科研产出
脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析
《南方水产科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：转录组测序可在各种环境条件下对物种进行高通量测序,通过基因结构分析和功能注释,探讨特定条件下相关基因的功能和表达情况.该研究分别获取低盐胁迫组(盐度0.2)和自然海水组(盐度31)脊尾白虾(Exopalae-mon carinicauda)样品,通过Illumina平台进行转录组测序,获得13.92 Gb高质量测序数据,组装得到111618条转录本和72734条Unigenes,其中有22879条Unigenes得到注释,比对到Nr数据库的Unigenes为21931条;筛选出1492条脊尾白虾低盐胁迫差异显著表达基因,包括829条上调基因和663条下调基因,其中有810条差异表达基因得到注释.通过差异表达基因GO功能注释和富集分析及KEGG通路富集分析,锁定大量脊尾白虾在自然海水和淡水环境下的差异表达基因,为深入探讨脊尾白虾在低盐胁迫条件下的生理保护机制提供了技术支撑.
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远海养殖平台的锚泊定位能力分析
《船舶工程 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：针对某远海养殖平台在一定作业海况及作业工况下的锚泊定位能力的问题,基于准动态分析方法,使用多个软件及其各自二次开发的接口程序组成的集成系统进行水动力计算分析。该方法解决了各软件独立计算时通用性差的问题,可以系统的研究该平台在各个工况下的运动响应,得到在一定范围内的有义波高下的平均位移,从而评估该平台的锚泊定位能力。
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凡纳滨对虾养殖环境及肠道微生物群落特征分析
《水产学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究凡纳滨对虾养殖过程中其肠道和养殖环境微生物群落的结构及变化,本实验采用Illumina MiSeq测序平台,基于16S rRNA基因的测序结果,对46和86 d虾龄的凡纳滨对虾肠道以及养殖水样、底泥中的微生物群落进行分析.结果显示,86 d时微生物Shannon-Wiener多样性指数显著高于46 d,水样中的Shannon-Wiener指数显著低于底泥和凡纳滨对虾肠道;有35个门、70个纲、152个目、274个科以及420个属在水样、底泥和虾肠道中均能检测到,其中虾肠道和底泥间共有菌类较水样中更多.微生物群落随养殖时间增加发生变化,46与86 d的差异性门类为放线菌门、绿菌门、丝状杆菌门、浮霉状菌门和TM6,相对丰度随时间增加而增高.水样、底泥和虾肠道中有相对固定的优势菌群,在水样、底泥和虾肠道中主要的门类均为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门,优势纲类为α变形菌纲、β变形菌纲以及放线菌纲,除此以外,虾肠道与底泥共有的优势纲为δ变形菌纲、γ变形菌纲以及芽单胞菌纲;从目、科、属的分类水平上看,水样、底泥和虾肠道中菌类相对丰度各异,鲜有明显重叠的优势菌类,在水样、底泥和虾肠道中均为一种未分类的属占优势地位,水样中优势属为hgcIclade,底泥和虾肠道中优势属为Ambiguoustaxa.研究结果进一步解释了虾肠道和环境微生物群落结构之间的相关性以及随虾龄增长呈现的差异性.
关键词： 凡纳滨对虾 养殖水样 底泥 虾肠道 微生物群落结构 多样性
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基于长度贝叶斯生物量法估算北部湾二长棘鲷种群参数
《水产学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：渔业数据缺乏是渔业资源评估和管理面临的难题.以2006-2018年北部湾二长棘鲷体长频率数据为例,运用基于长度频率的贝叶斯生物量方法 (LBB),估算二长棘鲷的渐近体长(L∞)、最适开捕体长(Lcopt)、相对自然死亡率(M/k)和相对捕捞死亡率(F/k)等种群参数.结果发现,2006-2018年间北部湾二长棘鲷的渐近体长平均为21.0 cm,最适开捕体长平均为12.6 cm,相对死亡率M/k、F/k、Z/k和开发率E分别为1.49、3.65、5.15和0.67.二长棘鲷的开捕体长和渐近体长的变化趋势一致,均呈下降趋势,且其生长速度有加快趋势.基于LBB估算的最适开捕体长和开发率与运用独立评估模型估算的结果基本一致.如果长度频率能代表资源开发阶段的长度组成,使用LBB估算的结果将较好地反映其真实情况.基于LBB的研究方法可为渔业数据缺乏情况下进行渔业资源评估提供借鉴.
关键词： 二长棘鲷 种群参数 长度频率 长度贝叶斯生物量 数据缺乏 北部湾
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拖网渔船轴带发电机的经济性分析
《船舶工程 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：轴带发电机可以利用主机富余的功率储备发电,减少拖网渔船的燃油消耗,达到节能减排的目的,但节能的效果通常缺乏数据支持。文章介绍了一型拖网渔船轴带发电机系统的设计方案,并对常规方案及轴带发电机的方案进行比较,通过经济性分析,提出了轴带发电机并非为最佳的减少成本之方案的结论。
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不同运动强度和训练时间对紫红笛鲷幼鱼血清生理生化指标的影响
《海洋渔业 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究运动训练对紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)免疫与抗氧化能力的影响,根据鱼类逆流游泳的习性,以不同水流速度(1.43、2.87、5.74体长·s-1和对照0体长·s-1)对紫红笛鲷幼鱼进行游泳训练实验,并于不同的周期节点(7、14、28 d)采集血清进行生理生化和酶活性检测.研究发现,不同水流速度下,运动训练对血清生化指标的影响差异显著(P<0.05),且不同训练强度间的差异亦显著(P<0.05).在时间上,各代谢标志物均有随训练时间的增长而升高的趋势.与其他训练强度组相比,2.87体长·s-1强度较有利于紫红笛鲷幼鱼抗氧化和免疫水平的提高.7 d训练后效果与14 d训练后效果的差异显著(P<0.05),而14 d训练后与28 d训练后的效果差异不显著,即14 d以后的训练不能使紫红笛鲷幼鱼的抗氧化能力和免疫水平有显著增加.研究证明,适当强度的运动对鱼体内的抗氧化能力和免疫水平有提高作用,而过高的运动强度会使鱼的抗氧化能力和免疫力下降.研究表明,紫红笛鲷幼鱼在2.87体长·s-1强度下训练14 d有助于提高鱼体内的抗氧化和免疫水平,这种运动训练方法在提高鱼类成活率、优化增殖放流前的关键技术环节等方面具有重要意义.
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小型远洋拖网渔船机舱结构优化设计
《船舶工程 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：毛塔33.2 m双甲板远洋拖网渔船,系综合考虑双甲板远洋渔船项目系列渔船优缺点后,依据中国船级社《钢质远洋渔船建造规范（2018）》新规要求对船体结构进行了最优化设计,着重对机舱做到空间最大化,使用更便利。首次在该系列渔船机舱中采用结构风管,优化液舱、支柱吊机口以及甲板开口设置,做到既符合规范要求又满足施工维修及日常操作要求。结果表明:优化设计使得结构连续性更好,机舱布置更合理,吊机更方便,机舱既简洁美观又舒适,船东满意度高。同时,也为后续远洋渔船送审中国船级社提供了经验。
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暗纹东方鲀性别相关基因dmrt1的分离、鉴定及表达分析
《海洋湖沼通报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为探究暗纹东方鲀dmrt1基因的序列和结构信息,初步研究dmrt1基因在性腺发育和性别分化过程中的作用,我们利用RACE技术成功分离出暗纹东方鲀dmrt1基因cDNA的全长序列,并对其在成鱼不同组织和幼鱼不同发育期性腺组织中的表达进行了鉴定和分析。结果表明:dmrt1基因cDNA全长1620bp（NCBI登录号:MH218816）,编码294个氨基酸,与红鳍东方鲀及星点东方鲀序列相似性最高。dmrt1基因编码的蛋白是一种不稳定的亲水性蛋白,不存在信号肽序列和跨膜区;该蛋白最可能存在于线粒体、细胞质和细胞核;Dmrt1蛋白含有45个磷酸化位点,但不含N(糖基化位点和跨膜保守结构域,二级结构以无规卷曲为主;氨基酸多重序列比对结果显示Dmrt1氨基酸序列的DM结构域在哺乳动物和鱼类中均高度保守,且近C—末端的氨基酸序列也比较保守。荧光定量PCR分析显示dmrt1基因主要在雄鱼中表达,尤其是在精巢中表达量最高,而且dmrt1在幼鱼不同发育期精巢中的表达量呈现出先降低再迅速升高的表达趋势,而相对于精巢而言,卵巢中dmrt仅有微弱表达。研究结果表明,dmrt1可能在雄性性别分化和精巢发育等过程中发挥重要的作用。
关键词： 暗纹东方鲀 dmrt1 cDNA分离 组织表达 发育期
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黄姑鱼异质雌核发育子代的遗传分析
《中国水产科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解黄姑鱼(Nibea albiflora)异质雌核发育子代的基因纯合情况,利用微卫星标记(SSR)和扩增片段长度多态性标记(AFLP)对黄姑鱼异质雌核发育家系进行遗传鉴定和分析.结果显示:(1)雌核发育家系在4个SSR位点和5对AFLP引物组合扩增出的位点均未发现父本特异性等位条带,表明雌核发育体比率为100%.(2)用于遗传分析的7个SSR位点在雌核发育家系和正常交配家系中均未见完全纯合的情况,雌核发育家系7个SSR位点的平均纯合度为0.382,是正常交配家系(0.161)的2.37倍.雌核发育家系各个体的纯合位点数为0~6个,纯合位点所占比例为0~85.7%.(3)5对AFLP引物共扩增出182条清晰的扩增条带,其中有21条父本特异性条带和16条母本特异性条带.16条母本特异性条带中有7个条带在雌核发育家系中显著偏分离(P<0.05).雌核发育家系和正常交配家系多态性条带比例分别为14.7%和20.3%.(4)雌核发育家系与母本的遗传相似度高于与正常交配家系的遗传相似度,正常交配家系同父本和母本的遗传距离大致相同.研究结果表明,黄姑鱼异质雌核发育二倍体家系的遗传纯合度显著高于正常交配家系,人工诱导雌核发育是促进基因纯合的一个有效途径,它不仅可以加速有利基因的纯合固定,还可以加速有害基因的淘汰,从而有效提高育种效率.
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一株鲤春病毒血症病毒SVCV-shlj4全基因组序列分析
《大连海洋大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了分析中国北方地区现行的一株鲤春病毒血症病毒(Spring Virernia of Carp Virus,SVCV)SVCV-shlj4全基因组序列,根据GenBank收录的SVCV参考毒株(SVCV-A2,DQ491000.1)基因序列设计了3对重叠引物,对SVCV-shlj4毒株基因组编码区进行扩增,利用RACE试剂盒对该基因组5′和3′非编码区(Untranslated region, UTR)进行扩增,并利用DNAstar软件对测得的序列进行拼接,获得完整的SVCV-shlj4全基因组,结合Lasergene及MEGA 5.1生物信息学软件对该病毒基因组及其编码的核蛋白、糖蛋白和磷蛋白基因序列进行系统进化分析.结果表明:SVCV-shlj4毒株基因组全长为11 029 bp,共编码5种结构蛋白(3′端-5′端),分别为核蛋白(Nuclear protein,N)、磷蛋白(Phosphoprotein,P)、基质蛋白(Matrix protein,M)、糖蛋白(Glycoprotein,G)和RNA聚合酶(RNA polymerase,L);基因组序列系统进化分析显示,SVCV-shlj4毒株与中国株SVCV-A2的核苷酸序列一致性最高(99.0%),与欧洲株VR-1390核苷酸序列一致性最低(93.0%);编码M蛋白、G蛋白和P蛋白的基因序列进化分析结果显示,SVCV-shlj4毒株在进化上处于亚洲分支,属于Ⅰa基因型,Ⅰaii基因亚型;SVCV-shlj4毒株各基因变异位点分析显示,与中国株SVCV-A1相比,SVCV-shlj4毒株在N基因编码区第1357、1364和1376 nt位点分别缺失1个碱基,在G基因3′端非编码区4630 nt位点和4639 nt位点分别缺失两段基因序列(44 bp和31 bp),与欧洲株VR-1390相比,SVCV-shlj4毒株在G基因3′端非编码区(4637 nt位点)插入10 bp的基因片段,与中国株BJ0505-2相比,SVCV-shlj4毒株在L基因编码区(5822 nt位点)缺失18 bp碱基.本研究系统地分析了中国北方地区现行SVCV分离株的分子特征,为SVCV分子进化研究提供了数据支撑.
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