芹菜AgHAT4的克隆与表达模式分析

尹莲; 刘洁霞; 陈龙正; 沈迪; 段奥其; 冯凯; 徐志胜; 熊爱生; 《园艺学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：以两个芹菜品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’为试验材料,分别克隆获得HAT4转录因子基因AgHAT4。应用生物信息学方法分别从氨基酸组成、蛋白结构与理化性质、以及系统进化树等方面对该基因进行分析。结果表明,AgHAT4含有1个长为900 bp的开放阅读框(ORF),编码299个氨基酸。‘六合黄心芹’和‘文图拉’中的AgHAT4基因有1个核苷酸位点的差异,编码的氨基酸有1个位点的差异,其蛋白质相对分子质量分别为33.71和33.68 kD,等电点均为9.12。进化树分析表明芹菜AgHAT4与胡萝卜的HAT4属于同一分支。蛋白结构预测显示,该蛋白主要由3个α螺旋和一些无规则卷曲构成,且未定位到信号肽。荧光定量PCR结果表明,AgHAT4在芹菜叶柄中的表达量最高,根中次之,叶片中表达量最低。多种非生物胁迫导致芹菜AgHAT4的表达量发生变化。与未胁迫对照相比,高温胁迫处理后‘六合黄心芹’中AgHAT4的表达量在24h明显上调,在盐胁迫条件下‘文图拉’和‘六合黄心芹’中AgHAT4的表达有着相似的变化趋势,均先上升后下降且在处理2h后表达量达到峰值。‘文图拉’中AgHAT4的表达量在高温处理4 h后表达量最高,而在低温条件下在处理2 h后表达量最高。

关键词： 芹菜 AgHAT4 基因表达 组织 非生物胁迫

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芸薹根肿菌蛋白磷酸酶组的鉴定及生物信息学分析

余方伟; 王神云; 张伟; 王红; 于利; 李建斌; 《江苏农业学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：由蛋白激酶和蛋白磷酸酶调控的蛋白质可逆磷酸化是一种重要的蛋白质翻译后修饰,它在信号转导、细胞周期、基因转录、代谢调控等过程中起到至关重要的作用.本研究以芸薹根肿菌e3菌株的基因组为试验数据来源,采用生物信息学方法对芸薹根肿菌全基因组蛋白磷酸酶进行了鉴定和表达分析.基于隐马尔可夫模型(Hidden markov model,HMM)搜索与SMART分析相结合,本研究在芸薹根肿菌基因组中共鉴定出54个蛋白磷酸酶基因.编码的54个蛋白磷酸酶可以进一步被分成4类,包括10个磷酸化蛋白磷酸酶(PPP),21个金属离子依赖型蛋白磷酸酶(PPM),19个酪氨酸蛋白磷酸酶(PTP),4个基于天冬氨酸的蛋白磷酸酶(APP).这54个蛋白磷酸酶的相对分子质量为10 780~125 140,等电点为4.43~10.45.通过信号肽和跨膜结构域分析发现在这54个蛋白磷酸酶中,PBRA007461存在信号肽,PBRA003636、PBRA004449、PBRA004464、PBRA005270、PBRA006854和PBRA007201存在跨膜结构域.转录组分析结果表明这54个蛋白磷酸酶基因在不同时期差异表达,值得一提的是在休眠孢子萌发期和休眠孢子成熟期,金属离子依赖型蛋白磷酸酶基因PBRA001085的表达量最高,说明该磷酸酶在休眠孢子发育中起到重要作用.综上所述,本研究可为芸薹根肿菌蛋白磷酸酶功能研究和根肿病防治靶标选择提供理论基础.

关键词： 根肿病 芸薹根肿菌 蛋白磷酸酶

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钙肥和硅肥对葡萄留树保鲜效果的影响

王壮伟; 黄学熹; 王博; 吴伟民; 王西成; 钱亚明; 《中国野生植物资源 》 2020 CSCD

摘要：以白罗莎里奥葡萄为试材,通过分析钙、硅肥处理对葡萄果实品质、烂果率、生理指标及休眠期冬芽发育的影响,研究了钙、硅肥在葡萄留树保鲜中的应用效果。结果表明:100 mg/L硅酸钠和1. 5%的硝酸钙处理葡萄留树保鲜效果最佳,可减缓葡萄果实成熟后果实品质变化,降低葡萄果实中丙二醛的含量和多酚氧化酶活性,又能促进冬芽的发育,从而可以有效抵充留树保鲜对树体营养的消耗,不会影响次年生产。

关键词： 葡萄 留树保鲜 钙肥 硅肥

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小叶杨TMM基因启动子克隆及表达模式分析

乐丽娜; 滕青云; 宋冰倩; 匡华琳; 陈英; 《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：气孔作为植物与外界进行气体交换的通道,对植物自身的生长发育至关重要。研究表明植物TMM蛋白与植物气孔的形成发育密切相关。本研究利用PCR技术克隆了小叶杨(Populus simonii Carr.) TMM基因5'端上游的调控序列pPsTMM,长度为2 336 bp。生物信息学分析结果表明:小叶杨启动子pPsTMM除了含有TATA-box、CAAT-box等核心启动子元件之外,还含有多种光响应元件、植物激素响应元件、抗逆胁迫相关元件以及生理代谢和生长发育相关元件等,说明转录活性还可能受到光、植物激素、逆境胁迫等因素诱导。利用双酶切法构建植物表达载体pBI121-pPsTMM-GUS,叶盘法稳定遗传转化烟草,GUS化学组织染色显示GUS主要集中在叶芽起始发育部位表达,说明pPsTMM启动活性具有组织特异性。对非生物胁迫的转基因烟草进行GUS化学染色以及进行荧光定量PCR,结果显示pPsTMM对不同因素的非生物胁迫响应程度存在差异性,干旱和盐胁迫下启动活性很低,高温和低温对其调控作用也不明显,但对外在施加的植物激素(GA, NAA, ABA)和水杨酸(SA)响应程度很高,说明pPsTMM启动子对物理因素的响应值要远低于化学因素的诱导。本研究为进一步阐明TMM蛋白表达模式与小叶杨气孔发育特性及抗旱性之间的分子机制提供理论基础。

关键词： 小叶杨(Populus simonii) pPsTMM启动子 GUS化学组织染色 表达模式

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江苏和东北粳稻稻米理化特性及Wx和OsSSIIa基因序列分析

赵春芳; 岳红亮; 田铮; 顾明超; 赵凌; 赵庆勇; 朱镇; 陈涛; 周丽慧; 姚姝; 梁文化; 路凯; 张亚东; 王才林; 《作物学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：依据地理来源和直链淀粉含量将87份供试粳稻品种(系)划分为江苏普通粳稻、东北粳稻和江苏半糯粳稻3种类型,系统比较了稻米理化性状及淀粉合成主效基因Wx和OsSSIIa序列的差异,以探究其食味品质特征及其形成的分子基础.与东北粳稻相比,江苏普通粳稻的直链淀粉含量偏低,蛋白质含量和糊化温度偏高,而胶稠度和RVA谱特征值相当.与江苏普通粳稻和东北粳稻相比,江苏半糯粳稻具有较低的直链淀粉含量、较大的胶稠度及独特的RVA谱特征.大多数性状变异系数在3种类型粳稻中均较小,仅消减值变异系数较大,说明品种(系)间的稻米回生性存在较大差异而其他性状较为一致.各性状间的相关性在3种类型粳稻中表现不尽相同,说明地理来源和品种特性影响食味品质性状间的相关程度.聚类分析将87份粳稻分为4个类群,江苏普通粳稻与东北粳稻主要分布于类群I和II,且品种间相互交错;类群III由2个江苏普通粳稻品系和1个江苏半糯粳稻(徐稻9号)组成,多数性状值位于普通粳稻与半糯粳稻之间;类群IV中均为江苏半糯粳稻.序列分析表明江苏普通粳稻和东北粳稻中Wxb基因无序列差异,而江苏半糯粳稻在Wxb第4外显子上发生G/A替换,属Wxmp等位基因型;江苏省部分粳稻品种(系)携带OsSSIIa(G-GC)等位基因,从而导致高糊化温度.

关键词： 粳稻 食味品质 低直链淀粉含量 Wx OsSSIIa

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基于传统培养和高通量测序方法分析羊肉加工过程中的菌群多样性

刘亚文; 刘芳; 孙芝兰; 吴海虹; 张新笑; 诸永志; 《食品工业科技 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：通过传统培养和高通量测序分析了羊肉加工过程中的菌群多样性及其变化,确定了羊肉加工过程主要的污染菌群组成.传统培养结果表明在羊肉加工过程中,初始胴体表面菌数在10~3~10~4 CFU/cm~2之间,而在后续的分割过程中其菌数增长到10~5~10~6 CFU/cm~2,说明加工过程可能会造成羊肉二次污染.从不同选择性培养基中分离得到43株菌,通过16S rDNA序列分析鉴定为嗜水气单胞菌、肠杆菌、变形杆菌、葡萄球菌和大肠杆菌,结晶紫染色测定成膜能力结果发现上述肠杆菌的成膜能力最强.高通量测序发现,胴体和台面表面的腐败菌均有莫拉菌科、嗜水气单胞菌科、嗜冷杆菌科、希瓦氏菌科、普雷沃氏菌科、假单胞菌科、李斯特菌科、葡萄球菌科、肠杆菌科等,说明胴体和加工环境间存在交叉污染.本研究发现羊肉加工过程中的优势菌群复杂,并且污染菌株也具有较强的成膜能力,为冷鲜羊肉的保鲜技术开发提供了理论基础.

关键词： 传统培养 高通量测序 生物膜 羊肉加工

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银杏雌株高黄酮种质定向筛选

郁万文; 韩晋; 曹福亮; 汪贵斌; 《中国野生植物资源 》 2020 CSCD

摘要：以46个银杏雌株为试验材料,研究了生育前期和生育后期单株间叶中总黄酮及其组分含量差异及变异,基于聚类分析筛选出高黄酮含量的春茶用、提取黄酮用及两者兼用的优株。主要研究结果如下:(1)生育初期的黄酮及其组分含量显著高于生育后期,两个生育时期的各银杏雌株间的叶中总黄酮及各组分含量均存在极显著性差异。(2)银杏雌株间的叶中总黄酮及各组分含量均存在较大的变异,其中生育前期叶中总黄酮及各组分含量变异系数为2106%～3335%,生育后期为2911%～5013%。(3)生育前期和生育后期的叶中总黄酮含量分别与对应生育期的槲皮素、山奈酚、异鼠李素含量均呈极显著正相关;生育前期和生育后期间叶中总黄酮及其组分含量均呈极显著高度正相关。(4)基于生育前期叶中的总黄酮及3个主要组分含量,筛选出了15、29、30、42、43、44、45、46、47、49、50、48等12个春茶用优株;基于生育后期叶中的总黄酮及3个主要组分含量,筛选出了42、46、43、44、45、47、48、50等8个提取黄酮用优株;基于生育前期和生育后期叶中总黄酮含量,筛选出了29、42、43、44、45、46、47、50、48等9个可作为银杏春茶及黄酮提取的兼用型优株。综上三类分别可作为春茶用、黄酮提取用及兼用型银杏种质,进一步无性系化扩繁、区试或推广。

关键词： 银杏雌株 高黄酮 定向筛选

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高产稳产国审小麦新品种—淮麦46

顾正中; 周羊梅; 王安邦; 杨子博; 杜莹莹; 《麦类作物学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：淮麦46(原代号淮麦4046)是江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所于2006年以淮麦33为母本、淮麦18/淮麦97255的F1为父本,通过人工杂交后经多年系谱法选育而成的高产、稳产小麦新品种。2019年3月通过国家农作物品种审定委员会审定,审定编号为国审麦20190011。1 特征特性淮麦46属半冬性中熟品种,全生育期230.9 d,较对照品种周麦18早0.7 d。幼苗半匍匐,叶片短宽,深绿色。冬季抗寒性好。分蘖力中等,春季起身拔节

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介孔氧化硅微纳材料的卫生检验应用研究进展

邵雪梅; 陈进; 《南京医科大学学报(自然科学版) 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：近年来,介孔氧化硅微纳材料由于具有良好的生物相容性及易于修饰的孔道结构,在卫生分析和抗菌等生物医学领域得到广泛应用。本文结合国内外这一领域的最新研究现状,对介孔氧化硅微纳材料在卫生分析和抗菌应用的研究进展作一评述。

关键词： 介孔氧化硅 卫生检验 生物传感器 抗菌 多重耐药

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水稻光温敏核不育基因tms5与pms3的互作效应

王芳权; 范方军; 夏士健; 宗寿余; 郑天清; 王军; 李文奇; 许扬; 陈智慧; 蒋彦婕; 陶亚军; 仲维功; 杨杰; 《作物学报 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：tms5与pms3是水稻的光温敏核不育基因,其功能位点已经明确,然而它们在两系不育系中的效应尚不清楚.本研究针对tms5与pms3基因功能位点,分别设计了功能标记AS-TMS5和CAPS-PMS3.经鉴定发现,这2个功能标记能准确区分不育、可育性状对应的隐性纯合、杂合和显性纯合3种基因型.利用AS-TMS5和CAPS-PMS3对培矮64S/9311、广占63S/湘恢47和粤光S/宁恢108的F2群体单株的基因型及育性的关系分析发现,tms5基因是广占63S和粤光S控制光温敏不育性状的主效基因,而pms3基因在培矮64S和粤光S中并不能独立起作用,还需要与其他基因共同调控.进一步分析粤光S/宁恢108的F2:3群体基因型与育性的关系,发现在粤光S/宁恢108背景下,携带pms3基因的株系几乎都表现可育,而携带tms5基因的株系在较高气温条件下表现不育,但育性转换温度可能较高;而携带tms5与pms3基因的株系育性转换温度比仅携带tms5基因的株系低,这为聚合2个基因选育不育性状稳定的光温敏不育系提供了思路和方法.

关键词： tms5 pms3 功能标记 光敏不育 温敏不育

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