科研产出
辣椒果色全基因组关联分析
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：辣椒果色作为辣椒重要的农艺性状直接影响辣椒商品价值，其遗传机制的解析可对辣椒果实外观品质改良提供指导。本研究利用全基因组关联分析（GWAS）挖掘辣椒果色显著关联的SΝP位点及候选基因。以195份一年生辣椒构成的自然群体为试验材料，分别在2020年和2021年调查辣椒果色（青果色和熟果色）性状，通过DNA测序和SNP变异检测，质控得到的高质量SNP位点用于GWAS分析。结果表明：两年间辣椒果色性状表型完全一致，性状遗传稳定，其中青果色为绿的分布频率最高，达89.74%，熟果色为鲜红的分布频率最高，达60.51%;GWAS分析后共筛选出8个与辣椒果色相关的SNPs，这些位点分布在0、1、3、4号等4条染色体上；对显著SNP位点进行LD block分析并筛选候选基因，共注释到31个基因，预测呼吸爆发氧化酶同源蛋白A（Capana01g000138）、类异黄酮2′-羟化酶（Capana04g000616、Capana04g000617、Capana04g000618、Capana04g000619、Capana04g000620、Capana04g000621和Capana04g000622）和F-box-like/WD重复类蛋白TBL1Y（Capana04g000624）可能与辣椒果色相关。这些结果将为开展辣椒果色相关分子辅助育种提供参考依据。
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马齿苋PoFAD6基因克隆、原核表达及对低温胁迫的响应
《种子 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究以马齿苋为材料，采用同源克隆获得马齿苋ω-6脂肪酸脱氢酶PoFAD6基因，并对其进行了生物信息学分析、原核表达及在低温胁迫下的表达研究。结果表明，PoFAD6基因CDS全长为1 380 bp,推导编码459个氨基酸，其氨基酸序列具有Membrane-FADS-like超家族共同的保守结构域。PoFAD6蛋白N端无信号肽，具有4个跨膜结构，为不稳定亲水蛋白，亚细胞预测定位于叶绿体上，二级结构主要包括α-螺旋和不规则卷曲。氨基酸同源比对和系统发育树分析结果表明，PoFAD6与藜麦FAD6氨基酸序列一致性最高，为77.54%,亲缘关系最近。PoFAD6融合蛋白可在大肠杆菌BL21表达宿主中成功表达，分子量约为53 kD。RT-qPCR结果表明，5℃低温处理0～24 h,PoFAD6基因的表达模式呈先升后降的趋势，说明PoFAD6基因能响应低温胁迫。
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贵州省农业科学院水稻研究所水稻两系杂种优势利用研究团队简介
《植物遗传资源学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：贵州省农业科学院水稻研究所，现有科研人员57人，其中研究员10人，副高职称17人，博士13人。享受国务院特殊津贴专家2人，享受省政府特殊津贴专家1人，省青年优秀科技人才培养对象2人，西部之光访问学者1人。贵州省农业科学院水稻研究所秉承“团结、协作、求实、创新”精神，立足贵州面向世界农业科技前沿，以科技创新为核心，服务省内外农业产业发展。
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石墨烯负载二氧化锡电化学传感器检测4-碘苯氧乙酸研究
《分析测试学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：该文通过水热法合成了珊瑚状的二氧化锡纳米颗粒，将其均匀生长在石墨烯上，构建了石墨烯负载二氧化锡电化学传感器对外源植物激素4-碘苯氧乙酸（4-IPOAA）进行电化学检测的方法。采用方波伏安法对不同浓度的4-IPOAA进行检测，结果显示4-IPOAA在0.5～20μmol/L和20～100μmol/L范围内具有良好线性关系，检出限（LOD,S/N=3）为9.86×10-2μmol/L。4-IPOAA的电化学氧化过程受混合控制，有2个电子参与。所制备的传感器具有良好的重现性，相对标准偏差（RSD）不大于3.8%。使用加标回收法对白菜和黄瓜中的4-IPOAA进行检测，回收率分别为91.3%～106%和91.4%～116%,RSD分别为1.1%～5.2%和3.8%～8.0%。表明该传感器对4-IPOAA的实际检测具有良好的应用前景。
关键词： 植物激素 4-碘苯氧乙酸（4-IPOAA） 石墨烯 二氧化锡 电化学检测
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贵州多花黄精炭疽病病原鉴定
《中药材 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的：分离鉴定贵州道地中药材多花黄精炭疽病病原，明确其种类和分类学地位，为该病害的科学防控提供理论依据。方法：采用组织分离法分离纯化病原菌，依据柯赫氏法则回接验证其致病性，结合病原菌形态特征和多基因（ITS、β-TUB2、GAPDH、ACT和CHS-1）序列系统发育分析进行种类鉴定。结果：菌株HJ 12和HJ 20均能引起多花黄精健康植株发病，多基因系统发育分析发现，菌株HJ 12和HJ 20与白蜡树炭疽菌Colletotrichum spaethianum标准菌株CBS 100063聚为一支，自展支持率为100%,结合形态学鉴定结果，将2个菌株鉴定为白蜡树炭疽菌Colletotrichum spaethianum。结论：贵州多花黄精炭疽病病原为白蜡树炭疽菌Colletotrichum spaethianum。
关键词： 多花黄精 炭疽病 多基因系统发育分析 白蜡树炭疽菌
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贵州黑山羊不同肌肉组织FASN基因表达与肌内脂肪含量相关性分析
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为探究FASN基因在贵州黑山羊不同肌肉组织中调控脂肪沉积的作用,采集 12 月龄公、母贵州黑山羊胸肌、背最长肌、肱三头肌、臂股二头肌,运用实时荧光定量PCR法(qPCR)检测FASN基因表达量,酸水解法测定肌内脂肪(IMF)含量,并通过Pearson分析FASN基因表达量与IMF含量相关性.结果显示,FASN基因在公、母羊不同组织中表达量均为臂股二头肌>胸肌>肱三头肌>背最长肌,其中公羊臂股二头肌显著高于背最长肌,母羊臂股二头肌极显著高于背最长肌;相同组织比较,母羊胸肌、肱三头肌、臂股二头肌表达量均高于公羊,背最长肌表达量低于公羊,但均未达到差异显著水平.IMF含量测定发现,公、母羊 4 个组织中IMF含量均为臂股二头肌>胸肌>肱三头肌≥背最长肌,同性别各组织之间比较差异不显著;相同组织比较,母羊 4 个组织中IMF含量均高于公羊.FASN基因表达量与IMF含量相关性分析表明,公、母羊FASN基因表达量与胸肌IMF含量呈正相关,与背最长肌、肱三头肌、臂股二头肌IMF含量呈负相关.
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基于离散小波-微分变换算法定量反演火龙果茎枝叶绿素含量的研究
《光谱学与光谱分析 》 2023 EI SCI 北大核心 CSCD
摘要：作为一种仙人掌科植物,火龙果植株无叶,主要依靠肉质茎进行光合作用、蒸腾作用等生理功能,火龙果的肉质茎与常见绿叶类植物叶片在组织结构、形态等方面存在明显差异,且二者在植株冠层结构方面也存在明显差异,该差异会直接影响植株冠层光谱特征,进而影响基于与光谱技术的光合色素监测.为探寻提升火龙果茎枝叶绿素含量估测精度的方法,研究以贵州省罗甸县龙坪镇烟山火龙果种植基地为试验区,先采集火龙果茎枝光谱及光谱测定部位的组织,并采用乙醇萃取法测定此组织的叶绿素含量,然后选用传统数学变换、连续小波变换、离散小波变换、离散小波-微分变换方法分别处理分析光谱数据,并采用相关性分析算法提取、筛选敏感特征波段,最后选用偏最小二乘算法构建火龙果茎枝叶绿素含量估测模型,分析结果如下:(1)采用离散小波-微分变换算法,高频信息与低频信息的峰、谷交替依次呈现,且可用信息分部具有较强的稳定性,可用信息随尺度的增加,曲线振幅加大、频率降低.(2)数学变换内的微分变换、连续小波变换、离散小波变换与离散小波-微分变换方法均能明显提升光谱对火龙果茎枝叶绿素含量的敏感性,其中以离散小波-微分变换方法最优,经处理后光谱与火龙果茎枝叶绿素含量的决定系数最高可达0.565(位于H1分解尺度737.5 nm处).(3)离散小波-微分变换最能有效提升光谱对火龙果茎枝叶绿素含量的估测能力,并且基于离散小波-微分变换H2尺度构建的估测模型为最优模型,其验证精度的R2=0.769,RMSE=0.040,RPD=1.739.研究分析了四类光谱处理算法在提升光谱对火龙果茎枝叶绿素含量敏感性与估测能力方面的效果,表明离散小波-微分变换算法能有效提升光谱对火龙果茎枝叶绿素含量的估测能力,为火龙果茎枝叶绿素含量的无损估测提供了基础技术支撑.
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薏苡ramosa2基因的克隆及表达分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：ramosa基因属于LBD基因家族,在植物侧生器官原基的启动和形态形成中发挥重要作用.为了解薏苡ramosa基因的功能及表达特征,本研究采用RT-PCR和RACE技术克隆获得薏苡ramosa2(ClRA2)基因,并对其序列的生理生化特征及表达模式进行分析.ClRA2cDNA序列全长1 421 bp,ORF长813 bp,编码270个氨基酸,含有LOB结构域,位于26~124位置,属于LBD基因家族.C1RA2相对分子质量为49.96 kD,等电点为9.08,属于疏水性的不稳定蛋白.分子进化树分析发现C1RA2与高粱SbRA2亲缘关系最近.实时荧光定量PCR检测结果表明,ClRA2在根中的表达丰度最高,表达量远高于茎和花穗.本研究为解析ClRA2基因功能及其调控薏苡侧生器官发育机制提供了理论基础.
关键词： 薏苡(Coix lacryma-jobi L.) ramosa2 基因克隆 表达分析
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水热条件对辣椒生长速率的影响
《贵州农业科学 》 2023 北大核心
摘要：【目的】探明水热条件对辣椒生长发育的影响，为合理规划辣椒种植和开展辣椒气象防灾减灾提供科学参考。【方法】以贵州主要辣椒种植品种“辣研1号”为研究对象，于2019年和2020年在贵阳国家一级农业气象试验站开展分期播种试验，根据分期播种创造的不同气候水热条件，运用线性回归方法分析不同水热条件对辣椒各生长阶段生长速率的影响。【结果】温度是辣椒各生长阶段生长速率的主要影响因子，气温升高有利于提高辣椒生长速率，缩短辣椒各生长阶段所需的天数，气温每升高1℃,辣椒苗期、全生育期、营养生长阶段和生殖生长阶段分别缩短1.1 d、10.9 d、1.1 d及6.0 d。降水量和气温对辣椒营养生长和生殖生长阶段的生长速率均有重要影响；大气干燥程度对辣椒营养生长和生殖生长阶段的生长速率的影响不同，其与2个生长阶段生长速率的关系分别呈负相关和正相关，对2个生长阶段的影响率分别为-0.25%和0.16%。【结论】水热条件变化对辣椒生长速率的影响显著，在气候干暖化趋势背景下，辣椒播期适度提前，以及构建合理的种植方式是辣椒种植应对未来气候变化的有效措施。
关键词： 辣椒 分期播种 气象因子 水热条件 生长速率 气候变化
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冬凤兰叶绿体基因组密码子使用偏好性分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确冬凤兰叶绿体基因组密码子的使用模式及其影响因素,利用CodonW、CUSP、CHIP等软件对得到的43条序列进行分析.结果表明:冬凤兰叶绿体基因组密码子GC3平均值为27.78%,ENC平均值为47.59,偏好性较弱;GC3碱基组成较GC1、GC2存在显著差异,且3位碱基使用T>A,G>C;结合30个高频密码子和 22 个高表达密码子,确定 GCA、CGU、CGA、AAU、UGU、CAA、GGU、CAU、AUU、UUA、AAA、UUU、CCU、GAA、UCU、UCA、ACU、UAU、GUA等19个密码子为最优密码子.综合分析表明,冬凤兰叶绿体基因组偏好A/U结尾密码,主要受自然选择的影响,同时也受其他如突变和碱基组成等因素的影响,这对应用叶绿体基因工程对其进行性状改良和外源基因表达等具有指导意义.
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