科研产出
金定鸭与台湾褐色菜鸭遗传差异全基因组选择信号分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:[目的]对金定鸭与台湾褐色菜鸭进行选择信号分析,挖掘这2个蛋鸭品种在长期进化过程中受到强烈选择的重要经济性状相关候选基因,为揭示优异性状形成的遗传差异奠定基础.[方法]选取金定鸭和台湾褐色菜鸭各30只进行全基因组重测序,经过滤获取高质量单核苷酸多态性位点(SNPs)后,对其进行主成分分析(PCA),确定其遗传分化情况;然后采用群体遗传分化指数(Fst)和群体核酸多样性比值(π ratio)2种方法综合筛选金定鸭和台湾褐色菜鸭的受选择信号,分析其遗传差异.[结果]金定鸭和台湾褐色菜鸭重测序分别获得5.68和5.59 Gb高质量数据,分别检测到152 238 286和155 009 562个SNPs,其SNP位点分布相似.主成分分析结果显示,金定鸭和台湾褐色菜鸭显著分化;以100 kb为窗口、10 kb为步长分别计算Fst与π ratio值,将Fst top 5%(Fst>0.482)与π ratio top 5%&bottom 5%(0<π ratio≤0.47& π ratio≥3.00)作为信号重叠区域,共注释到208个候选基因.对这208个候选基因进行GO与KEGG富集分析,发现金定鸭在免疫、脂质代谢、肌肉生长发育等方面受到更强烈的选择,筛选到IL15、CCL3、CD180、AKT1、PPARGC1A、PRKAA1、FASN、PIK3R1等功能基因.[结论]金定鸭和台湾褐色菜鸭显著分化,金定鸭在免疫、脂质代谢、肌肉生长发育等方面受到强烈选择.
关键词: 金定鸭 台湾褐色菜鸭 全基因组重测序 选择信号 候选基因
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基于高通量测序筛选鸽子下丘脑和卵巢组织早熟性状相关基因
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:[目的]解析调控鸽子早熟性状的关键基因和信号通路,丰富鸽子早熟性状研究数据.[方法]选取同一批次180日龄开产和未开产大宝鸽各4只,处死后采集下丘脑和卵巢组织进行高通量测序分析,筛选与鸽子早熟性状相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO和KEGG富集分析.从DEGs中选取P值由小到大的前1 000个基因进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析,筛选早熟性状相关DEGs.采用qRT-PCR方法检测早熟相关DEGs的转录水平,验证高通量测序数据的可靠性.[结果]①下丘脑和卵巢共鉴定出685个DEGs.相比于未开产鸽子,已开产鸽子下丘脑中存在上调基因159个,下调基因201个;卵巢中存在上调基因118个,下调基因207个.②GO富集分析发现,DEGs显著富集于微管运动、神经系统过程、膜筏、细胞死亡和免疫反应等;KEGG分析显示,DEGs在ECM-受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、焦点黏连、MAPK信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控等信号通路显著富集.这些信号通路和生物学过程涉及多个与卵泡形成和发育密切相关的基因.③筛选到AKR1D1、COL1A1、FAS、PRLR和TGFBR2等5个早熟性状相关DEGs,其中AKR1D1在开产鸽子下丘脑中上调表达,其他4个在卵巢中下调表达.④对5个DEGs进行qRT-PCR验证,结果与高通量测序结果一致,表明测序结果可靠.[结论]试验揭示了开产和未开产大宝鸽下丘脑和卵巢DEGs及相关信号通路,筛选到5个可能调控鸽子早熟性状的关键基因.
关键词: 鸽子 下丘脑 卵巢 早熟性状 差异表达基因 高通量测序
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光色对福建白兔血清生殖激素和繁殖性能的影响
《中国兽医学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:3.5~4.0月龄体况相近、健康的福建白兔母兔随机分成白光组(对照组,Ⅰ组)、绿光组(试验组,Ⅱ组)、红光组(试验组,Ⅲ组)和蓝光组(试验组,Ⅳ组)共4组,每组3个重复,每个重复12只。采用人工授精,前6 d,每天光照16 h,光照强度均设置为80 lx。进行3个繁殖周期,测定不同光色下母兔血清生殖激素水平和同期受胎率、总产仔数、断奶窝重等繁殖性能。3个繁殖周期综合统计结果显示:(1)褪黑激素绿光组和红光组极显著低于白光组(P<0.01),绿光组显著低于蓝光组(P<0.05);黄体生成素绿光组和红光组极显著高于白光组(P<0.01);促卵泡素绿光组显著高于白光组(P<0.05);雌二醇含量绿光组显著高于白光组和蓝光组(P<0.01),显著高于红光组(P<0.05);(2)同期受胎率绿光组极显著高于白光组(P<0.01),显著高于红光组和蓝光组(P<0.05);(3)30日龄仔兔数绿光组显著高于红光组和蓝光组(P<0.05),30日龄窝重极显著高于红光组和蓝光组(P<0.01),显著高于白光组(P<0.05)。结果表明,LED灯带采用动态光照控制系统控制,光照强度均设置为80 lx,采用人工授精前6 d每天光照16 h,绿光可以降低福建白兔血清褪黑激素,对福建白兔同期受胎率和繁殖性能综合效果最佳。
关键词: 福建白兔 光色 繁殖周期 血清生殖激素 同期受胎率 繁殖性能
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尾丝蛋白在噬菌体吸附鸭疫里默氏菌中的作用
《福建农业学报 》 2024 CSCD
摘要:【目的】以鸭疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer)噬菌体CRP2为对象,研究尾丝蛋白(Tail fiber protein,TFP)对噬菌体吸附功能的影响。【方法】克隆ORF70假定的TFP基因,构建重组表达载体pET28a(+)-TFP,在大肠杆菌E.Coli BL21(DE3)中诱导表达,通过Ni-NTA亲和层析纯化。酶联免疫吸附试验(ELISA)测定重组蛋白与CRP2噬菌体的宿主菌外膜蛋白(Outer membrane protein, OMP)的结合作用。竞争吸附试验测定重组蛋白对CRP2噬菌体吸附率的影响。【结果】构建了pET28a(+)-TFP重组表达质粒,在大肠杆菌中得到了可溶性表达。纯化的重组蛋白可以与宿主菌的OMP结合,也可以抑制CRP2对其宿主菌的吸附。【结论】ORF70编码的TFP是噬菌体CRP2的一种受体结合蛋白,其对应的受体是宿主菌的OMP。
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溶血相关基因缺失降低鳗弧菌感染花鲈的致病性
《水产学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为阐明毒力因子溶血素对鳗弧菌感染花鲈过程中发挥的作用,实验以花鲈为研究对象,通过对花鲈幼鱼分别注射5.0×10~5 CFU鳗弧菌野生株和缺失株△vah1-vah4-rtxA,评估了溶血相关基因缺失对花鲈的感染能力、花鲈各组织的病理变化情况以及免疫响应的影响。结果显示,花鲈感染野生株后的LD50为2.103×10~5 CFU/mL,感染缺失株△vah1-vah4-rtxA后LD50为1.837×10~6 CFU/mL,溶血相关基因缺失使鳗弧菌毒性降到原来的11.44%;鳗弧菌主要定植在花鲈的肠道和鳃中,溶血相关基因缺失降低鳗弧菌在花鲈体内的定植能力,同时降低对鳃和肠道的损伤程度;转录组分析表明vah1、vah4和rtxA缺失后,头肾组织的差异表达基因显著富集到造血细胞谱系、抗原处理和呈递、细胞黏附分子、肠道免疫网络的IgA生产等免疫通路,并用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对表达水平进行了验证。研究表明,溶血相关基因缺失降低了鳗弧菌感染花鲈的致病能力。研究结果有助于进一步了解鳗弧菌的致病机制,并为开发花鲈抗弧菌免疫增强剂或减毒疫苗提供依据。
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长期施用炭基有机肥对土壤铜形态及微生物群落的影响
《中国农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为明确炭基有机肥施用对土壤重金属污染的缓解作用以及对土壤微生态的改良效果,设计小区试验,研究相同施氮量条件不同炭基有机肥处理(T1、T2和T3处理炭基有机肥中生物质炭的质量分数分别为3%、6%和9%)下,连续施用5年后,对土壤养分、土壤铜形态以及微生物群落的影响。结果表明:与对照组CK1(有机肥处理)相比,T1、T2和T3处理土壤pH分别显著提高0.65、0.86和0.90个单位,T2和T3处理显著提高土壤铵态氮含量,分别提高了1.94和1.66倍,T3处理土壤有机碳含量显著提高22.7%;只有T3处理对可交换态和可还原态Cu分配率的影响较大,分别显著降低了21.9%和45.1%;T2和T3处理能显著提高土壤基础呼吸速率(增幅分别为51.5%和37.6%); T3处理能够显著提高土壤细菌、革兰氏阴性菌以及PLFAs总量(增幅分别为15.5%,16.8%和17.2%)。此外,冗余分析表明,pH和总Cu是影响土壤微生物群落特征变异的主要环境因子。综上,炭基有机肥T3处理在改善土壤化学性质、钝化重金属Cu有效性、提高土壤微生物活性和数量方面的效果最佳。
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牧草的重金属胁迫效应及修复机制研究进展
《河南农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:土壤重金属污染是造成生态环境质量下降、农作物重金属含量超标以及危害人类健康的主要因素。植物修复兼具生态和经济效益,是目前重金属治理的重要方式之一,但多数植物品种修复能力有限,不能达到良好的重金属去除效果。与之相比,牧草易栽培、生物量大、生长周期短,在重金属污染土壤治理中表现出较强的修复能力,具有良好的应用前景和开发价值。结合牧草植物修复重金属污染土壤的研究现状,系统阐述了重金属胁迫下牧草的响应特征及其对重金属的富集效果和修复机制,旨在为高效利用牧草治理重金属污染土壤提供参考。
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乌衣红曲黄酒年份特征挥发性物质指纹图谱分析
《中国食品学报 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要:目的:建立乌衣红曲黄酒基酒挥发性成分指纹图谱,用于年份基酒酒龄的判别.方法:通过顶空固相微萃取-气相色谱联用质谱法(HS-SPME-GC-MS)分析不同陈酿时间的乌衣红曲黄酒中的挥发性成分,结合正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)和Spearman相关性分析确定与年份相关的关键成分,用于构建年份基酒特征指纹图谱.结果:从不同年份的乌衣红曲黄酒中,共检出并定性挥发性成分122种,与陈酿时间显著相关的有20种(|r|>0.5),其中N-苯甲酰甘氨酸乙酯、6-庚烯酸乙酯、乙酸-2-乙基苯酯等8种与陈酿时间呈正相关关系,2-呋喃甲醇、辛酸、庚酸乙酯等12种与陈酿时间呈负相关关系.基于筛选的20种年份特征挥发性物质,构建了乌衣红曲黄酒基酒年份基酒指纹图谱.依据香气成分的OPLS-DA分析和指纹图谱数据信息将2~15年陈乌衣红曲基酒样品区分为青陈酒(2~4年)、中陈酒(5~9年)、老陈酒(10~15年)3个类别,并通过二次取样分析,验证所建图谱的可靠性.结论:GC-MS技术构建的挥发性成分指纹图谱可为乌衣红曲黄酒基酒品质评价及酒龄的识别提供基础数据.
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果园红壤供氮水平季节性变化及对长期套种绿肥的响应研究
《草地学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:本研究以柿子(Diospyros kaki)园为对象,研究了长期(近20年)套种豆科绿肥对土壤可溶性氮和氮水解酶季节性变化的影响。试验设3个处理:套种平托花生(Arachis pintoi)(TPA)、套种圆叶决明(Chamaecrista rotundifolia)(TPC)和清耕果园(CK)。结果表明:长期套种2种豆科绿肥没有改变果园红壤供氮水平的季节性变化规律,6月各处理硝态氮(NO-3-N)、可溶性总氮(Total soluble nitrogen, TSN)和可溶性有机氮(Soluble organic nitrogen, SON)含量最高,分别为17.71~21.81,31.40~75.12和7.77~47.65 mg·kg-1;12月NO-3-N,TSN和SON含量最低,分别为4.88~6.02,15.17~17.45和5.03~7.92 mg·kg-1。3月、6月和8月铵态氮(NH+4-N)含量高于4月、10月和12月;6月4种氮水解酶活性最高,8月和12月活性最低。长期套种2种豆科绿肥显著提高了生长季3—8月NO-3N,TSN,SON和NH+4-N含量以及蛋白酶、天冬酰胺酶、脲酶和谷氨酰胺酶活性。因此,长期套种圆叶决明和平托花生是通过增加生长季的可溶性氮含量和氮水化酶活性来增加土壤氮供应。
关键词: 豆科绿肥套种 可溶性氮 季节性变化 氮水解酶 定位试验
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引诱剂与杀虫剂联合使用对茄子黄胸蓟马的防治效果
《中国生物防治学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:由于化学杀虫剂的频繁和高剂量使用已渐渐失去对蓟马的防控效果,为进一步探究杀虫剂与引诱剂在控制蓟马方面的联合作用,本文通过设置不同剂量的杀虫剂与蓝板引诱剂进行复合诱杀蓟马,并与单独使用杀虫剂或蓝板对黄胸蓟马的防治效果进行了比较。结果表明,随着处理时间的增加,不同杀虫剂处理对黄胸蓟马的防治效果逐渐升高,总体上,复配药剂的防效要好于单剂药剂。且在药后3 d,30%虫螨腈·唑虫酰胺悬浮剂对黄胸蓟马的防效(84.36%)要显著高于240 g/L虫螨腈悬浮剂(74.32%)、15%唑虫酰胺悬浮剂(76.84%)、3%甲氨基阿维菌素苯甲酸盐微乳剂(71.85%)三个单剂的防效。药后10 d,30%虫螨腈·唑虫酰胺悬浮剂对黄胸蓟马的防效最高可达90.17%。杀虫剂与蓝板引诱剂联合使用对黄胸蓟马的田间防治效果要显著好于仅用杀虫剂的防效,而且在药后3 d、7 d和10 d,复合药剂或单剂对黄胸蓟马的防效均高于90%,最高可达98.54%,说明蓝板引诱剂对黄胸蓟马起到了很好的防治效果。在单独统计蓝板引诱剂的防治效果时发现,对黄胸蓟马防治效果高的药剂,与其联合作用中的蓝板诱集效果比较低;反之,对黄胸蓟马防治效果低的药剂,与其联合作用中的蓝板诱集效果比较高;这也说明蓝板诱集可作为低剂量杀虫剂用于防治蓟马类害虫的有效互补措施。本研究明确了杀虫剂与引诱剂的联合作用效果,以期在提高蓟马防治效果的同时降低杀虫剂浓度或减少其使用剂量,为害虫综合防控措施提供参考。
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