科研产出
文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：本研究基于NCBI数据库中文心兰的EST序列,对其EST-SSR标记进行分析,并设计了20对EST-SSR引物用于30个文心兰品种遗传多样性性分析研究。对3 183条文心兰EST序列进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.61%。二核苷酸重复类型是文心兰EST-SSR的主要重复类型,占60.58%。通过PCR扩增检测到13对引物有扩增产物,其中10对引物有多态性,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00%~100.00%,多态性信息含量变化范围为0.69~0.93。聚类分析发现30个文心兰品种间的遗传距离变化在0.04~0.58,且在遗传距离为0.39处可将30个文心兰品种分为7大聚类群。
全文链接
请求原文
亚热带茶园土壤酸度特征研究——以福建省武夷山市为例
《中国环境科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：调查测试福建省武夷山市60个茶园6个土类120个土层的土壤酸度指标,分析茶园土壤酸度特征,结果表明:福建省武夷山市茶园0~20cm土层土壤平均p H值为4.52,其中p H<4.5的重度酸化土壤占总调查样本的55.00%;20~40cm土层土壤平均p H值为4.52,p H<4.5占53.33%;茶园红壤、紫色土、粗骨土0~20cm、20~40cm土层土壤平均p H值均低于4.5,茶园土壤酸化严重.总体上茶园土壤中交换性Al3+的数量和相对比例随交换性酸总量增加而增大,交换性H+的相对比例则呈相反的变化特征,交换性Al3+占交换性酸的比例为76.67%~98.40%;茶园土壤p H值与交换性酸、H+和Al3+均呈极显著的负相关关系,相关系数分别为-0.61、-0.46和-0.59.茶园土壤酸碱缓冲性能随着土壤p H值的降低呈现下降趋势;总体上茶园土壤p H值与盐基饱和度呈极显著正相关关系,土壤p H值与盐基饱和度的正相关主要受到交换性Ca2+、Mg2+饱和度的制约.但不同土壤类型表现不一,体现了茶园土壤酸度的复杂性、多样性.
全文链接
请求原文
闽牧3号圆叶决明的选育研究
《草地学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为提高草产量及适口性,2002年由福建省农业科学院农业生态研究所利用~(60) Coγ射线辐射闽引圆叶决明(Chamaecrista rotundifolia‘Minyin’,CPI86134)种子,经多代筛选选育出闽牧3号圆叶决明(Chamaecrista rotundifolia‘Minmu No.3’),并于2011年通过福建省品种认定委员会认定。2005-2010年进行品种比较试验、区域试验和生产试验,结果表明:闽牧3号圆叶决明平均种子产量260.9kg·hm~(-2),比对照增产7.7%,但差异不显著;初花期植株粗蛋白含量为18.84%;平均干草产量11110.4kg·hm~(-2),比对照闽引圆叶决明增产22.05%,差异极显著(P<0.01)。因此,闽牧3号圆叶决明适用于加工草粉饲料。
全文链接
请求原文
福建省烟粉虱不同地理种群遗传结构特征
《植物保护学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为明确福建省烟粉虱种群遗传结构特征,基于福建省烟粉虱不同地理种群中40个代表性的线粒体COI基因序列,分析了种群遗传多样性、遗传分化及分子变异情况,并构建了单倍型系统发育树与网络图。结果显示:在590 bp长度的mt COI基因序列中有效位点558个,其中187个核苷酸位点存在变异;序列核苷酸中A、T、C、G含量分别为42.32%、24.36%、20.25%、13.06%,其中A+T的含量为66.68%,表现出明显的A+T偏向性;共检测出11个单倍型,其中Hap3、4、7、9、11为特殊单倍型;种群多样性指数为0.838,核苷酸多样性指数为0.093,表明遗传多样性水平较高;AMOVA分析表明种群遗传变异主要来自种群内,总种群遗传分化系数仅为0.027,种群遗传分化较低。表明福建烟粉虱种群基因交流未受地理距离明显影响,种群遗传分化不显著。
关键词： 烟粉虱 线粒体COI基因 地理种群 遗传结构 遗传分化
全文链接
请求原文
山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织转录组分析
《中国农业科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探明山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织的转录组差异,丰富蛋鸭转录组数据信息。【方法】选取6份山麻鸭卵巢组织样品(开产期和产蛋高峰期各3份),利用Illumina Hi SeqTM 2000进行高通量测序,构建山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织转录组文库,并用测序评估、基因功能注释等生物信息学方法进行分析。【结果】经过测序获得质量不低于20的碱基比例(Q20)均高于93%;开产期获得了43 489 798条reads,4 380 847 061 bp数据量;高峰期获得了42 782 676条reads,4 307 499 083 bp数据量;分别有70.92%和72.70%的reads能比对到鸭参考基因组序列上。对开产期与产蛋高峰期转录组进行比较,发现开产期有26 808个表达基因,产蛋高峰期有27 013个表达基因,与开产期为参考,在高峰期卵巢组织中共获得1 929个差异表达基因,其中上调基因989个,下调基因940个;进一步将这些差异基因在Nr数据库进行注释,发现获得注释的基因有1 423个,其中上调基因695个,下调基因728个;COG功能注释分析发现这些差异表达基因共获得663个功能注释,涉及25个功能分类;GO功能注释分析表明,有1 122个基因获得GO功能注释,可以分为61个功能分类,这些分类主要涉及到分子绑定、催化活性、细胞过程、生物调节等诸多生理生化过程,其中涉及到发育繁殖生物学过程的相关注释基因有406个;KEGG分析发现共有425个基因注释到160个代谢通路中,其中Gn RH信号通路、GPI-anchor生物合成、TGF-β信号通路、核糖体生物合成等通路显著富集。Gn RH信号通路和TGF-β信号通路在卵巢的生理生殖活动发挥了重要作用,而GPI-anchor生物合成和核糖体生物合成,这两类代谢通路在卵巢生理生殖活动的作用尚不明确。【结论】利用高通量测序技术对山麻鸭开产期和产蛋高峰期卵巢组织的转录组进行测序和分析,揭示了山麻鸭不同生理状态下卵巢组织差异表达基因的数量,获得了差异表达基因的功能、分类和代谢通路。为丰富蛋鸭卵巢组织转录组信息,为开展蛋鸭产蛋性状相关基因的研究及分子调控机制研究奠定基础。
全文链接
请求原文
芽胞杆菌中的喷他霉素检测与分析
《中国农学通报 》 2016 CSCD
摘要：采用高效液相四级杆飞行时间质谱分析巴达维亚芽胞杆菌Bacillus bataviensis FJAT-10043发酵液中胞外代谢物的成分。运用安捷伦公司的Mass Hunter软件,对数据进行分子特征提取,并通过Metlin代谢物质谱数据库检索,获得总体代谢物的信息。在巴达维亚芽胞杆菌Bacillus bataviensis FJAT-10043发酵液中,用液相质谱检测到656种代谢物,通过Metlin谱库搜索得到初步鉴定结果的有121种。其中,喷他霉素是相对含量最高的成分。喷他霉素占该菌发酵液总代谢物相对含量的4.22%,匹配得分达到96.39,保留时间为2.7339 min。喷他霉素发现为巴达维亚芽胞杆菌来源的抗真菌抗生素的开发与利用提供理论依据。
关键词： 液相四级杆飞行时间质谱 巴达维亚芽胞杆菌 胞外代谢物 喷他霉素
全文链接
请求原文
猪伪狂犬病毒和猪圆环病毒2型TaqMan-MGB双重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
《中国兽医学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：参照GenBank中猪伪狂犬病毒(PRV)gE基因以及猪圆环病毒2型(PCV2)中ORF2特异性序列,设计特异引物和TaqMan-MGB探针,通过优化反应条件,建立了同时检测PRV野毒株和猪圆环病毒(PCV2)的双重荧光定量PCR检测方法,并验证该方法的特异性、敏感性、重复性。结果表明,该方法检测PRV和PCV2灵敏度分别可达2.23×101、4.5×102拷贝/μL,均比常规PCR检测方法高100倍;同时检测猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖和呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)、均为阴性,无交叉反应;对30份疑似病料进行检测并与普通PCR进行比较,结果显示,二者检测PRV的总符合率为96.67%,检测PCV2的总符合率为93.33%。本试验建立的TaqMan-MGB双重荧光定量PCR检测方法可同时对PRV野毒株和PCV2进行早期快速诊断,可应用于病原学监测,流行病学调查等。
关键词： 猪伪狂犬病毒 猪圆环病毒TaqMan-MGB 双重荧光定量PCR
全文链接
请求原文
福建省玉米小斑病菌对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺的敏感性
《农药学学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为明确玉米小斑病菌对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺的敏感性,采用菌丝生长速率法测定了自福建省15个市、县分离的185株玉米小斑病菌对3种药剂的敏感性。结果显示:供试菌株对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺的EC_(50)值分别在0.018 6~7.779、0.041 6~22.32和0.005 3~7.930μg/m L之间。敏感性频率分布图显示,玉米小斑病菌群体中已出现对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺敏感性降低的亚群体。以连续单峰频次分布的大多数菌株群体的EC_(50)平均值(0.519 9±0.028 4)、(0.407 9±0.020 4)和(0.381 8±0.020 2)μg/m L分别作为玉米小斑病菌对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺的相对敏感基线,发现各有15.14%、20.00%和17.30%的菌株对丙环唑、烯唑醇和咪鲜胺产生了抗性,抗性倍数最高分别为14.96、54.71和20.77。玉米小斑病菌对3种杀菌剂之间具有显著的交互抗性,而丙环唑和烯唑醇之间的交互抗性相关系数最高,为0.866 2。本研究结果可为田间玉米小斑病防控杀菌剂的合理使用提供理论依据。
关键词： 玉米小斑病菌 丙环唑 烯唑醇 咪鲜胺 敏感性 交互抗性
全文链接
请求原文
能源植物无患子种质的分子遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：本研究应用ISSR分析了来自5个不同种源地的73份无患子种质的遗传多样性。ISSR共扩增出条带119条,其中多态性条带105条,多态性百分率为88.24%;表明不同地区的无患子种质间存在较高的多态性,遗传多样性较为丰富,各地区种质间的遗传差异较大;5个无患子种群间的遗传距离变化范围在0.032 4~0.081 0之间;UPGMA聚类分析表明,73份无患子种质可分为2大类,组A由安徽黄山、浙江台州、江西吉安和福建建宁组成;组B仅含江西龙南。分布于浙江台州与分布于江西吉安的无患子种质亲缘关系最近,分布于安徽黄山和江西龙南的无患子种质亲缘关系最远。ISSR方法能有效地阐明不同地区无患子种质的多样性,为更好地利用无患子优异种质资源进行育种提供参考。
全文链接
请求原文
茄子基因遗传定位和遗传图谱构建的研究进展
《中国细胞生物学学报 》 2016 CSCD
摘要：基因定位有助于了解基因的功能,而遗传图谱构建不仅可以对多种性状进行遗传分析,同时也是开展基因定位、分子标记辅助选择育种以及图位克隆的基础。该文就近几年茄子基因遗传定位和遗传图谱构建进行了总结,并讨论了所发现的问题,结合当今分子生物学的前沿技术,对今后我国茄子分子生物技术辅助育种的前景进行了展望。
全文链接
请求原文
