谷氨酸脱氢酶（GDH）活性及鳃rhbg、rhcga和glud1a在中、高碱度组均上调表达,表明草鱼可能通过提高鳃氨转运基因高表达及激活GDH途径进行氨解毒,维持其中、低碱度的血氨稳定。在免疫应答方面,尽管不同碱度组3种免疫细胞数量（白细胞数、淋巴细胞数和中性粒细胞数）均与淡水对照组无明显差异,但随着碱度的升高,3种免疫细胞数量呈先下降后上升的趋势,AW-50与对照组相比数量增多。免疫相关基因c3在碱度处理组均显著高表达,il-1β在高碱度组显著上升,tnf-α在中碱度组显著高表达,中、高碱度组发生了较为严重的炎症反应。在离子和渗透压调节方面,不同碱度组草鱼4种血清离子含量(Na+、Cl-、K+、Ca2+)均与淡水对照组相比无显著差异（P>0.05）,但Na+含量随碱度升高呈下降趋势,AW-50组含量最低;尽管鳃钠钾ATP酶（NKA）活性在AW-30和AW-50组显著低于淡水对照组（P<0.05）,但其对应基因ATP1a1b和ATP1a3b在AW-30组极显著上调表达,推测基因表达可能与其蛋白合成滞后有关。在血氧运输方面,不同碱度组常氧条件下草鱼鳃血红蛋白生成基因hbaa2和hbba1表达被显著抑制,但血液红细胞数、血红蛋白含量和血清铁含量随碱度升高呈增加态势,且在AW-50组达到最高,表明机体出现缺氧症状。综合分析来看,碱度≤30 mmol/L,草鱼基本能够维持生理稳态,高于30 mmol/L碱度临界值,因氨中毒和组织细胞缺氧造成死亡的风险将显著增加。因此,研究判定草鱼的耐碱性能为中等,具备选育耐碱新品种的潜力,适于在碱度≤30 mmol/L水体中增养殖。
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