科研产出
广东省侵染美香占2号的稻瘟病菌致病性及无毒基因变异分析
《中国农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析侵染广东稻区优质品种美香占2号稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)的致病性及无毒基因变异特征,为美香占2号在不同稻区的合理布局提供参考依据.[方法]利用9个抗稻瘟病单基因系,对稻瘟病菌单孢分离菌株进行致病性测定;并利用8个稻瘟病菌已克隆无毒基因的功能性分子标记对2013-2018年不同年份、不同稻区采集的稻瘟病菌单孢分离菌株的DNA进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测分析,选取不同带型和不同年份代表性菌株的相应无毒基因全长或CDS区域的PCR片段进行测序.测序结果与相应无毒基因的参考序列进行碱基序列的比较分析;并利用相应的水稻抗稻瘟病单基因系,对无毒基因不同变异类型的稻瘟病菌菌株进行致病性测定.根据稻瘟病菌两种交配型MAT1-1和MAT1-2型分子标记,检测侵染美香占2号的稻瘟病菌可能存在的交配型.[结果]致病性分析结果显示,2013-2018年采集自美香占2号品种的52个稻瘟病菌菌株对其中的4个单基因系IRBL9-W(Pi9)、IRBLzt-T(Piz-t)、NIL-e1(Pi50)和 IRBLkh-K3(Pikh)均表现无毒;然而,侵染单基因系 IRBLz-Fu(Piz)、IRBLkp-K60(Pikp)和 IRBLi-F5(Pii)的有毒菌株频率维持在57%以上,且侵染单基因系IRBLz-Fu(Piz)的有毒菌株频率在不同年份间呈现显著性差异,表明美香占2号种植区田间稻瘟病菌群体中存在较高频率的avrPiz、avrPikp和avrPii毒性菌株.根据8个已克隆无毒基因的功能性分子标记检测,在52个供试菌株中均可检测到无毒基因AvrPiz-t、AvrPi9和AvrPik-CDE,但扩增不到Avr1-C039、AvrPia和AvrPii,仅有4个菌株可检测到无毒基因AvrPita,有3个菌株可检测到无毒基因AvrPik-ABF.所测序7个菌株的AvrPi9编码区序列和AvrPiz-t包含启动子及编码区的序列与其各自无毒基因的序列完全一致;所测序7个菌株的AvrPik-CDE包含启动子及编码区的序列中,有4个菌株的序列与AvrPik无毒基因序列完全一致,有3个菌株在编码区存在CTTT连续4个碱基的插入.在来自广东不同稻区美香占2号的分离菌株群体中,共发现了 4种不同的AvrPib无毒基因扩增模式(扩增预期大小的条带、有转座子Pot3插入的条带、有转座子Mg-SINE插入的条带和无扩增条带),共呈现5种不同的单倍型(AvrPib-AP1-1、AvrPib-AP1-2、avrPib-AP2、avrPib-AP3和 avrPib-AP2+avrPib-AP3),AvrPib-AP1-1和AvrPib-AP1-2是无毒型,而avrPib-AP2和avrPib-AP3则在基因的启动子区域分别存在Pot3或Mg-SINE的插入而呈现毒性型,在1个菌株中检测到avrPib-AP2+avrPib-AP3双单倍型.交配型分子标记分析结果表明,检测的52个稻瘟病菌菌株均为MAT1-2交配型,其中有2个菌株GD18-009和GD18-185采集于广东韶关稻区,同时可检测到MAT1-1交配型,具有双交配型.[结论]在广东美香占2号品种上分离的稻瘟病菌普遍含有无毒基因AvrPiz-t、AvrPi9、AvrPi50和AvrPikh,AvrPib的变异类型丰富多样,该研究结果可为优质品种美香占2号的科学布局及其种植区域其他不同抗病基因型品种的合理选择提供参考.
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不同抗逆性菠萝品种的差异基因和差异代谢物分析
《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：该研究对2个不同抗逆性的菠萝品种PZ2(抗逆性较差)和PZ3(抗逆性强)进行转录组和代谢组比较分析,以探索品种间抗逆性差异的分子生理机制,为菠萝抗性育种提供理论依据.(1)转录组结果显示,以PZ2为对照,在2个品种间共筛选到1667个差异表达基因,上调和下调的差异表达基因分别为770个和897个;其中筛选到20个与抗逆性相关的差异表达基因,包括WRKY和MYB转录因子基因以及ASR3、SOD1、POD48、HSP20、GSTF1、GSTU17等基因.(2)代谢组分析表明,以PZ2为对照,在2个品种间共筛选到208个差异代谢物,含量上调和下调的差异代谢物分别为98个和110个,其中22种差异代谢物与抗逆性相关,包括氨基酸及其衍生物、脂类、黄酮类、糖类和糖苷等.(3)qRT-PCR分析验证表明,所选的8个差异表达基因在菠萝品种PZ2与PZ3中的差异表达趋势与转录组测序中差异基因表达水平变化趋势基本一致.(4)关联分析表明,差异表达基因和差异代谢物共同富集的通路有类黄酮生物合成,苯丙素生物合成,莨宕烷、哌啶和吡啶丙酸盐生物合成,半胱氨酸与蛋氨酸代谢等4条.研究发现,抗逆性强的菠萝品种的非生物逆境反应相关基因、抗氧化酶基因、逆境响应结构基因和调控基因的表达水平高于抗逆性较差的品种,且黄酮类、氨基酸衍生物类及木脂素、脂质等代谢物的含量也高于抗逆性较差的品种.
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不同种植模式对水稻生长的影响及适宜直播品种的筛选
《广东农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]育苗移栽和直播是当前广东应用最广的水稻种植方式.探究育苗移栽和直播两种不同种植方式对水稻产量的影响,筛选适宜广东及华南地区淹水直播的水稻品种,为广东及华南地区直播稻品种选择和育种应用提供理论依据.[方法]以广东育成的25份水稻品种为材料,进行模拟大田淹水成苗试验,并在早、晚两季的育苗移栽和直播两种不同种植模式下,测定各品种的生育期、株高、抗倒伏性、产量等性状,筛选适宜直播的水稻品种.[结果]粤新银占2号、粤农丝苗、粤泰油占等12个品种的耐淹成苗率达到80%;通过分析育苗移栽和直播两种种植模式,发现早、晚季直播稻的生育期比育苗移栽平均缩短7~15 d;田间抗倒伏表型鉴定表明,有11份水稻品种的抗倒性强;产量分析表明,早、晚季直播产量比育苗移栽表现为增产,平均增幅分别为0.99%和1.25%.[结论]综合参试品种的耐淹性、抗倒性和丰产性筛选出粤农丝苗、粤美占、五山丝苗、粤特油占等4个品种适宜华南稻区的直播栽培模式.
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显齿蛇葡萄叶绿体基因组密码子使用偏好性分析
《广东农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]显齿蛇葡萄(Ampelopsis grossedentata),是葡萄科(Vitaceae)蛇葡萄属(Ampelopsis)中的一种藤本植物,具有良好的药用价值.分析显齿蛇葡萄叶绿体基因组密码子使用偏好性及其主要影响因素,为其叶绿体基因组学研究、物种保护和种质创新提供参考.[方法]从NCBI在线数据库下载完整的显齿蛇葡萄叶绿体基因组序列,并进行蛋白编码序列筛选,再利用CodonW软件计算各基因的有效密码子数(ENC)、同义密码子相对使用度(RSCU)及密码子3个位置的GC含量,最后利用R软件计算各参数间的相关性并绘图.[结果]从显齿蛇葡萄叶绿体基因组中共筛选出59条蛋白编码序列.总的GC平均含量和密码子第3位碱基的GC平均含量分别为37.98%和29.45%,ENC值介于37.39~57.12之间,表明显齿蛇葡萄叶绿体基因组密码子使用具有较弱的偏好性.ENC-plot、PR2-plot及中性绘图分析表明,影响显齿蛇葡萄叶绿体基因组密码子使用偏好性的最主要因素为自然选择.此外,还鉴定出13个最优密码子,分别为UUU、CUA、AUA、UCA、CCA、ACA、GCA、CAU、GAU、UGA、AGA、GGA和GGG.[结论]研究结果为显齿蛇葡萄系统发育及叶绿体基因组密码子进化研究提供参考.
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优质稻'黄华占'籽粒发育过程中代谢物差异分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探究代谢物质、尤其是营养物质在优质稻籽粒发育过程中的数量、种类及丰度变化.本研究以中国南方稻区推广面积最大的优质常规籼稻品种'黄华占'为材料,选取花后8 d(乳熟期),15 d(蜡熟期)和30 d(完熟期)的籽粒和精米,进行广泛靶向代谢组分析.在籽粒发育过程中,大分子代谢物质淀粉和直链淀粉的含量呈上升趋势,而可溶性蛋白变化则相反;在小分子代谢物方面,本研究鉴定获得23类622个代谢物,在花后8和15 d的籽粒中发现281个差异的代谢物,其中脂质是上升数量最多的物质.在花后15和30 d籽粒的差异物质最少,仅有61个,主要是黄酮物质且其丰度显著下降;在花后30 d籽粒和精米中,发现387个显著差异的代谢物,主要是氨基酸、有机酸和核苷酸及衍生物并发现135个代谢物完全流失.总之,在乳熟期和腊熟期代谢最为活跃,无论是淀粉和蛋白质,还是氨基酸、脂质、黄酮、维生素和萜类等小分子,均在此时期合成和积累.而在完熟期,仅黄酮的丰度显著下降.成熟籽粒至精米过程中,人为因素导致94%差异代谢物显著下降,甚至完全流失.本研究为在代谢物水平探究水稻营养品质形成机理提供理论依据,并为实际生产过程中,水稻收获后人为因素影响营养品质提供了重要参考.
关键词： 代谢组学;精米;’黄华占’;脂质;黄酮
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柑橘提取物对肥育猪后肠食糜蛋白质代谢产物的影响
《中国畜牧兽医 》 2022 北大核心
摘要：【目的】通过研究柑橘提取物对肥育猪后肠食糜蛋白质代谢产物的影响,旨在为柑橘提取物从源头调控臭气的产生提供依据。【方法】选取108头56日龄（19.73±0.39）kg杜×长×大猪,公母各半,随机分为3组,每组分6栏,每栏6头猪。对照组饲喂基础饲粮,抗生素组在基础饲粮中添加75 g/t金霉素,柑橘提取物组在基础饲粮中添加柑橘提取物（56～112日龄添加250 mL/t柑橘提取物,113～194日龄添加200 mL/t柑橘提取物）。194日龄时收集肥育猪盲肠和结肠食糜,测定食糜中游离氨基酸、酚和吲哚类物质、生物胺的含量。【结果】（1）在盲肠食糜中,与对照组相比,柑橘提取物组和抗生素组牛磺酸、天冬氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、组氨酸、精氨酸、吲哚和甲胺含量均显著降低（P<0.05）。与对照组相比,柑橘提取物有降低苏氨酸、丝氨酸、谷氨酸、甘氨酸、瓜氨酸、异亮氨酸、脯氨酸和粪臭素含量的趋势（0.05≤P<0.10）,苯酚、腐胺、酪胺和精胺含量均显著降低（P<0.05）。与抗生素组相比,柑橘提取物组腐胺和酪胺含量均显著减少（P<0.05）。（2）在结肠食糜中,与对照组相比,柑橘提取物组和抗生素组天冬氨酸、丝氨酸、异亮氨酸、胱硫醚、亮氨酸、γ-氨基丁酸、总氨基酸、苯酚、对甲酚、粪臭素和甲胺含量均显著降低（P<0.05）,脯氨酸和吲哚含量均有降低的趋势（0.05≤P<0.10）。柑橘提取物组丝氨酸、异亮氨酸、胱硫醚、亮氨酸、总氨基酸和对甲酚含量均显著低于抗生素组（P<0.05）;与对照组相比,柑橘提取物组苏氨酸、谷氨酸、甘氨酸、鸟氨酸和酪胺含量均显著降低（P<0.05）,亚精胺含量有降低的趋势（0.05≤P<0.10）;与对照组和抗生素组相比,柑橘提取物组苯丙氨酸、色氨酸和赖氨酸含量均显著降低（P<0.05）。【结论】柑橘提取物降低了肥育猪后肠食糜蛋白质代谢产物的含量,可减少臭气的产生。
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21日龄仔猪断奶过程不同肠段细胞外基质重要蛋白表达规律的研究
《动物营养学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究21日龄仔猪断奶过程不同肠段细胞外基质(ECM)重要蛋白的表达规律.选用24头21日龄的断奶仔猪随机分配到6个栏中,分别于断奶后0、7、14和28 d每栏随机选择1头仔猪进行麻醉后处死,采集十二指肠、空肠和回肠样品,测定ECM相关基因和蛋白的表达量.结果表明:1)与0 d相比,7、14和28 d十二指肠Ⅰ型胶原蛋白α2链(COL1A2)、Ⅲ型胶原蛋白α1链(COL3A1)、Ⅳ型胶原蛋白α2链(COL4A2)、Ⅴ型胶原蛋白α1链(COL5A1)、Ⅵ型胶原蛋白α1链(COL6A1)、纤维黏连蛋白1(FN1)、肌腱蛋白C(TNC)和整合素α1(ITGA1)的mRNA相对表达量显著降低(P<0.05),且14 d十二指肠COL1A2和FN1的mRNA相对表达量显著低于28 d(P<0.05),14 d十二指肠COL3A1的mRNA相对表达量显著低于7和28 d(P<0.05),7 d十二指肠整合素β2(ITGB2)的mRNA相对表达量显著低于14和28 d(P<0.05).2)与 0 d 相比,7、14 和 28 d 空肠 COL1A2、COL3A1、COL4A2 和 ITGA1 的 mRNA 相对表达量显著降低(P<0.05),且7 d空肠COL5A1和COL6A1的mRNA相对表达量显著低于0和28 d(P<0.05),7 d空肠TNC和ITGB2的mRNA相对表达量显著低于28 d(P<0.05).3)7 d回肠FN1的mRNA相对表达量显著低于0、14和28 d(P<0.05).4)与0 d相比,7、14和28 d空肠COL1A2和Ⅵ型胶原蛋白的蛋白相对表达量显著降低(P<0.05),14和28 d空肠COL4A2、层黏连蛋白和FN1的蛋白相对表达量显著降低(P<0.05).综上所述,仔猪断奶后十二指肠和空肠的胶原蛋白(COL1A2、COL3A1、COLAA2、COL5A1、COL6A1和Ⅵ型胶原蛋白)、FN1、层黏连蛋白、TNC、ITGA1和 ITGB2的表达和分泌降低;十二指肠COL1A2、COL3A1和FN1的mRNA相对表达量在断奶后14 d降到最低,空肠COL5A1和COL6A1的mRNA相对表达量在断奶后7 d降到最低;仔猪断奶后7 d回肠FN1的mRNA相对表达量显著降低,但断奶对其他ECM相关基因表达无显著影响.
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黄芪多糖对巨噬细胞活化及其吞噬功能的影响
《中国畜牧杂志 》 2022 北大核心
摘要：为研究黄芪多糖对巨噬细胞增殖、抗原呈递与吞噬活性的影响,揭示黄芪多糖免疫调节作用机制,试验采用不同浓度的黄芪多糖(0、0.1、1、10、50、100μg/mL)处理巨噬细胞12 h,用CCK-8比色法检测细胞增殖活性,用流式细胞仪检测细胞表面CD80、CD86、MHC-II分子表达及细胞吞噬活性.结果发现:与对照组相比,50μg/mL的黄芪多糖能够促进巨噬细胞增殖(P<0.001),提高细胞表面CD80、MHC-II分子的表达水平(P<0.001)和单个细胞吞噬能力(P<0.05);100μg/mL的黄芪多糖能够促进巨噬细胞增殖(P<0.001),提高细胞表面CD80(P<0.001)、CD86(P<0.05)、MHC-II(P<0.001)分子的表达水平,增加细胞吞噬率(P<0.05)及单个细胞吞噬能力(P<0.001).结果表明,50和100μg/mL黄芪多糖能显著活化巨噬细胞并增强其吞噬功能,但黄芪多糖活化巨噬细胞的分子机制仍需进一步探究.
关键词： 黄芪多糖;巨噬细胞;吞噬功能
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丁型流感病毒在中国的流行状况及研究进展
《广东农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：丁型流感病毒是继甲型、乙型和丙型流感病毒之后的一种新型正粘病毒,2011年首次由美国从表现出流感样症状的猪只中分离出来,并于2016年被国际病毒分类委员会正式命名为丁型流感病毒.目前丁型流感病毒已广泛分布于美洲、亚洲、欧洲和非洲的数十个国家.丁型流感病毒利用牛作为其自然宿主和扩增宿主,并定期扩散到其他哺乳动物物种,包括猪、马、羊和骆驼等.因此,丁型流感病毒具有广泛的地域分布和宽泛的宿主范围.丁型流感病毒感染可导致牛患轻度至中度呼吸道疾病,被认为是牛呼吸系统疾病综合征的重要关联因子.血清学证据表明,丁型流感病毒具有感染人的潜在风险.我国研究人员于2014年首次在山东省的牛群中检测到丁型流感病毒,随后,来自不同团队的研究人员分别于2017、2021和2022年报道了丁型流感病毒核酸阳性病例.为更好地了解丁型流感病毒对我国畜牧养殖业的影响,系统综述了丁型流感病毒在我国的分布情况和研究进展,并分析了丁型流感病毒在我国的流行趋势及对我国畜牧养殖业的潜在威胁.
关键词： 丁型流感病毒 流行趋势 遗传与演化 致病与传播 致病性 人畜共患风险
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