科研产出
白斑狗鱼zpax4基因表达分析及其敲除模型的建立
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究ZP基因家族中zpax4基因在白斑狗鱼性腺生长发育中的表达情况,利用CRISPR/Cas9技术建立白斑狗鱼zpax4基因敲除模型,为后续探究其生物学功能提供参考依据.[方法]利用RACE克隆白斑狗鱼zpax4基因的全长cDNA序列,利用生物信息学软件进行zpax4蛋白理化性质、结构特点和系统进化分析;应用实时荧光定量PCR分析zpax4基因在白斑狗鱼126、180和320 d 3个时期8个组织中的相对表达量;设计并筛选合适的sgRNA,通过对受精卵的显微注射,建立白斑狗鱼zpax4基因的CRISPR/Cas9敲除模型,并对获得的F0代敲除嵌合体进行组织切片观察.[结果]白斑狗鱼zpax4基因cDNA全长2771 bp,其中,5'非编码区(5'-UTR)为162 bp,3'非编码区(3'-UTR)为150 bp.zpax4基因编码811个氨基酸残基,蛋白分子式C4117H6364N1092O1209S39,理论分子量为91.752 kD,理论等电点(pI)为5.43,且编码蛋白N端有信号肽序列,靠近C端有ZP结构域,无跨膜结构域,其二级结构由α-螺旋(14.3%)、无规则卷曲(54.5%)和延伸链(31.2%)构成.多序列比对和系统发育树分析显示,白斑狗鱼zpax4蛋白与其他几种鱼类的zpax4蛋白氨基酸序列相似性为54.85%,功能结构域位置相对保守.实时荧光定量PCR检测结果显示,白斑狗鱼zpax4基因在肠道、肌肉、鳃、头肾、肾脏、肝脏和精巢中基本无表达,而在3个时期的卵巢中均呈极显著表达(P<0.01),且卵巢中相对表达量在126、180和320 d 3个时期呈先增后减的变化趋势,180 d相对表达量最高;此外,在320 d雄鱼的脑组织中也有一定量的表达.利用CRISPR/Cas9技术筛选得到合适的sgRNA,并成功建立白斑狗鱼zpax4基因敲除模型,得到多种突变类型个体,缺失碱基数分别为1、4、7和8,均不为3的倍数.对F0代嵌合体鱼苗进行整鱼切片分析,并未发现明显的性腺及其他部位的表型异常.[结论]利用CRISPR/Cas9技术对白斑狗鱼zpax4基因进行敲除,成功构建了敲除模型,获得白斑狗鱼zpax4基因敲除嵌合体,并筛选出更优的sgRNA靶点序列.zpax4基因可能在白斑狗鱼卵巢发育的前中期发挥重要作用.
关键词： 白斑狗鱼 zpax4基因 表达特征 基因敲除 CRISPR/Cas9
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广东沿岸重要河口玻璃鳗资源量空间分布特征
《水生生物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为厘清玻璃鳗空间分布特征,特别是更新代的栖息地选择,基于广东全省6个站位的调查研究,广东沿岸重要河口玻璃鳗资源量从东到西(从潮州到珠海)逐渐减少,重点捕捞区域有莲阳河河口、榕江河口和龙江河口等水域.2024年玻璃鳗发生的时间为2023年12月—2024年3月,高峰期为2024年2月.进入广东沿岸河口的玻璃鳗多为50 mm左右,呈透明线状,处于玻璃鳗和线鳗之间.采用冗余分析方法(RDA)分析了玻璃鳗空间分布与环境因子的关系,玻璃鳗资源量呈现出空间自相关关系,总体上受径流量和潮差的正影响,受水体盐度的负影响,受水体物理环境因子(如河流径流量、潮汐等)的影响要远大于水体化学环境因子(如水体COD浓度、DO、pH等)的影响(P<0.05).研究结果为广东沿岸重要河口玻璃鳗资源管理提供基础数据,对阐明其洄游特征具有重要意义.
关键词： 资源调查 广东沿岸 空间分布 冗余分析 环境因子 玻璃鳗
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崇州市黑石河浮游生物和大型底栖动物资源现状与分析
《湿地科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为了摸清四川省崇州市黑石河流域浮游生物和大型底栖动物资源现状，于2023年10月对该流域浮游生物和大型底栖动物的资源状况及其群落结构特征开展了系统调查与分析。研究结果表明，黑石河流域共鉴定出浮游植物6门47属125种（含变种），总平均丰度为34.11×10～4 ind./L，总平均生物量为0.324 7 mg/L，硅藻门的种类数、总平均丰度和总平均生物量都相对最高；浮游动物15属30种，总平均丰度为19.09 ind./L，总平均生物量为0.053 6 mg/L，其中原生动物丰度最高，桡足类生物量最高；大型底栖动物12目27种，总平均丰度为18.2 ind./m2，总平均生物量为3.223 7 g/m2，其中水生昆虫种类数目和总平均丰度最高，软体动物生物量最高。崇州市黑石河流域水生生物群落结构特征表现明显，其中，浮游生物种类及资源量较高，在浮游植物中，硅藻占绝对优势；在大型底栖动物方面，上游地区喜洁净水体物种较多，而中下游以耐污能力较强的种类居多。本研究结果有助于更好地管理黑石河流域渔业资源并制定相应的保护策略。
关键词： 黑石河 浮游生物 大型底栖动物 群落结构 生物多样性
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温度对四种鱼类游泳能力的影响
《生态学杂志 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为探究不同种类鱼类之间游泳能力存在的差异,以及驯化温度对长须黄颡鱼(Pelteobagrus eu-pogon)、鳜(Siniperca chuatsi)、鲫(Carassius auratus)和大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)游泳能力的影响,分别在26±1 ℃和10±1℃,采用流速递增法测试4种鱼类临界游泳速度(Urcrit)和爆发游泳速度(Urburst).结果表明:4种实验鱼Urcrit和Urburst均存在极显著差异(P<0.01);与低温组相比,高温条件下长须黄颡鱼、鳜、鲫3种实验鱼的Urcrit极显著上升(P<0.01),大鳞副泥鳅则呈显著上升(P<0.05),且鲫Urcrit最大,鳜Urcrit、长须黄颡鱼Urcrit次之,大鳞副泥鳅Urcrit为最小;爆发速度则无显著变化(P>0.05),鲫Urburst最大,长须黄颡鱼Urburst和鳜Uburst次之,大鳞副泥鳅rburst最小.4种鱼类临界游泳速度和爆发游泳速度存在差异.温度对4种鱼类临界游泳速度有显著影响,而对爆发速度几乎没有影响.研究结果可为鱼类科学养殖以及资源恢复等提供参考价值.
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桑叶的营养价值及其在水产饲料中应用的研究进展
《动物营养学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：桑叶是一种具有悠久历史的药食同源类植物资源,富含蛋白质、氨基酸、脂肪酸、维生素和矿物元素,还含有脱氧野尻霉素、槲皮素、绿原酸、苯甲酸、芦丁等生物活性物质,具有抗氧化、提高免疫力、抗菌消炎等药理活性,越来越多地受到研究者的关注.研究发现,桑叶产品可作为非常规蛋白质饲料资源和添加剂,在改善水产动物营养物质消化吸收、糖与脂代谢、健康和产品品质等方面具有正面效果.本文综述了桑叶的营养价值及其在水产饲料中的应用效果,以期为桑叶在水产饲料中的应用及桑叶资源的综合利用提供参考.
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基于CO Ⅰ基因分析长江中下游陈氏新银鱼群体遗传多样性
《基因组学与应用生物学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：长江中下游地区生境多样,是陈氏新银鱼(Neosalanx tangkahkeii)的核心分布区域.为深入了解不同生境下陈氏新银鱼的遗传多样性和遗传分化情况,本研究利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ(cytochrome c oxidase Ⅰ,CO Ⅰ)基因序列作为遗传标记,对来自长江中下游泰州(Taizhou,TZ)、南京(Nanjing,NJ)、安庆(Anqing,AQ)、湖口(Hukou,HK)4个江段,以及鄱阳湖(Poyang Lake,PY)和洞庭湖(Dongting Lake,DT)2个通江湖泊的6个陈氏新银鱼群体进行了遗传多样性研究.研究结果表明,6个群体共检测出12个单倍型,单倍型多样性范围和核苷酸多样性范围分别为0.074~0.725,0.000 28~0.00202.6个群体的遗传多样性水平表现为PY群体最高,DT群体次之,然后依次是NJ、AQ、TZ和HK群体,群体间的遗传距离范围为0.000 46~0.001 96,NJ和PY群体之间的遗传距离最大,AQ群体和HK群体之间的遗传距离最小,不符合地理分布格局.群体间遗传分化系数Fst及遗传距离分析结果表明,PY和DT群体与其他群体的遗传距离相对较远.分子系统树和单倍型网络进化分析显示,PY和DT群体聚为一个分支.AMOVA分析发现,遗传变异主要来自群体内,中性检验、错配分布图及BSP(Bayesian skyline plot)结果表明陈氏新银鱼群体可能出现过群体扩张.
关键词： 陈氏新银鱼 遗传多样性 细胞色素c氧化酶Ⅰ(CO Ⅰ)基因
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溪洛渡-向家坝梯级水库生态调度对长江上游江津江段四大家鱼繁殖的影响
《水生生物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：为减缓水电站运行对坝下河流鱼类繁殖的不利影响、充分发挥水库的生态效益,自2017年起开展了溪洛渡-向家坝联合生态调度.研究基于2017-2022年长江上游江津江段早期资源调查数据,评估梯级水库联合生态调度对坝下江段四大家鱼自然繁殖效果,并识别影响四大家鱼自然繁殖的关键水文指标.结果表明,2017-2022年江津江段四大家鱼鱼卵径流总量为0.42亿—4.01亿粒,总体呈波动变化趋势,其中2022年最高(约4.01亿粒);6年间共观察到25次产卵高峰期,主要集中在6月上旬至7月上旬.生态调度期间,四大家鱼鱼卵径流量为0.001亿—1.088亿粒,占当年总卵径流量的0.06%—34.47%,其中2022年超过30%,2018年超过10%.从生态调度效果来看,与生态调度相吻合的繁殖高峰期占总繁殖高峰期的16%,表明生态调度有效促进坝下江津江段四大家鱼自然繁殖活动.水文需求分析结果表明,江津江段适宜四大家鱼产卵流量为6000-15000 m3/s,适宜水温为21-23℃.产卵量与水文指标相关性分析显示,四大家鱼产卵量与洪峰流量、流量涨幅及流量增长率具有显著正相关(P<0.05).根据四大家鱼早期资源调查结果,建议在5月中下旬及6月上旬开展2-3次生态调度,并保持江津江段涨水持续时间维持3d以上且流量日增长率维持在900 m3/s以上,有利于促进江津江段四大家鱼大规模繁殖.研究成果可为金沙江梯级水库调度方案制定提供科学依据.
关键词： 梯级水库 自然繁殖 联合生态调度 四大家鱼 水文指标
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大口黑鲈PTEN基因的克隆、组织表达及初步功能分析
《农业生物技术学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：第10号染色体上缺失的磷酸酶与张力蛋白同源物基因(phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome ten, PTEN)是迄今发现的第1个具有双特异性磷酸酶活性的抑癌基因，在多种信号通路中发挥重要作用。为了阐明鱼类PTEN在核因子κB (nuclear factor kappa-B, NF-κB)、干扰素(interferon,IFN)和激活蛋白-1 (activator protein-1, AP-1)信号通路中的调控作用，本研究利用逆转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)方法从大口黑鲈(Micropterus salmoides)中扩增并克隆了PTEN基因ORF序列，利用qPCR检测了不同病原体相关分子模式—诺卡氏菌(Nocardia seriolae)、大口黑鲈蛙病毒(Largemouth bass virus, LMBV)及聚胞肌酸Poly I:C对大口黑鲈PTEN基因表达水平变化的影响。通过构建真核表达质粒pCMV-Flag-PTEN对大口黑鲈PTEN进行亚细胞定位以及过表达对NF-κB、AP-1、IFN启动子荧光素酶活性的激活作用进行研究。蛋白质序列分析显示，大口黑鲈PTEN编码了439个氨基酸，其中包含1个PTPc结构域和1个PTEN＿C2结构域，在系统发育树中与其他硬骨鱼类PTEN家族聚为一支。qPCR检测发现PTEN在健康的大口黑鲈多种组织中广泛表达，且在脾脏和鳃中高表达。人工感染诺卡氏菌可引起PTEN基因表达量显著下降；注射LMBV、Poly I:C后，PTEN基因表达量呈先下降后上升或先上升后下降的表达趋势。亚细胞定位结果显示，大口黑鲈PTEN在HEK-293T细胞的细胞质和细胞核中分布。双荧光素酶活性分析发现过表达pCMV-Flag-PTEN可以增强AP-1和抑制NF-κB、IFN启动子荧光素酶活性。以上研究表明，大口黑鲈PTEN可以通过激活AP-1和抑制NF-κB、IFN信号通路，在机体抗细菌和抗病毒先天免疫应答中发挥重要的调控作用。本研究为阐明大口黑鲈抗病免疫应答机制的研究提供基础资料，为抗菌疫苗开发、抗病品种(系)的选育提供理论基础。
关键词： 大口黑鲈 第10号染色体上缺失的磷酸酶与张力蛋白同源物基因(PTEN) 基因克隆 组织表达 亚细胞定位 双荧光素酶活性分析
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鳗弧菌及脂多糖刺激下大菱鲆肝脾凝集素和Toll样受体基因的时序表达分析
《海洋与湖沼 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：凝集素和Toll样受体对激活先天免疫系统以应对入侵的病原体至关重要,为探究革兰氏阴性菌鳗弧菌、灭活鳗弧菌以及LPS刺激大菱鲆PAMP识别受体基因的免疫应答机制,以平均体质量为(19.37±4.31) g、平均体长为(10.71±0.69) cm的大菱鲆为实验对象,分别于免疫后0、12、24、48、72和96 h采集肝和脾组织,提取总RNA,采用qPCR检测肝脏和脾脏中LEC、SAP、TLR5M、TLR14基因的表达水平。结果显示:在肝脏中,活菌刺激下LEC、SAP、TLR5M和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,上调表达高峰均在0～24 h,基因表达量最高值是对照组的14～3 857倍;灭活菌和LPS刺激下LEC、TLR5M和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,表达高峰分别在24～72 h和48～72 h,最高表达量分别是对照组的52～447倍和18～184倍。在脾脏中,活菌刺激下LEC和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达,上调表达高峰均在0～24 h,基因表达量最高值是对照组的5～223倍;灭活菌和LPS刺激下LEC、SAP和TLR14基因与对照组相比均呈上调表达, LEC和SAP表达高峰在0～12 h,TLR14表达高峰在48～72 h,最高表达量分别是对照组的4～28倍和2～68倍,其他基因表现为显著下调或无明显变化。研究结果表明:不同免疫刺激能引起肝脏和脾脏PAMP识别受体基因的快速变化,并且这些基因的表达变化具有组织特异性。免疫后肝脏和脾脏在0～72 h中,可用更为简单的免疫增强剂LPS或灭活菌代替活菌注射,通过LEC、SAP、TLR5M和TLR14 PAMP识别受体基因表达作为评价指标。研究结果可为抗鳗弧菌新品种选育和海水鱼类免疫增强剂筛选提供理论依据。
关键词： 病原相关分子模式 模式识别受体 凝集素 Toll样受体 革兰氏阴性菌 鳗弧菌
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乌龟蛋营养成分分析及品质评价
《甘肃农业大学学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探明乌龟蛋的品质，对乌龟蛋蛋清、蛋黄中的营养成分进行比较分析，旨在为后续的高价值利用和精深加工等提供支撑。【方法】选取200枚乌龟蛋，进行蛋清、蛋黄的常规营养成分、氨基酸、脂肪酸、胆固醇、维生素及矿物质元素含量的测定，并对其进行营养评价。【结果】乌龟蛋蛋清中水分含量达94.87%，乌龟蛋中蛋白质、脂肪主要存在于蛋黄；乌龟蛋中含17种氨基酸，第一限制性氨基酸为Leu，第二限制性氨基酸为Ile，其中蛋黄Lys含量达421 mg/g N，必需氨基酸总量高于FAO/WHO理想模式；乌龟蛋蛋清中含9种脂肪酸，蛋黄中含27种脂肪酸，蛋黄中PUFA含量达5.89 g/100g，胆固醇含量为302.00 mg/100g；乌龟蛋中含有丰富的维生素A、B1、B2和E，还含有K、Ca、Na、P、Mg等常量元素和Fe、Zn、Cu、Se等微量元素。【结论】乌龟蛋的氨基酸、脂肪酸和矿物质种类丰富，具有必需氨基酸、不饱和脂肪酸和维生素B2、E含量高，胆固醇低的特点，有较高的营养价值。
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